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质控过滤以及标准

背景 标准处理流程:读取数据后对矩阵进行标准处理流程,包括 QC 过滤,数据标准化以及检测差异表达基因组。...一、数据质控 数据质控就是分别对行(基因)以及列(细胞)进行过滤,目的是过滤掉一些不符合要求数据,例如油滴中空细胞,多细胞,以及死细胞。...其他数据集请使用不同标准。例如当测序量增加,细胞数增多时,选择相应参数。...< 3500 & percent.mt < 5) dim(pbmc) # 13714 2643 基因数没变,细胞减少了 对过滤数据集进行可视化。...由于不同细胞中测序到不同数据,需要对表达量进行数据标准化,标准化有多种方式,默认使用 LogNormalize 标准化算法,还有 CLR,RC 等。

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基于用户协同过滤算法VS基于物品协同过滤算法

现有的条件就是以上这么多,至于实际情况不同会有不同衍生,像基于用户协同过滤算法和基于物品协同过滤算法就是一些典型实例。...虽然经过这么多年发展,但其思想都没有变,变化主要是在计算相似度衡量标准上。...3.基于用户协同过滤算法vs基于物品协同过滤算法 基于用户协同过滤算法和基于物品协同过滤算法两者区别在哪呢?...首先先解释下”协同过滤”: 所谓协同就是大家一起帮助啦,过滤就是把大家讨论结果告诉你,不然原始信息量太大了。很明显啦,两者区别在于一个是基于用户,一个是基于物品。...4.常用相似度衡量标准 欧氏距离算法 余弦距离算法 Jaccard距离算法 皮尔逊距离算法 …….

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基于DFA敏感词过滤

在计算理论中,确定有限状态自动机或确定有限自动机(英语:deterministic finite automaton, DFA)是一个能实现状态转移自动机。...对于一个给定属于该自动机状态和一个属于该自动机字母表{\displaystyle \Sigma }Σ字符,它都能根据事先给定转移函数转移到下一个状态 DFA算法 DFA((Deterministic...Finite automation))确定性有穷状态自动机: 从一个状态输入一个字符集合能到达下一个确定状态。...xiqi4145/article/details/84313809 ☆文章版权声明☆ * 网站名称:obaby@mars * 网址:https://h4ck.org.cn/ * 本文标题: 《基于...DFA敏感词过滤》 * 本文链接:https://h4ck.org.cn/2019/11/%e5%9f%ba%e4%ba%8edfa%e7%9a%84%e6%95%8f%e6%84%9f%e8%af

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基于AngularJS过滤与排序

前面了解了AngularJS使用方法,这里就简单写个小程序,实现查询过滤以及排序功能。...本程序中可以了解到:   1 angularjs过滤器   2 ng-repeat使用方法   3 控制器使用   4 数据绑定   程序设计分析   首先,如果要是先查询过滤,就要使用到...AngularJS中 过滤器filter 了。   ...直接在表达式后面使用管道命令符 | ,按照下面的写法就可以达到一个过滤效果: {{ persons | filter:query }}   通过使用filter实现过滤操作,query是查询过滤时输入字符串...相比于其他一些框架,是基于字符串通过DOM节点innerHTML添加到DOM中,AngularJS实现方式加快了模型与视图展现。

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布隆过滤Python实现(标准、计

bloompy github:bloompy 布隆过滤Python3实现,包括标准、计数、标准扩容、计数扩容。更新自pybloom。...安装 pip install bloompy 使用 通过bloompy你可以使用四种布隆过滤标准布隆过滤标准布隆过滤器只能进行数据查询和插入,是下面几种过滤基类,可以进行过滤存储和恢复...内置默认使用4位二进制位来表示标准布隆过滤1个位,从而实现可以增减。...标准扩容布隆过滤器 当插入元素个数超过当前过滤容量时,自动增加过滤容量,默认内置一次扩容2倍。支持查询和插入功能。...计数扩容布隆过滤标准扩容布隆过滤子类,功能继承自标准扩容布隆过滤器,但支持删除元素操作。

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@NotNull 等注解简单使用

=null){ return "密码不能为空,请重新输入"; } 这样就会显得特别low,而且极不美观 这时候就要用到一个注解@NotNull 简单举例说明: @Data public class...UserInfo { @NotNull(message = "姓名不能为null") private String name; @Max(value = 30,message...System.out.println(userInfo); return "注册成功"; } 这时候我们传入参数 到此结束,再也不用写一堆各种判空了 附上 部分注解 @Null 限制只能为null @NotNull...@Future 限制必须是一个将来日期 @Max(value) 限制必须为一个不大于指定值数字 @Min(value) 限制必须为一个不小于指定值数字 @Past 限制必须是一个过去日期...只应用于字符串且在比较时会去除字符串空格 @Email 验证注解元素值是Email,也可以通过正则表达式和flag指定自定义email格式 二次更新:所有的Controller 都写这样代码就要封装成异常类

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基于物品协调过滤算法

基于物品协同过滤(item-based collaborative filtering)算法是目前业界应用最多算法。...基础算法 基于用户协同过滤算法在一些网站(如Digg)中得到了应用,但该算法有一些缺点。...因此,著名电子商务公司亚马逊提出了另一个算法——基于物品协同过滤算法。 基于物品协同过滤算法 (简称ItemCF)给用户推荐那些和他们之前喜欢物品相似的物品。...基于物品协同过滤算法可以利用用户历史行为给推荐结果提供推荐解释,比如给用户推荐《天龙八部》解释可以是因为用户之前喜欢《射雕英雄传》。... 流行度 和UserCF(基于用户协同过滤推荐)不同,参数K对ItemCF推荐结果流行度影响也不是完全正相关

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基于近邻协同过滤算法

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 这节课我们来学习K近邻在推荐系统中应用,你将完成本课程第一个实战项目:基于KNN电影推荐系统!...为了使你能够顺利地完成实战内容,我们先了解一下推荐系统中基础知识。 基于近邻用户协同过滤 假定有一个场景:某个周日下午,你感觉很无聊,然后从电脑上打开了一个视频网站,想看下最近有什么好看电影。...然而你发现网站上热门电影基本都看过,其他电影又太多,不知道该看什么。...这种思想其实就是基于近邻用户协同过滤算法(简称UserCF):给用户 A 推荐和他有着相似观影兴趣用户 B 喜欢观看电影。...基于近邻用户协同过滤算法很容易给出推荐理由是: 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https://javaforall.cn/147446.html原文链接:https://javaforall.cn

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基于协同过滤推荐系统

本文介绍了一种较基础推荐算法,协同过滤Collaborative Filtering。基于用户购买历史商品推荐--物品协同过滤基于用户相似用户购买物品推荐--用户协同过滤。...推荐系统基于业务场景规则,由于召回算法Match和排序算法Rank都是基于模型,因此可以定制一些场景调整模型结果。 四、工业界系统架构 ? model&KV:离线模型。...Item cf 基于物品协同过滤 1. 原理 ? 此系统中存在: 用户 A B C D 商品 a b c d 用户A购买过a、b、d;用户B购买过b、c、e。...如果用户消费了物品i和物品j,如果消费时间间隔越近,那么这次“同现”权重应该越大,间隔越远权重越小。在分子上除以间隔时间,惩罚时间间隔影响。 User CF 基于用户协同过滤推荐算法 原理 ?...可以给新用户推荐行为物品相识物品。 推荐系统可解释性 UserCf,基于相似用户推荐,很难说明相识用户喜好 。 ItemCF,基于用户点击过物品进行推荐,解释性好。

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Java中注解 – @NotNull「建议收藏」

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 比如说,你写了一个后台系统,接收用户请求,经过运算后返回结果,很通用一个实现方案。...记得我们之前说过编码理念,Don’t repeat yourself,就派上用场了。 Java中已经定义了@NotNull注解,可以用来做这件事。...(我们也可以自定义注解,见上一篇文章)在我们这个场景,我们需求是: 在请求类中,所有不能为空属性上,需要标记为@NotNull 写一个通用validation方法,获取请求中参数,检查如果有标记...@NotNull,且参数值为null,则抛出异常。...NotNull private Integer age; private Boolean gender; // 省略getter, setter方法 } 为了使校验参数方法得到最大通用性

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基于协同过滤SVD推荐系统

我们通常会假设Aij = Xij+error,而error服从均值为0,标准差为 ? 所以有 ? 所以在给定Xi,j条件下,Ai,j似然函数为: ? 我们假定 ?...就可以看作是最可能或者说是最能表达矩阵A秩为k矩阵了,显然我们把一个求极大似然估计问题转换为了对矩阵ASVD矩阵分解问题。...对于m、n比较小情况,可能是可以受,但是在海量数据下,m和n值通常会比较大,可能是百万级别上数据,这个时候如果再进行SVD分解需要计算代价就是很大。...参数为X Expection E步是求在当前t下参数以及可观测田间下隐数据条件分布期望。 ? 确定EM函数E步,首先要确定起着核心作用Q函数 ? 这里Q函数: ?...进行SVD分解,那么如果迭代l步才能达到收敛,得到稳定X,我们时间复杂度则为l*O(n^2*m+m^2*n),这在m、n都很大情况下显然是不能被接受。所以可以基于采样来减少计算复杂度。

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@NotNull注解引出关于Java空指针控制

这是最重要避免NullPointExceptionjava技巧,但是结果会是极大改进,因为equal()是一个很普遍方法。...5)使用@NotNull和@Nullable注释 当写你可以定义关于约定可空性(Nullability),要通过使用像@NotNull和@Nullable类似的注释提示这个方法是否为空安全(null safe...这些注释也是JSR 305(译者注:可以理解为java标准一部分。通过看到@NotNull和@Nullable,程序猿可以自己决定是否去进行空检查。...但是这种处理必须非常小心地处理对空值检查而不是检查非法输入。同样要注意,定义可以使空值或者不可以空值时候,提醒调用者作出被告知决定。失败之后选择或者接受空值也是一个你需要重视重要设计。...如果调用者没有任何上述这些方法,那么有可能返回是空对象而不是空(null)。空对象是一个特别的对象,它在不同上下文中有不同含义。

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基于用户协同过滤python代码实现

在推荐算法概述中介绍了几种推荐算法概念,但是没有具体代码实现,本篇文章首先来看一下基于用户协同过滤python代码。 1 数据准备 本次案例中,我们使用用户对电影打分数据进行演示。...数据包含两个表,一个是movies表,记录了电影编号和电影名称对应关系? ? 另外一张是ratings表,记录了每个用户对电影打分情况? ?...else: data_dic[line[1]][line[4]]=line[2] self.data = data_dic 计算用户间距离 基于用户协同过滤第二步就是计算用户两两间距离...("推荐用户:",(user,score)) for movies,scores in self.data[user].items():#推荐用户电影列表...后台回复“协同过滤用户”获得数据及完整代码 ----

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近邻推荐之基于物品协同过滤

推荐阅读时间:6min~8min 文章内容:基于物品协同过滤 在了解了基于用户协同过滤之后,还有基于物品协同过滤。它们原理非常类似。...在电商平台中经常看到“看了又看”,“看过它的人还看”等等推荐,这些推荐背后对应算法大多数都是基于物品协同过滤。 ?...原理简介 介绍基于物品协同过滤之前,先来看下基于用户协同过滤可能带来问题。...那么它是如何解决基于用户协同过滤存在上面的问题呢?...相关推荐: 近邻推荐之基于用户协同过滤 如何构建基于内容推荐系统 如何从文本中构建用户画像 一文告诉你什么是用户画像 推荐系统中重要却又容易被忽视问题有哪些 个性化推荐系统中绕不开经典问题有哪些

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快速开发基于AUTOSAR标准驱动软件

它能够让开发人员面向应用进行软件开发,为了解决汽车系统设计中与日益增多软件内容和不断收紧开发时间问题。今天我们就来看看如何开发符合AUTOSAR标准软件。...小猿第一次接触AUTOSAR是因为我一个朋友张果老(化名)原来在汽车行业,后来介绍我认识AUTOSAR标准,那还是在2013年左右,后来就研究了下这个标准,确实觉得好处很多。...既然这么多公司都在遵从这一标准,虽然他是专为汽车行业设计,但是我们同样可以借鉴他架构和标准开发用于其他行业和产品软件,就像MISRA 现在已普遍应用于各个嵌入式软件开发中,而不只是局限于一个行业...我们以一个简单例子MCU GPIO来说明如何开发基于AUTOSAR标准驱动软件,首先请自行下载AUTOSAR4.2标准压缩包到本地电脑,并熟悉AUTOSAR文档结构,这次我们主要参考AUTOSAR_SWS_PortDriver.pdf...在microship 8位机和NXPkinetis kv46 32位机上验证。我们这里没有完全遵照AUTOSAR标准但是大架构是按照AUTOSAR来

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