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跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2堆积柱形图柱子单独配色多个图例排序

pdf 论文中大部分作图数据都有,争取把论文中的图都复现一下 今天的推文我们试着复现一下论文中的Figure2b image.png 今天推文的主要知识点就是四个柱子,每个柱子单独配色,然后4个图例如何调整四个图例的前后顺序...read_excel("data/20230305/41564_2022_1270_MOESM5_ESM.xlsx", sheet = "Fig2b") head(df) 每一列单独统计频率...%>% summarise(phylum_counts=n()) %>% ungroup() %>% mutate(group01=case_when( Phylum ==..."Actinobacteriota"))) -> df01 df01 image.png 以上代码需要单独运行四次 这里统计的和论文中的内容有些出入...(Class) %>% summarise(class_counts=n()) %>% ungroup() %>% mutate(group02=case_when( Class

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    在 WordPress 中如何使用 Date 和 Time

    使用 Date 和 Time 是程序员一个非常日常的工作,比如定时发布,定时抓取信息等。...PHP 提供很多 date/time 函数,但是 WordPress 有自己的一套,下面讲解下 WordPress 中使用 Date 和 Time 的经验和坑。...时区 - Timezone 使用 date/time 第一个的要注意的时时区,很多错误都是因为这个引起的,比如定时发布的文章在错误的时间发布了(比如你想是北京时间明天早上8点发布的,但是发布在格林尼治时间早上...Date 和 time 格式 WordPress 让我们在 设置 > 常规 修改默认的时间格式,所以我们尽量在代码使用这个格式,而不要使用 date() 来生成,除非你自己要生成特殊的格式。...PHP 中可以使用 Date 和 Time 做很多事情,但是一定要用 WordPress 方式使用它们。

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    在Git和GitHub中如何使用分支

    在之前关于 git 版本控制软件的两篇教程中,我们学习了 使用 git 的基本命令,以及 如何使用 GitHub 来建立仓库并将我们的项目代码推送到网站。...像 GitHub、GitLab 和 BitBucket 这样的平台通过在云端托管 git 仓库,使使用 git(尤其是在团队项目中)更加用户友好,开发人员可以在云端存储、共享和与他人协作编写代码。...如何在 Git 中使用分支 与其直接在主分支上工作,每个人都会从主分支创建新的分支来进行实验、修复错误,以及进行一般性的编辑、添加和更改。...在我们的场景中,我们将使用 hello_octo 分支来进行和测试我们的更改,然后将这些更改推送到 GitHub 上的主分支。...到目前为止,我们一直在使用一个极其简化的示例项目,因为此时最重要的是理解和吸收 git 工作流程。在现实世界中,合并比这要复杂得多 - 例如,如果您的合并出现冲突,会发生什么?

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    MySQL中变量的定义和变量的赋值使用

    说明:现在市面上定义变量的教程和书籍基本都放在存储过程上说明,但是存储过程上变量只能作用于begin…end块中,而普通的变量定义和使用都说的比较少,针对此类问题只能在官方文档中才能找到讲解。...前言 MySQL存储过程中,定义变量有两种方式: 1、使用set或select直接赋值,变量名以@开头 例如: set @var=1; 可以在一个会话的任何地方声明,作用域是整个会话,称为用户变量...注意上面两种赋值符号,使用set时可以用“=”或“:=”,但是使用select时必须用“:=赋值” 用户变量与数据库连接有关,在连接中声明的变量,在存储过程中创建了用户变量后一直到数据库实例接断开的时候...在此连接中声明的变量无法在另一连接中使用。 用户变量的变量名的形式为@varname的形式。 名字必须以@开头。 声明变量的时候需要使用set语句,比如下面的语句声明了一个名为@a的变量。...其区别在于使用set命令对用户变量进行赋值时,两种方式都可以使用;当使用select语句对用户变量进行赋值时,只能使用”:=”方式,因为在select语句中,”=”号declare语句专门用于定义局部变量

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    如何使用es和grafana在tempo中查找trace

    Tempo的工作是存储大量跟踪,将其放置在对象存储中,并通过ID检索它们。日志和其他数据源使用户能够比以往更快,更强大地直接跳转到跟踪。 以前,我们使用Loki和示例程序[1]研究了发现traces。...在本文中,我们探索使用另一个日志记录替代方案Elasticsearch和Grafana来直接建立从日志到traces的链接。...Elasticsearch数据链接 设置从Elasticsearch到Tempo的链接的技巧是使用data-link。在Elasticsearch数据源配置中,它类似于以下内容: ?...正确设置此链接后,然后在Explore中,我们可以直接从日志跳转到trace: ? 现在,您还可以使用Elasticsearch日志记录后端的所有功能来查找trace!...在过去的文章中,我们研究了使用Loki和示例,但我们也知道Elasticsearch是一个极其常见的日志记录后端。

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    在Java中如何把两个对象相同属性赋值

    在Java编程中,我们经常需要把一个对象的属性复制到另一个对象。...有多种方法可以实现这一目标,包括使用Java内置功能、使用第三方库如Apache Commons BeanUtils、或者使用Java 8的Streams API。下面我们会详细说明这几种方法。...一、使用Java内置功能进行属性复制 我们可以编写一个方法用于复制对象的属性,这需要访问对象的getter和setter方法。...BeanUtils.copyProperties(target, source);     } catch (Exception e) {         e.printStackTrace();     } } 注意,在使用...Streams API是Java 8引入的一个新特性,它能够把集合类(如List或Set)的元素转换成一个stream(数据流),通过对这个stream的操作,我们可以实现一些复杂的操作,例如过滤、映射、排序和归约

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    听说WGCNA官网崩了?那还能做基因共表达分析吗?

    对实验设计有良好的理解有助于我决定如何分析和可视化数据。 关键问题包括: 变异的来源是什么? 复制的水平是什么? 这metadata就派上用场了。...换句话说,在发育阶段和组织之间,哪个因素对实验中的变异贡献更大?这个问题的答案对于我们如何最有效地可视化数据至关重要。 获得实验全局视图的一个好方法是进行主成分分析(PCA)。...y轴(PC3)明显区分了种子和所有其他东西。 因此,在变异贡献方面,解剖方法 > 阶段 > 组织。我们将使用这些信息来指导下游的可视化。...为了最好地区分生物学变异和技术变异,我们应该对手收集和LM样本进行单独的基因共表达分析。 下面使用手收集的样本。...在实际分析中需要包含更多的基因,但是相关性分析中的基因越多,速度就会越慢。

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    在 ES 中如何使用排序

    在 Elasticsearch 中,排序是一项重要的功能,它允许我们按照特定的字段或条件对搜索结果进行排序。通过合理使用排序,我们可以更方便地找到所需的信息。...最常见的方式是在查询请求中使用`sort`参数。我们可以指定要排序的字段,并指定升序或降序排序。...例如,我们可以设置排序的权重,以确定不同字段在排序中的重要性。 在实际应用中,排序的使用需要考虑以下几个因素: 1. 用户需求:了解用户对搜索结果的期望排序方式,以便提供最相关和有用的结果。 2....12.使用缓存:缓存常用的排序结果,减少重复计算。 13.分布式架构:通过分布式部署提高系统的可扩展性和性能。 14.数据压缩:减少存储空间和网络传输量,提高效率。...总之,ES 中的排序功能为我们提供了强大的工具,使我们能够根据各种需求对搜索结果进行灵活的排序。通过合理使用排序,我们可以提高搜索的效率和准确性,为用户提供更好的体验。

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    在 Java 中如何使用 transient

    A:当对象被序列化时(写入字节序列到目标文件)时,transient阻止实例中那些用此关键字声明的变量持久化;当对象被反序列化时(从源文件读取字节序列进行重构),这样的实例变量值不会被持久化和恢复。...transient使用介绍 Q:如何使用transient? A:包含实例变量声明中的transient修饰符。片段1提供了小的演示。 ? ? ?...片段1:序列化和反序列化ClassLib对象 片段1中声明ClassLib和TransDemo类。...类中的成员变量和transient Q:类中的成员变量中可以使用transient吗? A:问题答案请看片段2 ? 片段2:序列化和反序列化Foo对象 片段2有点类似片段1。...但不同的是,序列化和反序列化的是Foo对象,而不是ClassLib。此外,Foo包含一对变量,w和x,以及实例变量y和z。

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    在Scrapy中如何使用aiohttp?

    特别是当你使用的是Scrapy,那么这个问题变得尤为麻烦。 我们一般在Scrapy的下载器中间件里面设置爬虫的代理,但问题来了,在下载器中间件里面,你怎么发起网络请求?...实际上,我们可以在Scrapy里面,使用aiohttp,这样既能拿到代理IP,又能不阻塞整个爬虫。...为了说明如何编写代码,我们用Scrapy创建一个示例爬虫。...请求频率和延迟如下图所示: ? 请求频率接近1秒钟一次。 现在,我们创建一个中间件,在这个中间件里面,使用requests请求一个需要延迟5秒钟才会返回的网址: ?...在等待第一页返回的过程中,第二个延迟请求完成并返回,于是Scrapy去请求正式网址的第二页…… 总之,从Scrapy打印出的信息可以看出,现在Scrapy与aiohttp协同工作,异步机制正常运转。

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    在HTML中如何使用CSS?

    一、前言 在 HTML 中使用 CSS,包括内联式、内嵌式、链接式和导入式。...使用链接式 CSS,可以在设计整个网站时,将多个页面都会用到的 CSS 样式定义在一个或多个 文件中,然后在需要用到该样式的 HTML 网页中通过 标记链接这些 文件,通过链接式 CSS 可以降低整个网站的页面代码冗余并提高网站的可维护性...2.4 导入式 导入式和链接式的用法基本相同,区别在于语法和使用方式上略有不同。导入式通过在 标记的 标记中使用 方法导入相应的 CSS 文件。...例如,可以在 文件中不写任何 CSS 代码,只写 ,这样所有导入或链接到该 CSS 文件的 HTML 页面都可以使用 中定义的所有样式效果。...这时解决 CSS 冲突你就要了解在 HTML 中使用 CSS 的优先级规则: 内联式 > 内嵌式 > 外部样式; 在多个样式中,后出现的样式的优先级高于先出现的样式; 在样式中,选择器的优先级: 样式

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    在Python中如何使用Elasticsearch?

    来源:Python程序员 ID:pythonbuluo 在这篇文章中,我将讨论Elasticsearch以及如何将其整合到不同的Python应用程序中。 什么是ElasticSearch?...通过实施ES,你不仅可以为Web应用程序提供强大的搜索引擎,还可以在应用程序中提供原生自动补全功能。 你可以获取不同类型的日志数据,然后可以使用它来查找趋势和统计信息。...不过,你可以使用ElasticSearch的Python库专注于主要任务,而不必担心如何创建请求。 通过pip安装它,然后你可以在你的Python程序中访问它。...我们的目标是访问在线食谱并将它们存储在Elasticsearch中以用于搜索和分析。我们将首先从Allrecipes中获取数据并将其存储在ES中。...我使用Chrome,借助名为ElasticSearch Toolbox的工具使用ES数据查看器来查看数据。 在我们继续之前,让我们在calories字段中发送一个字符串,看看它是如何发生的。

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    在XCode中如何使用高级查询

    对于一个框架来说,仅有基本的CURD不行,NewLife.XCode同时还提供了一个非常宽松的方式来使用高级查询,以满足各种复杂的查询需求。...(本文同样适用于其它任何数据访问框架) 先上图看一个复杂查询的效果图: image.png 这里有8个固定的查询条件和1个模糊查询条件,加上多表关联(7张表)、分页、统计,如果用传统的做法,这个查询会非常的复杂...XCode不支持多表关联(v7开始测底不支持,以前的支持太鸡肋,几乎从未使用),这种涉及多表关联的查询,就需要子查询来代替了,看看SearchWhere: image.png image.png 可以看到...在各个小片段上使用MakeCondition格式化数据,保证这些代码能根据当前数据库生成相应的语句,使得系统能支持多数据库。比如时间日期类型,在MSSQL是单引号边界,在Access是井号边界。...NewLife.XCode下载地址:http://XCode.codeplex.com 没有很完整的教程,只有本博客中的点点滴滴!

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    在 Python 中如何使用 format 函数?

    前言 在Python中,format()函数是一种强大且灵活的字符串格式化工具。它可以让我们根据需要动态地生成字符串,插入变量值和其他元素。...本文将介绍format()函数的基本用法,并提供一些示例代码帮助你更好地理解和使用这个函数。 format() 函数的基本用法 format()函数是通过在字符串中插入占位符来实现字符串格式化的。...占位符使用一对花括号{}表示,可以在{}中指定要插入的内容。...位置参数和关键字参数 除了使用位置参数外,还可以使用关键字参数来指定要插入的值。关键字参数可以提高代码的可读性,并允许我们按照需要指定要插入的值的顺序。...我们学习了如何使用占位符插入值,并可以使用格式说明符指定插入值的格式。我们还了解了如何使用位置参数和关键字参数来指定要插入的值,以及如何使用特殊的格式化选项来格式化数字。

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    在Vue 中如何使用动态样式

    在日常开发中随着用户需求的日益多样化,界面设计也日益复杂,如何在保持代码简洁的同时,实现界面的动态变化,是一项不小的挑战。...,这些变量可以在整个项目中的任何SCSS文件中使用。...这样做的好处是可以在一个地方集中管理项目的样式,便于统一修改和维护。SCSS变量的优势一致性:通过全局变量,可以确保整个项目中使用的颜色、字体大小、间距等样式属性保持一致。...,各种组件都需要统一使用样式变量,每个页面引入是不现实的,最佳的解决方案就是,将scss中的变量在全局引入,所有页面都可以访问到.安装 sassnpm install sassvite.config.ts...scss和js变量互相使用在 Vue 3 中使用 SCSS 变量 来实现样式的一致性和可重用性是一个很好的做法。

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