这种图又称 cross-talk ，当数据集做完富集分析后，查看两个通路里有哪些基因是重叠的。...输入矩阵 假设我们整理好这样的矩阵，第一列是FC值，第二列是基因名，第三列是基因所在的通路名，其中在两个通路中都有的基因用intersect表示。...一直以来都觉得自己是弱弱的小透明，执着的学一点就在简书上更一点，和众多在生信路上自学的伙伴抱头前(tong)行(ku)…… 扯远了，补一下健明大大给我的建议，用upsetR绘制crosstalk 1...还是整理好这样的矩阵df,第三列就是富集分析得到的结果 此次我们关注以下这5个通路，看他们中的基因是否存在交集，于是把df中其他无关的通路都删掉。...6个，和上面的crosstalk花瓣图一致 总结：如果想讨论两个通路的交集，请选择花瓣图，如果超过3个，请毫不犹豫的选择UpsetR。
这道题目是看着是比较诡异的，因为正常情况下 Java 有两种传递方式，其一是值传递，其二是引用传递，所以本题需要我们修改 a 和 b 变量的值，可是 int 的值怎么能被改变呢 ？...你如果说这两个变量是 Interger 的，哪无话可说，很容易就可以实现这个功能，但此处是 int 。 我的沙雕实现 是不是简单明了 ?...使用这个方法，虽然可以实现功能，但是不科学，因为好端端的我们不能去人为中止虚拟机的执行，可是了想了半天，又没有啥好的想法。...具体讲座地址在 ：http://t.cn/EGlIYaC 问题延伸 如果是 a 和 b 两个变量是 Integer 类型的话又该怎么做？...这个问题大家可以先思考一下，因为 Integer 是 int 的包装类，此处会好操作很多，我们可以直接使用反射获取到具体变量的 value 值，然后进行修改。 具体代码实现可以参考： ?
4.3.2 使用gglot()创建绘图时的简单概念 Ggplot2的算法很简单：您提供数据，告诉ggplot2如何将变量映射到几何，使用什么图形，它负责细节。...本书第5章中解释了如何逐层构建图。 4.3.2.3 通过使用qlot()减少键入语法代码的数量 在ggplot2中，有两个主要的高级函数用于创建绘图：qlot()和gglot()。...空图 应该在aes()函数中指定数据帧中需要绘图的任何信息。在本例中，我们通过aes()函数实现美学映射：分别指定x和y变量。但是，只绘制了一个空白的GGPlot。...使用facet_grid(公式)在栅格中绘制多个图 数据根据两个或多个变量分成亚组，facet_grid(公式)函数用来生成grid faceting。...~y+z))对两个变量执行刻面，两个变量都按列显示，绘图将基于一个变量与另一个变量的级别并排显示。这种可视化使得两个分类变量的比较非常有效。
在C代码中为什么要使用取址符号 & ?...原因： 一，在C代码中，这样的语句： int foo = 1000; 会导致2件事情发生： 在代码中，留出4字节的空间，保存数值1000 在C语言的symbole talbe，即符号表中，有一个名为foo...二，在链接脚本中，假设 __bss_start = 1000 __bss_start并不是一个变量，它只是一个值，并不需要在内存中留出一段空间来保存它； 在C语言中，符号表中会有一个名为__bss_start...所以：在C语言中，要去使用链接脚本中定义的值时，应该这样做： extern int __bss_start; int val = &__bss_start; 使用取址符号&去得到它在符号表中的值。...注意，这个值只是链接脚本中定义的值，并不表示某个变量的地址。
ggplot2-绘制非洲地区新冠肺炎（COVID19） 最近接触COVID的项目，目前COVID已经在世界上普遍大流行，而且WHO官网及霍普金斯大学等都有相对应的全球COVID19监测平台。...image.png 其实最早出现的新冠肺炎监测平台是2020年1月27日上线的丁香园疫情动态。 好了，今天要介绍的主要是，如何在R里面绘制非洲地区的COVID地图。...这里提一下，在ArcGis中，可以选择几何分段，jenks分段，等间距分段对连续性数值进行转换。得到分类的图例数据。...参考GGPLOT LEGEND TITLE, POSITION AND LABELS 3.更改图例颜色 更改颜色及顺序用到scale_fill_manual函数，这里是分类变量的设定。...参考R 地图绘制-比例尺与指北针如何改变比例尺大小及位置。
“能用代码解决的问题就不要手动去数”mpg直接查看dim(mpg)都可以解决（3）变量drv的意义是什么？?mpg（4）使用hwy和cyl绘制一张散点图。...mpg中的哪些变量是分类变量？哪些变量是连续变量？当调用mpg时，如何才能看到这些信息？glimpse(mpg)显示为chr的是分类变量，为int的是连续变量。...将一个连续变量映射为color、size和shape。对分类变量和连续变量来说，这些图形属性的表现有什么不同？...facet_grid()只会是单列或者单行，不需要nrow和ncol这两个参数。（6）在使用函数facet_grid()时，一般应该将具有更多唯一值的变量放在列上。为什么这么做呢？...不使用统计变换函数的话，如何使用几何对象函数重新生成下列图形？
变量 am 在原数据集里是一个数值型变量（取值为 0 和 1），实质上它应该是一个分类变量，因此我们先把它转换为一个二水平的因子。...分面是将整个数据按照某一个或几个分类变量分成多个子集，然后用这些子集分别作图。例如，要将上图按照变量 am 的两个水平分别展示，可以使用下面的命令。绘图结果如下图所示。...接下来我们将探索用 ggplot2 包绘制常用统计图形的方法。 2.分布的特征 在探索数据的过程中，最基本的手段就是观察单个变量的取值情况。对于连续型变量，可以绘制直方图或密度曲线图。...打开当前工作目录就可以看到这两个文件。 如果要把图片用于出版物中，我们可以对图片的尺寸和分辨率等进行设置。...下面以 epiDisplay 包里的数据集 Oswego 为例绘制金字塔图，这里需要用到数据集里的两个变量 age 和 sex。
信用卡的评分，包括多个预测变量，其中多数为0-1属性变量。分类为Good和Bad两类。采用logistic回归作为分类器，输出结果是分类为正例的概率。...分类器预测正确的比例称正确率（accuracy）：（TP+TN）/T 分类器预测错误的比例称错误率（error rate）:(FP+FN)/T TP <- confusion[4] TN <- confusion...，因此可以定义下面两个比率： TPR又可称为查全率，表示正确分类的正例占实际正例（TP/（TP+FN））的比例，用于衡量分类器预测正例的可信程度。...sensitivity(TPR)：正确分类的正例数占实际正例的比例； specicity(TNR)：正确分类的反例数占实际反例的比例； 1-specicity=FPR，错误分类的反例（“报警”）占实际反例的比例...使用plot函数可以绘制ROC曲线，colorize=T表示可以按颜色在图形上表示出阈值的分布。
它的主要功能包括以下三个方面： 映射变量：aes()函数可以将数据框中的列名或变量名映射到图形属性上，例如将x和y变量映射到点图的x轴和y轴上，或将fill变量映射到柱状图的填充颜色上。...dev.off() dev.new() dev.off()是一个用于关闭图形设备的函数。在R中，我们可以使用不同的图形设备来绘制图形，例如屏幕、PDF文件、PNG图像等。...切换图形设备：在R中，可以使用pdf()、png()、jpeg()等函数打开多个图形设备。使用dev.off()函数可以切换到之前开设的某个设备上，以便继续在该设备上进行图形绘制。...需要注意的是，在使用dev.off()函数关闭图形设备之后，如果还需要绘制图形，就需要重新打开一个新的图形设备。否则，所有的图形绘制将会输出到同一个设备中，可能导致图形重叠或其他问题。...用 “因子” 解决 横坐标-分类变量 自定义的需求 图片
ggplot(small)+geom_histogram(aes(x=price, fill=cut), position="dodge") #还可以使用position="fill"，按照相对比例来画...ggplot(small)+geom_bar(aes(x=clarity)) #柱状图两个要素，一个是分类变量，一个是数目，也就是柱子的高度。...数目在这里不用提供，因为ggplot2会通过x变量计算各个分类的数目。...而柱状图是分类数据，按类别计数。我们可以用前面直方图的参数来画side-by-side的柱状图，填充颜色或者按比例画图，它们是高度一致的。...ggplot2提供了很多的geom_xxx函数，可以满足我们对各种图形绘制的需求。
所以如果你的代码中有很多全局的变量，那么你的整个程序必然是难以维护的。 本文将展示如何通过不同的技术或者设计模式来防止这种全局变量问题。...当然，首先让我们看看如何使用“global”关键字来进行全局数据以及它是如何工作的。...在开发的过程中，你可能会知道知道每一个全局变量，但大概一年之后，你可能会忘记其中至少一般的全局变量，这个时候你会为自己使用那么多全局变量而懊悔不已。 那么如果我们不使用全局变量，我们该使用什么呢？...虽然这些变量都非常标准，而且在你使用中也不会出什么问题，但是在某些情况下，你可能同样需要使用注册器来封装它们。 一个简单的解决方法就是写一个类来提供获取这些变量的接口。...> 正如你看到的，现在我们不再依靠任何全局变量了，而且我们完全让这些函数远离了全局变量。 结论 在本文中，我们演示了如何从根本上移除代码中的全局变量，而相应的用合适的函数和变量来替代。
script> 当然如果其他地方要用的话，可以选择单独下载echarts.min.js 下载地址 https://echarts.apache.org/handbook/zh/get-started/ 使用方式...然后还支持npm的方式引入，这种看官网文档即可 https://echarts.apache.org/handbook/zh/get-started/ 这里重点介绍在fasadmin中如何使用echarts...绘制图表 拿柱状图为例 以fasadmin网站首页的index.html文件为例讲解 1、引入echarts.min.js （路径正确就可以） <script src=”__CDN__/assets/js...type: 'bar', data: [5, 20, 36, 10, 10, 20] } ] }; // 使用刚指定的配置项和数据显示图表...div上的id即可 不懂的比葫芦画瓢即可 未经允许不得转载：肥猫博客 » echarts的引入和使用（fasadmin中如何使用echarts绘制图表）
本章将以ggplot2为主进行学习啦~~ ---- 3.1 绘制基本条形图 Q:当你有一个包含两列的数据框，一列为x轴上的位置，一列为y轴上的对应高度，基于此如何绘制条形图？...Q:如何绘制基于某些分类变量的簇状条形图？...fill参数上，并运行geom_col(position = 'dodge') #这里的fill参数用来指定填充色，并且必须使用dodge使两组数据在水平上错开排列，# 这里映射的变量需要是分类变量ggplot...,scales = 'free_y',space = 'free_y') 第四章 折线图 折线图通常对两个连续的变量之间相互依存的关系进行可视化，x轴对应自变量， y轴对应因变量。...折线图主要针对的是连续型变量，当然也可以用于有序的离散变量 ---- 4.1 绘制折线图 Q:如何绘制基础折线图？
对象是一个你能够看得到，摸得着的具体实体 如何定义Java中的类： 1.类的重要性：所有Java程序都以类class为组织单元 2.什么是类：类是模子，确定对象将会拥有的特征（属性）和行为（方法...方法n； } Java对象 使用对象的步骤： 1.创建对象： 类名 对象名 = new 类名（）； ...5 引用对象的方法：对象.方法 phone.sendMessage() ; //调用对象senMessage（）方法 成员变量和局部变量 1.成员变量 在类中定义，用来描述对象将要有什么... 2.局部变量 在类的方法中定义，在方法中临时保存数据 成员变量和局部变量的区别 1.作用域不同： 局部变量的作用域仅限于定义他的方法 成员变量的作用域在整个类内部都是可见的... 2.初始值不相同： Java会给成员变量一个初始值 Java不会给局部变量赋予初始值，必要初始化 3.在同一个方法中，不允许有同名局部变量； 在不同的方法中，
aes( )来指变量，还可以指定其他分类变量，如颜色，形状，大小等。...=clarity))#定义的第一图层存储于p中 (2)几何对象 基本图层确定了数据源和映射后，通过加号(+)就可以不断地添加新图层.第二图层添加几何对象类的函数，在图中绘制图形元素其他类型的图形，如直方图...:position用于这一层图形的位置调整，常用于条形图(bar)和直方图，取值为“identity”时表示直接显示，" dodge”为按分类变量并列放置，" stack”为堆叠放置，"fill”显示相对比例...4.7图形保存 完成绘图后，最后一步是按照指定文件格式、属性保存和导出图形，以备以后使用。R绘制好的图可以保存成多种格式，对应的生成函数名即它的扩展名。...、名称及扩展名，文件路径也可以通过path设置;plot填写图形对象，默认为最后显示的图形:device指定要使用的设备，自动提取文件扩展名;scale为比例因子。
以gcookbook包中的cabbage_exp数据集为例，该数据集包含两个分类变量Cultivar和Date和一个连续变量Weight。...x轴上的分类变量和一个绘制在y轴上的连续型变量。...有时候，我们想额外添加一个分类变量跟x轴上的分类变量一起对数据进行分组。 此时，可通过将该分类变量映射给fill参数来绘制簇状条形图，这里的fill参数用来指定条形的填充色。...输出图片 3 绘制堆积条形图 演示数据 同上，以gcookbook包中的cabbage_exp数据集为例，该数据集包含两个分类变量Cultivar和Date和一个连续变量Weight。...= T)) + guides(fill=guide_legend(reverse = T)) 4 绘制百分比条形图 演示数据 同上，以gcookbook包中的cabbage_exp数据集为例，该数据集包含两个分类变量
在 PHP 中如果要交换两个变量的值，一般使用中间临时变量来处理，比如： $tmp = $x; $x = $y; $y = $tmp; 比如上面交换临时变量 x 和 y 的值，就要用到临时变量 其实可以是用...PHP 函数 list 来处理： list($x,$y) = array($y, $x); 这样一行代码就简洁得多了，如果使用 PHP 7.1 及以上的版本，还可以使用短数组语法（[]）： [$x,
基本思想是ggplot2将数据的几何对象（圆圈，线条等），主题和比例放在上面。...几何对象的形式由geom_xxx（）函数定义，基于数据变量的几何对象的属性（位置，大小，颜色）由美学（aes（））函数指定（ 在geom_xxx（）函数中）。...使用+将图层添加到ggplot对象中。可能最常见的geom层是geom_point。 在geom_point（）里面，您将指定从变量到所需几何对象的美学映射。...但是，如果您想使用数据框中的变量来定义geoms的颜色（或任何其他美学特征），需要将它包含在aes（）函数中。...组合图片 您可以通过添加构面图层来创建由您选择的分类变量（例如“大陆”）分隔的图形的网格（或“构面”）。
ggstatsplot是ggplot2的扩展，用于绘制带有统计检验信息的图形。...ggstatsplot的思路就是将这两个阶段统一在带有统计细节的图形中，提高数据探索的速度和效率。 ggstatsplot提供了多种类别的统计绘图。...ggstatsplot和它的后台组件还可以和其他基于ggplot2的R包结合起来使用。...直方图 分配数字变量 ggdotplotstats 点图/图表 分配有关标记数字变量的信息 ggscatterstats 散点图 两个变量之间的相关性 ggcorrmat 相关矩阵 多个变量之间的相关性...如果只输入一个类别变量，单样本比例检验(即卡方拟合优度检验)的结果将显示为副标题。
KNN 算法基本要素 KNN 算法中，所选择的邻近实例都是已经正确分类的对象，该算法只依赖于最邻近的一个或者几个实例的类别来决定待分样本所属的类别，分类器不需要使用训练集进行训练，训练时间复杂度为 0，...3.2 作图分析 为了理解这些变量之间的关系，使用 R 中常用的 ggplot2 包绘制图。...在本例中，数据是 diabetesTib，我们想用变量 class 作为目标变量对数据进行分类。 定义 learner。learner 只是计划使用的算法的名称，以及该算法接受的任何其他参数。...mmce 是被分类为其他类别而不是真实类别的实例所占的比例，acc 与此相反，是模型正确分类的实例比例。 由此可见，模型对 98.62% 的实例都进行了正确的分类。...小编有话说 本期关于 KNN 算法的内容就先介绍到这里啦，下期将继续介绍交叉验证、如何选择参数 k 来优化模型以及使用 R 语言里的 knn 或 kknn 函数实现 k 近邻分类和有权重的 k 近邻分类等内容
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