1 显示或隐藏标尺和参考线 2 设置标尺选项 3 设置参考线颜色 主菜单 -> 选项 -> 系统 4 添加或删除参考线
本节主要使用ggridges包[1]中的geom_density_ridges()进行绘制峰峦图。详细介绍如下： 1.数据结构 这里使用base包中的diamonds数据集做例子。...# library library(ggridges) # Ridgeline Plots in 'ggplot2', CRAN v0.5.2 library(ggplot2) # Create Elegant...2.4加入统计量 设置选项quantile_lines = TRUE，可以使stat_density_ridges计算指示分位数的线的位置。...注意：quantiles=2意味着在两个分位数之间的边界上有一条线(即中位数)。 我们还可以通过切点而不是数字来指定分位数。...如果你还想再加入一个变量进行可视化，可以在geom_density_ridges()加入。
ggplot2 介绍 语法构成 GGPlot2是一个强大而灵活的R包，由HadleyWickham实现， ggplot2中的gg表示Grammar of graphics，ggplot通过使用“语法”来描述图形...plot stat_ecdf() Title and axis labels labs() 例子 对iris数据集进行绘制散点图 library(ggplot2) ggplot(iris, aes...# 添加分组，这里在geom_point中使用aes ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width))+ geom_point(aes(color...# ggplot theme # ggplot的默认主题是theme gray()，它是具有灰色背景和白色网格线的主题。...结束语 今天是公众号创立以来的第100篇文章，转眼间已经过去这么长时间了，物是人非，再回首，有些人背叛了革命，有些人迷失在了熙熙攘攘的人海，总归是意难平。
❝最近看到一篇论文通过系统发育树添加饼图来展示数据，本节来简单介绍一下如何绘制一个类似的图。下面小编通过一个小案例来进行展示，图形过程仅供展示用，希望各位观众老爷能够喜欢，代码可直接复制粘贴运行。...non" ) + scale_fill_brewer(palette = "Set1") # 设置颜色 }) # 为饼图列表设置名称 names(pies) <- 1:15 将饼图添加到树图中...inset(p + geom_tiplab(), pies, width = 0.3, height = 0.3, hjust = -0.5) ❝本节内容介绍到此结束，过程仅供参考；
简介 最近有个需求，统计课中需要绘制以下图形： 这里我主要使用 ggridges 包中的 stat_density_ridges()。...加载包 library(ggplot2) library(ggridges) 产生数据集 假设数据来源于一个混合分布。...1), rnorm(item - inds, 8, 1)) data <- data.frame("value" = x, "class" = rep(1, length(x))) 绘制密度函数图并添加分位数线...= TRUE, quantiles = c(0.025, 0.975) #添加分为数线 ) + scale_fill_manual( name = "Probability",...小编对该包的介绍做过几期，可见：cowplot包：用R添加水印。其他合并的方式还有：R可视乎｜合并多幅图形；R可视乎|分面一页多图。
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来复现nature上的一张小图介绍如何使用「ggplot2构建误差线组图并添加组间显著性标记」， 下面小编就通过一个案例来进行结果展示，添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢...value ~ group) %>% adjust_pvalue() %>% add_significance("p.adj") %>% select(2,3,p.adj.signif) 添加注释
strip.text.x = element_text(color="black",face="bold",size=11))+ guides(x.sex="axis",y.sec="axis") 代码解释 ❝ggplot2...函数 aes() 指定数据帧中哪些列应用于图表美学。...❞ geom_jitter(aes(fill=case_control,color=case_control), pch=21, width=0.1, size=2) ❝向图表添加了一个抖动散点图。...❞ stat_boxplot(geom="errorbar", width=0.1, linetype="solid") ❝使用函数 stat_boxplot 向图表添加了误差条。...❞ stat_summary(geom="crossbar", fun="mean", width=0.2, linetype="solid") ❝向图表添加了一条水平线，以显示每个 case_control
ggplot2 更改图例的顺序 箱线图添加误差线这个自己老是记不住，每次作图都得现查，今天的推文记录一下实现代码，方便自己以后查看。...基本箱线图 ggplot(data = dfa, aes(x=Species,y=value,fill=Species))+ geom_boxplot() image.png 添加误差线...scale_fill_material_d()+ theme_bw()+ guides(fill=guide_legend(reverse = T)) image.png 分组箱线图需要我们在stat_boxplot...()函数和geom_boxplot()函数里分别加上position = position_dodge(0.5)参数，目的是使误差线和箱子的位置对应上 如果不加这两个参数，效果如下 image.png...这里还有一个疑问是 箱线图中间的线好像是中位数，如何把这个线更改为平均值呢？
image.png 公众号后台有读者留言问这个图的实现办法，这个图相比于普通的PCA散点图是多了一个垂直和水平的误差线，这个如何实现之前还没有尝试过，所以查了查资料，找到了一个参考链接 https:/.../cran.r-project.org/web/packages/SIBER/vignettes/Plot-SIA-ggplot2.html 按照这个参考链接的代码 我们试试。...用之前提到的小麦种子数据做示例数据 加载需要用到的包 library(ggplot2) library(ggforce) library(tidyverse) 读取数据 df<-read.csv(
05275-y s41586-022-05275-y.pdf 代码没有公开，但是作图数据基本都公开了，争取把每个图都重复一遍 今天的推文重复论文中的extended Figure4 频率分布直方图和散点图添加误差线...read_excel("extendFig4.xlsx", sheet = "Panel a") dat colnames(dat)<-"Var1" library(ggplot2
stat_qq(aes(color = sex)) + # 配色方案 scale_color_manual(values = c("#00AFBB", "#E7B800")) + # 添加...lab labs(y = "Weight") # 除了ggplot2，ggpbur也可以进行qq图的绘制 # 使用ggpbur包中的ggqqplot函数绘制 library(ggpubr) p2...ECDF图 ECDF：Empirical cumulative distribution function，用于描述数据的分布，横坐标为指标，纵坐标为累计概率 从图中可以看出数据的分布比例 代码 # 绘图...p3 % ggplot(aes(x = weight)) + # ECDF函数 # 设置性别组，绘制两条曲线 stat_ecdf(aes(color = sex,...结束语 此次为ggplot2系列的最后一次内容，基本的图形已经介绍完毕，总体来说，ggplot语法结构大同小异，用的时候查函数就行。
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05710-8
left_join(dat01.gwas,dat01.local,by="ID") -> dat 作图代码 这里没有搞清楚他用来映射颜色的数据是什么，这里我就直接用x轴的数据映射颜色了 library(ggplot2...GWAS})"), y=TeX(r"(\textit{h}$^2$ {(\textit{cis})} { local})")) image.png 今天的推文没啥新知识点，熟悉下ggplot2...的基本语法，熟悉下latex2exp这个R包用来添加文本的语法 拼图 library(patchwork) p+ scale_color_paletteer_c("ggthemes::Red-Green
下面来看一下怎么对RecyclerView中的子项添加分隔线： 首先，我们要知道，要对RecyclerView控件中的子项添加分隔线，我们要利用RecyclerView.ItemDecoration...RecyclerView.State state) { super.onDraw(c, parent, state); } // 也可以在这个方法中绘制分隔线，这个方法会在...在Android studio 工程中的app目录下的buil.gradle文件中加上上图划出的代码，之后点击右上角的 async now 蓝色字体，android studio 就会为我们添加对RecyclerView...layout_height="match_parent" > 可以看到，我们在布局文件中只加入了一个...好了，RecyclerView控件的分隔线就介绍的差不多了，RecyclerView控件相当于ListView控件的升级版，使用步骤也类似：定义控件、使用适配器添加数据、添加布局管理器、添加分隔线、添加动画效果等等
今天给大家分享三种在ggplot2包画的图形上添加拟合的线性回归方程和R^2的值的方法。...1 解决方案1 library(ggplot2) set.seed(1234) df <- data.frame(x = c(1:100)) df$y <- 2 + 3 * df$x + rnorm(...library(ggplot2) library(ggpmisc) set.seed(1234) df <- data.frame(x = c(1:100)) df$y <- 2 + 3 * df$x...library(ggplot2) library(ggpubr) set.seed(1234) df <- data.frame(x = c(1:100)) df$y <- 2 + 3 * df$x
箱线图展示的就是分位数，中间的线表示的是中位数，也就是50%分位数，如果非要在箱线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的，今天介绍一下实现代码 示例数据集我们用R语言的内置数据集PlantGrowth...image.png 首先是画一个最普通的箱线图 df<-read.csv("PlantGrowth.csv") library(ggplot2) library(tidyverse) p1<-ggplot...image.png 通过ggplot_build()函数可以获取画箱线图用到的数据 ggplot_build(p1)$data[[1]] image.png 我们利用原始数据计算一下平均值，然后将数据集的平均值添加到这组数据中...>% rename("group_1"="group") %>% cbind(ggplot_build(p1)$data[[1]]) -> df1 然后利用geom_segment()函数添加品均值的线段...找到一种办法是重新画一条线把原来的中位数的线给盖住 p1+ geom_segment(data=df1, aes(x=xmin,xend=xmax,
折线图添加误差线是非常常用的一种可视化方法，今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2作图的代码。...genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genetic history of apple domestication 中的...Figure3中的d图 ?...image.png 数据保存为csv格式 df<-read.csv("line.csv",header=T) df 基本的折线图 library(ggplot2) head(df) ggplot(df...image.png 添加误差线 ggplot(df,aes(x=time_point,y=value))+ geom_line()+ geom_point()+ ylim(0,40)+
最近有人在公众号后台留言问到这个问题，今天的推文介绍一下ggplot2做堆积柱形图并添加误差线的办法 完整代码 ''' 堆积柱形图添加误差线 ''' getwd() library(ggplot2)...我将其写出到一个文件里，部分数据如下 image.png 我们只用到其中的三列 species 企鹅的种类 sex 企鹅的性别 bill_length_mm 企鹅嘴的长度 解释代码 用到的R语言包 ggplot2...summarise(mean_value=mean(bill_length_mm), sd_value=sd(bill_length_mm)) -> df1 df1 给数据集添加新的一列用来控制误差线的位置...limits = c(0,100))+ scale_fill_material_d()+ theme_bw()+ labs(x=NULL,y="ABCD") 画图代码在今天推文的第三条视频中会有介绍...，这里就不用文字来解释了 今天的推文完整示例数据和代码可以在第二条推文的留言区获取（第二条推文是一个广告） 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和
https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic 今天的推文重复一下论文中的figure1b image.png 数据集 image.png 这里误差线的范围是平均值加减标准差...，数据提前算好，整理到csv文件中 读取数据 library(readr) dat01<-read_csv("newdataset/MockData_Fig_1B_microbiome_rarefaction_datatable.csv...") head(dat01) 分组折线图 library(ggplot2) ggplot(data=dat01,aes(x=nr,y=spec.nr.mn,color=Taxon))+ geom_line...(size=1.5,linetype=dat01$linetype) image.png 添加误差线 ggplot(data=dat01,aes(x=nr,y=spec.nr.mn,color=Taxon
本文将介绍通过Java编程在PDF文档中添加表格的方法。添加表格时，可设置表格边框、单元格对齐方式、单元格背景色、单元格合并、插入图片、设置行高、列宽、字体、字号等。....*; public class AddTable { public static void main(String[]args){ //创建文档，添加PDF页面...data[i].split("[;]"); } //填充数据到表格 grid.setDataSource(dataSource); //在表格第...} //绘制表格到PDF grid.draw(page,0,30); //保存文档 pdf.saveToFile("添加表格
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