首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

【生信文献200篇】10 单细胞转录组探索小鼠肝脏发育

02 文章背景 肝脏是由肝细胞组成的异质组织,肝细胞在称为小叶的重复解剖单位运作。六角形的小叶由大约15层同心的肝细胞组成。...我们以前已经应用了单分子荧光原位杂交(smFISH)来测量完整小鼠肝脏肝细胞的mRNA含量。该技术具有灵敏度和动态范围,可测量不同小叶坐标下的精确mRNA分布。...(c,d)9层的每一层观察到肝细胞的先验概率 ? 我们的重建精确度接近6个基因的饱和度。它在很大程度上取决于我们标志性基因的区域划分程度,而仅在很小程度上取决于层内细胞之间的变异性 ?...约有50%的肝基因表达是非随机空间分区的,比以前的估计高一个数量级。我们重建的图谱概括了超过4个数量级的基因表达,包括低表达的基因 ?...「肝小叶背景知识」 肝小叶是组成肝脏结构的基本单位,呈六角轮柱状,由肝细胞、毛细胆管、肝血窦和相当于毛细淋巴管的窦周隙(狄氏间隙)组成。研究人员发现,肝小叶不同层分别执行不同的功能。

2.1K10

【说站】Springboot如何yml或properties配置文件获取属性

=2022/12/12person.map.k1=k1person.list=a,bc,cperson.dog.name=xiaogouperson.dog.age=2 @Value 获取配置文件的...java.util.Date;import java.util.List;import java.util.Map;/** * @author sunyc * @create 2022-04-24 9:43 *///将配置文件映射到...person//@ConfigurationProperties 告诉springboot将本类的所有属性与配置文件相关的属性配置//这个组件是容器的组件,才能提供功能加@Component注解...ConfigurationProperties(prefix = "person")@Validated//数据校验public class Person {//@Email@Value("${person.name}")//properties...配置文件获取值String name;@Value("${person.age}") //properties配置文件获取值int age;@Value("${person.birth}")//

7.9K10

NC:儿童和青少年的小脑生长模型

最后,我们说明了目前的方法如何可以用于检测临床样本的小脑异常。2. 引言虽然小脑更多地被认为参与了运动控制,但最近的研究已经表明,它也与广泛的认知功能有关。...图例的星号表示显著的AP生长系数(线性拟合线的斜率)。功能包裹中心的解剖位置在第一个面板中用数字表示,并列于补充表5。B使用小脑工具沿着两个功能梯度显示生长梯度23。...因此,我们通过研究当前分析纳入和排除的参与者在以下描述特征方面的可能差异:性别、父母国籍(荷兰,非荷兰但欧洲,非欧洲;出生记录获得),家庭月净收入(低=<1200€,=1200€−3200€,高...如果数据的规范估计大于1.96或小于−1.96(即分布的上下尾,95%置信区间的临界),我们将数据定义为在规范模型存在较大的偏差。...5.9 功能分割的规范模型偏差与智商之间的关系在临床验证之外,我们在补充分析中使用同样的方法来说明智商如何与功能分割的小脑偏差相关,其中包含运动和认知亚区域。

16610

如何向图形添加曲形文本

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何在绘制图形添加曲形文本,以往都是通过调整文本角度来展示看起来非常别扭但是使用「geomtextpath」包就显得丝滑了很多。...pos = if_else(is.na(pos), n/2, pos)) # 如果位置为空,则将位置设置为n/2 df %>% ggplot(aes(x = 5, y = n..., fill = new_status, label = n)) + # 使用"data.frame"的数据创建ggplot对象,设置x轴为常数5,y轴为n列,填充颜色为new_status列,标签为...xlim(c(1.5, 5.5)) + # 设置x轴的范围为1.5到5.5 coord_polar("y", start = 0, clip = "off") + # 将坐标系设置为极坐标系,y轴0...legend.title = element_blank(), # 图例标题为空 legend.spacing.x = unit(0.05, "cm"), # 图例水平间距为

18520

ggplot2自定义离散型热图图例

本节来介绍ggplot2绘制图例设置方面的问题,通过一个热图的案例进行阐述。整个过程仅参考,希望对各位观众老爷能有所帮助。...ggplot2图例体系 ❝在ggplot2针对图例的自定义设置可通过guide与guides函数来完成,二者虽只有一字之差具体参数上也基本一致,但是使用时却也有些许不同。...❝因此在使用前需针对图例所对应的几何对象来选择正确的函数,同时在实际绘图过程图例绘制还存在一种情况,即数据为连续型但是在绘制图例将其定义为离散型。...这时就可使用「guide_colorsteps」函数来实现,该函数可将区域显示为单一恒定颜色,而不是颜色条对应项已知的渐变。...下面就通过此函数来自定义设置图例 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(MetBrewer) df % drop_na

17310

Python 数据分析(PYDA)第三版(四)

,将选择b,否则将选择a的非空。...matplotlib 不会检查标签是否重叠,因此在这种情况下,您需要通过指定显式刻度位置和刻度标签自行修复标签(我们将在后面的部分刻度、标签和图例中看到如何做到这一点)。...我在刻度、标签和图例更多地讨论图例。 注意 无论您在绘制数据时是否传递了label选项,都必须调用ax.legend来创建图例。...loc图例选项告诉 matplotlib 在哪里放置图例。默认是"best",它会尝试选择一个最不起眼的位置。要从图例排除一个或多个元素,请不传递标签或传递label="_nolegend_"。...您可以其基本组件组装图表:数据显示(即绘图类型:线条、柱状图、箱线图、散点图、等高线图等)、图例、标题、刻度标签和其他注释。 在 pandas ,我们可能有多列数据,以及行和列标签。

26400

Python数据分析——以我硕士毕业论文为例

数据表合并 首先遇到的第一个需求就是,所有样本点的列变量存储在不同的数据表,比如,样本点的指标分为上覆水的指标与沉积物的指标两部分,分别存储在两个或者多个数据表,那么如何将两个或者多个数据表进行合并呢...; method:填充方式,method='ffill' 向前填充,method='bfill'向后填充,也就是说用前面的来填充NA或用后面的来填充NA。...另外,在使用读取pd.read_csv()读取csv文件的时候,也可以通过参数: na_values=None keep_default_na=True na_filter=True 的设置来对NA进行过滤或者识别...= '': # 注意两种特殊情况:[0, 0, -5, 7]、[0, -5, 7]如何排除 cur_item = '+' + cur_item...例如利用get_skip_rows()函数获取到.txt文件数据表第156行开始: df = pd.read_table(search_info['Path'], skiprows=156, index_col

3.1K20

R语言之可视化(25)绘制相关图(ggcorr包)

在相关矩阵需要考虑的第一个设置是选择要使用的观测。...此设置可能采用以下任何:“everything”,“all.obs”,“complete.obs”, “na.or.complete”或“pairwise.complete.obs”(ggcorr使用的默认...这些设置控制在存在缺失如何计算协方差。它们之间的区别在cor函数的文档中有解释。 ggcorr需要的第二个设置是要计算的相关系数的类型。...绘制参数 其余的这些小插图侧重于如何调整ggcorr绘制的相关矩阵的方面。 控制色标 默认情况下,ggcorr使用-1到+1的连续色标来显示矩阵中表示的每个相关的强度。...控制内部 由于ggcorr生成ggplot2对象,因此理解对象是如何构造的以便从中获取更具体的图可能很有用。

7.5K31

这些条形图的用法您都知道吗?

= FALSE,show.legend = NA, inherit.aes = TRUE) mapping:通过aes的方式指定图形的属性(如轴信息、边框色、填充色等),但要求属性来自于原始的绘图数据...na.rm:bool类型的参数,在剔除绘图数据的缺失时,是否不返回警告信息,默认为FALSE; show.legend:bool类型的参数,是否显示条形图的图例信息,默认为NA,即表示显示图例;如果设置为...FALSE,则不显示任何图例;如果设置为TRUE,则显示图例; inherit.aes:bool类型的参数,绘图时是否延用ggplot函数的数据和轴属性,默认为TRUE;根据作者的经验,如果ggplot...aes(x = name, y = sales, fill = factor(is_done)), width = 0.6, stat = 'identity') + # 修改图例...本文中的代码和数据可以百度云盘中下载,只需关注“数据分析1480”公众号,并回复“条形图”即可。

5.5K10

如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

请注意,对于折线图而言,折线的颜色或对于条形图而言是条形的颜色,并不是bbc_style()函数中直接获得的,而是需要在其他标准ggplot图表函数明确设置 。...以下代码显示了在标准图表制作工作流程如何使用bbc_style()。 这是一个非常简单的折线图的示例,使用了来自gapminder包的数据。...默认为占位符PNG文件,其背景与绘图的背景颜色匹配。...添加到guide来更改图例符号的默认外观,例如下面将增加图例符号的大小: + guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 4)))) 在图例标签之间添加空格...将左对齐标签添加到条形图 如果您想为条形图添加左对齐标签,只需根据数据设置x参数,而是直接使用数字指定y参数。y的确切将取决于数据范围。

13K10
领券