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多组学在线分析工具

那拿 TCGA 的数据库而言,对于同一个患者,就检测了RNA-seq, miRNA-seq, 甲基化芯片等等多组学的数据。...对于这样有多组学数据的情况,除了基本的单一组学的分析,也可以尝试着融合多个组学一起分析。所以,今天就介绍一个多组学分析的工具。...聚类热图分析 在这个分析结果当中,可以观察基于多组学的数据各个样本的聚类分析的结果。这样的结果可以用来当作多组学的分子分型。 在聚类热图当中,除了可查看不同基因的聚类结果。...现在的降维是在多组学数据融合的基础上来进行降维的。 最后可以在一个三维的散点图上观察降维分析的结果。...总的来说 以上就是这个工具的主要使用过程了,OmicsAnalyst 主要还是用于对多组学的数据联合分析的时候,寻找多组学之间的联系(相关分析)或者通过聚类来寻找相关的多组学基因分型的时候可以使用。

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    空间多组 | NG | 使用多组学和生态空间分析对组织状态进行量化表征

    Para_05 我们介绍了MESA(多组学和生态空间分析),这是一个结合生态原理和多组学整合来解读组织重塑的框架。...基于计算机生成的多组学谱图,MESA表征每个细胞的局部邻域,以识别保守且独特的细胞邻域(图1a(ii))。 此过程聚合来自空间确定的邻居(例如,20个细胞)的多组学信息,以捕捉细胞环境。...◉ 这种整合丰富了空间组学数据,并创建了用于下游分析的虚拟多组学空间剖面。◉ 接下来是邻域识别,通过将每个细胞的k最近邻(k-NN)中的多组学信息聚合成邻域特征向量(NFV),捕捉局部细胞环境。...这些分析通过多组学方法得以实现,并且能够在复杂的细胞环境中揭示细微的功能通路。 这些分析是通过多组学方法实现的,并且可以揭示复杂细胞环境中微妙的功能通路。...结果一致表明,使用多组学信息能够更好地界定邻域(补充图2)。

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    单细胞多组学刻画EGCs特征

    本研究主要应用 scRNA-seq 和多组测序技术同时测量单个细胞核中的 ATAC 信号和 RNA 转录本(scMulti-seq)来描述 EGCs 的特征并研究神经元分化的动态变化。...多组测序揭示了神经球中 EGC 神经发生的染色质准备状态 Fig3. 小肠肌胶质细胞具有转录多样性,且包含准备用于神经发生的细胞 Fig4....肠道胶质细胞(EGCs)是神经元祖细胞 2 神经球内 EGC 向神经元转变的多组学分析揭示了一种为神经发生做好准备的染色质结构 然后神经球里的GFP+细胞测了 单细胞Multiome(细胞来源三只小鼠)...多组测序揭示了神经球中 EGC 神经发生的染色质准备状态 3 出生后小肠中的EGC具有转录多样性,包括具有神经发生所需的染色质结构的细胞 接着又用小鼠出生大约14天后的GFP+ 细胞测了单细胞Multiome

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    单片机为什么有多组VDD?

    但是现在的MCU通常却有多组电源引脚,这是什么原因呢?...以某款100脚MCU为例,可以看到它有5组VDD/VSS,并且会要求每一组VDD/VSS都要接上,实际上这多组VDD内部是互相连接在一起的,既然这样,那么芯片厂家为什么不只留一组出来呢?...或者说虽然留了多组出来,能不能外面只接一组呢?如果能这样既节约引脚,外面连接走线也更少。 如果外面只接一组VDD的话,电流在芯片内部经过的路径相对较长,如下图红色的线条。...多组VDD可以减少电感效应(电感并联总电感变小,路径变短电感也越小)。 可以把上述芯片供电的过程,想象成给一块田地灌溉的过程,如果只有一个进水口,肯定不如多个进水口一起进水好。...这时也需要分出来多组供电,常见的是复杂的SOC芯片。 3)多组VDD相比单个VDD,一个VDD引脚上经过的电流会减小,这样引脚不必承受过高的电流,增强可靠性。

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    TCGAG多组学联合分析数据库

    但是对于TCGA数据而言,里面包括相同样本的表达、突变、拷贝数、甲基化以及临床信息等数据,所以我们其实可以利用TCGA数据库来进行多组学之间的交叉分析。...今天我们就介绍一个TCGA多组学分析的经典数据库: cbioPortal(https://www.cbioportal.org/) ? ?...多组学比较分析:这个数据库能够进行多组学分析的选项也是在Plot里面。在Plot里面。这里结果的呈现是通过定义一个图片的X和Y轴的数据来进行分析的。...大家都进行一些多组学分析的时候,可以使用这个经典的数据库,还是挺好用的,而且所有的分析的图片以及数据都可以下载。...多组学文献精读05 | TCGA中的致癌信号通路(视频) 2020-05-16 可能是最出名的TCGA表达相关数据库(一) 2020-05-16 可能是最出名的TCGA表达分析数据库(二) 2020

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