但是如果我们并不是在差异分析结果里面的自定义阈值,定上下调差异基因列表,而是根据某个指标(比如logFC)把全部的基因排序,再去进行GO/KEGG数据库注释,一般来说就是GSEA分析啦。...而且有各种各样的参考文献基因列表,比如转录因子列表,关于转录因子列表我在生信菜鸟团公众号看到了有一个介绍:TCGA数据挖掘常见基因集合,首先是Cancer Manag Res. 2020的文章《Prognostic...这些来源于参考文献基因列表往往是千奇百怪的格式,它们并不会遵循MSigDB的gmt文件标准(其实绝大部分人应该是都没有听说过这个标准),绝大部分都是Excel里面的列表格式。...如下所示就是长短不一的Excel,读取就考验大家的代码能力了: 数据框 这个大概是基因集合最容易看人看懂的形式了, library(msigdbr) all_gene_sets = msigdbr(species...x){ data.frame(gs_name=x,gene_symbol=glist[[x]]) })) 对象(遵循MSigDB的gmt文件标准) 前面的数据框或者列表,要弄成对象就比较麻烦了,需要做一些转换
通常情况下我们的ORM框架都是将单表或者视图映射成一个实体类,有时候也会将存储过程映射成实体类,如果处于系统移植性的考虑,你不想写存储过程,那这些复杂的SQL查询怎么映射成实体类?...实际上,不管是单表,视图,存储过程,SQLSERVER的表值函数,自定义的SQL查询,甚至是任意复杂的SQL查询,都可以用一个SQL语句来表示,只要我们的ORM框架能够实现将SQL语句的查询结果映射成实体类...工具支持各种类型的数据库。 3,新建一个查询,在上图右边的内容区输入你的SQL语句,按“F5”键,如果正确将会看到结果网格。 ...这个时候可以看到我们生成的实体类的原貌,如果觉得不好,可以修改重新进行。 关闭窗口后,如果还想添加更多的自定义查询,请单击“高级”按钮,将重复上面的步骤,添加一个新的查询,结果如下图: ?...除了可以通过本文说的方式将SQL语句映射到实体类,还可以通过PDF.NET内置的SQL-MAP技术来实现实体类映射,就像iBaits那样,但比iBaits简单很多,详细内容,请参看: PDF.NET数据开发框架
,主要特点是具有iBatis特点的SQL-MAP功能和框架独特的实体对象查询语言--OQL,下面我们使用OQL来构造一个复杂的实体查询。...首先定义两个实体类:用户类和订单类,可以使用框架提供的实体类生成器生成,下面是详细代码: /* 本类由PWMIS 实体类生成工具(Ver 4.1)自动生成 http://www.pwmis.com...System.DateTime>("OrderDate"); } set { setProperty("OrderDate", value); } } } } 然后,我们来构造两个复杂的查询条件...10日内提交了订单的用户信息,程序声明了两个OQL对象: OQL oql;//用户相关的OQL对象; OQL q_order //订单相关的OQL对象; 关键点在于q_order 对象作为oql对象的... IN ( SELECT UID FROM Table_Order Where OrderDate >= @CP1 ) OK,到此为止,我们可以使用我们的OQL查询出真正的实体集合了:
1.查询一个实体类对象 /* * 根据用户id查询 * */ User GetUserByID(@Param("id") int id); <!...map集合 map集合属性不固定,比如有些属性没有值就不会查询出来 /** * 根据用户id查询用户信息为map集合 */ Map getUserToMap...map集合 方法1 /** * 查询所有用户信息为map集合 * @return * 将表中的数据以map集合的方式查询,一条数据对应一个map;若有多条数据,就会产生多个map集合,此 时可以将这些...map集合 * @return * 将表中的数据以map集合的方式查询,一条数据对应一个map;若有多条数据,就会产生多个map集合,并 且最终要以一个map的方式返回数据,此时需要通过@MapKey注解设置...map集合的键,值是每条数据所对应的 map集合 */ @MapKey("id") Map getAllUserToMap(); <!
OQL”语言“ 是PDF.NET数据开发框架的实体对象查询语言,一直以来,ORM的复杂查询条件都是困扰ORM的问题,所以很多时候不得不舍弃ORM,直接手工拼接SQL。...我们来看看OQL是怎么解决这些问题的,现在举一个今天同事遇到的问题: 有这样一个实体类 MyEntity,实体类的具体定义在此忽略,有兴趣的朋友请看我的博客。...cmpResult,接下来看看怎么样构造完整的OQL语句: //e 是前面的实体类对象实例 OQL q=OQL.From(e).Select().Where(cmpResult).End; 当然也可以这样写...(e.F1,e.F2).Where(cmpResult); 最后就可以到数据库查询实体了,非常简单: List result=EntityQuery.QueryList...(q); 至此,一个复杂的ORM查询使用OQL语言就完成了,是否方便,还得大家评说。
有时候我需要控制某条记录在我读取后就不许再进行更新,那么我就可以将所有要处理当前记录的查询都加上更新锁,以防止查询后被其它事务修改.将事务的影响降低到最小。...上面这个例子可能比较抽象,让我们来举一个实际的例子。 假设有一个投资产品表,当我们查询到该产品记录后,要进行一系列的判断,最后对该记录进行更新。该记录的状态会影响到下一个人查询到此记录的处理。...下面我们来看看用SOD框架的OQL怎么处理。...db.Commit(); 上面的操作,首先在AdoHelper对象上开启事务,然后查询投资产品实体的时候在With方法上加上 OQL.SqlServerLock.UPDLOCK 更新锁,接着进行复制的业务处理...,然后更新此实体记录,之后还有复杂的其它业务操作,最后提交事务。
什么是 WordPress Transients API Transients 是瞬时的意思,WordPress Transients API 是 WordPress 用来缓存一些复杂的 SQL 查询和运算结果的最简单的方法...所以如果你在制作 WordPress 插件的时候,需要存储一些有一定生命周期的数据的时候,Transients API 是最好的选择。...WordPress Transients API 缓存的数据存储在哪里 这个取决你的服务器设置,如果你的服务器开启 Memcached,那么缓存的数据就存在 Memcached 的内存中,如果没有开启的话...WordPress Transients API 例子 假设你要获取博客的流量最高的 10 篇文章,这个要设计复杂的 SQL 查询,而流量最高的 10 篇文章一般来说在一段时间(比如:12小时)之内是不会变化的...posts = get_transient('top_10_posts'); if(false === $top_10_posts){ // 临时变量过期了或者根本就没有创建 // 通过 SQL 查询获取流量最高的
1.封装结果集时,有两个对象 1.1.解决方案1 ? 在第一个实体类中定义它不存在的那个字段 1.2.解决方案2 ?...设置关联关系: 在第一个实体类中定义它不存在的那个字段的整个对象(新定义一个类型(对象)) 2.JSP页面跳转的时候连接多个属性时,第二个和以后需要使用&,而不是? ?...3.封装实体类时,BeanHandler(*.class) ?...需要数据库属性名与自己封装的实体类的属性名一样, 如果不一样可以用as或者修改实体类的属性名 4.dao层尽量写最底层的代码,不要调用方法 可以在dao层的main里面先调用上面的方法进行测试,节约时间...,不必启动tomcat 5.两个对象不能用BeanListHandler(),它只能封装cart,product为null,要使用MapListHandler() MapListHandler()返回值为
大名鼎鼎的 iBatis,MyBaits.Net 就是这样的功能,但它定义了一套复杂的规则,配置起来很复杂,项目可能80%的时间都在写查询配置,如果没有代码工具开发工作量很大的。...当然,与MyBatis不一样之处,SOD框架并不主张将项目的查询都用SQL写到SqlMap文件,建议大家仅将复杂的SQL查询写到SqlMap配置文件,一般项目这类复杂查询也就20%左右,而对于80%的一般查询...注意:如果要执行获得结果集的查询,需要在Sql-Map文件的命令节点里面使用 Select 节点,并且需要指明 ResultClass 的类型,它有下面几种可选值: ValueType --结果为值对象...,比如Int,String之类的查询单值结果 DataSet --数据集,默认 EntityObject --单个实体类对象 EntityList --实体类列表 注意:如果指定 ResultClass...; Console.Read(); } } 结果运行如下: ? 设置一个断点,我们来看看 ”SQL-MAP DAL对象“的Mapper对象有哪些内容: ?
我用的数据库版本太低,不能直接存入json,遂将原来json格式的文件转换成字符串 ¥=并用python自带的方法--eval()恢复成原样 例如:将列表里套着的字典类型的做处理 mes = [{'alert_settings...': '1'}, 'user_id': '35545633'}] # 将数据转成字符串格式 str_mes = str(mes) # 存数据库用 LONGTEXT 这个格式存大文件 # 将数据库拉下的数据用...mes_mysql表示 改格式后的数据用 new_mes_mysql表示 new_mes_mysql = eval(mes_mysql) print(type(new_mes_mysql)) 会发现格式是...list ,然后查看里边的格式是dict 成功!
QueryDSL是一个Java语言编写的通用查询框架,专注于通过JavaAPI方式构建安全的SQL查询。...本章目标 学习使用SpringBoot项目下SpringDataJPA与QueryDSL框架整合,完成多表关系复杂查询。...图15 上图5我们注入了EntityManager对象,因为我们构建JAPQuery对象需要它作为参数传入,使用QueryDSL查询的形式完全就是我们平时使用对象的形式那么简答,没有多余的内容!...图17 相对于单独的QueryDSL查询而言,整合的方式会更复杂一点,所以可以封装简单的查询对象来简化代码。...Inquirer 自定义查询实体类,该类可以完成查询添加封装,查询结果处理操作,具体代码如下图18、19所示: ? 图18 ?
可伸缩性:MergeTree引擎可以高效处理大规模的数据集。它支持分布式部署,可以水平扩展到数百台服务器,以处理高吞吐量的数据流。优化的查询性能:MergeTree引擎在查询性能方面经过了优化。...它使用了复杂的索引结构和预先计算的汇总数据,并通过数据分片和并行查询来提高查询性能。数据压缩:MergeTree引擎支持数据的压缩,可以大幅减少存储空间的占用。...合理选择数据分片大小、合并策略和分布式节点数量等参数,对于获得较好的性能非常重要。ClickHouse的MergeTree引擎支持复杂的数据查询和分析需求。...)PARTITION BY toYYYYMM(date)ORDER BY (date, product_id)为了满足数据查询和分析的需求,可以使用ClickHouse的SQL查询语句来完成各种操作。...这些查询和分析都是复杂的数据操作,ClickHouse的MergeTree引擎能够快速处理和返回结果。
本文实例讲述了thinkphp 3.2框架视图模型 实例视图查询结果的二维数组合并操作。...分享给大家供大家参考,具体如下: 使用视图模型查询的时候 结果是这样的 array(6) { [0] = array(5) { ["picTitle"] = string(7) "标题2"...16" ["pictureurl"] = string(55) "attachment/picture/uploadify/20141120/546da0784831c.png" } } 想要的结果是这样...picPostTime,pictureurl')- order('picPostTime desc')- select(); /* dump($PicModel- getLastSql()); 查询最后的...希望本文所述对大家基于ThinkPHP框架的PHP程序设计有所帮助。
你好,我是大彬 比 MyBatis 效率快 100 倍的条件检索引擎,天生支持联表,使一行代码实现复杂列表检索成为可能!...4、功能概述 支持 实体多表映射 支持 动态字段运算符 支持 分组聚合 查询 支持 Select | Where | From 子查询 支持 实体类嵌入参数 支持 字段转换器 支持 Sql 拦截器 支持...但查询,特别是有 多条件、联表、分页、排序 的复杂的列表查询,却一直是它们的弱项。...传统的 ORM 很难用较少的代码实现一个复杂的列表检索,但 Bean Searcher 却在这方面下足了功夫,这些复杂的查询,几乎只用一行代码便可以解决。...普通的复杂列表查询只需一行代码 单表检索可复用原有 Domain,无需定义 SearchBean 集成简单 可以和任意 Java Web 框架集成,如:SpringBoot、Spring MVC、Grails
1 开源项目简介 比 MyBatis 效率快 100 倍的条件检索引擎,天生支持联表,使一行代码实现复杂列表检索成为可能!...4 功能概述 特性 支持 实体多表映射 支持 动态字段运算符 支持 分组聚合 查询 支持 Select | Where | From 子查询 支持 实体类嵌入参数 支持 字段转换器 支持 Sql 拦截器...ORM 的强项,但查询,特别是有 多条件、联表、分页、排序 的复杂的列表查询,却一直是它们的弱项。...传统的 ORM 很难用较少的代码实现一个复杂的列表检索,但 Bean Searcher 却在这方面下足了功夫,这些复杂的查询,几乎只用一行代码便可以解决。...普通的复杂列表查询只需一行代码 单表检索可复用原有 Domain,无需定义 SearchBean 集成简单 可以和任意 Java Web 框架集成,如:SpringBoot、Spring MVC、Grails
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比 MyBatis 效率快 100 倍的条件检索引擎,天生支持联表,使一行代码实现复杂列表检索成为可能,绝无夸张之语! 开源协议 使用 Apache-2.0 开源协议。...功能概述 特性如下: 支持实体多表映射 支持动态字段运算符 支持分组聚合、查询 支持Select | Where | From 子查询 支持实体类嵌入参数 支持字段转换器 支持 Sql 拦截器 支持数据库...虽然增删改是 hibernate 和 mybatis、data-jdbc 等等 ORM 的强项,但查询,特别是有 多条件、联表、分页、排序的复杂的列表查询,却一直是它们的弱项。...传统的 ORM 很难用较少的代码实现一个复杂的列表检索,但 Bean Searcher 却在这方面下足了功夫,这些复杂的查询,几乎只用一行代码便可以解决。...: 普通的复杂列表查询只需一行代码 单表检索可复用原有 Domain,无需定义 SearchBean | 集成简单 可以和任意 Java Web 框架集成,如:SpringBoot、Spring MVC
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