在matlab中查看HDF5
在MATLAB中查看HDF5文件，可以使用MATLAB的HDF5工具箱。HDF5是一种常用的数据存储格式，它可以存储大量的数据，并且可以在不同的应用程序之间共享。
在MATLAB中，可以使用以下命令来查看HDF5文件：
- 使用
h5disp命令可以显示HDF5文件的内容，包括文件名、数据集名、数据类型、数据空间等信息。例如，如果要查看名为example.h5的HDF5文件，可以使用以下命令：
h5disp('example.h5')- 使用
h5ls命令可以列出HDF5文件中的所有数据集和组。例如，如果要列出名为example.h5的HDF5文件中的所有数据集和组，可以使用以下命令：
h5ls('example.h5')- 使用
h5read命令可以读取HDF5文件中的数据集。例如，如果要读取名为example.h5的HDF5文件中的名为data的数据集，可以使用以下命令：
data = h5read('example.h5','data')- 使用
h5info命令可以获取HDF5文件的元数据，包括文件名、文件大小、文件创建时间、文件访问时间等信息。例如，如果要获取名为example.h5的HDF5文件的元数据，可以使用以下命令：
h5info('example.h5')需要注意的是，在使用HDF5工具箱之前，需要先安装MATLAB的HDF5工具箱。如果没有安装，可以在MATLAB中使用以下命令来安装：
web(fullfile(prefdir,'mcr','hdf5_toolbox_setup.m'))安装完成后，就可以使用上述命令来查看HDF5文件了。
相关·内容
1回答
我通过apt-get在Ubuntu上安装了libhdf5，但是没有目录。
数独找到-type d -name 'hdf5‘
./share/doc/hdf5 5-工具
./share/doc/libhdf5-mpich2-dev
./share/doc/libjhdf5-java
./share/doc/hdf5 5-帮手
./share/doc/libjhdf5-jni
./share/doc/libhdf5-mpich2-7
./local/MATLAB/R2016b/toolbox/matlab/imagesci/@hdf5
./local/MATLAB/R2016b/tool
浏览 16提问于2017-01-06得票数 0
回答已采纳
1回答
不幸的是，我无法检查这一点，因为我没有IDL或Matlab许可证，这就是我在这里问的原因。
场景是，我用熊猫保存HDF5文件，其中一个列是对象。IDL和Matlab有很好的HDF5读取库(至少我听说过)，但是IDL/Matlab用户能够对HDF5文件中的datetime对象做任何有用的事情吗？
浏览 2提问于2014-03-05得票数 2
回答已采纳
我正在尝试使用h5py库在python中读取hdf5格式的MATLAB文件。这个文件叫做"Q_visSDF_accurate.mat“，有两个键："filename”和"sdf“。"filename包含一个单元格数组字符串。" sdf“是一个包含浮点数的6001,49380矩阵。我使用以下代码提取变量sdf没有问题：
import h5py
data = h5py.File("Q_visSDF_accurate.mat", 'r')
sdf = data.get("sdf")[:,:]
sdf = sdf.
浏览 0提问于2016-12-08得票数 1
我有一个hdf5数据库，但几乎没有这种数据库的经验。我需要在Matlab中打开/加载它。然而，Matlab函数h5read需要两个参数
data = h5read(filename,dataset)
我知道我的文件名(很明显:)，但是我不知道数据集的名称(因为我不能查看hdf5数据库)。
有人知道如何在hdf5数据库中查找数据集名称吗？
浏览 3提问于2015-06-09得票数 0
回答已采纳
我在Matlab中将一个单元格数组保存为一个.mat文件，如下所示：
test = {'hello'; 'world!'};
save('data.mat', 'test', '-v7.3')
我如何用H5py导入它作为Python中的字符串列表？
我试过了
f = h5py.File('data.mat', 'r')
print f.get('test')
print f.get('test')[0]
这张打印出来：
<HDF5 dataset
浏览 3提问于2015-02-01得票数 7
回答已采纳
在Caffe中有一个HDF5 [600000,1,7,256].The函数'compute_image_mean.cpp‘的数据块不适合hdf5。那么，如何利用matlab中的Caffe进行均值减法呢？
浏览 2提问于2016-04-08得票数 3
回答已采纳
3回答
HDF5 :存储NumPy数据
、、、、
当我使用NumPy时，我以本机格式*.npy存储它的数据。它非常快，给了我一些好处，就像这个
I可以将*.npy从C代码中读取为简单的二进制数据(我的意思是*.npy与C结构兼容)
现在我正在与HDF5 (目前的PyTables)打交道。当我在本教程中阅读时，他们使用NumPy序列化程序来存储NumPy数据，这样我就可以像从简单的*.npy文件一样从C中读取这些数据了吗？
HDF5 5的numpy与C结构也是二元兼容的吗？
UPD：
我有matlab客户端从hdf5读取数据，但不想从C++读取hdf5，因为从*.npy读取二进制数据要快得多，所以我确实需要从C++读取hdf5 (二进制兼容性)
浏览 9提问于2010-11-09得票数 2
回答已采纳
我得到了1,000+非常长的matlab向量(不同的长度~ 10^8样本)，表示来自不同患者和不同来源的数据。我希望将它们紧密地组织在一个文件中，以便在python中进行稍后的方便访问。我希望每个样本以某种方式保存更多的信息(病人身份，抽样频率等)。
命令应是：
Hospital 1:
Pat. 1:
vector:sample 1
vector:sample 2
Pat. 2:
vector:sample 1
vector:sample 2
Hospital 2:
Pat. 1:
vector:sample
浏览 4提问于2020-01-01得票数 1
回答已采纳
我正在尝试使用.mat在python文件中读取v7.3 matlab h5py。
我遇到了一个问题，即字符数组(例如，通常包含单个字符串的.mat字段)和uint16数组的表示形式是相同的。
>> ushortarr = uint16([63 109 105 102])
>> strarr = 'gibl'
>> save('short_string_difference.mat', 'ushortarr', 'strarr', '-v7.3')
当加载回matlab中时，mat
浏览 0提问于2016-03-17得票数 2
回答已采纳
2回答
我有一些Python和Matlab之间共享的数据。我以前是通过将NumPy数组保存在MATLAB样式的.mat文件中来实现的，但是我希望切换到HDF5数据集。但是，我注意到了一个有趣的特性:当我将一个NumPy数组保存在一个HDF5文件中(使用)，然后在Matlab中读取它(使用)时，它最终会被转置。我遗漏了什么吗？
Python代码：
import numpy as np
import h5py
mystuff = np.random.rand(10,30)
f = h5py.File('/home/user/test.h5', 'w')
f['m
浏览 2提问于2014-02-07得票数 10
回答已采纳
1回答
MATLAB在打开和查看HDF5文件方面到底有多好？我可以看到有几个h5...命令，但我想知道是否有一种方法可以像.mat文件或HDFView工具那样交互式地“查看”文件？
浏览 3提问于2012-08-03得票数 1
回答已采纳
MyApp是一个C# .NET v4.5.2WPF应用程序。MyAssembly是我创建的包含MyClass的Matlab .NET程序集。MyAssembly需要MCR v9.1。MyApp执行各种任务；当需要Matlab并试图实例化MyClass时，会显示一个弹出窗口：
过程入口点H5Rdereference不能位于动态链接库C:\Program \MATLAB\MATLAB Runtime\v91\bin\win64\libmat.dll中。
MyApp包含一个版本的hdf5.dll (从Nuget包HDF.PInvoke v1.10.1获得)，我发现MCR9.1还包含C:\Progr
浏览 3提问于2020-03-10得票数 0
回答已采纳
1回答
我有一个可以用Matlab、IDL和python读取的.h5 file。然而，Matlab和python都加载了这个文件，但是Dataset获得了一个Datatype H5T_STD_U16LE (uint16)。基本上，我的浮点值在读取过程中被转换为整数，使得像0.1这样的值变成了0。
使用IDL读取时，不知何故忽略了HDF5文件中的内部标志，并给出了正确的值。
在Matlab或python中有没有办法以双精度强制读取HDF5文件数据集？
在Matlab中，我这样做：
hinfo = hdf5info('./data.h5');
dset = hdf5read(hinfo.G
浏览 1提问于2019-05-03得票数 0
想知道如何将HDF5数据集值解释为标准和/或原始C++数据类型？
我有一个.mat文件，它包含一些用户设置信息。我不熟悉Matlab (.mat文件)或HDF5。其中一些数据将是双倍、布尔值、字符串或int类型，在Matlab中查看打开的文件。
我想出了如何使用HDF5读取文件并打开DataSet。我还知道了如何迭代DataSet中的所有对象。但我只需要知道每种类型是什么，这样我就可以执行适当的读取调用。
下面是我到目前为止工作的代码。
H5::DataSet data_set;
try
{
data_set = file->openDataSet(
浏览 11提问于2022-10-11得票数 0
回答已采纳
我在MATLAB中用'-v7.3‘标志创建了下面的.mat文件。我需要这个标志，因为数据量很大。我在MATLAB中使用了以下命令来保存此文件。 save('sample10_properties.mat', 'stats','-v7.3') 以下是数据的链接 https://drive.google.com/file/d/195fj6Tl1n_drS8R_A6bdbOEc3rGkiMqS/view?usp=sharing 我可以在python中看到stats变量，但我不知道如何访问。任何帮助都将不胜感激。 import numpy
浏览 25提问于2019-05-07得票数 1
我正在尝试编写一个HDF5文件，它将保存在MATLAB中创建的一组结构，然后在C++中读取这些结构。这些结构包含不一定是数字的数据，例如字符串、单元格数组和子结构，因此使用hdf5write是out。
但是，使用参数save调用'-v7.3'保存到HDF5，那么在C++/C中读取这些文件并提取数据是可能的吗？这是个好主意吗？
为每个结构创建一个自定义数据类型并编写一个自定义HDF5编写器是一个更好的主意吗？
浏览 2提问于2015-08-20得票数 1
回答已采纳
2回答
取消引用hdf5格式？
、、、
我正在使用两种不同的语言，即Matlab和python。我在Matlab中创建了5个变量。每个变量都有一个大小- (150x1)单元格，如下所示：
每个单元格的大小为(128 x (:))，如下所示：
我使用.mat格式-v7.3将这个工作区保存到一个hdf5文件中。
在python中，我使用.mat加载了h5py文件。我能够加载变量，但无法从每个变量中提取值。
我得到了这个语句"array([[]，dtype=object)“，但是这些值没有加载到python工作区中。我想把所有150个单元格o加载到一个变量中，例如A。我如何去引用hdf5引用？
浏览 1提问于2016-06-07得票数 1
回答已采纳
我有多个3D矩阵需要存储在hdf5文件中。我已经到处找过了，但我对在hdf5文件中存储数据的过程感到困惑。我可以在hdf5文件中的单个数据集中存储多个3D矩阵吗?还是必须为每个3D矩阵创建单独的数据集？我需要这个数据集来训练一个3D CNN模型。如果两种方法都有可能，哪种方法最适合培训目的？
附加信息:矩阵大小为12x24x12，单个数据占用不到100kb的存储空间。数据集是在matlab中创建的，生成的文件将在python中使用(模型将在python中训练)。
浏览 17提问于2020-02-04得票数 0
我已经找到了从Spark读取HDF5文件的工具，但不是用来写它们的。有可能吗？
我们有一个大小为10-40TB的数据集。我们目前将其写出为大约20,000个Python pickle文件。这并不是很容易移植。此外，HDF5还提供了压缩功能。
我们可以编写拼图文件，一种方法是写出拼图文件，然后将它们转换为HDF5。但是，这种方法是不需要的，因为没有一个转换工具是多线程的。
我们希望使用HDF5，因为它在科学界得到了广泛的接受。它在Matlab和Stata等程序中的支持似乎明显好于parquet。
浏览 14提问于2021-03-11得票数 1
回答已采纳
1回答
我有一套垫子文件，其中包含一个matlab struct.这个结构有很多数组。我想打开文件并将它们全部转换为数组。到目前为止，我已经编写了以下代码：
import h5py
>>> fs = h5py.File('statistics_VAD.mat','r')
>>> list(fs.keys())
['#refs#', 'data']
>>>
>>> fs['data'].visititems(lambda n,o:print(n, o)
浏览 3提问于2021-02-28得票数 0
我有大量的matlab文件数据文件，我需要在Python中访问它们。使用save和-v6或-v7选项保存文件，但不使用-v7.3。
我必须从每个文件中只读取一个数字值，文件多(100k+)和相对较大(1MB+)。因此，我把99%的时间花在无用的I/O操作上。
我正在寻找类似于部分加载的东西，这对于使用-v7.3库的HDF5文件来说是可行的。
到目前为止，我已经使用了scipy.io.loadmat API。
文件上说：
v4 (Level 1.0), v6 and v7 to 7.2 matfiles are supported.
You will need an HDF5 python li
浏览 1提问于2017-11-28得票数 2
回答已采纳
我有一个.h5文件，可以以pandas.read_pickle('X.h5'，'r')的形式在python中读取。现在我想在MATLAB-2014 a中加载这个，我不知道数据集的名称。我试着获取信息，但发现了错误
info=h5info('X.h5');
Error using h5infoc
The HDF5 library encountered an error and produced the following stack trace
information:
H5F_locate_signature unable to f
浏览 4提问于2017-07-19得票数 0
我试图使用hdf5storage将numpy数据写入.mat文件。
import hdf5storage
# For example
numpy_array = [array([(b'<detect>', 192, 1)], dtype=[('packet_sync', 'S8'), ('n_bytes', '<u4'), ('n_detect', '<u4')]), array([(b'<detect>', 192, 2)],
浏览 21提问于2022-02-23得票数 2
1回答
我最近升级了python安装上的表，一些奇怪的事情似乎发生在HDF5库中。
我得到了一堆数据，这些数据最初被保存为一个.mat文件，它使用HDF5格式。我一直在使用pyTables将其读到python中，到目前为止，它一直运行得很好。
我将pyTables升级到3.0版，这似乎也升级了我的HDF5安装(或者类似的东西)。现在，每当我试图将.mat文件读入内存时，都会得到以下错误：
Warning! ***HDF5 library version mismatched error***
The HDF5 header files used to compile this application
浏览 3提问于2013-11-16得票数 0
我正在尝试在MATLAB中找到类似于PyTables的，它根据条件(例如col1 = 4)选择数据集的一个子集。到目前为止，我的搜寻完全没有结果。我不敢相信这样一个有用的特性不会以某种方式得到支持……有人能帮上忙吗？
MATLAB vs. R2011b.
编辑:如果问题不清楚，我在MATLAB中使用HDF5文件进行数据存储，因此我希望找到类似于PyTables的功能。
浏览 0提问于2012-06-16得票数 0
回答已采纳
我在用Python语言读取hdf5 Matlab7.3文件时遇到了问题。我使用的是h5py 2.0.1。
我可以读取文件中存储的所有矩阵，但不能读取字符串列表。h5py将字符串显示为形状为(1,894)、类型为|04的数据集。此数据集包含对象引用，我尝试使用h5file[obj_ref]语法取消对它们的引用。
这会产生类似于dataset "FFb": shape (4, 1) type "<u2"的东西。我将其解释为长度为4的字符数组。它似乎是字符串的ASCII表示。
有没有一种简单的方法可以把字符串弄出来？
有没有提供matlab to python
浏览 1提问于2012-08-20得票数 8
回答已采纳
我正试图将一个大的400x300x60x28数据集从Matlab (.mat文件)作为一个HDF文件加载到Python中，但是每次我试图查看文件中的内容时，它都说它是空的。
到目前为止，我尝试过的一些事情：
输入：
f=h5py.File(r'D:\Natalie\Research\Vascular Hand\output.mat','r')
print(f)
输出：
<HDF5 file "output.mat" (mode r+)>
输入：
store=pd.HDFStore(r'D:\Na
浏览 0提问于2017-07-14得票数 3
1回答
我正在尝试构建FLAN库，以便在之后构建PCL库。
在使用CMake编译源代码时，我得到了一个错误。我想我遗漏了一些非常基本的东西。由于我找不到适用于我的系统的编译库，所以我必须自己构建它。
使用命令
~/flann-1.8.4-src/build> cmake ..
我得到了
CMake Error at src/cpp/CMakeLists.txt:86 (add_library):
No SOURCES given to target: flann
CMake Error at src/cpp/CMakeLists.txt:32 (add_library):
No SOURCES
浏览 20提问于2018-06-08得票数 0
1回答
我使用MATLAB R2012a来读取一个hdf5数据文件，使用h5disp函数。如何将输出分配给变量或将其写入磁盘？有办法在MATLAB中重定向输出吗？我的目标是读取许多文件，并以相当于或类似于h5disp的格式将其内容的摘要输出到磁盘。
喜欢
h = output(h5disp(myhdf5file))
或者到磁盘上
h5disp(myhdf5file) > outputfile.txt
浏览 3提问于2017-09-30得票数 0
回答已采纳
2回答
我试图将一些字符串表保存到Torch中的文件中。我试过使用Deepmind：的火炬扩展。
require 'hdf5'
label = {'a', 'b','c','d'}
local myFile = hdf5.open(features_repo .. 't.h5', 'w')
myFile:write('label', label)
myFile:close()
我发现了一个错误：
/home/user/torch/install/bin/luajit: ..
浏览 1提问于2016-04-24得票数 9
回答已采纳
我已经使用下面的代码使用H5PY在python中打开了一些在MATLAB中生成的HDF5文件：
import h5py as h5
data='dataset.mat'
f=h5.File(data, 'r')
然而，我得到了以下错误：
OSError: Unable to open file (File signature not found)
我已经检查了我试图打开的文件是7.3版本的MAT文件，并且是HDF5格式。事实上，我以前已经使用H5PY成功地打开了相同的文件。我已经确认文件存在并且可以访问，所以我不确定错误是从哪里来的。任何建议都将非常感谢，提前感
浏览 1提问于2016-06-29得票数 33
1回答
我有一个与这里的问题类似的独特问题：
我有一个高速流量分析框，它以大约5 Gbps的速度捕获，并从中选择特定的数据包以保存为C++程序中的某种格式。每天可能会有1-3 TB写入磁盘。因为它是网络数据，所以所有的时间序列都下降到纳秒级，但是将其保存在秒或毫秒级别，然后让另一个应用程序对嵌入的高分辨率时间戳进行排序是很好的。我的问题是决定使用哪种格式。我的两项要求是：
能够以50 MB/s的速度连续写入磁盘，并有几个不同的时间戳参数。
能够将这些数据块导出到MATLAB (HDF5)中。
为分析目的，每天查询一次或两次此数据。
另一件并不难的好事情是：
这些框中将有4个独
浏览 1提问于2015-02-21得票数 0
1回答
我在Python中有一个大型稀疏矩阵(大约50亿个非零值)，存储在格式中。我需要在Matlab中以稀疏矩阵的形式打开它。显然无法保存如此大小的数据(似乎上限为5GB)，因此我求助于将其保存为hdf5文件，作为详细的。但是，我在matlab中打开它是有困难的。
给出这三个向量：data, indices, indptr，其含义为
标准的CSC表示，其中第一列的行索引存储在索引[indptri:indptri+1]中，其相应值存储在数据[indptri:indptri+1]中。
如何在Matlab中构造这个矩阵？我可以在Matlab中使用h5read打开这三个向量，但我不知道如何使用它们来
浏览 6提问于2017-03-25得票数 0
1回答
有一个Matlab函数(h5write)，允许用户以hdf5格式写入输出文件。当使用Matlab环境和Matlab文件时，这看起来很好。但是，当我试图从Matlab文件中生成C++代码时，就会出现一个转换错误。代码生成器(Matlab )似乎无法将h5write操作转换为C++代码。
有什么办法解决这个问题吗？效率在这里也很重要，因为需要由生成的C++可执行文件存储的数据集相当大。如果有人能在这里帮助我，这将使我的日子过得很愉快！
浏览 1提问于2013-07-31得票数 1
回答已采纳
1回答
我已经在Pytorch中创建了一个模型，并希望将其传输到MATLAB，下面显示了一个最小的示例
import torch.nn as nn
import torch
class cnn(nn.Module):
def __init__(self):
super(cnn, self).__init__()
self.fc1 = nn.Sequential(
nn.Linear(10, 1),
nn.ReLU(True)
)
def forward(self, x):
浏览 1提问于2018-06-26得票数 3
2回答
我有一个来自NASTRAN的HDF5输出文件，其中包含模式形状数据。我试图将它们读入Matlab和Python，以检查各种后处理技术。所讨论的文件位于这两个测试的本地目录中。该文件是半大的，1.2GB，但肯定没有那么大的HDF5文件，我以前读过。我想访问的表中有17567342行8列。第一列和最后一列是整数，中间6是浮点数。
Matlab：
file = 'HDF5.h5';
hinfo = hdf5info(file);
% ... Find the dataset I want to extract
t = hdf5read(file, '/NASTRAN/RESU
浏览 0提问于2019-01-22得票数 0
回答已采纳
1回答
我有一个相当大的HDF5数据集，其大小为1 12672 1 228020，格式为:高、宽、通道N。此文件在硬盘上约占22G。
我想把这个文件分成更小的部分，比如2G文件。
h5repart已经试用过了，但效果不好，因为我不能使用h5disp('...')在MATLAB中显示分区文件。
浏览 2提问于2015-10-06得票数 0
2回答
所以我一直在尝试将这个特定的.mat文件读入R中。我对matlab不太了解，但我知道R.matlab包只能将未压缩的数据读入R中，要将其保存为未压缩的数据，我需要使用save new.mat -v6将其保存在matlab中。
好的，我这样做了，但是当我在R中使用readMat("new.mat")时，它就永远地卡住了。我还尝试通过以下方式使用package hdf5：
> hdf5load("new.mat", load=FALSE)->g
Error in hdf5load("new.mat", load = FALSE) :
浏览 0提问于2011-10-31得票数 5
回答已采纳
我知道以前有人问过这个问题，但在我看来，仍然没有答案来解释发生了什么，也没有发生在我的案件中。我有一个matlab v7.3文件，结构如下，
---> rank <1x454 cell> ---> each element is <53x50 double>
f.mat
---> compare <1x454 cell> ---> each element is <53x50 double>
我希望这足够直截了当。因此，我要做的是使用h5py库将所有维度为53x54的
浏览 3提问于2014-12-27得票数 2
回答已采纳
我想在一些C++，matlab和python代码中使用hdf5文件。我的h5文件在C++和matlab中工作得很好，但不能用h5py读取。
h5py是否不能很好地支持像H5T_STD_B64LE这样的数据类型？谢谢!
In [2]: f = h5py.File('art.mips.log.h5', 'r')
In [3]: f.keys()
Out[3]: [u'mem']
In [4]: f['mem']
Out[4]: <repr(<h5py._hl.dataset.Dataset at 0x29f70d0&g
浏览 0提问于2015-07-09得票数 2
我一直在使用HDF5文件处理C和Matlab文件，它们都使用相同的方式读取和写入数据集：
用h5fopen数据集打开带有h5dselect空间和h5s的文件
等等..。
但是现在我正在使用Python，通过它的h5py库，我看到它有两种管理HDF5的方法:高级接口和低级接口。对于前者，从文件的单个变量获取信息所需的代码行较少。
在使用高级接口时，是否有明显的性能损失？
例如，在处理包含许多变量的文件时，我们必须只读取其中的一个变量。
浏览 2提问于2011-11-11得票数 7
回答已采纳
1回答
我正在尝试从名为的RGB数据集中提取图像(及其标签等)。(我下载了标签数据集)
这是一个matlab文件，所以我尝试使用hdf5来读取它，但我不知道如何从这里开始。如何将图像及其相应的标签和深度保存到不同的文件夹中？？
下面是我使用的脚本及其相应的输出。
import numpy as np
import h5py
f = h5py.File('nyu_depth_v2_labeled.mat','r')
k = list(f.keys())
print(k)
输出是
['#refs#', '#subsystem#',
浏览 1提问于2018-09-20得票数 0
回答已采纳
我有几个MATLAB变量的以下数据区，我保存在test.mat文件中使用-v7.3标志，并希望读回使用h5py模块的其他目的。
load('test.mat'); % give me this
struct with fields:
volume: [4240×1 double]
centroid: [4240×3 double]
faces: {4240×1 cell}
nuc: {4240×1 cell}
我可以读取双字段变量，但无法访问单元格字段变量。有什么方法可以从python访问nuc和faces变量吗？
浏览 0提问于2020-01-09得票数 0
1回答
我正在将二进制OpenCV Mat保存到HDF5文件中。
在OpenCV中，Mat文件以第一个索引通道存储在内存中，第二个索引为x坐标，第三个索引为y坐标，因此地址访问如下：
address = M.data + M.step[0]*y + M.step[1]*x + ch
其中M.step = NUM_X*NUM_CH和M.step1 = MAX_CH
我遇到的问题是，Matlab和Python错误地解释了数据。
虽然读取数据的尺寸是正确设置的(通道，x，y)，但当我查看数据存储时，例如numpy向后读取数据，意味着首先y增加，然后是x，最后是通道数，这意味着它假定通道数据的平面配置，而它实
浏览 1提问于2017-08-24得票数 0
回答已采纳
1回答
在python2.7中，我可以使用关键字分析hdf5文件
$ python
>>> import h5py
>>> f = h5py.File('example.h5', 'r')
>>> f.keys()
[u'some_key']
然而，在python3.4中，我得到了一些不同的东西：
$ python3 -q
>>> import h5py
>>> f = h5py.File('example.h5', 'r')
>
浏览 1提问于2015-06-25得票数 21
回答已采纳
我在Matlab中创建了一个矩阵大小为(1×19,000,000)的hdf5文件。文件的大小为150兆字节。
我的问题是如何找到完美的块体大小和透气率？在玩了一遍之后，我发现一块大小为1x1,000,000，并将放气设置为7的块可以实现100 to的文件。
我的第二个问题是我无法用Python导入这个文件。
Matlab
h5create('Xn.h5','/rawdata',size (data),'ChunkSize',[1 1000000],'Deflate',7 )
Python
import h5py
f
浏览 0提问于2019-02-11得票数 0
2回答
在hdf5中，我必须将所有巨大的数据放在一个单独的数据集中。现在，问题是，如果你尝试：
>> hdf5write('hd', '/dataset1', [1;2;3])
>> hdf5write('hd', '/dataset1', [4;5;6], 'WriteMode', 'append')
??? Error using ==> hdf5writec
writeH5Dset: Dataset names must be unique when appending
浏览 0提问于2013-03-11得票数 3
回答已采纳
我很难从MATLAB .mat文件中将'str‘变量'Et’(Endtime)和'St‘(Starttime)加载到Python中。 我想要与MATLAB中相同的输出。相反，我在尝试解决这个问题时遇到了问题。请参见下面的Python代码和输出。 # Import numpy and h5py to load in .mat files
import numpy as np
import h5py
# Load in Matlab ('-v7.3') data
fname = 'directory/file.mat'
f = h5py
浏览 112提问于2019-02-13得票数 1
回答已采纳
2回答
我正在使用Scipy堆栈进行数据分析，并且经常有具有复杂层次结构的数据，例如具有元素作为列表的字典，而且这些列表中还有多个字典.
因此，我需要将这些数据存储在一个文件中。我一直在使用scipy.io.savemat，但我读到HDF5更合适，更少特定于平台(savemat是用于Matlab的)。缺点是，使用h5py，而不是直接在工作区中保存变量，我必须手动复制复杂的结构(即，对于每个字典，我需要手动create_group相应)。
是否有一种标准的方法来做到这一点，比如我们如何在Matlab中保存".mat“文件？
谢谢!
-Shawn
浏览 0提问于2013-07-31得票数 2
回答已采纳
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
实时音视频
即时通信 IM活动推荐
腾讯云开发者
