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scRNA | 顶刊学分析,OR值展示不同分组的细胞类型差异

在对单细胞数据进行注释后,通常会使用柱形图比较 不同分组 之间的cluster/celltype差异 scRNA分析|单细胞文献Fig1中的分组umap图细胞比例柱形图,本文介绍张老师2021年发表于...<0.5标示不倾向在该分组中分布,详见文献methods),来比较不同分组(正常组织,肿瘤组织,PBMC,用药前后等)间cluster/celltype之间的分布差异 。...二 OR分析 1,载入单细胞数据 仍然使用之前的sce2数据,为减少计算量提取Myeloid亚群做示例 ,注意该分析 需要不同分组 的 cluster/celltype细胞数均不为 0。...这就完成了真实数据的OR分析,受限细胞数 分组,本图不是很美观。...考虑到OR值在文献中定义的0.5 1.5 值,这里设置bk参数。

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.NETC# 使用 #if Conditional 特性来条件编译代码的不同原理适用场景

然而实际上两者的编译处理是不同的,因此也有不同的应用场景。 于是我写到这篇文章当中。...---- 条件编译符号预处理符号 我们有时会使用 #if DEBUG 或者 [Conditional("DEBUG")] 来让我们的代码仅在特定的条件下编译。 而这里的 DEBUG 是什么呢?...这个叫做 “定义常量”(Define constants) 而在将 C# 代码编译到 dll 的编译环节,这个叫做 “预处理符号”(Preprocessor symbols) 本文要讨论的是 #if ...; #endif 在这段代码中,#if DEBUG #endif 之间的代码仅在 DEBUG 下会编译,在其他配置下是不会编译的。...场景 因为 #if DEBUG #endif 仅仅影响包含在其内的代码块,因此其仅仅影响写的这点代码所在的项目(或者说程序集)。于是使用 #if 只会影响实现代码。

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疑车无据:大熊猫何时交配才能怀上宝宝?四川学者用音频AI给出预测

他们在自己的研究中以人工方式定义了 5 种不同大熊猫叫声,并基于人工设计的声学特征使用聚类方法对叫声数据进行了分组。...他们没有使用人工定义的特征发声类型,而是使用了深度网络来学习不同的发声特征,自动预测交配成功率。 ? 图 1:基于大熊猫发声行为的自动交配成功率预测能更好地协助大熊猫繁殖。...图 2:CGANet 的结构,其主要由卷积模块、GRU 模块注意力模块构成 1. 卷积模块 卷积模块由三个完全一样的部件顺序连接而成。其中每个部件都由卷积层批归一化层构成。...然后如下方式对帧上的这些概率值求和: ? 如果 P_s > P_f,则预测发出输入音频段的叫声的大熊猫能成功交配,反之则预测结果为交配失败。 实验 ?...表 1:CGANet、FLDA SVM 的表现比较。加粗的结果为最佳。 ? 表 2:当使用不同的特征作为输入时,新提出的方法的表现。加粗的结果为最佳。 ?

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SQL索引优缺点

索引的优点:这个显而易见,正确的索引会大大提高数据查询,对结果进行排序、分组的操作效率。...因为出现了范围查找,如果一个索引一个索引的比较,在性能上比起直接聚集索引查找全部数据后再过滤来的差。那学分上的索引什么时候 SQL会优先考虑呢?...1、聚集索引的情况下:聚集索引将被插入更新的行指向特定的页,该页由聚集索引关键字决定; 2、只有堆的情况下:有空间就可以插入新的行,对行数据的更新需要更多的空间,如果大于了当前页的可用空间,行就被移到新的页中...第二:针对上述索引可能造成的页分页的解决方案,填充因子。 创建索引时,可以为索引指定一个填充因子,在索引的每个叶级页面上保留一定百分比的空间,将来数据可以进行扩充减少页分裂。...随着业务的变化,数据的变化,会发生有些索引的用处可能发生变化,例如: 1:原来主要靠用户名搜索记录,现在业务更改为用户所在城市搜索等等,此时我们需要即时变更表索引以适应新业务的变化,即数据使用模式发生了大幅度变化

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富集分析:GSEA 分析介绍

那么,将获得的两组数据进行一定处理后与先验知识归类的基因集合比对分析,将某个干预某个生物学功能变化联系起来,这个过程就叫富集分析。 4....二、分析前准备 进行分析之前需要准备 3 个文件:表达数据集、样品分组信息基因数据集。...表达数据集是测序或芯片获得的表达谱信息、样品分组信息是自己构建的文件、基因数据集是已知功能的基因集合。 表达数据集表达丰度排列,也就是上图中热图所展示的。...名义 p 值,因为它没有进行功能基因子集大小多重假设检验校正,因此称为名义 P 值,它描述的是针对某一功能基因子集得到的富集得分的统计显著性,p 值越小富集性越好。...错误发现率 FDR,该指标进行了功能基因子集大小多重假设检验矫正,用于判断假阳性率。

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.NET面试题解析(11)-SQL语言基础及数据库基本原理

查询平均成绩大于60分的同学的学号和平均成绩 GROUP BY 语句用于结合合计函数,根据一个或多个列对结果集进行分组。...查询不同老师所教不同课程平均分从高到低显示 select t.Name,c.Name, avg(sc.Score) from Score sc,Teacher t,Course c where sc....其实SQlServer也很简单,不同的版本也有些不同,可以参考:SQL Server 常用分页SQL 12....同时,页也是IO读取的最小单元(物理IO上不是行读取),也是所有权的最小单位。如果一页中包含了表A的一行数据,这页就只能存储表A的行数据了。...非聚集索引也是B树(B+树B-树)的结构,与非聚集索引的存储结构唯一不一样的,就是非聚集索引中不存储真正的数据行,因为在聚集索引中已经存放了所有数据,非聚集索引只包含一个指向数据行的指针即可。 ?

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SqlServer 索引

可以有多个,小于249个 索引类型:再次用汉语字典打比方,希望大家能够明白聚集索引聚集索引这两个概念。 唯一索引: 唯一索引不允许两行具有相同的索引值。...聚集索引(clustered index) 在聚集索引中,表中各行的物理顺序与键值的逻辑(索引)顺序相同。表只能包含一个聚集索引。例如:汉语字(词)典默认拼音排序编排字典中的每页页码。...默认拼音排序的字典,其索引顺序逻辑顺序是一致的。即拼音顺序较后的字(词)对应的页码也较大。如拼音“ha”对应的字(词)页码就比拼音“ba” 对应的字(词)页码靠后。...例如,笔画排序的索引就是非聚集索引,“1”画的字(词)对应的页码可能比“3”画的字(词)对应的页码大(靠后)。 提示:SQL Server中,一个表只能创建1个聚集索引,多个非聚集索引。...–         该列用于频繁搜索 –         该列用于对数据进行排序 •          请不要使用下面的列创建索引: –         列中仅包含几个不同的值。

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.NET面试题解析(11)-SQL语言基础及数据库基本原理

查询平均成绩大于60分的同学的学号和平均成绩 GROUP BY 语句用于结合合计函数,根据一个或多个列对结果集进行分组。...查询不同老师所教不同课程平均分从高到低显示 select t.Name,c.Name, avg(sc.Score) from Score sc,Teacher t,Course c where sc....其实SQlServer也很简单,不同的版本也有些不同,可以参考:SQL Server 常用分页SQL 12....同时,页也是IO读取的最小单元(物理IO上不是行读取),也是所有权的最小单位。如果一页中包含了表A的一行数据,这页就只能存储表A的行数据了。...非聚集索引也是B树(B+树B-树)的结构,与非聚集索引的存储结构唯一不一样的,就是非聚集索引中不存储真正的数据行,因为在聚集索引中已经存放了所有数据,非聚集索引只包含一个指向数据行的指针即可。 ?

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【SQL Server】创建索引

聚集索引:非聚集索引指定表的逻辑顺序。 数据存储在一个位置,索引存储在另一个位置,索引中包含指向数据存储位置的指针。 可以有多个,小于249个。 唯一索引:唯一索引不允许两行具有相同的索引值。...CLUSTERED|NONCLUSTERED] INDEX index_name ON table_name [WITH FILLFACTOR=X] [WITH FILLFACTOR=X] 填充因子...:指定0-100之间的值,表示索引页填充的百分比 使用T-SQL语句删除索引 DROP INDEX table_name.index_name 表名索引名称之间,用“.”分开 索引创建示例 在...Students表的StudentName列创建非聚集索引 use StudentManager go if exists(select name from sysindexes where name...创建索引的原则 按照下列标准选择建立索引的列 - 频繁搜索的列 - 经常作为查询选择的列 - 经常排序、分组的列 请不要使用下面的列创建索引 - 仅包含几个不同值得列 如男,女 -

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河狸生存记:90后女博士与AI开发者们

、河水旱涝、人为活动等方面对河狸的生存情况所造成的影响; 河狸对周围生态环境的影响,如是否有更多的物种在河狸制造的小生境内聚集,被河狸制造的小生境聚集来的物种在数量上是否每年有增长; 河狸的繁衍数据,如生育情况幼崽存活率...,当相机能够全面覆盖每一窝河狸,通过对周围的生态环境因子拍摄分析就能发现更多可以帮助河狸提升种群数量的地方。...在科研数据的基础上,协会决定发起一个叫做「河狸食堂」的公益项目,在更多自然生境因子与河狸栖息地接近的区域来种植灌木柳,人工为河狸修复栖息地环境,从而解决河狸的吃饭问题繁衍环境问题。...2020年,一次偶然的机会,初雯雯与协会成员在新闻中看到我国的科学家用 AI 技术识别不同大熊猫个体,效果很好,心中灵机一动:AI 或许也可以帮助解决河狸识别与图像数据处理的问题。...它们会自己修水坝,围成一个小池塘,粪便养活一些水草藻类。有了水生植物,就会吸引到鱼类聚集,鱼类又会吸引水鸟、狐狸、金雕、獾类等等,但凡有河狸巢穴所在的地方,都会变得生机勃勃。

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MySQL(五)汇总和分组数据

②获得表中行组的 ③找出表列(或所有行或某些特定的行)的最大值、最小值和平均值 聚集函数(aggregate function):运行在行组上,计算返回单个值的函数(MySQL还支持一些列的标准偏差聚集函数...(sum()函数忽略列值为null的行) 6、distinct与聚集函数 MySQL5.0.3以及之后的版本,聚集函数distinct可以搭配使用,比如: ①对所有的行执行计算,指定all参数或不给参数...,返回四个值(products表中items的数目、price的最高、最低以及平均值) PS:在指定别名以包含某个聚集函数的结果时,不应该使用表中实际的列名;这样便于使用SQL更加容易理解,以及排除方便排除错误...)的那些分组; havingwhere的区别: where在数据分组前进行过滤,having在数据分组后进行过滤;where排除的行不包括在分组中(这可能会改变计算值,从而影响having子句中基于这些值过滤掉的分组...2或2以上的分组; 3、分组排序 group byorder by的区别: ?

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大熊猫“丫丫”相关商标已被注册

2003年4月,三岁的大熊猫“丫丫”大熊猫“乐乐”一同前往美国田纳西州孟菲斯动物园,开始了近二十年的旅居生活。...此外,熊猫界的其他顶流“熊猫花”“熊猫萌兰”“熊猫乐乐”等相关商标也已被注册。...成都大熊猫繁育研究基地在今年4月开始注册申请多个熊猫“花”相关商标,这些商标涉及国际分类第28类、第39类、第12类、第41类等。...早在成都大熊猫繁育研究基地申请注册熊猫“花”的商标前就已有企业申请注册该商标,这些企业无疑是想利用大熊猫的流量蹭热度,提前抢注商标好为日后牟利。...由于不同地区商标政策不同,并且商标注册具有一定的时间周期,提前了解注册地区商标注册规则,以免影响后续品牌拓宽市场的发展。

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RNA-seq 详细教程:样本质控(6)

图片我们从cage因子开始,但cage因子似乎无法解释 PC1 或 PC2 上的变化。图片然后,我们 sex 因素着色,这似乎在 PC2 上分离样本。...图片接下来我们探索 strain 因子,发现它可以解释 PC1 上的变化。图片很高兴我们能够确定 PC1 PC2 的变异来源。...我们的期望是样本聚集在一起类似于我们在 PCA 图中观察到的分组。在下图中, Wt_3 KO_3 样本没有与其他重复聚类在一起。我们想要探索 PCA 以查看我们是否看到相同的样本聚类。图片5....您不只是获得转换值矩阵的原因是因为用于计算 rlog 转换的所有参数(即大小因子)都存储在该对象中。我们使用此对象绘制 PCA 层次聚类图以进行质量评估。5.2....此外,与 PCA 图类似,您会看到样本样本组聚集在一起。总之,这些图向我们表明数据质量很好,我们有信心可以进行差异表达分析。

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RNA-seq 详细教程:样本质控(6)

PCA_1 我们从cage因子开始,但cage因子似乎无法解释 PC1 或 PC2 上的变化。 cage 然后,我们 sex 因素着色,这似乎在 PC2 上分离样本。...sex 接下来我们探索 strain 因子,发现它可以解释 PC1 上的变化。 strain 很高兴我们能够确定 PC1 PC2 的变异来源。...我们的期望是样本聚集在一起类似于我们在 PCA 图中观察到的分组。 在下图中, Wt_3 KO_3 样本没有与其他重复聚类在一起。我们想要探索 PCA 以查看我们是否看到相同的样本聚类。...您不只是获得转换值矩阵的原因是因为用于计算 rlog 转换的所有参数(即大小因子)都存储在该对象中。我们使用此对象绘制 PCA 层次聚类图以进行质量评估。 5.2....此外,与 PCA 图类似,您会看到样本样本组聚集在一起。总之,这些图向我们表明数据质量很好,我们有信心可以进行差异表达分析。 ----

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Python Data Structures - C1 Search

2.folding method: 分组求和再取余数 ? 3.mid-square method:平方值的中间两位数取余数 ?...常用的解决冲突的办法: 1.open address(开放寻址):线性探测(linear probing)下一个位置,缺点是容易造成聚集现象(cluster),解决聚集现象的办法是跳跃式地查找下一个空槽...分析hash查找的性能:一般使用平均查找长度来衡量,装载因子有关 散列表的载荷因子定义为:$\alpha$ = 填入表中的元素个数 / 散列表的长度 $\alpha$是散列表装满程度的标志因子。...实际上,散列表的平均查找长度是载荷因子$\alpha$的函数,只是不同处理冲突的方法有不同的函数。 对于开放定址法,荷载因子是特别重要因素,应严格限制在0.7-0.8以下。...因此,一些采用开放定址法的hash库,如Java的系统库限制了荷载因子为0.75,超过此值将resize散列表。 ? From wiki ?

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alphalens教程2--基于return的因子分析

by_date : bool        是否天计算收益率      by_group : bool        是否组别来计算收益率     demeaned : bool        ...当然,我们也可以不分组。...,也可以没有分组的,一般建议不分组或者按照行业分组     by_group : bool         如果mean_ ret的数据是安按照group分组的,那么这里也需要设置为True.    ...,效果大概如下吗,每个行业,五层因子值中每层在不同周期下的收益率均值的直方图。...4.各层因子累计收益率图 对于一个因子,我们希望好的分层差的分层的收益率有很大的差别,也就是说,因子的区分度越好,我们越觉得因子有效。下面这个函数能够计算出不同分层下的投资累计收益回报。

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新闻情绪因子进阶来啦!

表1 新闻情绪样例数据 我们将测试基于以上步骤计算的情绪得分平均分因子情绪得分总分因子,并分别命名为SENTI_MEANSENTI_TOTAL。...我们20分的区间将因子值的范围[-100,100]划成了10个区间,进而观察每个区间出现的股票的数量及收益率表现。...表2 因子分布统计数据 图4 分组收益率统计 基于以上的结论,我们在进行分组时并没有采用等分的方法,而是采用了以下两种方法: a) 固定分位数法(SENTI_MEAN_1D/QUANTILE): 每日以下分位数区间...图8 SENTI_MEAN_1D因子IC序列 因子的分层性预测性固然重要,但最终还是要看交易的可行性,A股的换仓成本极大的限制了中高频多因子策略的收益,因子的换手率可以直观的反映交易成本,下表给出了不同调仓周期的各组平均换手率...图12 SENTI_TOT_1D/QUANTILE分组收益累计 总结 本篇推文我们主要测试了日度情绪因子,包括日度情绪平均分因子SENTI_MEAN_1D及日度情绪总分因子SENTI_TOT_1D,并对比了不同分组方法的效果

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野生大熊猫面部已被成功“认出”

作者 | 来自镁客星球的毛毛 据新华社报道,大熊猫国家公园卧龙片区首次通过红外触发相机实时监测系统成功实时回传野生大熊猫影像,并在四天后同一点位再次记录到野生大熊猫。...报道表示,今年4月,在卧龙牛头山海拔约3200米左右区域,一台红外触发相机分别两次拍到大熊猫在竹林中漫步的身影,并通过系统实时提示了卧龙管理局的工作人员,以便其及时通过远程视频下载并清晰地看到所传回的实况影像...据称,这是全国首次结合超短波传输“猫脸”识别技术,实现荒野监测实况无线传输野生大熊猫视频。...卧龙管理局表示,不同于传统的红外触发相机数据提取的滞后性,新技术能实时掌握动物活动情况,实时了解红外触发相机状态,保障各点位的有效监测,还有覆盖面广、监测点位多、太阳能供电等优点。...除此之外,“猫脸”人工智能识别系统在对大量卧龙大熊猫历史图片的学习后,能通过动物面部识别筛选出大熊猫,从而可以帮助管理局更好的了解大熊猫的行为。

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大熊猫迎来熊生高光时刻,以后终于可以认清我了

VGGNet由5个卷积模块,3个全连接层一个软-max连接层组成。 此次数据集有65000张大熊猫面部图像,平均每只4300张。...这也改变了之前识别监测大熊猫的传统方法。 比如: 1、 基于经验的人工视觉识别 其实就是靠你的脚力,眼力以及各大感觉支撑。这对于一般人比如我来说,仅仅是眼力就是不可能实现滴。...但是大熊猫的移动距离受到多种因素的影响,很难获取区别不同个体的阈值。 3、 分子生物学法 换句话说,就是提取大熊猫粪便里的DNA来识别熊猫个体。...同时也会消耗很多的人力物力。 ? 4、 GPS定位项圈跟踪 顾名思义,就是对需要监测的个体麻醉并佩戴GPS项圈。 这样的话,就能够准确追踪,并能实时获取需要的行为数据。...另一方面,也是我们所更加重视的方面,即野生大熊猫的保护工作,我们下一步工作将考虑结合目前在野外监测中应用广泛的红外相机,收集更多的野生大熊猫个体照片,对这些数据进行识别,从而建立野生大熊猫种群身份库,并实现及时监测大数据分析

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