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利用python绘制EC数据全国降水图

Python的绘图功能非常强大,在大气和海洋常常用来绘制一些有关地理方面的图。本片主要介绍python绘制EC数据(grib格式)的的全国降水分布图。...总体流程:首先利用pygrib读取grib数据中的累计降水量数据,然后利用matplotlib进行绘图,其中利用cartopy进行地图shp文件的处理,并绘制南海小地图。.../国家基础地理数据400万/国界线.shp').geometries() # 绘制中国国界省界九段线等等 ax.add_geometries(china, proj,facecolor='none',edgecolor...所以在绘制地图时,特别是有国家分界线的一定多加要小心。 获取国家基础地理数据,加载全国shp文件,可以后台回复chinashp获取链接。 关注气海同途,获取更多大气海洋数值模拟相关内容。...WRF中使用SRTM高分辨率的地形资料 构建适合大气与海洋应用的Anaconda环境 WRF后处理:降雨量的说明以及降雨的绘制 python爬取中央气象台台风网当前台风实况和预报数据

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    基因型数据绘制PCA图和聚类分析图

    下面看一下利用基因型SNP数据进行PCA计算,以及可视化的分析。 很多软件可以分析PCA,这里介绍一下使用plink软件和R语言,进行PCA分析,并且使用ggplot2绘制2D和3D的PCA图。...绘制后的图如下: 2-D PCA图: 图片解释,将每个品种用不同的颜色表示,同时绘制置信区间圆圈,X坐标是PC1,解释24.9%的变异,Y坐标是PC2,解释10.61%的变异。...可以看到,三个品种在PCA图里面分的比较开,C品种的有两个A和B的点,应该是异常数据。 基因型数据: 共有3个品种A,B,C,共有412个个体。...,将其转化为0,1,2的形式 2,计算G矩阵 3,计算PCA的特征向量和特征值 4,根据特征值计算解释百分比 5,根据特征向量和品种标签,进行PCA的绘制 绘制代码如下: 首先,使用plink命令...然后使用R语言,计算PCA,并绘制PCA图。

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    【数据结构】排序算法---计数排序(动图演示)

    定义 计数排序又称为鸽巢原理,是对哈希直接定址法的变形应用。计数排序不是基于比较的排序算法,其核心在于将输入的数据值转化为键存储在额外开辟的数组空间中。...作为一种线性时间复杂度的排序,计数排序要求输入的数据必须是有确定范围的整数。 2....算法步骤 算法的步骤如下: (1)找出待排序的数组中最大和最小的元素 (2)统计数组中每个值为i的元素出现的次数,存入数组C的第i项 (3)对所有的计数累加(从C中的第一个元素开始,每一项和前一项相加)...动图演示 4. 性质 稳定性: 计数排序是一种稳定的排序算法。...空间复杂度: 计数排序的空间复杂度为 O(range) 时间复杂度: 计数排序的时间复杂度为 O(n + range) , 其中range代表待排序数据的值域大小,也就是下面算法分析中的k 5.

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    Python数据分析之Seaborn(热图绘制)

    Seaborn热图绘制 %matplotlib inline import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np; np.random.seed(0)...) 或 RdBu_r (数据集为离散数据集时) center:将数据设置为图例中的均值数据,即图例中心的数据值;通过设置center值,可以调整生成的图像颜色的整体深浅;设置center数据时,如果有数据溢出...如果是False,则不绘制列名。如果是列表,则绘制列表中的内容作为xticklabels。 如果是整数n,则绘制列名,但每个n绘制一个label。 默认为True。...0.96513582 0.57781451 0.96400349]] # 改变颜色映射的值范围 ax = sns.heatmap(uniform_data, vmin=0.2, vmax=1) #为以0为中心的数据绘制一张热图...(flights) #绘制热图 ax = sns.heatmap(flights, annot=True,fmt="d") #在heatmap中每个方格写入数据,按照整数形式 ax = sns.heatmap

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    maftools包分析突变数据,绘制瀑布图

    前面给大家介绍了MAF文件格式 ☞ MAF格式(mutation annotation format) 以及如何从TCGA数据库下载MAF格式的突变数据。...☞ 如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somatic mutation) 今天我们来讲讲,怎么用R的maftools包来分析MAF格式的突变数据,并用瀑布图来展示结果。...我们先用maftools包自带的数据,给大家讲解这个包的使用方法。后面再来实战,重现SCI文章中的瀑布图。...接下来我们就可以来绘制瀑布图了,我们可以通过top来控制展示多少个突变最多的基因,这里展示20个突变最多的基因。...具体可以查看左下角的图注。右边的柱形图表示包含该基因突变样本的占比,以及突变类型的组成。 到这里我们瀑布图的绘制就完成了,是不是很简单。后面我们会找一篇SCI文章中的瀑布图来复现。

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    ggplot2绘制科研数据柱状图~

    导语 GUIDE ╲ ggplot2是一个神奇的R包,可以可视化各种各样的统计数据。 背景介绍 ggplot2是一个神奇的R包,可以将自己的统计数据绘制成想要的图案。...那么首先呢,大家在可视化自己的科研数据时,最最最常用的就是绘制一个带误差或者显著值的柱状图。...#ggplot绘制柱状图 ggplot(frame,aes(group,num,fill=group)) + geom_col() 03 修改一些参数 我们发现柱状图有一丢丢粗糙,那就修改一下高度宽度...由于数据比较复杂不方便自己创建,我们这里使用ggplot2自带的汽车数据集mpg为例绘制叠加柱状图。 如果我们直接绘制原始数据的柱状图,显示的是每种汽车种类及其个数。...ggplot(mpg,aes(x=class)) + geom_bar() 但是如果绘制堆叠图,就可以把多维度数据融合进来,例如汽车的年份(year),手动档还是自动档(trans)等。

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    实现绘制Sankey桑基图(河流图、分流图)流程数据可视化

    p=24996 我一直在寻找一种直观的方法来绘制流程中状态之间的流程或连接。R软件恰好满足了我的需求。 将数据设置为正确的格式是一个比较麻烦的过程。现在,本文仅说明如何构建多级图。...从边开始,然后使用这些数据提取节点。 边数据帧由具有“从”节点(N1)和“至”节点(N2)的记录以及它们之间的流的值组成。在这里,我系统地构建了一个随机流网格,并删除了一些破坏对称性的记录。...> eges = data.frame > > head(eges) 然后从边数据帧中提取节点的名称。根据标签计算节点的水平和垂直位置。...> plot 结论 通过仔细观察,可以得到不少信息,桑基图绘制目的就是让各类别间的区别和联系更加直观展现出来。今天的分享到此结束,下次再见!...---- 本文摘选《R语言实现绘制Sankey桑基图(河流图、分流图)流程数据可视化》

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    Python绘制时间序列数据的时序图、自相关图和偏自相关图

    时序图、自相关图和偏相关图是判断时间序列数据是否平稳的重要依据。...另外,绘制自相关图的函数plot_acf()和绘制偏自相关图的函数plot_pacf()还有更多参数可以使用,请自行挖掘和探索。...,模拟某商店营业额 data = generateData('20170601', '20170701') print(data) # 绘制时序图 myfont = fm.FontProperties...(data).show() # 绘制偏自相关图 plot_pacf(data).show() 某次运行得到的随机数据为: 营业额 2017-06-01 333...从时序图来看,有明显的增长趋势,原始数据属于不平稳序列。 相应的自相关图为: ? 从自相关图来看,呈现三角对称形式,不存在截尾或拖尾,属于单调序列的典型表现形式,原始数据属于不平稳序列。

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    圈图 | 不同品种的基因型数据绘制PCA图和聚类分析图

    很多软件可以分析PCA,这里介绍一下使用plink软件和R语言,进行PCA分析,并且使用ggplot2绘制2D和3D的PCA图。 绘制后的图如下: 2-D PCA图: ?...可以看到,三个品种在PCA图里面分的比较开,C品种的有两个A和B的点,应该是异常数据。 3-D PCA图: ?...可以看到,三个品种在PCA图里面分的比较开,C品种的有两个A和B的点,应该是异常数据。 基因型数据: 共有3个品种A,B,C,共有412个个体。...,将其转化为0,1,2的形式 2,计算G矩阵 3,计算PCA的特征向量和特征值 4,根据特征值计算解释百分比 5,根据特征向量和品种标签,进行PCA的绘制 绘制代码如下: 首先,使用plink命令...然后使用R语言,计算PCA,并绘制PCA图。

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    Python-Matplotlib 动态柱形图绘制(数据分享)

    这期开始,我们将公众号刚开始的不成熟风格文章推文改成与现在相统一的风格,同时也为了解决大家复制不了代码的问题,本期推文,将介绍使用Python-matplotlib 绘制动态柱形图的教程推文,主要涉及的知识点如下...: matplotlib的animation模块制作动态图 ticker的定制化操作 自定义图例的添加 练习数据分享 animation模块制作动态图 在之前的推文中有转载过优秀的Python第三方包绘制动态图...但小编的建议是,若想系统的学习可视化绘制,还是从基础的图表开始,这样可以使你熟悉绘图函数;但若只为了制作出动态图,则可以考虑使用优秀的集成包。...静态柱形图绘制 在绘制动态图表之前,我们需要单独绘制一幅静态图表用于查看数据的分布情况及可能需要修改的图表元素。...这里,我们选取一年的数据进行柱形图的绘制,具体绘制代码如下: current_test = 2015 current_data = (gapminder[gapminder['time'].eq(current_test

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    Python数据分析 利用NetworkX绘制网络图

    NetworkX 概述 NetworkX 是一个用Python语言开发的图论与复杂网络建模工具,内置了常用的图与复杂网络分析算法,可以方便的进行复杂网络数据分析、仿真建模等工作。...networkx支持创建简单无向图、有向图和多重图;内置许多标准的图论算法,节点可为任意数据;支持任意的边值维度,功能丰富。主要用于创造、操作复杂网络,以及学习复杂网络的结构、动力学及其功能。...绘制网络图实例如下: import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt # 初始化一个有向图对象 DG = nx.DiGraph() DG.add_node...在提取出的数据的基础上,通过判断球员是否属于同一俱乐部,绘出随机分布网络图、Fruchterman-Reingold 算法排列节点网络图与同心圆分布网络图。...尽可能让网络图美观,如为属于同一俱乐部的节点设置相同的颜色。 将每个球员当作网络图中一个节点,计算节点之间的连通关系,同属一个俱乐部则连通。

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    Python matplotlib绘制列表数据的小提琴图

    本文介绍基于Python中matplotlib模块与seaborn模块,利用多个列表中的数据,绘制小提琴图(Violin Plot)的方法。   ...小提琴图作为一种将箱型图与核密度图分别所能表达的信息相结合的数据可视化图,在数据分析中得以广泛应用;本文就详细介绍在Python中,对存储于多个列表(List)中的数据,绘制小提琴图的方法。...plt.show()   其中,pic_save_name表示我们绘图完毕后,保存图片的路径;li_1、li_2与li_3是三个列表,其各自的元素个数可以相同,也可以不同,我们稍后需要分别对三者中的数据绘制小提琴图...接下来,我们即可通过sns.violinplot()函数绘制小提琴图;这一函数还有很多参数,可以调整小提琴图的各项可视化配置,具体大家可以查看函数的官方帮助文档。...最后,通过plt.savefig()函数将绘制好的小提琴图保存在指定路径中。   至此,大功告成。

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