基于NumPy和Plotlib的SIR模型

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python、numpy

对于我的一个作业，我正在用phyton上的Runge Kutta-4写一个简单的SIR模型，然而，我似乎遇到了某种障碍，因为我的模型总是解析成垂直线或水平线，而不是它应该的逻辑曲线，我找不到问题所在，import numpy as np def SIR(x, params= x[:, k]

浏览 5提问于2021-10-10得票数 0

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基于matlab和simulink的SIR模型建模

matlab、plot、model、simulink

我试图在matlab和simulink中建立SIR流行病模型。我想我已经在matlab中完成了，但由于某种原因，我的simulink模型无法工作。它只是在一个范围内显示直线。这是我计算微分方程的函数。function dx = sir(t, x) beta = .5; dx(1) = -beta * x(1) * x(2); dx(2) = beta * x(1) * x(2) - d

浏览 0提问于2015-11-27得票数 1

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我已经创建了上述模型的一些非常基本的实现。然而，虽然图表看起来是正确的，但这些数字加起来并不等于一个常数。也就是说，每个隔间中易受感染/感染/恢复的人的总和应该等于N(这是总人数)，但由于某种原因，它不会加成一些奇怪的十进制数，而且我现在看了3天之后，真的不知道如何修正它。plt.ticklabel_format(style='sci', axis='y', scilimits=(0,0)) plt.xlabel('

浏览 1提问于2017-11-18得票数 4

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基于SIR模型的疾病暴发模拟

c++

我有一个作业，我必须写一个C++程序来模拟疾病爆发使用SIR模型(易感，传染性，恢复期)。要求是使用7x7大小的2D数组，其中用户将选择X和Y坐标来初始化感染者。如果接下来的三个位置旁边有一个被感染的人，它会将状态更新为nextDayState。下面是到目前为止我为两个函数SpreadingDisease和RecoverState编写的代码。坐标，那么我就可以使用该坐标来更新第二天的状态。不幸的是，我不知道如何将X和

浏览 0提问于2018-10-18得票数 0

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基于fsolve和Euler 3BDF的SIR模型

matlab、numerical-methods、ode、differential-equations

嗨，我被要求使用MATLAB中的fsolve命令来解决SIR模型，并向后返回Euler 3点。我真的不知道该怎么做，请帮助我。这就是我到目前为止所拥有的。SIR模型如下所示 clcgamma=1/7;ode1= @(R,S,I) -(beta*I*S)/(S+I+R); ode2

浏览 2提问于2020-04-15得票数 1

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哪个有更多的信号和图像处理功能- Matlab还是Python？

python、matlab、scientific-computing

哪个有更多的信号和图像处理功能- Matlab还是Python？我不关心效率，只关心他们向程序员提供的功能的全面性。我的领域是生物医学研究。我处理了很多声音和图像数据。我熟悉Matlab的图像处理和信号处理工具箱。但我对Python完全不熟悉。我想知道Python的numPy、sciPy、plotLib等是否可以与Matlab的工具箱相匹配。

浏览 2提问于2013-10-02得票数 0

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如何计算Python中的度量"SDR“、"SI-SDR”、"SIR“、"SAR”？

python、audio、metrics

假设我有长度为10秒的立体声音乐，采样率= 44100，那么在读完音乐后，numpy数组形状将是REF = (2, 441000)。我有这个带有噪音EST = (2, 441000)的音乐的第二个版本。我想计算一下：对于特别提款权，提出了以下公式、SIR和SAR是否有相同的</em

浏览 41提问于2022-07-11得票数 0

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AnyLogic中的参数变体:特定变体的数据

anylogic

我使用AnyLogic中的参数变化(在系统动力学模型中)。我感兴趣的是一个参数如何随着不同的迭代而变化。该参数为二进制:当供水量大于需求量时为0，当供水量低于需求量时为1。变化的参数是室外灌溉的给定百分比减少，室内用水量的给定百分比减少，以及拥有雨水收集系统的家庭的给定百分比。在视觉上，我需要一个时间图，其中x轴上是时间(10,950天；即30年)，y轴上是二进制。我看过视频，看到了如何使用直方图和2D数据来可视化迭

浏览 1提问于2021-07-01得票数 0

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如何在JAVA中实现SIR模型，并在Repast中可视化？

java、agent-based-modeling、repast-simphony

我得到了一个项目，在JAVA中从头开始编写SIR模型(基于代理的建模)，然后使用Beta和Gamma的不同值通过RepastSimphony将其可视化。我已经安装了Java、Eclipse和，但是我不知道从哪里开始编写代码。任何帮助都是非常感谢的。谢谢!

浏览 17提问于2022-05-17得票数 0

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用SIR模型拟合曲线并进行预测

python、ode

我在这个网站上搜索并参考了解决SIR模型的代码，但是拟合效果很差。我的数据有问题吗？还是什么？我该如何预测这个SIR模型的新数据？import numpy as np from scipy import integrate, optimizeIO + SO + R0 is always 1 regardless of "value" I0 = 0

浏览 8提问于2022-10-07得票数 0

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将一组常微分方程应用于每个网格单元

r、ode、differential-equations

我正在开发一个基于agent的模型来模拟传染性疾病在由栖息地多边形(或连接的细胞簇)组成的异质景观中的传播。为了简化模型，我考虑一个包含每个单元格的多边形ID的生境网格(或光栅)。), 为了研究疾病动力学，我还开发了一个基于常微分方程组(ODEs)的<

浏览 2提问于2017-06-27得票数 0

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基于最小二乘的SIR模型拟合

python、scipy、curve-fitting、least-squares、model-fitting

我想优化SIR模型的拟合。如果我用60个数据点来拟合SIR模型，我就会得到一个“好”的结果。“好”的意思是，拟合的模型曲线接近数据点，直到t=40。我的问题是，我如何才能得到一个更好的拟合，也许是基于所有的数据点？= [float(t) for t in xdata] from scipy import in

浏览 2提问于2015-12-22得票数 6

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代理而不是系统动态库存的维数

anylogic、stock、dimensions、agent、systemdynamics

目前我有一批一年级的学生。股票是排列，所以Gr1_learners[..] = {10,10}意味着有10个高表现的学习者和10个低表现的学习者在这个股票。.] = {20,0}成为一年级学生，经过一年的学习和干预，提高了所有学习者的学习成绩。我的想法是创造学习者作为代理人，并将他们放在股票中。那么Gr1_learners = 20是一个有20个代理的股票，一半在state high_performing，一半在state low_

浏览 12提问于2022-05-18得票数 1

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用于SIR模型的耦合ODE的集成与拟合

python、scipy、model、curve-fitting

在这种情况下，有3个ODE描述了SIR模型。问题来了，我想要计算哪些beta值和gamma值最适合于来自x_axis和y_axis值的数据点。我目前使用的方法是从odeint库和来自同一个库的curve_fit方法集成使用scipy的ODE。在这种情况下，您如何计算β和gamma的值来拟合数据点？当前的错误是：ValueError: operands could not be br

浏览 13提问于2022-09-24得票数 0

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声源分离评价的负SDR结果

python、audio、deep-learning、signals、signal-processing

我正在尝试使用包的函数来评估我的音频源分离模型。我正在评估的模型是训练来预测声音的，结果与实际的声音相似，但是评估指标如SDR是负的。：accompaniment ==> SDR: -0.590 SIR: 1.704 ISR: -0.0

浏览 9提问于2022-04-13得票数 1

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如何在Jupyter Notebook中添加交互式绘图？

python、matplotlib、anaconda、jupyter、ipywidgets

我已经为基本的SIR模型做了一个图。我对我的图很满意，但是，我希望能够有一个交互式滑块，调整我的参数beta和gamma。我希望它们都在0到1的范围内，并且用户能够将它们递增0.01。提前感谢您的宝贵时间。下面是我的代码： # # Solving SIR Model in Python (INTERACTIVE) # Importing packages: # DisplayFor

浏览 32提问于2020-07-06得票数 1

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用python并行化实现图上的大进程

python、python-3.x、graph、parallel-processing

我正在处理复杂网络的图形和大数据集。我使用ndlib库在它们上运行SIR算法。但每次迭代需要大约1秒的时间，而make代码需要10-12小时才能完成。我想知道有什么方法可以让它并行化吗？代码如下所示sir = model.infected_SIR_MODEL(it, infectionList, False)for i in numpy.arange(

浏览 23提问于2019-10-24得票数 1

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如何用多条曲线和因变量进行曲线拟合

python、curve-fitting、least-squares、lmfit

我正在研究一个扩展的SIR模型，用于covid预测。现在，我正在尝试通过lmfit进行曲线拟合。，增加了一个“死亡”的案例。因此，现在我可以基于历史上的“死亡”对我的模型进行曲线拟合。但我也为可能的“感染”找到了一个可靠的来源。问题是，我只能对"D“(死亡)曲线或"I”(感染)曲线进行曲线拟合。是否有一些方法可以使用基于两条曲线的曲线拟合，这两条曲线基本上依赖于

浏览 48提问于2020-08-12得票数 1

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在SIR模型中更新出生率和死亡率

netlogo

我想用NetLogo软件用智能体模型来模拟疾病的传播。如何在SIR模型中更新出生率和死亡率。

浏览 5提问于2014-03-22得票数 0

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如何从AnyLogic获取最终的图形？

anylogic

我有一个与建筑安全相关的AnyLogic模型。我想得到一个图表，显示不安全行为与时间的关系。为了得到一个有把握的结果，我想运行我的模型100次，因此我将有100个不同版本的图形。如何获得最能代表这100个图中结果的最后一个图？有没有一种方法可以直接从AnyLogic中获得最终的图形？

浏览 63提问于2019-07-19得票数 1

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