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R语言指定取交集然后合并多个数据简便方法

思路是 先把5份数据基因名取交集 用基因名给每份数据做行名 根据取交集结果来提取数据 最后合并数据 那期内容有人留言了简便方法,很短代码就实现了这个目的。...我将代码记录在这篇推文里 因为5份数据以csv格式存储,首先就是获得存储路径下所有的csv格式文件文件名,用到命令是 files<-dir(path = "example_data/merge_data...相对路径和绝对路径是很重要<em>的</em>概念,这个一定要搞明白 pattern参数指定文件<em>的</em>后缀名 接下来批量将5份<em>数据</em>读入 需要借助tidyverse这个包,用到<em>的</em>是map()函数 library(tidyverse...) df<-map(files,read.csv) class(df) df是一个列表,5份<em>数据</em>分别以<em>数据</em>框<em>的</em>格式存储在其中 最后是合并<em>数据</em> 直接一行命令搞定 df1<-reduce(df,inner_join...之前和一位同学讨论<em>的</em>时候他也提到了tidyverse整理<em>数据</em>,但是自己平时用到<em>的</em><em>数据</em>格式还算整齐,基本上用<em>数据</em>框<em>的</em>一些基本操作就可以达到目的了。

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R-rbind.fill|数不一致多个数据“智能”合并,Get!

Q:多个数据数不一致,列名也不一致,如何按行合并,然后保留全部文件变量并呢? A:使用 rbind.fill 函数试试!...数据合并时,可以根据merge 或者 dplyr函数包merge系列函数决定连接方式,达到数据合并需求。...data1,data2,data3 数不一致,列名也不一致,现在需要按行合并,可能问题: 1)rbind: 是根据行进行合并(行叠加)但是要求rbind(a, c)矩阵a、c数必需相等。...2)数相同时候,变量名不一致也会合并,导致出错 二 rbind.fill“智能”合并 数不一致多个数据,需要按行合并,尝试使用plyr包rbind.fill函数 library(plyr) rbind.fill...呐,就是这样,rbind.fill函数会自动对应数据列名,不存在会补充,缺失时NA填充。

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Seaborn从零开始学习教程(三)

本次将主要介绍数据分布可视化使用。 数据分布可视化 当处理一个数据时候,我们经常会想要先看看特征变量是如何分布。...这会让我们对数据特征有个很好初始认识,同时也会影响后续数据分析以及特征工程方法。本篇将会介绍如何使用 seaborn 一些工具来检测单变量和双变量分布情况。 首先还是先导入需要模块和数据。...绘制单变量分布 在 seaborn ,快速观察单变量分布最方便方法就是使用 distplot() 函数。默认会使用直方图 (histogram) 来绘制,并提供一个适配核密度估计(KDE)。...当绘制直方图时,你最需要确定参数是矩形条数目以及如何放置它们。...可视化数据集成对关系 为了绘制数据集中多个成对双变量,你可以使用 pairplot() 函数。这创建了一个轴矩阵,并展示了在一个 DataFrame 每对关系。

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,当Pandas遇上Excel会擦出什么样火花呢?!

或者使用豆瓣镜像 pip install -i https://pypi.douban.com/simple xlsxwriter 安装成功之后,来看一下如何使用 将多个DataFrame数据保存到...我们来实现一下如何多个DataFrame数据保存在一张Excel表格当中,并且分成不同sheet import pandas as pd # 创建几个DataFrame数据 df1 = pd.DataFrame...Sheet当中分别存放着指定数据多个DataFrame数据放在一张Sheet当中 将多个DataFrame数据放在同一张Sheet当中,通过当中参数startcol与startrow,顾名思义就是从哪一行...Sheet1', startrow=10, startcol=15, header=False, index=False) writer.save() 如下图所示 针对表格数据绘制直方图...下面我们来看一下,如何利用Pandas来根据表格数据绘制柱状图,并且保存在Excel表格当中,在xlsxwriter模块当中有add_chart()方法,提供了9图表绘制方法,我们先来看一下柱状图绘制

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数据分析之Pandas快速图表可视化各类操作详解

下面就让我们来了解一下如何快速出图。 此篇博客篇幅较长,涉及到处理文本数据(str/object)等各类操作,值得细读实践一番,我会将Pandas精华部分挑出细讲实践。...: 可以使用plot()x和y关键字绘制与另一对比,比如我们想要使用星期六客流量和星期日客流量作对比: df_flow_7=df_flow[df_flow['日期']=='星期日'].iloc...现有接口DataFrame.hist,但仍然可以使用hist绘制直方图 plt.figure() df_flow_mark['风级'].hist()  DataFrame.hist()可以在多个子地块上绘制直方图...,因为上限和下限都差很多,用集中数据更好展现效果。...在本例,位置由a和b给出,而值由z给出。这些箱子通过NumPymax函数进行聚合。

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Python得可视化:使用Seaborn绘制常用图表

从Kaggle获得谷歌播放商店数据 现在,让我们看看如果我们绘制来自上述数据“Rating”分布图是怎样, #importing all the libraries import numpy...Rating数 根据上面的输出,由于“只有18岁以上成年人”和“未分级”数量比其他要少得多,我们将从内容分级删除这些类别并更新数据。...更新数据Rating计数 现在,让我们为Rating中出现类别绘制饼图。...此图是机器学习领域最强大可视化工具。 让我们看看数据评级和大小两个数字散点图是什么样子。首先,我们将使用matplotlib绘制图,然后我们将看到它在seaborn样子。...让我们为数据评论、大小、价格和评级创建一对图。 我们将在代码中使用sns.pairplot()一次绘制多个散点图。

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手把手教你用plotly绘制excel中常见16种图表(下)

不含任何分层数据(类别的一个级别)旭日图与圆环图类似,但具有多个级别的类别的旭日图显示外环与内环关系。...旭日图在显示一个环如何被划分为作用片段时最有效,而另一种类型分层图表树状图适合比较相对大小。...直方图 直方图是显示频率数据柱状图。...漏斗图 漏斗图显示流程多个阶段值。 例如,可以使用漏斗图来显示游戏注册付费流程每个阶段潜在玩数。通常情况下,值逐渐减小,从而使条形图呈现出漏斗形状。...股价图 以特定顺序排列在工作表或行数据可以绘制为股价图。 顾名思义,股价图可以显示股价波动。

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Python Seaborn综合指南,成为数据可视化专家

用分类数据绘图 抖动图 Hue图 箱线图 小提琴图 Pointplot 在上面的小节,我们了解了如何使用不同视图表示来显示多个变量之间关系。我们绘制了两个数值变量之间关系图。...使用Seaborn绘制Pointplot 另一种类型图是pointplot,这个图指出估计值和置信区间。Pointplot连接来自相同色调类别的数据。这有助于识别特定色调类别关系如何变化。...当我们将多个概念组合成一个概念时,我们很容易将这个概念形象化。这里群图将色调语义属性和性别属性作了分面处理。 可视化数据分布 无论何时处理数据,我们都想知道数据或变量是如何分布。...可视化数据集中成对关系 我们还可以使用seaborn库pairplot()函数来绘制数据集中多个二元分布。这显示了数据每一之间关系。并绘制各变量在对角线上单变量分布图。...我们看到了seaborn库在可视化和研究数据(尤其是大型数据)时是如何如此有效。我们还讨论了如何为不同类型数据绘制seaborn库不同函数。

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R语言进阶之图形合并

函数par( )使用 在使用函数par( )时, 你需要添加参数mfrow=c(n, m) 去创建一个n行 x m 画布,画布每一格可以放一张图片,此时图片是按照行排列。...# 创建一个2行2画布 # 使用mtcars数据作为示例 attach(mtcars) # 固定数据 par(mfrow=c(2,2)) # 2行2画布,按行排列 plot(wt,mpg,...# 创建3行1画布 attach(mtcars) # 固定数据 par(mfrow=c(3,1)) # 3行1画布,按行排列 hist(wt) # 绘制变量wt直方图 hist(mpg) #...绘制变量mpg直方图 hist(disp) # 绘制变量disp直方图 ?...关于图形合并就讲到这里,在后续内容我会简单和大家介绍一下如何使用“cowplot”包来对ggplot对象进行合并,敬请期待!

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可视化绘制技巧|对多图合理排版布局

通常而言,在绘制图形时候都是绘制某一种类型一张图形,例如绘制一张散点图,绘制直方图。但有的时候我们希望同时展示多幅图形,可能是因为这些图形有某种联系,需要共同展示才能够更好表达数据蕴含信息。...之前介绍边际图形就是这样一个例子。本章节会介绍,当我们绘制了好了多幅图形之后,如何将多幅图形合并起来。...图6 合并多幅图形 从图中可以看到,图形左方变成了直方图,这是因为矩阵第一都是1。右边由于三幅图形构成。...使用ggExtra包可以非常轻松在图形添加边缘分布图,可以添加图形包括直方图,箱线图和密度图。 下面的代码首先绘制了一幅散点图,然后添加了边际图形,如图7所示。...xmin, xmax:数据坐标x位置(水平位置)。 ymin, ymax:数据坐标y位置(垂直位置)。 通过下面的步骤可以在一幅散点图中添加图形元素: 首先创建一幅散点图。

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Python Seaborn (3) 分布数据可视化

直方图通过在数据范围内切成数据片段,然后绘制每个数据片段观察次数,来表示整体数据分布。 为了说明这一点,我们删除密度曲线并添加了地毯图,每个观察点绘制一个小垂直刻度。...可以通过cut参数来控制绘制曲线极值值距离; 然而,这只影响曲线绘制方式,而不是曲线如何拟合: ?...拟合参数分布 还可以使用distplot()将参数分布拟合到数据,并可视化地评估其与观察数据对应关系: ? 绘制双变量分布 在绘制两个变量双变量分布也是有用。...HexBin图 直方图双变量类似物被称为“hexbin”图,因为它显示了落在六边形仓内观测数。该图适用于较大数据。...呈现数据集中成对关系 要在数据集中绘制多个成对双变量分布,可以使用pairplot()函数。这将创建一个轴矩阵,并显示DataFrame每对关系。

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Seaborn-让绘图变得有趣

但是,由于这不是分类数据,并且只有一个分类,因此决定使用它。 seaborn地块也可以text使用来添加到每个条annotate。在仔细查看数据时,发现缺少许多元数据信息。...例如,该具有尚未在任何地方描述ocean_proximity值<1H OCEAN。人们应该始终收集元数据信息,并使用具有适当信息数据。由于这只是用于理解图参考数据,因此没什么大不了。...可以将其理解为该特定数据直方图,其中黑线是x轴,完全平滑并旋转了90度。 热图 相关矩阵可帮助了解所有功能和标签如何相互关联以及相关程度。...联合图 联合图是要绘制两个要素散布图与密度图(直方图组合。seaborn联合图甚至可以使用kindas 甚至单独绘制线性回归reg。...数据点揭示了数据如何分布。 对图 该对图会在每对特征和标签之间产生大量图集。对于特征/标签每种组合,此图均显示一个散点图,对于其自身每种组合,均显示一个直方图

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50种常见Matplotlib科研论文绘图合集!赶紧收藏~~

np.r_是按连接两个矩阵,就是把两矩阵上下相加,要求数相等,类似于pandasconcat()。...下图显示了数据各组之间最佳拟合线差异。要禁用分组并仅为整个数据绘制一条最佳拟合线,请从下面的sns.lmplot()调用删除hue ='cyl'参数。...针对每绘制线性回归线 或者,可以在其每显示每个组最佳拟合线。...结果,多个绘制会重叠并隐藏。为避免这种情况,请将数据点稍微抖动,以便您可以直观地看到它们。使用 seaborn stripplot() 很方便实现这个功能。...42、带有误差带时间序列 (Time Series with Error Bands) 如果您有一个时间序列数据,每个时间点(日期/时间戳)有多个观测值,则可以构建带有误差带时间序列。

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Python数据可视化,完整版操作指南(建议收藏)

我们将从最基本可视化开始,直接查看数据,然后继续绘制图表,最后制作交互式图表。 ? 数据 我们将使用两个数据来适应本文中显示可视化效果,数据可通过下方链接进行下载。...我们要做第一件事是可视化一些示例,查看这些示例包含了哪些、哪些信息以及如何对值进行编码等等。...使用命令描述,我们将看到数据如何分布,最大值,最小值,均值…… df.describe() ? 使用info命令,我们将看到每包含数据类型。...另一个最受欢迎是配对图,它向我们显示了所有变量之间关系。如果您有一个大数据,请谨慎使用此功能,因为它必须显示所有数据次数与有次数相同,这意味着通过增加数据维数,处理时间将成倍增加。...我想提到这个库,因为也许在他们示例画廊,我们可以找到一些可以帮助我们特定图形。 ? Folium Folium是一项研究,可以让我们绘制地图,标记,也可以在上面绘制数据

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0.052秒打开100GB数据?这个Python开源库这样做数据分析

无论如何,让我们从极端异常值或错误数据输入值开始清除此数据。一个很好方法是使用describe方法对数据进行高级概述,其中显示了样本数、缺失值数和每一数据类型。...如果数据类型为数字,则还将显示平均值、标准偏差以及最小值和最大值。所有这些统计信息都是通过对数据一次传递来计算。 ?...由于我们正在使用如此大数据,因此直方图是最有效可视化效果。使用Vaex创建和显示直方图和热力图速度很快,而且图表可以交互! ?...由于这是一个连续变量,因此我们可以绘制行程距离分布图。让我们绘制一个更合理范围直方图。 ? 纽约出租车数据行程距离直方图 从上图可以看出,出行次数随着距离增加而减少。...如果你对探索本文中用到数据感兴趣,可以直接在 S3 配合 Vaex 使用它,请参阅完整 Jupyter notebook 了解如何实现。

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这才是你寻寻觅觅想要 Python 可视化神器!

在这个最终版本,让我们在这里调整一些显示,因为像“gdpPercap” 这样文本有点难看,即使它是我们数据名称。...因为这是地理数据,我们也可以将其表示为动画地图,因此这清楚地表明 Plotly Express 不仅仅可以绘制散点图(不过这个数据缺少前苏联数据)。 ?...甚至是 动画帧到数据框(dataframe)。...仅接受整洁输入所带来最终优势是它更直接地支持快速迭代:您整理一次数据,从那里可以使用 px 创建数十种不同类型图表,包括在 SPLOM 可视化多个维度 、使用平行坐标、在地图上绘制,在二维、三维极坐标或三维坐标中使用等...您可以使用 color_discrete_map (以及其他 * _map 参数)将特定颜色固定到特定数据值(如果这对您示例有意义)。

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0.052s 打开 100GB 数据,这个开源库火爆了!

这将我们引向另一个重点:Vaex只会在需要时遍历整个数据,并且会尝试通过尽可能少数据传递来做到这一点。 无论如何,让我们从极端异常值或错误数据输入值开始清除此数据。...所有这些统计信息都是通过对数据一次传递来计算。 使用describe方法获得 DataFrame 高级概览,注意这个 DataFrame 包含 18 数据,不过截图只展示了前 7 。...由于我们正在使用如此大数据,因此直方图是最有效可视化效果。使用Vaex创建和显示直方图和热力图速度很快,而且图表可以交互!...由于这是一个连续变量,因此我们可以绘制行程距离分布图。让我们绘制一个更合理范围直方图。 纽约出租车数据行程距离直方图 从上图可以看出,出行次数随着距离增加而减少。...如果你对探索本文中用到数据感兴趣,可以直接在 S3 配合 Vaex 使用它,请参阅完整 Jupyter notebook 了解如何实现。

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8000 字 Python 数据可视化实操指南

我们将从最基本可视化开始,直接查看数据,然后继续绘制图表,最后制作交互式图表。 我们将使用两个数据来适应本文中显示可视化效果,数据可通过下方链接进行下载。...该数据包含了两个文件temporal.csv和mapa.csv。 在这个教程,我们将更多使用第一个包括随时间推移(从2004年到2020年)三个术语受欢迎程度数据。...我们要做第一件事是可视化一些示例,查看这些示例包含了哪些、哪些信息以及如何对值进行编码等等。...如果您有一个大数据,请谨慎使用此功能,因为它必须显示所有数据次数与有次数相同,这意味着通过增加数据维数,处理时间将成倍增加。...我想提到这个库,因为也许在他们示例画廊,我们可以找到一些可以帮助我们特定图形。 7. folium Folium是一项研究,可以让我们绘制地图,标记,也可以在上面绘制数据

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