首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

【R语言】因子临床分组应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R因子(factor) 今天我们来结合具体例子给大家讲解一下因子临床分组应用。 我们还是以TCGA数据CHOL(胆管癌)这套数据为例。...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾...接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成三个组,并转换成因子 方法一、使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=...*","stage III/IV",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到如下因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾A,...参考资料: ☞【R语言】R因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表

3.2K21

分组后合并分组字符串如何操作?

一、前言 前几天Python最强王者交流群【IF】问了一个Pandas问题,如图所示。...下面是他原始数据: 序号 需求 处理人 1 优化 A 2 优化 B 3 运维 A 4 运维 C 5 需求 B 6 优化 C 7 运维 B 8 运维 C 9 需求 C 10 运维 C 11 需求 B...如果不去重,就不用unique,完美地解决粉丝问题! 后来他自己参考月神文章,拯救pandas计划(17)——对各分类含重复记录字符串列去重拼接,也写出来了,如图所示。...这篇文章主要盘点了一个pandas基础问题,文中针对该问题给出了具体解析和代码实现,帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【IF】提问,感谢【月神】、【瑜亮老师】给出思路和代码解析,感谢【dcpeng】等人参与学习交流。

3.2K10
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

文献阅读|Nomograms线图肿瘤应用

线图,也叫诺莫图,肿瘤研究文章随处可见,只要是涉及预后建模文章,展示模型效果除了ROC曲线,也就是线图了。...所以线图是预后模型可视化形式,是回归公式可视化,一个典型线图如下所示 线图中,对于模型每一个自变量,不论是离散型还是连续型变量,都会给出一个表征该变量取值范围坐标轴,最上方有一个用于表征变量作用大小轴...2)Calibration 校准度,描述一个模型预测个体发生临床结局概率准确性。实际应用,通常用校准曲线来表征。...4)线图理论性能并不代表好临床效应 最后,线图作为预后模型可视化方式,可以辅助临床决策,但是前提是必须有清晰明了临床问题和模型构建,而且应用于临床决策前,需要了解其性能和局限。...只有这样,线图才能更好应用于临床。 ·end·

2.2K20

HyperLogLog函数Spark高级应用

更高层聚合可以带来进一步性能提升,例如,时间维天聚合,或者通过站点而不是URL聚合。...本文,我们将介绍 spark-alchemy这个开源库 HyperLogLog 这一个高级功能,并且探讨它是如何解决大数据数据聚合问题。首先,我们先讨论一下这其中面临挑战。... Finalize 计算 aggregate sketch distinct count 近似值 值得注意是,HLL sketch 是可再聚合 reduce 过程合并之后结果就是一个...Spark-Alchemy 简介:HLL Native 函数 由于 Spark 没有提供相应功能,Swoop开源了高性能 HLL native 函数工具包,作为 spark-alchemy项目的一部分...,本文阐述了预聚合这个常用技术手段如何通过 HyperLogLog 数据结构应用到 distinct count 操作,这不仅带来了上千倍性能提升,也能够打通 Apache Spark、RDBM 甚至

2.5K20

函数式编程ReduxReact应用

本文简述了软件复杂度问题及应对策略:抽象和组合;展示了抽象和组合在函数式编程应用;并展示了Redux/React解决前端状态管理复杂度方面对上述理论实践。...函数式编程Redux/React应用 从reduce到Redux reduce reduce 是对列表迭代操作抽象,map 和 filter 都可以基于 reduce 进行实现。...纯函数React应用 Redux可以用作React数据管理(数据源),React接受Redux输出state,然后将其转换为浏览器具体页面展示出来: view = React(state)...由上可知,我们可以将React看作输入为state,输出为view“纯”函数。下面讲解纯函数概念、优点,及其React应用。...最后讲了纯函数 react/redux 框架应用:将页面渲染抽象为纯函数,利用纯函数进行缓存等。 贯穿文章始终是抽象、组合、函数式编程以及流式处理。

2.1K90

回调函数Java应用

回调函数Java应用 In computer programming, a callback function, is any executable code that is passed as...关于回调函数(Callback Function),维基百科已经给出了相当简洁精炼释义。...Java面向对象模型不支持函数,其无法像C语言那样,直接将函数指针作为参数;尽管如此,我们依然可以基于接口来获得等效回调体验。...我们产品侧调用mop下单接口后还会有后续逻辑,主要是解析mop下单接口响应,将订单ID与订单项ID持久化到数据库;由于mop下单接口耗时较多,就会导致我们产品侧接口响应时间延长,原本响应时间不到一秒...void onResponse(Object response); void onFailure(Exception e); } 2 mop client sdk 异步下单接口 我们mop

2.9K10

javasort排序算法_vbasort排序

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 C++中提供了sort函数,可以让程序员轻松地调用排序算法,JAVA也有相应函数。...Arrays.sort(a); for (i=0;i<=4;i++) { System.out.println(a[i]+" "); } } } 2.基本元素从大到小排序: 由于要用到sort第二个参数...可以使用Interger.intvalue()获得其中int值 下面a是int型数组,b是Interger型数组,a拷贝到b,方便从大到小排序。capare返回值是1表示需要交换。...Arrays.sort(a,cmp); for (i=0;i<=4;i++) { System.out.println(a[i]); } } } 4.区间排序 如果只希望对数组一个区间进行排序...,那么就用到sort第二个和第三个参数sort(a,p1,p2,cmp),表示对a数组[p1,p2)(注意左闭右开)部分cmp规则进行排序 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https:

2.2K30

R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

, by=x][order(x)] #和上面一样,采取data.table链接符合表达式 DT[v>1, sum(y), by=v] #对v进行分组后,取各组v>1行出来,各组分别对定义...函数画图,对于每个x分组画一张图 DT[, m:=mean(v), by=x] #对DTx分组,直接在DT上再添加一m,m内容是mean(v),直接修改并且不输出到屏幕上 DT[, m:=mean...(v), by=x] [] #加[]将结果输出到屏幕上 DT[,c("m","n"):=list(mean(v),min(v)), by=x][] # x分组后同时添加m,n 两,内容是分别是mean...(y=max(y)), lapply(.SD, min)), by=x, .SDcols=y:v] #对DT取y:v之间x分组,输出max(y),对y到v之间求最小值输出。...SD就包括了页写选定特定,可以对这些子集应用函数处理 allow.cartesian FALSE防止结果超出nrow(x)+nrow(i)行,常常因为i中有重复而超出。

5.5K20

数学相关函数PHP应用简介

数学相关函数PHP应用简介 对于数学计算来说,最常见其实还是我们使用各种操作符操作,比如说 +加、-减 之类。当然,PHP 也为我们提供了一些可以方便地进行其他数学运算操作函数。...它产生随机数平均速度比 rand() 快四倍,这是官方文档,而且,mt_rand() 文档也说了是非正式用来替换 rand() 函数。...前面带 a 都是对应三角函数函数,后面带 h 都是对应三角函数双曲函数,又带 a 又带 h 就是反双曲函数了。 最后两段测试代码,我们数据出现了 NAN 这种情况。...数学是计算机基础,也是理工科所有专业基础,计算机编程语言中为我们提供这些函数大家还是要灵活掌握,特别是某些面试场景下会非常有用。...测试代码: https://github.com/zhangyue0503/dev-blog/blob/master/php/202012/source/9.数学相关函数PHP应用简介.php 参考文档

99710

R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

一、日期分组 1、关于时间包都有很多很好日期分组应用。...##按照已有的类别数据,分类 g<-split(Cars93,Cars93$Origin) #按照cars93数据集,按照origin进行分组 ##例2:对矩阵分组) m<-cbind...base包里和split功能接近函数有cut(对属性数据分划),strsplit(对字符串分划)以及subset(对向量,矩阵或数据框给定条件取子集)等。...可以看到,计算结果第一实际上是“SELLERID.CLIENT”,我们需要把它拆分成两并调换顺序才行。...(iris$setosa)] #按照照setosa大小,重排Sepal.Length数据 四、dplyr与data.table data.table可是比dplyr以及python

20.4K32

问与答62: 如何指定个数Excel获得一数据所有可能组合?

excelperfect Q:数据放置A,我要得到这些数据任意3个数据所有可能组合。如下图1所示,A存放了5个数据,要得到这5个数据任意3个数据所有可能组合,如B中所示。...Dim n AsLong Dim vElements As Variant Dim lRow As Long Dim vResult As Variant '要组合数据在当前工作表...A Set rng =Range("A1", Range("A1").End(xlDown)) '设置每个组合需要数据个数 n = 3 '在数组存储要组合数据...Then lRow = lRow + 1 Range("B" & lRow) = Join(vResult, ", ") '每组组合放置...代码图片版如下: ? 如果将代码中注释掉代码恢复,也就是将组合结果放置,运行后结果如下图2所示。 ? 图2

5.4K30

R︱高效数据操作——data.table包(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并)

data.table,还有一个比较特立独行函数: 使用:=引用来添加或更新一(参考:R语言data.table速查手册) DT[, c("V1","V2") := list(round(exp(V1...%>%功能是用于实现将一个函数输出传递给下一个函数第一个参数。注意这里,传递给下一个函数第一个参数,然后就不用写第一个参数了。dplyr分组求和过程,还是挺有用。...—————————————————————— 实战一:data.table如何选中,如何循环提取、操作data.table?...除了行,就是问题了。data.table操作,真的是费劲。。。 常规来看, data[,....(x)] 还有 data$x 如果有很多名字很长指标,data.table如果进行遍历呢? data[,1]是不行,选中方式是用列名。

7.2K43

data.table包使用应该注意一些细节

as.matrix作用于data.table时会调用as.matrix.data.table,有一个rownames参数可以指定保留为行名 矩阵转换成data.table时可以保留列名   ...as.data.table函数同样有一个rownames参数,设置为T可以将行名保留下来作为data.table 不建议set和for循环一起使用   虽然set可以在内存上直接改变数值,但在R...0.6就不等于0.6, 虽然很费解,但这是因为计算机存储浮点数时出现一些问题。...  类似于集合运算,data.tablefintersect, fsetdiff, funion,fsetequal函数能对不同数据框行求交集,差集,并集等 可以直接对分隔符进行分割   应用...分隔,分割成c1,c2两 支持类似于SQLs分组运算   带有rollup, cube, groupingsets函数 参考资料 data.table 1.11.2 manual:https://cran.r-project.org

1.5K10

scanf函数实战应用: 实例演示scanf函数实际应用使用方法

C语言中,scanf函数是一种常用读取数据方式,它可以按照我们预期格式读取数据。为了让scanf函数更高效地工作,我们可以使用格式化字符串来限制输入数据类型和长度。...基本格式 scanf函数格式化字符串由百分号(%)开头,后面跟着读取数据格式。例如,"%d"表示读取一个整数,"%f"表示读取一个浮点数,"%s"表示读取一个字符串。...清空输入缓存 在读取多个值时,scanf函数会将之前未读取数据留在输入缓存,可能会影响后续读取。我们可以使用 "%[^\n]% c" 这种格式化字符串来清空输入缓存。...总结 总之,scanf函数是C语言中非常常用函数,其强大格式化字符串可以帮助我们限制输入格式,但是,我们使用scanf函数时也要注意一些细节,如缓存区问题,还要注意scanf函数返回值,以确定读取是否成功...总结来说,scanf函数是C语言中非常常用函数,它格式化字符串能够帮助我们限制输入格式,但是我们使用时也要注意一些细节。

1.9K40

MySQL虚拟电商场景下应用

引言 有时候大家在做电商商品推广时候会涉及到一些json串存储,同时检索时候会通过json里面的段就进行相关检索,这样的话就可能会引入虚拟这个概念。...下面用一个简单例子来介绍一下虚拟使用。...JSON字段类型 MySQL 5.7.8开始支持JSON类型,JSON类型支持存储json格式字符串列,拥有以下特性: 自动校验存储JSON格式数据 优化json存储格式,存储 JSON ...JSON 文档被转换为允许对文档元素进行快速读取访问内部格式 虚拟实践 数据准备 确认MySQL版本 查看mysql 版本必须在5.7.8及以上,查看命令参考: show variables like...,参考如下 # coding: UTF-8 #批量插入数据到mysql数据库 import mysql.connector mydb = mysql.connector.connect( host

2.3K94

Power Query批量处理函数详解

; 第2参数是需要改变及操作(正常情况是由列名和操作函数组成,也可以是空列表); 第3参是去除第2参数中指定后剩余所需要进行处理函数; 第4参数是找不到第2参数指定标题时是忽略处理(1)还是返回错误处理...例2 如果是需要进行多个操作,可以第2参数中使用多次对应写法,并在最外面用符号{}括起来。 如果除了成绩要减去10,还需要在学科后面加上字符“(上)”。...例3 第3个参数是一个函数,是第2参数指定以外表格所有需要进行操作。 在前面的操作,成绩和学科都有了操作,那剩余其他(姓名列)也需要进行操作,那就要使用到第3参数了。...如果第2参数学科写错或者定义了其他未在操作表列名,则可以通过第4参数来控制返回。...因为指定里有 “班级”,但是原来表格不存在,所以会产生错误,但是第4参数有指定1,也就是忽略错误,最终返回结果如图所示。除了找到成绩列表外,其余数据都在后面添加了个“A”。 ?

2.4K21

「R」数据操作(三):高效data.table

N是最常用符号之一,它表示当前分组,对象数目(就不用调用nrow函数啦)。[]使用它指提取最后一行。...对数据进行分组汇总 by是data.table另一个重要参数(即方括号内第3个参数),它可以将数据按照by值进行分组,并对分组计算第2个参数。...data.table,by所对应组合值是唯一,虽然实现了目标,但结果没有设置键: key(type_class_test0) #> NULL 这种情况下,我们可以使用keyby来确保结果data.table...然后每个子集data.table语义中计算j表达式。...举例,我们定义一个函数,计算market_data由用户定义年度均值: average = function(column){ market_data[, .

5.9K20
领券