arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小 desc()
一、玩转字符串 stringr包 图片 1.str_length() 检测字符串长度 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 1.检测字符串长度 str_length(x) #计算字符串中有多少字符 length(x) #计算向量中元素的个数 图片 图片 2. str_split 字符串拆分 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 2.字符串拆分 str_sp
1.字符串图片1.str_length图片x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表,但是列表不能进行计算,对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")st
ctrl+shift+m,把上一个运算的结果输入为下一个函数的第一个参数,可以省略很多中间变量
哈喽,我是学习生物信息学的阿榜!非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记,将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误,欢迎指正。让我们一起加油,一起学习进步鸭? 这份学习目录可以
例如 y=c("nihaoa 11","niyehaoa 22","zhangsongwen 33")
i :代称,比如第一次循环则代表in后面向量的第一个元素;第二次则为第二个元素,直到完成in后面向量里所有元素的循环为止。如in后面的向量有8个元素,则8次循环。
专题一:玩转字符串1.检测字符串长度x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."xstr_length(x)#检测字符串内的字符数,空格也算length(x)#向量里面元素的个数2.字符串拆分str_split(x," ")#以空格为分隔符号将字符串拆分开x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")str_split(y," ")str_split(y,"
semi_join anti_join实际上没有发生过两个数据框的连接,其实是对左边的数据框取子集
⚠️注意:str_spilt的第二个参数,写你想分割的符号,上面代码“hello world”的分割是空格,因此输入“ ”,同样也可以是其他符号。
数据框函数- 排序arrange()和desc参数、distinct()去重复、mutate()数据框新增列
[1] "The birch canoe slid on the smooth planks."
作为同属于tidyverse 大家庭的一份子,stringr 也为R 的一般字符串处理,献上了一份自己的力量!
关系正确返回TRUE 否则FALSE== 相等 != 不相等>大于< 小于 ps:字母多的字符串比少的大
step1 对matrix进行转置:使gene名变为列名,将样本名转化为data.frame中的第一列
图片 专题1 玩转字符串 图片 检测字符串长度 代码1 str_length(x) if(!require(stringr))install.packages('stringr') library(stringr) x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x [1] "The birch canoe slid on the smooth planks." str_length(x) [1] 42 ### 1.检测字符串长度,包含空格和符号 le
-(3)注意:之前提到过,矩阵的某一列不能单独转换数据类型,需要把矩阵转换成数据框再转换某列的数据类型;或者把这列单独提取出来再转换其数据类型;
近期写R代码,经常用dplyr::case_when结合stringr::str_detect进行条件判断。
上篇是数据框中列的筛选(R语言列筛选的方法--select),本次讲解行的筛选,主要是介绍filter函数。
str_detect(x,"h")##是否含有关键词h,生成与X长度相等的逻辑值向量,可用于向量取子集;
https://github.com/cxli233/SimpleTidy_GeneCoEx/tree/v1.0.1
x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #是list 所以用[[]]
x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."
碎碎念:这个没啥好仔细展示的,含义也很直观,主要是要记住有这个函数,等需要用的时候回来找
lapply(list, FUN, …) :对列表/向量中的每个元素实施相同的操作
「代码链接」https://gist.github.com/AlbertRapp/438102c458fc8fbdffcb6feb76ff93f7 可以从网站直接获取,如果你下载网速很慢,可以从文末直接获取
「方法」:利用加权相关网络分析(WGCNA)从 GEO 数据库的 GSE60993、GSE48060 和 GSE61144 数据集中筛选出与 AMI相关性最高的基因模块。
由于一个知识星球的小伙伴急需学习如何从 PDF 文档中提取表格,所以先插这个课,「使用 R 语言处理 netCDF 数据」系列的课程下次再发新的哈。本课程介绍了如何使用 R 语言从 WHO(世界卫生组织)的官网上下载新冠疫情的每日报告以及如何从这些报告中的表格里面提取数据。
属性设置:映射:根据数据的某一列的内容分配颜色;统一设置:把图形设置为一个颜色,与数据无关
---title: "生信技能树学习笔记"author: "天空"date: "2023-01-04"output: html_document---R语言综合应用1. 玩转字符串图片(1) str_length()图片library(stringr)x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x## [1] "The birch canoe slid on the smooth planks."### 1.检测字符串长度str_length(x)##
循环允许我们通过循环数组或对象中的项并做一些事情,比如说打印它们,修改它们,或执行其他类型的任务或动作。JavaScript有各种各样的循环,for循环允许我们对一个集合(如数组)进行迭代。
stringr构建在stringi之上,stringr专注于最重要且最常用的字符串操作函数,而stringi提供了涵盖几乎所有可以想象的内容的全面集合。 如果发现stringr缺少所需的功能,请尝试查看stringi。
str_detect:用来匹配字符中的字母,返回布尔值 str_count():匹配字符,返回匹配的个数
从这期开始,大猫课堂将会推出一个新的系列:R练习50题,目的是使用50道练习题让大家掌握常用的数据操作,例如寻找每组最大的N个观测等。本练习题来源于Renkun (github.com/renkun-ken/r-data-practice) 在Github上的共享,我们认为它包括了绝大多数实践中会遇到的问题,特别具有代表性。只可惜Renkun并没有提供答案,所以我们在这里提供我们的版本。
这一部分,将R语言stringr包中的使用正则表达式的字符串函数简单介绍一下,会用到正则表达式的相关内容,有关正则表达式的知识可以回顾R&Python Data Science系列:数据处理(6)--字符串函数基于R(二)
然后马上这些策略就被应用到了单细胞转录组数据挖掘层面,因为反正也不需要自己产出数据了,过去三五年间单细胞的火热带动了海量的各种实验设计的公开的表达量矩阵。比如这个文献:《Lipid-related protein NECTIN2 is an important marker in the progression of carotid atherosclerosis: An intersection of clinical and basic studies》就是看了看两个分组的具体的基因的差异,在普通bulk转录组和单细胞转录组两个数据集里面,如下所示:
第一部分:字符串 1 检测字符串长度 x = "The birch canoe slid on the smooth planks." str_length(x) [1] "The birch canoe slid on the smooth planks." length(x) [1] 1 2 字符串拆分 str_split(x," ") [[1]] "The" "birch" "canoe" "slid" "on" "the" "smooth" "planks
上次推文,我们通过数字和字符进行了简单的行筛选,今天我们继续来探讨 filter()的进阶用法
在Python中可迭代(Iterable)、迭代器(Iterator)和生成器(Generator)这几个概念是经常用到的,初学时对这几个概念也是经常混淆,现在是时候把这几个概念搞清楚了。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云