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如何使用R中的变量为未根树的分支着色

在R中,可以使用ape包中的plot.phylo函数来为未根树的分支着色。该函数可以绘制进化树,并允许对分支进行自定义的颜色设置。

下面是一个示例代码,演示如何使用R中的变量为未根树的分支着色:

代码语言:txt
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# 安装并加载ape包
install.packages("ape")
library(ape)

# 创建一个简单的未根树对象
tree <- rtree(10)

# 创建一个颜色向量,用于为分支着色
colors <- c("red", "blue", "green", "yellow", "orange", "purple", "pink", "brown", "gray", "black")

# 使用plot.phylo函数绘制未根树,并为分支着色
plot.phylo(tree, edge.color = colors)

在上述代码中,首先安装并加载了ape包,然后使用rtree函数创建了一个包含10个叶子节点的未根树对象。接下来,创建了一个包含10种颜色的向量,用于为分支着色。最后,使用plot.phylo函数绘制了未根树,并通过edge.color参数将分支着色。

这样,就可以根据自定义的颜色向量为未根树的分支着色了。

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