文档建议反馈控制台
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗？
是的
没有找到

（数据科学学习手札38）ggplot2基本图形简述

abline()、hline()与vline() 　　在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()： 　　...x轴，则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条，xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置，若传入向量则可同时添加多条线条： library(ggplot2) p <- ggplot...()： 　　同样的，我们通过在geom_hline()中传入参数yintercept来绘制垂直于y轴的线条： p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) + geom_point...~cut) p 2.8 curve()与segment() 　　有时候我们需要在已绘制的图形中添加线段、曲线、小箭头之类的注解，这时候就可以用到ggplot2中的geom_curve()与geom_segment...= "white", fontface = "bold") 在图床指定位置添加文本标签： df <- data.frame( x = c(1, 1, 2, 2, 1.5), y = c(1,

5.1K20

R绘图|染色体SNP指数图绘制

/sliding_window.tsv", header=FALSE) # 在snp_index中需要用到数据有：V1（所在的染色体位置）、V2（在某条染色体上的特定位置）、V8（SNP-index值...）； # 在sliding_window中需要用到的数据有：V1（所在的染色体位置）、V2（在某条染色体上的特定位置）、V5（滑窗区域中的SNP-index均值）； snp_index sliding_window...2 作整图及美化 library(ggplot2) # 加载绘图包ggplot2 library(eoffice) # 为了后续将绘制好的图保存为ppt的可编辑格式 p1 <- ggplot()...facet_wrap( ~ V1,ncol = 5,strip.position = "bottom",scales = "free_x")+ # 添加值为0.95的垂直于y轴的辅助线，并设置颜色，指定线的类型...()+ # 修改坐标，axis.text.x指定x轴的数字不显示；strip.background设置标签的背景为空白；strip.placement将坐标轴的刻度向外显示；axis.line.x设置x

99820

ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来

2.2 细节优化火山图 1）根据阈值设定上下调基因 新增change列，利用ifelse函数添加基因的上下调情况，color进行区分，然后使用geom_hline() 和 geom_vline( )参数添加阈值线...2）添加阈值线 使用geom_hline() 和 geom_vline( )参数添加阈值线 ggplot(data = data, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val...4） 解决基因名重叠问题 基本和paper一致，但是因为差异表达基因太多，存在重叠情况，现使用R语言的ggrepel包解决标签太多导致的重叠问题。...5） 标示感兴趣的基因的表达情况 将我们感兴趣的基因添加到数据的LABEL列中，假设以下几个基因是我们重点关注的基因，单独查看以下基因的表达情况 ?...那可不可以在“paper”级静态火山图的基础上，实现交互式呢？当然可以！！！ ?

3K21

多种方法在火山图上标记感兴趣基因（差异基因，或者通路）

） 关于火山图加标签的需求，这里有几种方法来实现。...可以看到，一部分点有标签， 一部分没有，思路就是把不要标签的部分变成空字符串“”。 学以致用 火山图的本质就是点图，那么在火山图上标记部分基因，就是在点图上标记部分点。...端详代码找思路 1.从原来数据中挑选了一部分，生成新数据 2.用新数据作图，向原数据做的点图上叠加两个图层，一个空心点图，一个geom_label_repel。...step2：生成用于添加图层的新数据 ⭐重点在这里 新数据框的内容是你想要标记的基因，这里根据logFC和Pvalue的大小来筛选，可以自定义阈值来调整要显示的基因的数量： for_label <- test...代码来源 当然是群主在GitHub的的800M的GEO数据挖掘代码啦，还有配套视频： ?

16.2K34

R问题｜数值模拟流程记录和分享

在每个 R 脚本中存储所有 Rdata 和数据集 代码如下： write.xlsx(sheets, paste("....如果对ggplot2绘制还存在一定难度的朋友，可以在公众号输入[可视化文稿]得到教程文稿，再结合我的b站（账号：庄闪闪）“R可视化教程”，进行快速的入门学习。...annotate_figure()加入图片的标签，再使用cowplot包中的plot_grid()将图片进行合并。...具体教程参考：R语言统计与绘图：给组合图形添加ABCD小标签；R可视乎｜合并多幅图形；R语言ggplot2作图一些好看的颜色搭配；paletteer包：拥有2100多个调色板！...color = "black", size = 12)) plot_grid(fig11,fig21,fig31,ncol = 1,nrow = 3) 注意： 这里又有一个技巧：在标签中加入特殊符号

88210

ggplot2-annotation|画图点“精”，让图自己“解释”

一 绘制基础图 library(ggplot2) p <- ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) + geom_point() ?...更多参数ggplot2|详解八大基本绘图要素，主题ggplot2|theme主题设置，详解绘图优化-“精雕细琢”，图例ggplot2 |legend参数设置，图形精雕细琢 可参考。...二 添加“注释” 2.1 添加文字标签 1) 通过x y 指定标签的位置 p + annotate("text", x = 4, y = 25, label = "add text",...如果待注释的text太多，可使用ggrepel包解决标签太多导致的重叠问题 ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来 2.2 点注释 1）添加点 p + annotate(geom = "...2.4 添加垂直线 p + geom_hline(yintercept=25, color="orange", size=1) + geom_vline(xintercept=3, color="orange

6K10

目前最全的R语言-图片的组合与拼接

对象（与grid结合 ） Hide library(ggplot2)library(customLayout) 1.2 简单画布 通过设置简单的数字矩阵以及对应的宽高比，可以非常方便的设置出来数字拼图...关键函数： lay_new() 创建拼图画布 lay_show() 显示拼图画布 mat数字矩阵必须从1开始，且必须连续 library(ggplot2)library(customLayout) #...更重要的是，这个包可以组合多个”ggplot2”绘制的图为一个图，并且为每个图加上例如A,B,C等标签， 这在具体的出版物上通常是要求的。...把绘图对象添加到列表总，并把该列表传递给grid.arrange()函数中的grobs参数 library(ggplot2) library(gridExtra) library(lattice) #...，向图形内部添加一个图形 grob = g, # 插入图形对象，即添加内容 xmin = 1, xmax = 5, ymin = 5, ymax = 10 # 添加位置4个坐标 )

5.2K41

没想到修个火山图这么麻烦

二）——用R画带基因名标签的MA图》 RNA-Seq分析中（二）——用R画带基因名标签的MA图 - 知乎 (zhihu.com)另外 上面算是模板吧。...其实引起我最大注意的还是，看到横坐标是科学计数法显示的 于是就搜索的教程 《如何使用ggplot更改轴上数字的格式？》 如何使用ggplot更改轴上数字的格式？...感觉分组是作者另外加的注释 找到的教程：《ggplot中的注释图层annotate》 ggplot中的注释图层 annotate_zoujiahui_2018的博客-CSDN博客《R语言ggplot2...找到的教程5.4 添加注释：添加线段(segment) - 知乎 (zhihu.com)《ggplot2作图：隐去坐标轴标签（xlab、ylab）》ggplot2作图：隐去坐标轴标签（xlab、ylab...比如CCR7这个基因，在差异分析中呈现不明显的下调，但在作者的图像中呈现明显的上调..

47720

ggplot2-图形微调（1）

绘图过程中，通过给图形中添加适量的注释（图形、公式、注释）以及图形整体的外观，可以使读图者更快速、更准确的了解图形表达的含义。...ggplot2包中的annotate()函数帮助用户给图形的指定位置添加注释，一般注释可以从点、线和面的角度进行修饰，对应的geom参数是text、segment、pointrange、rect。...基本图形示例： library(ggplot2) x<-c(2015,2016,2017,2018,2019,2020) y<-c(12,13,14,25,36,57) test<-data.frame...annotate('text', x = 2019, y = 20, label = '输入信息1', colour = 'red')+ #参考线 geom_abline()、geom_vline() geom_hline...scale_x_continuous(limits = c(2014,2022)) ;p3 ## 一般使用倍数来限定大小，最小值有个0 p3 <- p1 + xlim(min(test 坐标轴刻度、标签

1.5K30

ggplot2玫瑰图案例——星巴克门店分布图

使用ggplot2制作放射状玫瑰图本不是什么难事，仅需将普通单序列柱形图添加添加一个极坐标转化参数即可。 但是遇到比较小清新的案例，还是值得手动操作一下的。...原图中并未给出任何实际数据（所以需要用眼睛估测了~—~） library("rvest") library("dplyr") library("ggplot2") library("grid") library...mydata,-value)%>%transform(id=1:20,class=c(1,6,rep(1:6,3))) mydata$label<-as.character(mydata$label) #标签拆成单字换行...n") } mydata[1:2,"label_ff"]<-c("上海","北京") mydata[16:20,"label_ff"]<-c("青岛","厦门","常州","福州","南通") #计算标签的旋转角度...20]<-rev(9*(1:5-1)+4.5) 图形可视化过程： p<-ggplot(mydata)+ geom_col(aes(x=id,y=value,fill=factor(class)))+ geom_hline

1.3K70

一小时掌握R语言数据可视化

，那么首先我们得有一张画布（如果没有安装R语言和ggplot2请见《 十八-R语言特征工程实战 》） [root@centos $] R> library(ggplot2) > ggplot() 使用geom_abline...、geom_hline、geom_vline画直线 下面我们来在这张画布上画一条横线： > ggplot() + geom_hline(yintercept = 5) 我们也可以画一条竖线 > ggplot...，可以这样：这里面对同一个x，不同y出现总数不一样，累加起来就像下图展示，其中如果y是数字，那么想把他当成类别，需要转成factor > x <- rep(c(1,2), c(2,3)) > y <-...aes(x)) + geom_density(adjust = 1/5) 如果我们想按照不同的y值来分开画密度图，并且用不同颜色来表示不同的y值，那么我们可以用描边的方式(左)，也可以用填充的方式(中)...(y))) + geom_density(adjust = 1/5, position='stack') 用geom_text和geom_label写标注文本 为了让图像更清晰，我们需要把关键数据打上标签展示出来

1.2K120

ggplot2画散点图拼接密度图

image.png 前几天有一个读者在公众号留言问上面这幅图应该如何实现，我想到一个办法是利用ggplot2分别画散点图和密度图，然后利用aplot包来拼图，aplot包是ggtree的作者新开发的一个包...这个aplot包的用法大家可以在微信搜索里直接搜aplot就可以直接找到原作者写的推文的介绍，而且这个公众号经常推送R语言的学习内容，非常好，作者是真正的大神级别的人物了。...image.png 按照Y轴的范围填充三个颜色，比如大于3填充一个，小于-3填充另外一种，-3到3中间的填充另外一种 给数据添加一列新的用来映射颜色 df$color3,"A...image.png 接下来是添加辅助线 ggplot(df,aes(x,y))+ geom_point(aes(color=color))+ scale_color_manual(values=...c("green","blue","grey"))+ theme_bw()+ geom_hline(yintercept = -3,lty="dashed")+ geom_hline(yintercept

79920

DT君的星巴克门店分布玫瑰图，被数据侠“破解”了！

出炉后，EasyCharts团队的杜雨用ggplot2，对其中一张清新可人的星巴克门店分布玫瑰图进行了操作“重现”。...本文转自公众号数据小魔方（ID：datamofang） 作者 | 杜雨 使用ggplot2制作放射状玫瑰图本不是什么难事，仅需将普通单序列柱形图添加添加一个极坐标转化参数即可。...mydata,-value)%>%transform(id=1:20,class=c(1,6,rep(1:6,3))) mydata$label<-as.character(mydata$label) #标签拆成单字换行...n") } mydata[1:2,"label_ff"]<-c("上海","北京") mydata[16:20,"label_ff"]<-c("青岛","厦门","常州","福州","南通") #计算标签的旋转角度...20]<-rev(9*(1:5-1)+4.5) 图形可视化过程： p<-ggplot(mydata)+ geom_col(aes(x=id,y=value,fill=factor(class)))+ geom_hline

62400

跟着Global Change Biology学作图：R语言ggplot2点线图（1）

plant inputs alter soil carbon and microbial communities in forest.pdf 今天的推文重复一下论文中的Figure3，这个是之前有读者在公众号后台的留言...有读者留言可以用分面然后调节主题里的参数panel.spacing = unit(0,'lines')，有了基本思路就可以尝试一下这个图 image.png 今天推文的主要内容是实现这个图的主题部分，四周的一些注释，分面图在指定的子图添加文本等等...再单独的一篇推文来介绍 添加注释会用到一个自定义函数 annotation_custom2 <- function (grob, xmin...layer(data = data, stat = StatIdentity, position = PositionIdentity, geom = ggplot2...是我自己随便构造的 读取数据集 library(readxl) dat<-read_excel("data/20220804/example_df.xlsx") dat 最基本的点和误差线 library(ggplot2

47611
点击加载更多

扫码

添加站长 进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

更多标签

活动推荐

    运营活动

    活动名称
    广告关闭

    腾讯云开发者

    扫码关注腾讯云开发者

    扫码关注腾讯云开发者

    领取腾讯云代金券

    热门产品

    热门推荐

    更多推荐

    Copyright © 2013 - 2024 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有

    深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 深公网安备号 44030502008569

    腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号 | 京公网安备号11010802020287

    领券