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color pathway 使用指南 : 通路图中标记基因

对于通路分析结果的可视化而言,最常用的展现方式就是通路中高亮显示富集到的基因。kegg 提供了Color Pathway 在线服务,可以方便的完成这一任务。...这个工具使用比较简单,分为4步: Select KEGG pathway map 输入框中输入想要标记的pathway ID ; Enter data中输入需要标记的基因和对应的信息,或者通过选择文件按钮...,上传对应的文件; Option中选择和上一步输入的文件格式相匹配的操作; 点击Exec按钮,提交任务; 从上面的截图可以看出,这个工具提供了3种标记方式 ,下面我们以hsa05200这条通路为例,看下实际用法...用基因表达量标记基因 当使用基因表达量时,需要指定一个颜色范围,将数值映射到该颜色范围中去,适合展示表达量上的渐变关系。...总结 通过color pathway, 我们可以有多种方式通路图中标记我们的基因,可以直接指定颜色,也可以将表达量等数值信息映射到图中。 对于每种输入格式,必须要有#开头的注释行。

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(数据科学学习手札57)用ggplotly()美化ggplot2图像

R包中有着函数ggplotly(),可以将ggplot2生成的图像转换为交互式的plotly图像,且还可以添加上ggplot2原生图像中无法实现的交互标签,最重要的是其使用方法非常傻瓜式,本文就将结合几个小例子来介绍...ggplotly()的神奇作用; 二、ggplotly()的使用   我们从一个简单的小例子出发: library(tidyverse) library(plotly) p <- ggplot(iris...可以观察到,经过ggplotly()处理后的ggplot2图像通过R-studio中的viewer窗口打开,即当前的图像是网页文件,而随着我们鼠标的放置,可以保留原有ggplot2外观的情况下,进行plotly...式的交互操作,注意上图中我们鼠标放置点位对应显示的悬浮标签,其中的内容是默认的格式,即在这张ggplot2图像中所涉及到的所有信息,在上图中即为横纵轴对应的数据,以及定义形状和颜色时使用到的分类属性信息...在上图中我们微调了图例的位置,但是对上图使用ggplotly()后效果如下: ?   可以看到图例并没有得到改变,因此实际应用中使用ggplotly()还需慎重考虑。

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R语言新神器visdat包(一行代码看穿整个数据集)

这是一个非常简单,功能却非常强大的包 介绍 (1)visdat的目的是 vis_dat通过将数据框中的变量类显示为绘图,并使用vis_miss简要查看缺失的数据,帮助数据框的可视化。...(2)visdat有6个功能函数: vis_dat()可视化一个数据框,显示列的类别,并显示缺少的数据。 vis_miss()只显示缺失的数据,并允许对缺失进行聚类并重新排列。...vis_compare()可视化相同维度的两个数据帧之间的差异 vis_expect()可视化数据中满足某些条件成立的数据 vis_cor()一个漂亮的热图中可视化变量的相关性 vis_guess...(7)绘制交互性图片 您可以通过将它们包装在plotly :: ggplotly中来制作visdat中的图: library(plotly) ggplotly(vis_dat(airquality))...ggplotly(vis_miss(airquality)) ggplotly(vis_guess(airquality))

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Android使用Notification状态栏上显示通知

使用手机时,当有未接来电或者是新短消息时,手机会给出相应的提示信息,这些提示信息通常会显示到手机屏幕的状态栏上。...使用Notification和NotificationManager类发送和显示通知也比较简单,大致可分为以下4个步骤。...Notification状态栏上显示通知: res/layout/main.xml: <?...PendingIntent pendingIntent=PendingIntent.getActivity(MainActivity.this, 0, intent, 0); //设置通知的内容 (上下文对象,标题...”按钮,屏幕的左上角将显示第一个通知,如图-4.2.2.a.jpg所示,过一段时间后,该通知消失,并显示第二个通知,再过一段时间后,第二个通知消失,这时状态栏上将显示这两个通知的图标,如图-4.2.2

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vue中使用Axios技术实现服务器数据显示

引言 本次将在vue中使用axios的get方法实现API数据的显示。...一、问题 一个实践项目中,要创建一个网站就需要引入服务器数据,本次将一步步的实现vue中使用get请求来显示服务器的数据显示。...2.第二步,拿到Api中的数据,App.vue中引入Axios依赖,再写入methods,并创建一个方法,如图所示,为其更为直观,需要看到服务器返回的数据,判断数组中所要的目标字符串,为api中所需要在页面上显示数据相对应的字符串的时候...3.第三步,默认接口export default部分添加data,并在其中添加一个容器,本项目设置容器名为counter,并在该容器中设置各个属性及初始值(对于字符串对象,可以使用一个空的字符串代替)...,本项目设置counter的属性为total和catagroyName,并设置属性值为0 4.第四步,双标签中设置个标签,并使用mastache语法进行展示

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MarkDown使用说明

# 五级标题 ###### 六级标题 效果: 一级标题 二级标题 三级标题 四级标题 五级标题 六级标题 二、字体 通过*、_和~符号来对文本经行字体设置 语法: 斜体:通过左右各一个*或者_包裹文本来实现...这是第一种方法换行 四、分割线 语法: 一行中使用三个以上*、-或_来创建分割线,其中一行内不允许有其他内容,可以符号中间加入空格 示例: *** * * * --- ___ 效果: ***...* * * 五、下划线 语法: 原生MarkDown是没有下划线的,可以借助html标签来实现 示例: 下划线 效果: 下划线 六、引用 语法: MarkDown中可以使用...[图片alt](图片地址 ''图片title'')图片alt就是显示图片下面的文字,相当于对图片内容的解释。 图片title是图片的标题,当鼠标移到图片上时显示的内容。...; } main(); Tips:由于编辑器问题,部分效果可能会无法正常显示

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MarkDown基础使用教程及使用jupyter notebook做笔记

notebook做笔记 标题 一级标题使用1个# 二级标题使用2个# 三级标题使用3个# 四级标题使4用个# 五级标题使用5个# 六级标题使用6个# 文字 删除线 斜体 加粗 斜体+加粗 下划线 高亮...# 标题名字(井号的个数代表标题的级数) 一级标题使用1个# 二级标题使用2个# 三级标题使用3个# 四级标题使4用个# 五级标题使用5个# 六级标题使用6个# ####### 最多支持六级标题# 文字...删除线 这就是 ~~删除线~~ (使用波浪号) 这就是 删除线 (使用波浪号) 斜体 这是用来 *斜体* 的 _文本_ 这是用来 斜体 的 文本 加粗 这是用来 **加粗** 的 __文本__ 这是用来...command+opt+T更方便(段落→表格→插入表格,即可查看快捷键) 引用 >“后悔创业” “后悔创业” >也可以引用中 >>使用嵌套的引用 也可以引用中 使用嵌套的引用 列表...(` 是 `Tab` 键上边、数字 `1` 键左侧的那个按键): 例如 `Markdown` Markdown 转换规则 代码块中的文本(包括 Markdown 语法)都会显示为原始内容 分隔线 可以一行中使用三个或更多的

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makedown语法常见用法

makedown语法 标题用法 段落换行 加粗和斜体 分割线 删除线 下划线 脚注 无序列表 有序列表 列表嵌套 区块引用 区块引用和列表嵌套 区块代码 链接用[标题](地址) 图片用法 表格制作 标题用法...或者有一行空行也可以另起一行,但是这样会有一个空行 123 加粗和斜体,一个*或者下划线代表斜体,两个*或下划线代表加粗,三个就代表斜体加粗 *斜体* _斜体_ **加粗** __加粗__...-- + 无序标题1 + 无序标题2 + 无序标题3 有序列表,在数字后面加一个点,加一个空格 1....,文章后面标记地址,用法,用两个中括号一个是显示标题,一个是定义变量,后面用该变量定义地址,定义的变量和调用的变量不能挨在一起 [百度一下](http://www.baidu.com) <http:...[显示名字](地址),或者还![显示名字](地址 标题),还可以定义变量调用 !

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MarkDown语法

Markdown 所用的文档的后缀名为 .md 比如此时,此篇文章就是使用markdown语法编写完成 看下语法: 1:标题 输入: # 一级标题 ## 二级标题 ### 三级标题 #### 四级标题...##### 五级标题 ###### 六级标题 显示: 一级标题 二级标题 三级标题 四级标题 五级标题 六级标题 2:强调 输入:*这是斜体文本* 显示:这是斜体文本 输入:**这是粗体文本**...显示:这是粗体文本 输入:***粗斜体文本*** 显示:粗斜体文本 输入:~~横线删除~~ 显示:横线删除 3:列表 输入: - Item 1 - Item 2 - Item 2a - Item...[name](图像存放地址) 显示: ?...--- *** 显示: ---- ---- 7:代码块 输入: 代码上下加入```符号 显示: print('hellow world') 高亮代码: 输入: ‘’‘python print(

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Markdown 语法

1 标题 Markdown支持6种级别的标题,对应html标签 h1 ~ h6 # h1 //一级标题 对应 ## h2 //二级标题 对应 ###...Markdown加入分隔线非常简单,使用下面任意一种形式都可以 *** --- 以上标记显示效果如下: 图片 6 内容强调 6.1 斜体和加粗 有时候,我们对某一部分文字进行强调,使用 * 或 _...使用单一符号标记的效果是斜体使用两个符号标记的效果是加粗 *这里是斜体* _这里是斜体_ **这里是加粗** __这里是加粗__ ***这里是加粗并斜体*** ___这里是加粗并斜体___ 以上标记显示效果如下...: 这里是斜体 这里是斜体 这里是加粗 这里是加粗 这里是加粗并斜体 这里是加粗并斜体 6.2 加下划线 下划线 效果如下: 下划线 也可以使用 标签完成加下划线的操作...10 修改图片 10.1 设置图片尺寸 markdown 直接使用提供的语法引入图片是无法设置大小的,所以我们需要用到 html 的 img 标签。

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常用的Markdown格式的语法规则

实际应用中,根据文档结构的需要,不一定需要使用所有六级标题,但了解它们的存在有助于更好地组织文档。...关于 # 的使用,需要注意的是,每个 # 后面应该至少跟一个空格,否则 Markdown 解析器可能无法正确识别标题。...___斜体加粗___斜体加粗斜体加粗Markdown 应用程序处理单词或短语中间添加的下划线上并不一致。...为了实现兼容性,通常建议使用星号将单词或短语的中间部分加粗并以斜体显示,以示重要。...图片能显示时,通常位于图片下面居中位置图片链接 也可以说是 图片路径 通常可以是相对路径或者绝对URL。本地文件系统中使用相对路径时,路径应相对于Markdown文件的位置。

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