•插值：和指定权重的方式不同，插值方法是根据给定的输入文件的变量信息，采用线性插值的方式得到输出结果。 上述操作对坐标变量和字符变量无效。...ncremap—netCDF Reapper ncremap是在NCO V4.5.4引入的新工具，可以将输入文件中的数据重新插值到map_fl、grd_dst或dst_fl选项给定的网格，并输出。...其主要应用是进行不同网格投影的数据插值变换，比如将WRF模式Lambert投影结果插值到lat-lon投影，或者是对不同模式的网格化结果进行插值变换。...ncwa—netCDF Weighted Averager ncwa可以对单个输入文件中任意维度的变量执行统计计算，可以给定权重、掩膜信息或归一化。...除了NCO之外，还有一个用于处理netCDF文件的命令行工具--CDO，也有对应的Python封装版本，感兴趣的可以查看。 此次仅对上述命令进行简要介绍，下次再详细介绍常用命令的使用方法。
所谓自描述就是自带属性信息，这和一般的雷达基数据格式不同，一般的雷达数据也是二进制的，但不是自描述的，而是需要额外的数据格式文档来说明数据格式，而NetCDF文件中包含了描述变量和维度的元数据信息。...很多工具都可以处理NetCDF文件，比如MATLAB，Python，NCL，GrADS，CDO，NCO，Panoply等等。...关于netCDF4-python库的介绍，之前已经提到了 netcdf4-python 模块详解，还有这里这里使用 Cartopy 和 netCDF4 可视化 WRF 模式数据 下面以一个例子来讲述一下如何处理...文件，根据不同的需要使用不同的方法。...此节仅记录了怎么读netcdf文件，关于如何写netcdf文件下次再说。 除了上述三种工具之外，CDO和NCO在处理netcdf文件时有时会非常有用，关于这两部分的介绍有空再说。
在格式转换的过程中，首先要确定NetCDF格式数据中是否全部变量都包含网格信息，或是网格类型为非 generic。因为CDO不支持上述两种情况下的格式转换。...查看 outfile.grb 文件信息可以发现，infile.nc中的generic网格类型变量都不存在了 ，而且变量名也都发生了变化 ，变量名命名方式为 var + infile.nc文件中变量的顺序...如果输入文件不包含网格信息，可以使用setgrid操作符设置网格描述信息，然后再执行转换操作。当然，NCO中也有命令可以完成网格信息添加。比如： ncatted。...注意： 编译CDO时，要使用--with*选项指定要支持的操作，比如支持NetCDF，GRIB数据格式，需要指定 --with-netcdf, --with-grib_api 选项。...（即ecCodes）支持grib_api的功能，但是在使用老版本的CDO时，对于初学者来说仍建议使用grib_api。
受NCO启发，通过命令行，提供了一系列的气候数据相关的操作 主要是被设计用在操作netCDF3/4，GRIB1/2 众多的函数可以被用在任何NetCDF/格点化数据 非常适合与特定任务 有效的调动内存...如需参考，只需输入：cdo -h 操作符：1.文件信息 $ cdo infov ifile 这是一个带有一个2D变量的数据集的示例结果，包括3个时间步长： -1 : Date...可以用一些不同的方法选择数据包括： 变量码，名称或者属性 层次 时间 空间区域（纬度/经度） 操作符：2.选择 用id选择变量：“SSTK”和”CI”: $ cdo selname,SSTK,CI...T是一个可选的参数，其缺省值T=20℃。 除此之外CDO还能做什么？ CDO有许多通用的命令行开关，可以与（大多数）运算符一起使用。...-z zip Deflate compression of netCDF4 vars. 组合运算符 所有的运算符都有一个固定的输入流和一个输出流，可以直接将结果管道给其它的操作符。
可移植性：或称跨平台性，即在一种操作系统上创建的 netCDF 文件通常可被其他操作系统上的软件读取。 可扩展性：即可有效地读取一个大 netCDF 文件的一个小子集，而无需读取整个文件。...本文不对NetCDF数据格式进行过多的介绍，主要讲一下如何处理NetCDF格式文件，并且如何对最终的数据进行可视化分析。...NetCDF 文件处理工具 其中列出的ncdump可以查看NetCDF文件中的变量和属性等信息，ncview，panoply可以对NetCDF文件中的变量进行简单的可视化，如果需要对NetCDF文件进行裁剪...，算术运算或者插值等操作，可以使用nco或cdo等工具。...复杂的数据处理工作和二维可视化可以使用matlab，python或NCL，三维可视化可以使用VisAD，Vis5d，IDV等。 处理nc文件的工具很多，此次仅利用python来讲一下如何处理nc文件。
二进制文件和文本数据 气象中的二进制文件是指利用ASCII及扩展ASCII字符编写的数据或程序指令的文件，一般没有格式，用文本编辑器打开只能看到无意义的乱码，需要特定的解码说明才能使用，例如气象雷达的数据...(Network Common Data Form) NetCDF数据是常用的气象和卫星数据存储的数据格式，结构形式包含维数、变量、属性和数据四个子域,公众号前几期有过利用python对netCDF...数据处理的介绍，有感兴趣的同学可以关注公众号查看历史精彩文章使用python处理NetCDF格式文件，这里介绍大家利用CDO如何处理netCDF格式的文件 CDO（Climate Data Operators...处理grib文件的常用工具包pygrib，Grib格式数据处理有详细介绍，gribapi也自带python接口，可以通过ECMWF提供的ecCodes或cgrib安装包进行安装使用。...###wgrib2命令行 wgrib2 -d 56 a.grb2 -netcdf a.nc ###将grib文件转位nc文件 wgrib2 a.grb2 -d 1 -s -lon 249 39 -lon
首先这不是一篇告诉你如何抛弃NCL的推送，而是告诉你如何更好的使用Python！ 作为曾经地球科学领域最炙手可热脚本语言之一的NCL已经进入维护模式，不再更新。...PyNGL和PyNIO中的函数和绘图方式与NCL是非常类似的，可以非常顺畅的从NCL转到Python。...数据处理 •NetCDF格式 : netCDF4-python，h5py，h5netcdf，xarray等。...除了上述简单的数据处理库之外，python还提供了NCO和CDO工具的封装，pynco和cdo，提供了更多的便捷操作。...当然还有一些库不知道该怎么分类，因为分析画图的时候会用到，就放到这边吧： •geopandas：地理空间数据处理和可视化神器•pyshp，fiona等可处理常规的shapefile文件，常在画图的时候添加海岸线和边界线使用
这是一篇告诉你如何更好的使用Python来解决地学领域问题的文章。 数据处理 •NetCDF格式 : netCDF4-python，h5py，h5netcdf，xarray等。...除了上述简单的数据处理库之外，python还提供了NCO和CDO工具的封装，pynco和cdo，提供了更多的便捷操作。...Python中有很多处理模式输出的库，功能都比较完善。 模式输出处理 •wrf-python：对于使用WRF模式的来说使用最为频繁的模式输出后处理工具之一。...当然还有一些库不知道该怎么分类，因为分析画图的时候会用到，就放到这边吧： •geopandas：地理空间数据处理和可视化神器•pyshp，fiona等可处理常规的shapefile文件，常在画图的时候添加海岸线和边界线使用...•Pytorch：与TensorFlow相比，Pytorch更加方便实现简单灵活的实验，它的前身是Torch，用的是lua语言，从Torch到Pytorch可以看成是lua到python的迁移。
还是以NetCDF数据集为演示，在演示之前，为了方便操作，从原始数据集中仅提取出单个时步单个变量的某一层数据。...-10-04_06\:00\:00 wrfoutsub_06.nc 使用 cdo info 查看数据集信息可以得到： cdo info wrfoutsub_03.nc -1 :...IF THEN ifthen 所执行的操作是：如果 wrfoutsub_03.nc文件中的变量值为0，那么相应的逻辑值为 false，如果不是0，那么对应的逻辑值为 true，然后根据变量的逻辑值从 wrfoutsub...= 0 # outfile = infile2 # elseif infile == 0 # outfile = miss # 如果 infile1 中变量的值不等于0，输出文件中的变量值等于...根据常数进行条件选择 当然，也可以使用 ifthenc 或 ifnotthenc 操作符 和常数进行比较，然后选择数据。
cdo无法处理坐标系（指griddes中xval和yval）中含有missing value的格点。NCL同样不行（见这个ppt）。这种情况往往出现在曲线网格curvilinear中。...好在cdo本身提供了投影网格（即gridtype = projection），为此往往需要以下变量（更具体的参见cdo user guide 1.5.2.4节） gridtype = projection...= y yunits = "meters" xfirst = xinc = yfirst = yinc = 其中，最后四个常数非常重要，需要针对不同的资料寻找对应的格点值...对于写好的网格描述文件，可以使用setgrid将描述文件赋给netCDF，之后就可以使用remapcon插值了。...除此以外，cdo支持PROJ库语法，写在proj_params的内容会被直接传递到PROJ库。
close netcdf dataset 读取未知名称的netCDF数据 与已知变量名称不同时，如果不知道变量等信息的名称，那么需要调用查询函数获取关于netCDF对象的信息，操作步骤如下： nf90_...定义新的变量 使用如下函数定义新变量： •nc_def_var•nf_def_var•nf90_def_var 定义新变量时通常会添加变量的属性信息，变量的属性有整型，浮点型和字符串等类型，针对不同类型的属性...定义变量的维度顺序与添加数据时变量的维度信息大小要一致，否则可能会出现NetCDF: Start+count exceeds dimension bound的错误。...字符和数字转换 字符和数字间的转换，可以使用write语句，将变量看作内部文件。...，近期在博客更新了一些内容，其中有涉及到NetCDF库的，也有使用其它高级工具处理NetCDF文件的，比如nco等。
CDO提供了一系列查看数据集信息的命令，可以非常方便的查看数据集信息，而不用想使用python，ncl，matlab等编程语言或软件一样，先读文件，然后再获取相关信息，可以通过命令行直接对文件操作，然后将文件信息输出到屏幕...，当然也可以重定向到文件或其它接口。...以NetCDF数据集为例： info # 通过列出参数ID查看数据集信息 infon # 通过列出参数名查看数据集信息 map # 展示数据集信息和样本映射 执行 cdo info...使用上述命令只能看出变量名，而执行以下命令除了变量名之外可以查看到变量的一些其它信息： cdo partab wrfout_d03_2016-06-23_06\:00\:00 ? 列出年月信息： ?...上述获取数据集信息的操作符在进行数据处理之前是非常有用的，比如查看变量名，可以确定要处理的变量名称，查看日期和时间可以确定要处理哪一部分日期的数据等等。
扩展新操作符 安装 安装方式非常简单，运行以下命令即可： pip install cdo 或 conda install python-cdo 操作符 一般情况下导入库时不建议使用如下方式导入的，...'2016-06-23 11:20:00 2016-06-23 11:30:00 2016-06-23 11:40:00 2016-06-23 11:50:00'] 查看文件信息的操作符与CDO..._00", output = "wrfmean.nc") 性能对比 对比CDO命令行和Python-cdo接口的执行效率： 以下两个命令执行相同的操作：先选择1-5时步的所有变量数据，然后在结果中选择指定的变量...参数 在利用 CDO转换数据集格式 时，需要指定输出文件格式，比如选择变量或时步时也需要指定操作符的参数。 在使用pyhon接口时如何指定CDO命令行方式的参数呢？...通常有3中方式来获取数据： 文件句柄 使用文件句柄可以非常方便的获取变量，属性，维度等信息。可以使用 returnCdf关键词或 readCdf 方法。
扩展新操作符 安装 安装方式非常简单，运行以下命令即可： pip install cdo #或 conda install python-cdo 使用方法 操作符 一般情况下导入库时不建议使用如下方式导入的...'2016-06-23 11:20:00 2016-06-23 11:30:00 2016-06-23 11:40:00 2016-06-23 11:50:00'] 查看文件信息的操作符与cdo..._00", output = "wrfmean.nc") 性能对比 对比cdo命令行和Python-cdo接口的执行效率： 以下两个命令执行相同的操作：先选择1-5时步的所有变量数据，然后在结果中选择指定的变量...参数 在利用 cdo 转换数据集格式时，需要指定输出文件格式，比如选择变量或时步时也需要指定操作符的参数。 在使用pyhon接口时如何指定CDO命令行方式的参数呢？...通常有3种方式来获取数据： 文件句柄 使用文件句柄可以非常方便的获取变量，属性，维度等信息。可以使用 returnCdf 关键词或 readCdf 方法。
扩展新操作符 安装 安装方式非常简单，运行以下命令即可： pip install cdo #或 conda install python-cdo 使用方法 操作符 一般情况下导入库时不建议使用如下方式导入的...'2016-06-23 11:20:00 2016-06-23 11:30:00 2016-06-23 11:40:00 2016-06-23 11:50:00'] 查看文件信息的操作符与cdo...参数 在利用 cdo 转换数据集格式时，需要指定输出文件格式，比如选择变量或时步时也需要指定操作符的参数。 在使用pyhon接口时如何指定CDO命令行方式的参数呢？...通常有3种方式来获取数据： 文件句柄 使用文件句柄可以非常方便的获取变量，属性，维度等信息。可以使用 returnCdf 关键词或 readCdf 方法。...由于变量 t 在上面已经获取并且处理了，因此此处直接使用。
netcdf 文件中的属性 netcdf 文件中包含了两种类型的属性：全局属性和变量属性。前者提供的是组或整个数据集的信息，后者提供的是组中变量的信息。...写或读取netcdf变量数据 现在创建了Variable 实例，那么如何写入数据呢？你可以将其视为一个数组，然后传递数据给一个切片即可。...然而，numpy 和 netcdf 变量在切片规则上稍有不同。通常是使用 start:stop:step 的形式进行切片。...对 netcdf 变量而言，布尔数组和整型序列索引的行为与 numpy 数组是不同的。这些索引在每一个维度是单独作用的（类似 fortran 中的向量下标法）。...，为了提取标量变量的数据，可以使用 np.asarray(v) 或 v[...]
为了读取或写入 netCDF 文件，需要安装 scipy 或 netcdf4-python。...写入编码数据 你也可以自定义 xarray 如何为 netCDF 文件中的每个数据集变量提供编码信息。encoding 参数接收包含编码信息的键值对字典。...这些信息会保存为 netCDF 变量的编码信息，从而使得 xarray 能够更准确的读取编码数据。 注意： 是否使用编码选项是可选的。...如果不指定编码信息的话，xarray 会使用默认的编码属性信息；如果指定的话，这会更有利于额外的处理操作，尤其是压缩操作。 当存储文件时，这些属性信息会保存为每一个变量的属性。...netCDF 文件通常是一个集合，比如，不同模式运行输出的不同文件。
本文介绍基于C++语言的netCDF库读取.nc格式的栅格文件时，出现数据无法读取、数据读取错误、无法依据维度提取变量等情况的原因与解决方法。 ...最近，由于需要读取ERA5气象数据，因此使用C++语言中的netCDF库读取.nc格式文件；这其中也是踩了很多的坑，所以在此记录一下，也相当于是汇总了C++的netCDF库读取.nc文件时的一些常见问题...针对不同语言，netCDF库也有着对应的不同版本，我们之前的文章也介绍过在Python、C++等代码的开发环境中，配置netCDF库的具体方法，大家直接参考文章Anaconda配置h5py与netCDF4...但当然，本文后续提到的各类问题，都是在基于C++语言的netCDF库读取.nc格式文件时，出现的问题（毕竟Python读取.nc格式文件还是很方便的，感觉一般也不会有太大的问题或坑）。...4 时间维度需要放在第一个位置 有时，我们需要按照不同维度，对变量数据加以读取。例如，我这里的.nc格式文件中，变量是1种气象数据，其具有3种维度，包括经度、纬度与时间等。
例如转换 pandas[1] 类型数据为 xarray 类型或者读取一些数据文件，如NetCDF[2]文件或zarr[3]文件。...", np.arange(5)), "b": (("x", "y"), np.ones((5, 4)))} ) ds 对象ds to_series:将多变量数据DataSet使用多重索引，将相应的DataArray...将 ds（Dataset）中的变量a转换为 pandas 类型 ds.a.to_series() ds.a.to_series() 如何理解这一句代码呢？...to_dataframe：将DataArray或Dataset对象转换为pandas.dataframe（数据框）。注意到DataArray对象名称与转换为数据框的名称一样都为a。...Xarray 采用open_dataset / open_dataarray 函数读取NetCDF 文件，采用to_netcdf方法将数据写入文件。
目录 1 生成nc 格式的文件 1.1 代码 2 简单读取nc 格式的文件 1 生成nc 格式的文件 1 首先是生成的nc格式文件使用panoply 软件打开的数据是： 第一个图解释： 以上就是使用代码生成的...nc格式的文件，使用panoply 软件打 开之后，我们就看到了具体的信息； 一共有两个维度，一个是X ，一个是Y ，这两个维度的值代表 数组的长度；或者这样理解，一个维度就是一个数组，维度 的长度...就是数组长度，就是这个数组里面可以存放多少数据； 第二个图解释： 这个nc文件里面存放的使一个二维数组，里面有具体的值； 有多少个值，就是维度相乘 ，因为当前有两个维度X和Y； 通过第一个图可知X的值为...//将虚拟数据写入文件。虽然netCDF支持//读取和写入数据的子集，但在本例中，我们在一个操作中写入所有//数据。...data”变量中的所有值读入内存。
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