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Docker PostgreSQL 崩溃恢复记录

Docker PostgreSQL 崩溃恢复记录 在 Docker 运行 PostgreSQL 数据库突然无法启动, 错误日志类似这样: PANIC,XX000,"could not locate...LOG,00000,"aborting startup due to startup process failure",,,,,,,,,"" 这种情况多数情况下是在执行事务时, 数据库被强行关闭导致,...修复方法是: 如果使用 PostgreSQL 是 10.x 或更高版本, 使用 pg_resetwal DATADIR 来解决; 否则使用 pg_resetxlog DATADIR 来解决;...由于数据库是在 Docker 运行, 因此需要按照 Docker 方式来修复: 使用 pg_resetxlog 或者 pgresetwal 有可能会丢失数据, 启动之后, 需要仔细检查数据库健康情况...更多请参考 PostgreSQL 文档 https://www.postgresql.org/docs/current/app-pgresetwal.html 在客户端创建要素图层

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基因选择参考群更新策略

基因选择,不同世代不断进展,一般后代选择表现好个体,测量表型数据后,将其添加到参考群,这样有可能会失去遗传多样性,今天分享一篇文献,介绍一下这方面的研究。 1....在家畜育种,GS包括对基因估计育种值(GEBV)估计,以及基于这些GEBV对仅有可用基因型个体(例如,作为选择候选年轻个体)实际选择(补充材料,图S1)。...参考群体由具有已知表型和基因型个体组成,基于基因许多标记,用于建立预测方程和推断选择候选GEBV。...最后,它允许选择难以记录且成本高昂新性状(Meuwissen等人,2001;Calus和Veerkamp 2011)。...飞哥笔记: 1,GS分析,参考群数量是最重要,在达到一定规模,才有必要对群体个体进行删减和候选群更新筛选,前期增加绝对数据是最最重要

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记录几个Impala日常使用遇到问题(持续更新)

在Impala,会对SQL资源有默认资源池限制,其参数为mem_limit,通过该参数来约束Impala在执行SQL查询时,Impala能够使用最大内存宗总量。...因为我们业务系统,有大量看板与报表需要请求Impala,所以Impala需要处理SQL查询数量,相对也是比较高。...经常会对kudu表数据进行更新操作。...而Impala自身维护元数据更新又有一定时延,导致业务系统在查询时无法立刻查询到最新数据。我们可以手动refresh Impala相应数据表元数据。...解决办法:为了返回最新数据,我们需要Impala元数据一直保持在最新状态,可以执行以下API,对Impala缓存元数据进行刷新。

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Gradle 手记|记录我使用过 build 基本配置(不断更新。。。

278041dfa64d44558fe2194942e61440~tplv-k3u1fbpfcp-zoom-1.image] 序 --- 小厂猿猿一枚,原谅我没见过世面的样子, 先放置一张目前 Demo 结构图...针对我之前这种法子做个小小升级,在原有 gradle 文件添加如下内容: android { // 封装项目的所有构建类型配置 buildTypes { debug {...boolean", "LOG_DEBUG", "false" // ... } } } 随后 Build 之后变会根据当前构建类型在 BuildConfig 插入此变量...三、local.properties 存放证书密钥 --- 其实这块我们也可以直接写入到 build ,但是不是相对来说并不安全吗,所以特意将这块放置在 local.properties 文件。...个人还是建议巧用 README,记录项目常用一些东西,方便之后小伙伴快速上手~ 这里附上一张我之前项目的事例,也是在尝试,欢迎提供更好建议~ 在这里我截个之前负责项目记录 README 做个抛砖引玉吧

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Baysor:在基于成像空间转录实现细胞分割

基于原位测序或多重RNA荧光杂交单分子空间转录学方案可以揭示详细组织结构。然而,在这些数据中区分单个细胞边界是具有挑战性,并可能会阻碍下游分析。...目前方法通常使用细胞核染色法来近似确定细胞位置。基于此,来自美国研究团队开发了一种分割方法:Baysor。...空间转录许多分析都可以被表述为标签分配问题。例如,细胞分割是将细胞标签分配给观察到分子。细胞间背景分离是一个将分子标记为“信号”与“背景”问题。...Baysor是一个基于MRF分割思想算法,其考虑到转录组成和细胞形态联合可能性,优化了二维(2D)或三维(3D)细胞边界。其不仅考虑到基于共染分割,也可以单独根据检测到转录物进行分割。...同时,研究人员还证明了Baysor在使用五种不同方案获得数据上表现良好,使其成为分析基于成像空间转录有力通用工具。

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Baysor:在基于成像空间转录实现细胞分割

基于原位测序或多重RNA荧光杂交单分子空间转录学方案可以揭示详细组织结构。然而,在这些数据中区分单个细胞边界是具有挑战性,并可能会阻碍下游分析。...目前方法通常使用细胞核染色法来近似确定细胞位置。基于此,来自美国研究团队开发了一种分割方法:Baysor。...空间转录许多分析都可以被表述为标签分配问题。例如,细胞分割是将细胞标签分配给观察到分子。细胞间背景分离是一个将分子标记为“信号”与“背景”问题。...Baysor是一个基于MRF分割思想算法,其考虑到转录组成和细胞形态联合可能性,优化了二维(2D)或三维(3D)细胞边界。其不仅考虑到基于共染分割,也可以单独根据检测到转录物进行分割。...同时,研究人员还证明了Baysor在使用五种不同方案获得数据上表现良好,使其成为分析基于成像空间转录有力通用工具。

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基于Python+appiumios自动化测试demo(更新

ios-deploy 1.9.4 xcpretty 0.3.0 appium-doctor 1.6.0 Appium v1.9.1 Python 3.7 WebDriverAgent 用GitHub[...no-reset": true, "startIWDP": true, "bundleId": "com.XXXXXX" 通过元素定位器进行定位 python通过appium进行脚本编写 遇到坑...设备通过手机IP和端口还不能访问,此时需要将手机端口转发到Mac上 : 终端输入:iproxy 8100 8100 如果存在多个版本Xcode,在安装brew包时候,会出现兼容性问题...Applications/Xcode9.4.1.app sudo xcode-select --switch /Applications/Xcode.app 两个wda模块地址 1、在命令行安装appium时候已经集成了...appium/node_modules/appium-xcuitest-driver/WebDriverAgent/WebDriverAgent.xcodeproj 2、使用appium desktopwda

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基于图形泛基因比对不再抓瞎 (VAG更新与中文手册v1.01)

另外VAG所支持图形泛基因可通过minigraph、cactus等工具进行构建,构建工具生成GFA文件(需要有特定参考基因主线;部分情况下需排序至S行与对应P行交错)需进一步通过gfatools...read比对结果展示(read)与图形基因(Graph)展示)。...具体可以分为利用graphsamtools脚本基于选定参考基因区间为尺度,提取感兴趣目标区间,并利用runVAG.py进行可视化生产。...基于图形泛基因序列比对(alignment/mapping)显示: Reads到graph映射阶段可以用vg giraffe/map或其他类似的软件来处理。...1677392879797.png-60.8kB 可是选择显示短序列比对pair-end信息,根据此信息可用VAG进行可靠比对路径推测。

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基于质谱蛋白质学在加速药物发现新角色

因此,药物发现工作可以从不同实验起点着手,例如,从靶点假设开始或由生物活性化合物探究疾病模型开始(图 1)。 图 1:基于质谱蛋白质学在临床前药物发现过程应用。...基于质谱(MS)蛋白质学已经达到了可以在几个小时内简化分析几乎完整蛋白质水平(图 2)。...图 2:主要蛋白质鉴定和定量策略 靶点识别 基于 MS 蛋白质学有助于直接分析小分子与蛋白质相互作用。 基于探针靶向反卷积。...在这些实验,相应肽片段谱提供了主要蛋白质靶点共价修饰氨基酸残基直接证据(图4e)。 通过基于片段配体发现拓展化学基因学空间。...将手性整合到完全功能化片段文库,也可以识别细胞中大量立体选择性蛋白质-片段相互作用。基于片段蛋白质学分析显然有望扩大化学蛋白质学空间,并使生物活性小分子及其分子靶点协同发现成为可能。

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【漏洞预警】PostgreSQL任意代码执行 漏洞(CVE-2019-9193)预警通告

预警编号:NS-2019-0010 2019-03-26 TAG: PostgreSQL、远程代码执行、提权 危害等级: 高,拥有“ pg_read_server_files”权限攻击者利用此漏洞可具备超级用户权限...PostgreSQL是一款功能强大数据库软件,可运行在所有主流操作系统上,包括Linux、Windows、Mac OS X等。...此次披露漏洞存在于导入导出数据命令“COPY TO/FROM PROGRAM””,“pg_read_server_files”内用户执行上述命令后,可获取数据库超级用户权限,从而执行任意系统命令...3.1 产品防护 目前官方暂无修复此漏洞计划,绿盟科技网络入侵防护系统(NIPS)将于例行更新中发布针对此漏洞防护规则,请相关用户关注,及时完成规则更新,以实现对此漏洞防护。...完成更新后,在系统默认规则库查找规则编号:41660,即可查询到对应规则详情。

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数据库设计原则

老师可以开课、学生可以选课,数据库设计,课程可以由课程编号和课程名称等确定; 如果现在维护两个表,一个表A存储课程信息(课程编号、名称、简介、学分、院系等),另一个表B存储开课信息(有哪些课程开课),...如果B重复存储了A课程名称、简介、学分、院系等信息,一旦A信息更新,B中和A中信息便出现不一致; 正确做法是,B只存储课程编号,并以此和A相关联; 解耦合: 一个表只存储它应该存储信息,和此表无关信息放到另一个表去存储...到另外一个表又叫另外一个名字; 一般来说,Table命名用单数,Column命名用单数; Table不用Prefix前缀来表示不同,而用schema来划分命名空间(postgresql); 命名用...字节,具体占用空间数目和语言、编码方式有关; 对外键要加Index; 数据库里面的密码一定要加密,不能保存明文; 用is_deleted=true来表示本条记录业务上删除,不要在数据库真正删除记录...; 数据库表可以有创建和更新时间戳,及所创建/修改行用户标示; 不删除字段,而是打上一个被删除标记; 版本化修改; 大型数据库设计 负载均衡; 读写分离; 分布式存储; 参考这篇文章(https

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PostgreSQL 对特定类索引优化,节省磁盘空间百倍 --BRIN 索引应用在生产案例

在使用POSTGRESQL数据库时候,我们经常发现一些常见问题 1 PG磁盘消耗,相对于其他数据库可能会稍快,尤其是进行DML操作UPDATE 操作居多情况下。...,通过便利来获取数据具体在哪个范围BLOCK基于这样原理,BRIN索引适合顺序型,日期型,数据查找,而非常不适合随机数据和采用率大数值索引替代方案。...同时需要注意 1 数据插入与索引更新,这数据在插入到数据库表,并不是马上会触发索引更新,而是要看情况。...1.1 索引使用range map page 被写满了,那么将触发更新索引工作 1.2 autovacuum 工作,会触发BRIN索引更新 1.3 vacuum 工作时会触发BRIN 索引更新...小结:写到最后,POSTGRESQL 索引在所有目前传统数据库,提供了丰富选择,对于不同PG提供类型索引定位和切实使用是一个我们应该进行工作。

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数据库简介与 Mysql 服务基础「建议收藏」

保证存储在数据库数据正确、有效和相容,以防止不合语义错误数据被输入或输出。 数据操纵功能:包括数据查询统计和数据更新两个方面。...通信功能:DBMS 与其他软件系统之间通信,如 Access 能与其他 Office 组件进行数据交换。...关系数据库存储结构是二维表格 在每个二维表: 每一行称为一条记录,用来描述一个对象信息 每一列称为一个字段,用来描述对象一个属性 主键 数据表每行记录都必须是唯一,不允许出现完全相同记录...,通过定义主键(主关键字,Promary Key)可以保证记录(实体)唯一性 键,即关键字,它是关系模型中一个非常重要元素 主键唯一标识表行数据,一个主键值对应一行数据,主键由一个或多个字段组成...,通过表主键值得一列或多列添加到另一个表,可创建两个表之间链接,这个列就称为第二个表外键 如下表所示,字段 “专业编号” 是该表主键,而上表也有一个相同字段 “专业编号”,则该字段称为外键

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Postgresql 内幕探索》读书笔记 - 第一章:集簇、表空间、元组

PostgreSQL: Documentation: 14: 70.1. Database File Layout Postgresql-14官方文档各个文件含义如下。 表 70.1....首部数据(header data):页面的起始位置是PageHeaderData 首部数据,固定大小为24个字节,首部数据组成如下: pd_lsn:8字节无符号整数,代表当前页面最后一次更新XLOG记录...ItemId itemId = PageGetItemId(page, offnum); // 检查当前编号是否被使用,根据结果更新lp_flags...fastupdate(快速更新)模式:基表元组产生GIN索引会以追加方式被插入到pending list列表。...需要注意GIN索引pending list代价要大,因为posting list 是一出现过key位置,一次大批量插入会导致扫描效率低。

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