在VirtualBox下，Cygwin下的可执行文件比Linux下的要慢

的原因是由于VirtualBox是一个虚拟化软件，它模拟了一个完整的计算机环境，包括处理器、内存、硬盘等。而Cygwin是在Windows操作系统上运行的一个兼容层，它提供了一套类似于Linux的环境和工具。

由于VirtualBox和Cygwin都是在Windows操作系统上运行的，而Windows操作系统相对于Linux来说，有一些性能上的差异。其中包括文件系统的差异、进程调度的差异、系统调用的差异等。这些差异导致了在VirtualBox下，Cygwin下的可执行文件相对于在Linux下的执行速度较慢。

虽然VirtualBox和Cygwin提供了在Windows上运行Linux环境的便利性，但是由于虚拟化和兼容层的存在，会带来一定的性能损失。因此，在需要高性能的场景下，建议直接在Linux操作系统上运行可执行文件，以获得更好的性能。

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