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R线性回归分析

回归分析(regression analysis) 回归分析是研究自变量与因变量之间关系形式的分析方法,它主要是通过建立因变量Y与影响它的自变量Xi(i=1,2,3...)之间的回归模型,来预测因变量Y...简单线性回归模型 Y=a+b*X+e Y——因变量 X——自变量 a——常数项,是回归直线纵轴上的截距 b——回归系数,是回归直线的斜率 e——随机误差,即随机因素对因变量所产生的影响...回归分析函数 lm(formula) formula:回归表达式y~x+1 lm类型的回归结果,一般使用summary函数进行查看 预测函数 predic(lmModel,predictData...) #第五步,利用回归模型进行预测。...newData.csv', header=T, sep=',', fileEncoding = 'utf8'); fix(pData) predict(lmModel, pData, level=0.95) 多重线性回归

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stargazer包——线性回归结果输出到文档

前言 今天小编在做线性回归的时候,突然想 R 能不能把结果以表格的形式输出呢?这样就不需要自己复制粘贴画表格啦。...2.2 本文说明 由于 stargazer() 的参数 type 可以指定输出 LATEX 代码、HTML 代码或 ASCII 文本,可将 R 输出结果粘贴到对应的编辑器上得到表格(例如 LATEX...R stargazer() 的输出结果 Fig 1 是 R stargazer() 的直接输出结果,此处默认的是 LATEX 代码,接下来再将此 LATEX 代码粘贴到 TEXworks ,就可以一键导出该表格啦...汇总统计表 3.2 多个模型并排 例 2 构建两个线性模型和一个 probit 模型并并排显示表格,如 Fig 3 所示。...R markdown 生成表格 小编有话说 综上所述,stargazer() 生成表格的代码非常简单明了,输出的表格结果也十分简洁美观,并且对 LATEX 和 R 的初学者都比较友好,可适用的模型也非常多

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R语言入门之线性回归

R语言提供大量函数用于回归分析,平时的学习和工作,最常用的就是多元线性回归,下面我将简单介绍如何在R中进行多元回归分析。 1....上述结果的第一行Residuals表示的是残差项结果,Coefficients就是不同变量的回归系数(包括标准误和P值等),另外输出的结果还有决定系数以及F统计量等用于评估模型优劣的信息,关于这些统计量...模型对比 R你可以使用anova()函数来比较不同的拟合模型,在这里我们比较去掉自变量drat后的模型与原模型的优劣。...交叉验证 R你可以使用DAAG包里的cv.lm()函数来进行K折交叉验证,使用方法如下: # K-fold cross-validation library(DAAG) #加载R包 cv.lm(data...R,常用的函数就是“MASS”包里的stepAIC()函数,它是依照赤池信息准则(AIC)进行筛选的。

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R语言进阶之广义线性回归

广义线性回归是一类常用的统计模型,各个领域都有着广泛的应用。今天我会以逻辑回归和泊松回归为例,讲解如何在R语言中建立广义线性模型。...R语言中我们通常使用glm()函数来构建广义线性模型,glm实际上是generalized linear model(广义线性模型)的首字母缩写,它的具体形式如下所示: glm(formula, family...从输出结果来看,花瓣长度是可以较好区分这两类鸢尾花的,但是这个模型是原始和粗糙的,我们应该通过回归诊断的方式来修正此模型,使之更加精确,关于回归诊断请参见R语言入门之线性回归,这里就不赘述。...summary(glm.D93) # 输出回归结果 ?...关于广义线性回归模型的应用就先分享到这里,希望大家持续关注【生信与临床】!

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R语言教程之-线性回归

线性回归中,这两个变量通过方程相关,其中这两个变量的指数(幂)为1.数学上,线性关系表示当绘制为曲线图时的直线。 任何变量的指数不等于1的非线性关系将创建一条曲线。...线性回归的一般数学方程为 - y = ax + b 以下是所使用的参数的描述 - y是响应变量。 x是预测变量。 a和b被称为系数常数。...使用R语言中的lm()函数创建关系模型。 从创建的模型中找到系数,并使用这些创建数学方程 获得关系模型的摘要以了解预测的平均误差。 也称为残差。...为了预测新人的体重,使用R的predict()函数。...语法 线性回归中lm()函数的基本语法是 - lm(formula,data) 以下是所使用的参数的说明 - 公式是表示x和y之间的关系的符号。 数据是应用公式的向量。

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python数据分析——python实现线性回归

本文主要介绍如何逐步Python实现线性回归。而至于线性回归的数学推导、线性回归具体怎样工作,参数选择如何改进回归模型将在以后说明。 回归 回归分析是统计和机器学习中最重要的领域之一。...那么回归主要有: 简单线性回归 多元线性回归 多项式回归 如何在python实现线性回归 用到的packages NumPy NumPy是Python的基础科学软件包,它允许单维和多维数组上执行许多高性能操作...x是二维的而y是一维的,因为复杂一点的模型,系数不只一个。...²等变量,所以创建数据之后要将x转换为?²。...其实多项式回归只是多了个数据转换的步骤,因此从某种意义上,多项式回归也算是线性回归

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R方和线性回归拟合优度

特别是,R平方的高值并不一定意味着我们的模型被正确指定。用一个简单的例子说明这是最简单的。 首先,我们将使用R模拟一些数据。为此,我们从标准正态分布(均值为零,方差一)随机生成X值。...加上随机误差,再次使用标准正态分布: n < - 1000 set.seed(512312) x < - rnorm(n) y < - x + rnorm(n) 然后我们可以拟合Y的(正确的)线性回归模型...因此,和以前一样,我们可以从拟合简单的线性回归模型开始,该模型假设Y的期望是X的线性函数: Call: lm(formula = y ~ x) Residuals: Min 1Q...,我们获得的参数估计(1.65,1.54)不是“真实”数据生成机制参数的无偏估计,其中Y的期望是exp(X)的线性函数。...此外,我们看到我们得到的R平方值为0.46,再次表明X(包括线性)解释了Y相当大的变化。我们可能认为这意味着我们使用的模型,即期望YX线性的,是合理的。

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R语言用于线性回归的稳健方差估计

p=6274 在这篇文章,我们将看看如何在实践中使用R 。...为了说明,我们首先从线性回归模型模拟一些简单数据,其中残差方差随着协变量的增加而急剧增加: n < - 100 x < - rnorm(n) residual_sd < - exp(x) y...< - 2 * x + residual_sd * rnorm(n) 该代码从给定X的线性回归模型生成Y,具有真正的截距0和真实斜率2.然而,残差标准差已经生成为exp(x),使得残差方差随着X的增加而增加...无论如何,如果我们像往常一样拟合线性回归模型,让我们看看结果是什么: 估计标准 误差t值Pr(> | t |) -0.08757 0.36229 -0.242 0.809508...为此,我们使用估计量渐近(大样本)正态分布的结果。

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基于R语言的lmer混合线性回归模型

混合模型很多方面与线性模型相似。它估计一个或多个解释变量对响应变量的影响。混合模型的输出将给出一个解释值列表,其效应值的估计值和置信区间,每个效应的p值以及模型拟合程度的至少一个度量。...如果您有一个变量将您的数据样本描述为您可能收集的数据的子集,则应该使用混合模型而不是简单的线性模型。 什么概率分布最适合数据? 假设你已经决定要运行混合模型。...如何将混合模型拟合到数据 数据是正态分布的 如果你的数据是正态分布的, 你可以使用线性混合模型(LMM)。您将需要加载lme4软件包并调用lmer函数。...如果你的数据不正态分布 用于估计模型效应大小的REML和最大似然方法会对数据不适用正态性假设,因此您必须使用不同的方法进行参数估计。...结束 :了解你的数据 熟悉数据之前,您无法真正了解哪些分析适合您的数据,熟悉这些数据的最佳方法是绘制它们。通常我的第一步是做我感兴趣的变量的密度图,按照我最感兴趣的解释变量来分解。 ?

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R语言逻辑回归中求R square R

p=6295 并非所有结果/因变量都可以使用线性回归进行合理建模。也许第二种最常见的回归模型是逻辑回归,它适用于二元结果数据。如何计算逻辑回归模型的R平方?...麦克法登R平方 R,glm(广义线性模型)命令是用于拟合逻辑回归的标准命令。据我所知,拟合的glm对象并没有直接给你任何伪R平方值,但可以很容易地计算出McFadden的度量。...R的数据,我们可以将响应传递给glm函数, : Call: glm(formula = cbind(s, f) ~ x, family = "binomial", data = data) Deviance...1.3323e-13 on 0 degrees of freedom AIC: 18.371 Number of Fisher Scoring iterations: 2 我们现在将分组的二项式数据转换为...伯努利 数据,并适合相同的逻辑回归模型。

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R语言多项式样条回归、非线性回归数据分析

p=9508 本文将使用三种方法使模型适合曲线数据:1)多项式回归;2)用多项式样条进行B样条回归;3) 进行非线性回归。在此示例,这三个的每一个都将找到基本相同的最佳拟合曲线。...多项式回归 多项式回归实际上只是多元回归的一种特殊情况。 对于线性模型(lm),调整后的R平方包含在summary(model)语句的输出。AIC是通过其自己的函数调用AIC(model)生成的。...###通过以下方式检查其他模型: 具有多项式样条的B样条回归 B样条回归使用线性或多项式回归的较小部分。它不假设变量之间存在线性关系,但是残差仍应是独立的。该模型可能会受到异常值的影响。...: 5.747 on 2 and 15 DF, p-value: 0.01403 模型的简单图解 检查模型的假设 线性模型残差的直方图。...非线性回归线性回归可以将各种非线性模型拟合到数据集。这些模型可能包括指数模型,对数模型,衰减曲线或增长曲线。通过迭代过程,直到一定的收敛条件得到满足先后找到更好的参数估计。

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R语言中的岭回归、套索回归、主成分回归线性模型选择和正则化

p=9913 ---- 概述和定义 本课程,我们将考虑一些线性模型的替代拟合方法,除了通常的  普通最小二乘法。这些替代方法有时可以提供更好的预测准确性和模型可解释性。...岭回归的要求是预测变量  X的  中心定为 mean = 0,因此必须事先对数据进行标准化。 为什么岭回归比最小二乘更好? 优势偏差方差显而易见  。随着λ的增加,脊回归拟合的灵活性降低。...回归中,我们构造  M个  主成分,然后使用最小二乘的线性回归中将这些成分用作预测变量。通常,与普通最小二乘法相比,我们有可能拟合出更好的模型,因为我们可以减少过度拟合的影响。...解释高维结果 我们必须始终谨慎对待报告获得的模型结果的方式,尤其是高维设置。在这种情况下,多重共线性问题非常严重,因为模型的任何变量都可以写为模型中所有其他变量的线性组合。...岭回归和套索 开始交叉验证方法 我们还将在正则化方法应用交叉验证方法。 验证集 R ^ 2  C p和BIC估计测试错误率,我们可以使用交叉验证方法。

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线性回归模型的正规方程推导

本文对吴恩达老师的机器学习教程的正规方程做一个详细的推导,推导过程中将涉及矩阵和偏导数方面的知识,比如矩阵乘法,转值,向量点积,以及矩阵(或向量)微积分等。...求θ的公式 视频教程,吴恩达老师给了我们一个如下图红色方框内的求参数 θ 的公式 ? 先对图中的公式简单的说明一下。...公式的 θ 是 n+1 元列向量,y 是m元列向量,X 是一个 m 行 n+1 列的矩阵。...具体到上图中的例子,X 和 y在上图已经有了,它们都是已知的值,而未知的 可以通过图中的公式以及X和y的值求出来,最终得到假设函数(hypothesis function)为 假设函数和代价函数 多元线性回归的假设函数和代价函数如下...m行n+1列的0矩阵,也就是 根据公式, 所以 把(2)和(3)代入(1)式有 如前所述,J(θ)取得最小值时其对于θ导数为0,于是有 推出 使用矩阵乘法的分配律有 移项 等式两边同时左边乘以

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