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Python在生物信息学中的应用:在字典中将键映射到多个值上

我们想要一个能将键(key)映射到多个值的字典(即所谓的一键多值字典[multidict])。 解决方案 字典是一种关联容器,每个键都映射到一个单独的值上。...如果想让键映射到多个值,需要将这多个值保存到另一个容器(列表、集合、字典等)中。...defaultdict 的一个特征是它会自动初始化每个 key 刚开始对应的值,只需要关注添加元素即可。...如果你并不需要这样的特性,你可以在一个普通的字典上使用 setdefault() 方法来代替。...因为每次调用都得创建一个新的初始值的实例(例子程序中的空列表 [] )。 讨论 一般来说,构建一个多值映射字典是很容易的。但是如果试着自己对第一个值做初始化操作,就会变得很杂乱。

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    Stata的绘图功能与绘图类型

    作为强大且灵活的数据分析利器,Stata 能够实现各式各样的绘图。本专题 [Stata 画图] 旨在促进广泛且深入地掌握 Stata 的画图功能。...绘图类型方面。从上表的绘图命令可知,Stata 绘图无非是要实现几种常见类型的图形绘制。...要说明的是,由于绘图命令十分“庞大”,在学习和应用中,不断积累各方资料中的图形代码很有必要;同时在绘图中也要善用 Graph Editor 对图形进行局部细节的优化,毕竟我们不可能记得所有绘图命令的选项...下面,我们用一组容易混淆的示例进行Stata绘图的展示,以帮助我们了解 Stata 的功能与绘图类型。 3....此时,变量的每一个唯一的值将有一个 bin,因而柱子的数量也较多,每个柱子的高度表示该值所对应的密度、频数、百分比或比例。

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    如何使用 Stata 绘制人口金字塔?

    作为强大且灵活的数据分析利器,Stata 能够实现各式各样的绘图。本专题 [Stata 画图] 旨在促进广泛且深入地掌握 Stata 的画图功能。...人口金字塔(Population Pyramid)是一种常见的图形,是人口统计学家用于刻画特定区域内人口构成及其变迁的可视化工具,常见的人口金字塔能够反映出年龄(age)和性别(sex)在总人口中的分布状况...相较于 Excel 而言,使用 Stata 绘制人口金字塔优势明显,因为除了所有图形对象均可按需调整之外,使用代码绘图也让绘图结果可复制,可以快速批量处理多年份多区域的人口数据,便于后期的管理和进一步呈现...在 Stata 中绘制人口金字塔,其实是两张twoway bar条形图和一张twoway scatter散点图的叠加,是这 3 幅图放在一起的结果,其绘图思路和实现方式清晰且简便,这种绘图思路也能够为其他数据的可视化提供借鉴...图片 图片 为节省篇幅,获得有关人口金字塔绘制过程(图3和图4)的全部代码可查看下文: Stata 绘图 | 如何绘制人口金字塔(Population Pyramid)?

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    打破常规的图表制作新思维!!!

    上一篇给大家讲了一个专业、规范、完善的商务图表的元素应该如何布局! 可能很多小伙伴儿会有疑问,默认的输出图表样式跟最终我们想要达到的效果相差十万八千里。...大家可以看到,除了绘图区的图表是用内置图表修改完成的之外,其他元素(主标题、副标题、脚注)全部都是利用图表背后的单元格文本所完成的。...❸此时你会发现图表四角已经严格的锚定到一系列矩形单元格区域之中。然后你就可以随意的在图表上下区域的单元格中添加主标题、副标题、脚注等图表辅助元素(注意对齐以及字体)。...❹对了图表格式化的时候一定要取消绘图区和图表区的填充色和外框线,否则会遮挡单元格中的文本(在图表的绘图区、图表区分别右键单击设置相应属性就OK了)。...今天的分享就到这里,锚定单元格技巧在以后的图标教程中将会频繁用到,一定要学会哦!

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    ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”

    学习了ggplot2的基本绘图元素ggplot2|详解八大基本绘图要素,可以初步绘制出需要展示的图形,legend可以对图例进行细节的修改ggplot2 |legend参数设置,图形精雕细琢,那theme...element_rect():使用element_rect()修改基于矩形的组件,如绘图区域和面板区域的背景。...精雕细琢 1 修改标题,坐标轴 由于绘图和轴标题是文本组件,使用element_text()参数修改。...以上示例涵盖了一些常用的主题修改,其中 vjust,控制标题(或标签)和绘图之间的垂直间距。 hjust,控制水平间距。将其设置为0.5将标题居中。...其中legend.justification参数可以将图例设置在图中,legend.position参数用来将图例设置在图表区域,其中x和y轴的位置(0,0)是在图表的左下和(1,1)是右上角。

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    M1 芯片的 Macbook 运行 Stata 如何?

    最新的 Stata16 已经本地支持 Apple Silicon,只需要运行update all将软件升级;或者在官网下载安装包之后输入db update进行离线升级。...根据官网的介绍,Stata 15 及之前的版本也可以在新 Mac 上运行,但在模拟下运行速度会慢得多。...如果希望在具有 Apple Silicon 的 Mac 上运行 Stata,建议您升级到 Stata 16。 另外,Github 上有个 M1 芯片兼容性测试的项目Does it ARM?...0.301 0.062 2013 842.6 MBP (Intel i5) 1.38 1.551 2013 842.6 Window (Intel i7-6700HQ) 8.885 8.977 数据整理和绘图的代码如下...但是总体而言,可以观察出两方面的结论: 一方面,M1 芯片的 MBP 运行耗时要快于其他两台设备,而且多次的导入显示运行较稳定; 另一方面,Stata15 和 Stata16 在新版电脑上都可使用,没有不兼容的问题

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    最新Python大数据之Excel进阶

    格式化图表 保证图表的完整性 一个完整的图表必须包含以下基本元素:图表标题、数据系列、图例、坐标轴、数据单位 格式化图表区/绘图区 图表区格式的设置主要包括字体、背景填充、边框、大小、属性等 格式化图表标题...、坐标轴标题、图例 图表标题、坐标轴标题和图例的设置比较简单,一般包括字体、边框、对齐方式、位置等的设置 格式化坐标轴 坐标轴包括分类轴和数值轴,设置的项目包括字体,线条,填充,对齐方式,坐标轴选项等...字段设置有以下两个要点:即,透视表的列和行分别显示什么数据、数据的统计方式是什么。 字段设置 •移动字段 首先,字段可以从字段列表中直接拖拽添加到下方区域。...如左下图所示,“日期”在【行】区域内,选中“日期”进行拖拽,可以拖动到【列】区域内。 字段设置 •设置字段的值 透视表是一种可以快速汇总大量数据的表格。...在透视表的字段设置区域,【值】区域内的字段会被进行统计 默认情况下统计方式是求和。如将“金额(元)”字段放到该区域内,就会对销量数据进行求和计算。

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    在 Stata 中基于世界银行开放数据库 API 开展跨国比较分析:wbopendata 命令详解

    wbopendata 在 Stata 中的应用有两种方式:界面勾选(傻瓜方法)和代码命令(敲代码)。...不仅如此,通过便捷的选项设定,利用该命令获取的指定数据集正是在 Stata 中开展面板数据分析时需要的数据呈现形式。...因此,导入 Stata 后无法进行对其进行直接计算,需要对其展开进一步处理。 (3)在原始数据表中,其尾部若干行会显示注释信息等内容,强行读入将被视为观测值。...由上可知,在 Stata 中将世行网站的原始数据用于统计分析需要一定的中间处理过程。解决上述问题的办法有两个,其一,对原始数据进行手动数据。...如果在界面中不做任何选择,Stata 的结果窗口中将显示如下内容: *Users need to select either a country, a topic, or an indicator.

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    R语言系列第六期: ④R语言高级绘图(下)

    轴的值由参数v=指定。...03 添加文本 用text()函数可将文本添加到绘图区域。而text()函数需要两个向量作为参数,这两个参数分别作为x-y坐标的值,并由此确定文本所在位置。另外还有一个字符串参数,它保存要绘制的文本。...在plot()函数中,也可以使用sub=选项。调用title()函数会变得很灵活,例如,当一个标题需要应用于同时展示的多个图中时,可以用此函数。...对于工作在同一会话的其他绘图函数,都会使用默认设置。即这类绘图函数更改的都是临时设定或者内部设定。...当一个参数在随后的绘图函数中发生变化时,这个变化只对该绘图函数有效。若在par()函数中指定了这个参数,则可恢复它的值。就像我们之前所接触的例子,par(mfrow=c(2,2))等。

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    Stata | 解决 graph 中 x 轴刻度重叠问题

    分析思路 把图调整成水平(horizontal); 将 x 轴刻度倾斜,避免重叠; 更改 x 轴的刻度显示区间,这可以通过定义 x 轴值的 label 实现。...简单解释代码中的 {char 0xa0},这是 SMCL(Stata Markup and Control Language) 语言,是 Stata 中的一种标记语言, help 文档大都是用它编写的。...char 表示字符,0xa0 是 ASCII 编码的空格。所以这里实际是“偷梁换柱”,将 x 轴刻度每隔 5 个单位换为空格,这样绘制出来的图就实现了肉眼不可见的空白。...我刚开始也顺着这个思路考虑是否能通过 SMCL 语句更改 x 轴刻度的倾斜角度,但 SMCL 似乎没有并不能实现文本倾斜。对绘图中可用的 SMCL 语句,可自行 help text 查看。...to(2010) set seed 2803 gen y = exp(rnormal()) 参考资料 https://www.statalist.org/forums/forum/general-stata-discussion

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    Matplotlib 可视化之图表层次结构

    在调用figure方法时创建的,可以指定它的长宽(figsize)及分辨率(dpi),也可以指定背景颜色(facecolor)和标题(suptitle)。...第一步,设置画布大小、调整坐标轴范围 第二步,设置图表边框格式 第三步,设置图表标题 第四步,设置图表的网格 第五步,设置轴刻度 第六步,绘图 第七步,配置图例 Step1设置画布..., 刻度线与刻度值之间的距离 labelsize : float/str, 刻度值字体大小 labelcolor : 刻度值颜色 colors : 同时设置刻度线和刻度值的颜色 zorder : float...格式化字符串,例如'ro'代表红色圆圈。格式字符串是用于快速设置基本线条样式的缩写,这些样式或更多的样式可通过关键字参数来实现。...Axes.legend(*args, **kwargs) 参数: labels:这个参数是在旁边显示的标签列表。 handles:这个参数列表是要添加到示例的。

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    Stata与Python等效操作与调用

    如生成最大值、最小值、均值,或者是求和、平方和取对数等。在 Stata 中,最基本的是使用 replace 和 generate 命令,另外 egen 提供了大量的函数能便捷的处理数据。...在 Stata,缺失值(.)大于每个数字,所以 10 在 Python 中,np.nan 不等于任何东西。...1.13.2 浮点数 在 Stata 中,小数和任何值都不相等,比如 3.0==3 是 False 。而在 Python 会返回 True 。 2....但要注意,添加的路径只是临时的添加到了 sys.path,这意味着只有执行脚本的时候才会生效。在脚本运行完毕后,添加的路径会从列表中删除。...2.2.3 交互式与脚本式的区别 不同于交互式,通过脚本执行的 Python 代码中所有对象在脚执行完之后不会保存,它们不会添加到 __main__ 的命名空间。

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    重合散点图绘制:neat

    许多同学学到的第一个Stata绘图命令想必就是scatter命令,该命令用于生成观测样本的散点图,但scatter命令存在一个缺点:当我们的数据集存在重复观测值时,scatter生成的图中不能体现那些“...而今天我们要介绍的命令专门用于解决这一问题——neat命令,它可以微调重复观测样本的变量值。使得其在散点图上清晰可见。...,这些重复观测值“挤”在了一起,我们看不到,那么怎样可以在图中直观地看到这些重复观测值呢。...stata的数据处理和分析技巧。...3)应广大读者要求,现开通有偿问答服务,如果大家遇到关于stata分析数据的问题,可以在公众号中提出,只需支付少量赏金,我们会在后期的推文里给予解答。 欢迎关注爬虫俱乐部

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    R基础知识及快速检阅你的数据

    考虑到公众号后台数不胜数的提问其实并不是生物学知识或者数据处理知识的困惑,仅仅是绘图小技巧以及数据转换的困难。...()-------SAS read_dta()-------Stata *可以使用foreign包替代haven包,其同样支持SPSS和Stata文件,但是其支持Stata12之前的文件版本 foreign...R基础包中的绘图函数,但是如果图形更复杂,ggplot2就会成为更好的选择。...这是因为其提供了一个统一的接口和若干选项来代替基础绘图系统中对图的缝缝补补。本章主要帮助我们从基础绘图过度到ggplot2之中。 2.1绘制散点图 Q: 如何绘制散点图?...boxplot:当箱线图分布值长度为奇数时,箱线图的下,上边缘分别为一分位和三分位。若为偶数则有余数决定。只有任意n/4的余数为1或者2,那么分位数等于观察值,否则则为两观察值的中间数。

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    STATA教程之二:自动化输出描述性数据表格

    STATA制作之:描述性数据表格 前言 本文将简单介绍如何利用Stata的tabout命令,设计出内容丰富的描述性表格。...我们将对输出这个表格的Stata Code进行详细解释。 ?...值得讨论的是 died drug这两个变量的顺序。 Tabout自动将前一个变量设定为列变量,后一个变量为行变量。行变量的意思很直白,就是每个变量的值在表格中以行的形式出现。...第三行是输出类容的格式设定。 clab的含义是column lable,即输出内容的标题,比如频数列的标题为 Freq, 而百分比数列的标题Col_Pct。...Tabout设置了3级行标题:如图所示,第一级标题是行变量的名称——Drug type;第二级行标题是行变量的具体取值——如Placebo, Trial drug 1等;第三级标题则是tabulate的内容

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    计量经济学课程论文踩坑日记 – 学金融的文史哲小生

    一、软件、环境及数据 软件为Stata14便携版 系统环境为Win10 数据文件结构如下 code region year FDI time policy_year hsr ......解决办法: 新建一张工作簿,将原工作表复制,选择“仅文字黏贴”进新的工作簿,在Stata中导入新的工作簿。问题解决成功。...解决办法: findit xxx //输入如上命令 xxx替换为要安装的命令 //然后按照下面的图执行 (三)设置面板数据报错 错误原因: 我购买的数据里有重复记录值,所以删除重复值即可。...个省 如果"地区变量"超越30个且数据量高达三四万,那么建议你看看自己的电脑配置带不带的动 //如果出现以下报错,说明Stata炸了 错误原因: 数据量太大,并且"地区变量"过多,计算过载(反正我是这么理解的...) 解决办法: //框定特定地区来绘图 *例如:使用20个城市绘制时间趋势图* xtline FDI if region=="Anqing" | region=="Ankang" | region=="

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