如何使用ggplot 2向boxplot上的标签添加下标_如何在R中使用ggplot2向图表添加名称标签？_ggplot2 -在条形图中的标签后面添加下标 - 腾讯云开发者社区

研究者常常要比较两组数据是否有统计学差异，并且要将这种差异在图形上通过线和注释标注出来。 ? ggplot2包是一个很好的可视化包，ggsignif包是ggplot2包的一个扩展包。...今天来学习怎么在ggplot2包绘制的图形上添加显著性差异注释。 1....安装R包 install.packages("ggplot2") # 安装包 install.packages("ggsignif") # 安装包 library(ggplot2) # 加载包 library...如上图所示，可以看到两组是有统计学差异的，但是图中的P值使用的是科学计数法，其实还可以使用*或注释来表示。通过添加参数map_signif_level=TRUE，可以将统计学差异表示为*符号。...3.2 多组两两比较还是使用上面的数据集数据。我们在图上添加3组数据两两比较的统计学差异P值。

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R语言ggplot2使用geom_label()函数添加文本标签的一些细节调节

首先是构造一份数据集 library(ggplot2) df<-data.frame(x=c(1,1), y=c(1,2), label=c(...image.png 文本框的四周默认是带有圆角的，如果不想要圆角可以使用参label.r ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_label(aes(label=label...image.png 这样就变成了直角如果不想要文本框四周的黑线，可以使用label.size=NA参数 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_label(aes(label...image.png 调整带颜色的背景的大小，可以使用label.padding参数 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_label(aes(label=label,...暂时没有找到参数来调节如果要调节文本框的位置可以使用nudge_x和nudge_y参数 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_label(aes(label=label

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R tips：ggtext的geom_richtext图层的格式调整和使用

ggtext的geom_richtext可以使用Markdown或者html语法来拓展ggplot2的文字图层geom_label用法。...fill、color还可以映射变量，和普通的ggplot2的geom_label类似，如果需要可以在aes函数中定义它。但是如果是映射的常量，则需要在aes函数外定义。...ggtext的使用举例上面均是测试的'test text'，但是这体现不出geom_text的功用，以一个较为复杂的label为例：注释文本分为两行，第一行为红色字体，第二行以空格开头，并使用上下标标签...这里的上标使用的^字符，也可以html的sup标签。至于上面的例子中特地提到换行和空格，是因为他们配合R中的无穷量Inf，可以实现一个相对优雅的固定排版布局。...PS：为了显示label的大小，注释文本添加了一个蓝色的边框。

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R语言ggplot2画热图的时候在色块上添加文本

画热图的数据 image.png 用来添加文本的数据 image.png 如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到的R包 library(ggplot2...) library(tidyverse) #install.packages("see") library(see) ggplot2 是用来作图的 tidyverse 是用来做数据整理的 see 这个包里有很多配色函数...X, names_to = "Y", values_to = "Value") -> dfa.1 head(dfa.1) 读取添加文本的数据 dfb...X, names_to = "Y", values_to = "Value") -> dfc.1 head(dfc.1) 作图的代码 ggplot...小明的数据分析笔记本小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记

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R语言ggplot2散点图如何使用更多的形状

R语言ggplot2如果要做散点图可以用自带的一些形状如果想用其他形状，有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/ggstar/vignettes...-1,-2,-1,0,1,2,1,-1,-1,1,1,0), y=c(2,1,0,-1,-2,-1,0,1,1,-1,-1,1,2)) %>% ggplot()+ geom_polygon...(aes(x=x,y=y),fill="red",color="black") 在 primitive.R 代码中添加上一段代码 else if (starshape == 28){ data.frame...fill=group), show.legend = FALSE)+ theme_bw()+ theme(panel.grid = element_blank()) 基本上能构造出形状的坐标...，就能够把这个形状用于ggplot2的散点图中

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ggplot2|从0开始绘制箱线图

继续“一图胜千言”系列，箱线图通过绘制观测数据的五数总括，即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数以及最大值，描述了变量值的分布情况。...VC 0.5 4 5.8 VC 0.5 5 6.4 VC 0.5 6 10.0 VC 0.5 1）geom_boxplot绘制基本的箱线图使用ToothGrowth数据集...2）修改异常点的属性设置outlier的 color, shape and size ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(...4）添加最大值和最小值的两条须线 ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.15...5)箱线图添加点 geom_point函数，向箱线图中添加点； ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot() + geom_dotplot

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散点图及数据分布情况

添加回归模型拟合线 5.7 根据已有模型向散点图添加拟合线 5.8 添加来自多个已有模型的拟合线 5.9 向散点图添加模型系数 5.10 向散点图添加边际地毯 5.11 向散点图添加标签 5.12 绘制气泡图...cw_sp+geom_boxplot(aes(group=Time))#分组时间 cw_sp+geom_boxplot()#不分组 5.6 添加回归模型拟合线 Q：如何向散点图添加回归模型拟合线？...(data = predvals)#好了，现在男女的x轴范围是一样的了 5.9 向散点图添加模型系数 Q：如何向图形添加模型信息？...#这里可以使用jitter添加扰动并且改变size减少线宽解决这个问题 5.11 向散点图添加标签 Q：如何向散点图添加标签？...#这是因为置信域即槽口的上边界超过了箱体，但是没有什么毛病图还是可以用的惹 6.8 向箱型图中添加均值 Q：如何向箱型图添加均值？

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「R」ggplot2数据可视化

标度控制着数据空间的值到图形属性空间的值的映射。一个连续型的y标度会将较大的数值映射至空间中纵向更高的位置。引导元素向看图者展示了如何将视觉属性映射回数据空间。...最常见的元素是坐标轴上的刻度线和标签（还有图例）。接下来以三个数据集解释ggplot2的使用。第一个是lattice包中的singer数据集，它包括纽约合唱团歌手的高度和语音变量。...ggplot函数设置图形但没有自己的视觉输出。使用一个或多个几何函数向图中添加了几何对象(简写为geom)，包括点、线、条、箱线图和阴影区域。...labs()函数是可选的，可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数，并且大多数包含可选的参数。下面我们来看一下相应扩展。...小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意，ggplot2包在定义组或面时使用因子。这里我们使用mtcars数据集查看分组和面，并进行绘图。 ?

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跟着Nature microbiology学画图~堆积柱形图+箱线图以及组合图

发现目标图里的横坐标标签存在一定角度的，那么横坐标和纵坐标标签用以下代码实现： ggplot(df,aes(x=Status,y=Relative.abundance.......发现目标图中，下标都单独拿出来形成了legend，这是想到其实ggplot直接作box plot就可以直接搞定，但是数据格式略有不同，准备的数据为： ?...这下就按照第一个堆积图的后续修饰，删除横坐标标签： ggplot(bp, aes(x=Diet, y=Richness, fill=Diet)) + geom_boxplot()+theme(axis.title.x...或者再原图基础上可以删除横坐标的所有标签： p1<-p1+theme(axis.title.x=element_blank(), axis.text.x=element_blank()...各类检验适用的情况如下： ? ggsignif主要的一个函数是geom_signif()，使用方法和ggplot2中其他的geom_***()一样，作为图层添加到图形中就可以，他的主要参数为： ?

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R语言ggplot2做箱线图的时候如何添加表示平均值的线

image.png 首先是画一个最普通的箱线图 df<-read.csv("PlantGrowth.csv") library(ggplot2) library(tidyverse) p1<-ggplot...(data=df, aes(x=group,y=weight))+ geom_boxplot(aes(fill=group)) p1 image.png 通过ggplot_build...()函数可以获取画箱线图用到的数据 ggplot_build(p1)$data[[1]] image.png 我们利用原始数据计算一下平均值，然后将数据集的平均值添加到这组数据中 df %>%...不知道有没有比较好的办法（猜测geom_boxplot函数里应该是有一个步骤计算中位数的，试着看看源代码，看能不能把中位数的代码改为平均值）还有一个问题是如果是分组的箱线图那么应该如何来实现呢？...欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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R语言ggplot画图(autocad命令输入方式有几种)

目录一、基本绘图二、精雕细琢 (1) 添加标题、横纵轴标签 (2) 图片标题字体、大小、样式设置 (3) 坐标轴标题及标签字体、大小及样式设置 (4) 颜色设置 (5) 图例样式设置 (6) 多图汇总...，接下来将逐步对其进行微调 (1) 添加标题、横纵轴标签 ggplot(data=singer, aes(x=voice.part,y=height,fill=voice.part,color=...voice.part))+ geom_boxplot(alpha=0.7)+ labs(x="音域",y="身高",title="不同音域的歌手身高分布箱线图") 添加标题及横纵轴标签后...(或者使用family指定其他字体样式) #size指定字体大小 #hjust标题水平位置(0.5则表示水平居中) #R里面的说明虽是0-1,实际上可以取到超过这个范围的值,还可以取负值！...而普通设置画布的方式par(mfrow=c(n,m))，在ggplot中是不起作用的。以下，介绍两种多图呈现的方式。使用的数据集为鸢尾花 I.

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56-R可视化-5-ggplot2基石三部曲之基础二

当我们通过 ggplot(data=example) 后，便相当于设定了默认的ggplot2 设定的背景图层，接着依靠 +geom_point() , +geom_bar() 等等，便可以实现图层的添加...也正因其代表不同的图层，因此也可以利用新的图层对旧的图层进行叠加（或覆盖）。先后顺序但也正和图层的叠加一样，R中ggplot 的叠加也有先后顺序，后来的图层会覆盖在原来的图层上。...我们可以使用ggplot 内建的theme。...绘图中的标签进行修改。...图层存在先后顺序，后来的图层越靠近顶层。 ggplot2 无法借助循环直接批量将绘图映射在同一层面上，可以借助列表先存储这些绘图，再使用拼图函数将它们拼接在同一画面上。

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（数据科学学习手札38）ggplot2基本图形简述

一、简介　　上一篇中我们介绍了ggplot2的基本语法规则，为了生成各种复杂的叠加图层，需要了解ggplot2中一些基本的几何图形的构造规则，本文便就常见的基础几何图形进行说明；二、各基础图形 2.1...我们主要使用两个参数控制线条的位置，slope控制斜率，intercept控制截距，下面是一个简单的例子，我们在散点图层上叠加截距为20，斜率为2的直线： library(ggplot2) p <-...()：　　如果你想添加的直线垂直于x轴，则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条，xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置，若传入向量则可同时添加多条线条： library...='直线'), arrow = arrow(length = unit(0.02, 'npc'))) 2.9 text()与label() 　　有些时候我们需要在已绘制的图形上添加文本类标签...使用别致的标签： p + geom_label() 改变文本标签的大小： p + geom_text(size = 10) 调整文字标签位置： p + geom_point() + geom_text

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ggplot2修改坐标轴详细介绍

ggplot2的每个细节都是可以修改的，非常推荐大家系统学习一下，用到再学确实是一种不错的方式，但是如果要提高进阶，还是有必要系统学习的。今天给大家介绍下如何自定义ggplot2坐标轴。...交换x轴和y轴设置坐标轴范围使图形从0开始反转连续型坐标轴修改类别型坐标轴的顺序设置x轴和y轴的比例设置刻度线位置移除刻度线和标签修改刻度标签修改坐标轴标签沿坐标轴显示直线使用对数坐标轴...library(ggplot2) library(patchwork) p <- ggplot(diamonds, aes(cut, price))+ geom_boxplot() # 方法1...p1 <- p+coord_flip() # 方法2 p2 <- ggplot(diamonds, aes(price, cut))+ geom_boxplot() p + p1 + p2...-9 修改刻度标签 p <- ggplot(diamonds, aes(cut, price))+geom_boxplot() p1 <- p+scale_y_continuous(breaks =

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R语言-专题

= T)gg[,4]# 2.如何把上一题结果中的Control和Vemurafenib改成全部小写？...循环for (i in x) {CODE}图片下标循环用两个中括号identical(x1,x2) #判断两个变量是否一致1.下标循环的应用library(ggplot2)a = data.frame(...a","b","c"),each = 5))a#下标循环不保存library(ggplot2)for (i in 1:3) { p = ggplot(data = a)+ geom_boxplot...(data = a)+ geom_boxplot(aes_string(y = i, x = "g")) print(p) }# 下标循环，可以保存数据p...,scales = "free") #分面5.隐式循环1.apply 矩阵/数据框的隐式循环图片如何取数字中最大10个数a= norm(100)tail(sort(a),10)2.列表的隐式循环—lapply

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天天Get 新技能！！

绘制密度图的方法： plot(density(x)) 其中的x是一个数量型向量，由于plot()函数会创建一副新的图形，要向一幅已经存在的图形上叠加密度曲线，可使用lines()函数： >par(mfrow...在第一次使用之前需要安装vioplot()，vioplot()的使用格式： Vioplot(x1,x2,......小提琴图基本上是核密度图以镜像方式在箱线图上的添加。在图中，白点是中位数，黑色盒型的范围是下四分位点到上四分位点，细黑线表示须，外部形状即核密度估计。...可以使用dotchart()函数创建点图，格式为: dotchart(x,laberls=) 其中的x是一个数值向量，而labels是由每个点的标签组成的向量。...可以通过添加参数groups来选定一个因子，用以指定x中元素的分组方式。如果这样做，参数gcolor可以控制不同组标签的颜色，cex可控制标签的大小。

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绘制带显著性比较的bar图

概述：本文介绍如何轻松地为ggplot图形添加P值和显著性水平：比较两组或多组的均值自动地将P值和显著性水平添加到ggplot图形中，如箱形图，点图，条形图和折线图等使用工具： R语言中的ggplot2...包中的函数 compare_means()：用于执行均值比较 stat_compare_means()：用于在ggplot图形中自动添加P值和显著性水平 compare_means() 两样本间的比较...df<-ToothGrowth ggplot(df,aes(x=supp,y=len,fill=supp))+ geom_boxplot(position=position_dodge(),width...,label.x=1.5,label.y = 30) #label指定显示计算出的显著性标签，这里为ns #labe.x和label.y指定ns的坐标轴位置 image.png 多样本之间的比较...),c("0.5","2")) #构建比对信息 #compare_means(len~dose,data=df) #如果由大于2组的样本，默认会用wilcox.test进行两两比较 ggplot(df

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ggplot2绘图小技巧(分面添加标签)

❝本节来分享一个小技巧，给分面图形添加小标签，主要使用ggpp包内的函数来实现，整个过程仅参考。希望对各位观众老爷能有所帮助。...(mtcars) + geom_point(aes(mpg, disp)) p2 <- ggplot(mtcars) + geom_boxplot(aes(gear, disp, group = gear...+p2)/(p3+p4)+ plot_annotation(tag_levels = 'A') ❝上图主要绘制了四幅图，并通过patchwork包进行布局拼图进而添加标签，实现起来非常的容易。...若图形都是拼图组成则添加标签则可使用此法，但图形若是分面而成那又该如何添加标签哪？在R中可通过ggpp包内的geom_text_npc函数即可实现此需求。...❞ ggpp为分面图形添加标签 corner_letters.tb <- tibble(label = LETTERS[1:4], x = "left

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详谈R中散点图添加误差线的细节

❞ df %>% ggplot(aes(case_control,logCPM)) ❝使用 df 数据帧创建了一个新的 ggplot 对象，并将 x 轴和 y 轴变量分别设置为 case_control...❞ geom_jitter(aes(fill=case_control,color=case_control), pch=21, width=0.1, size=2) ❝向图表添加了一个抖动散点图。...❞ stat_boxplot(geom="errorbar", width=0.1, linetype="solid") ❝使用函数 stat_boxplot 向图表添加了误差条。...参数 geom 指定使用哪种误差条，参数 width 控制误差条的宽度。...❞ 自定义函数绘图 ❝上方给出了该图像绘制的代码及解释，那么我们也可以将其写成一个函数使其居然通用性，下面针对会员朋友小编将介绍如何定义函数绘制此图，代码见会员群文档。 ❞

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R基础知识及快速检阅你的数据

A: 使用library() 函数，在括号内直接添加加载包的名字。但是要注意包与库之间的区别，即库实际上是一个包含了若干包的目录。...每个人或者系统都可以由自己的库~ library(ggplot2) 1.3更新包 Q: 如何更新包？...第二个设置每一个条形对应的标签，若向量中的元素已被命名则自动使用元素的名字作为条形标签 head(BOD)#BOD数据记载了BOD与时间的关系 Time demand 1 1 8.3 2...plot(ToothGrowth$supp,ToothGrowth$len) 当两个参数向量在同一个数据框中时，使用boxplot(),其允许我们在x轴上使用变量组合 #公式语法 boxplot(len...10))} curve(myfun(x),from=0,to=20) #根据已有函数添加新的线型 curve(1-myfun(x),add=T,col='red') 2.使用ggplot2绘制函数

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如何在ggplot2图形上添加显著性差异注释？

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