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scRNA挖掘 |只有矩阵如何构建单细胞对象?meta信息如何利用?

如果提供的是标准的10X的三个文件就可以直接read10X读取,那如果只有矩阵文件如何进行下游分析呢? 如果额外给了细胞水平的meta文件,如何利用呢?...1.2 创建seurat对象 依然使用CreateSeuratObject 函数,此处count 为读取的矩阵文件。...二 添加meta信息 文献提供的metadata文件中含有每个细胞的patient ,sample ,celltype 以及 cluster ,是很有利用价值的 。...之前在scRNA分析|Marker gene 可视化 以及 细胞亚群注释--你是如何人工注释的?...中提到了如何添加亚群注释(cluster level)结果到metadata的方式,这里介绍下如何添加每个细胞(cell level)的metadata。

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    Active Record基础

    Record 模式: 中,对象中既有持久存储的数据,也有针对数据的操作,Active Record 模式把数据存取逻辑作为对象的一部分,处理对象的用户知道如何读写数据。...对象关系映射: ORM是一种技术手段,把应用中的对象和关系型数据库中的数据表连接起来,使用ORM,应用中对象的属性和对象之间的关系可以通过一种简单额方法从数据库中获取,无需直接编写SQL语句,也不过度依赖特定的数据库种类...Active Record 的约定 命名约定 Rails把模型的类名转换为复数,然后查找对应的数据表,Rails提供的单复数转换功能非常强大,类名应该使用驼峰命名: ?...User.find_by(name: 'huruji') user.update(name: 'xie') 使用update_all批量更新数据 User.update_all "age = 12, sex = man" 删除...迁移的代码储存在特定的文件中,可以通过rails命令执行。

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    AFNetworking源码探究(十一) —— 数据解析之子类中协议方法的实现

    回顾 上一篇我们主要介绍了有关数据解析类和协议,以及实现解析的架构,这一篇就分开讲述各个类是如何实现对应的数据解析的。...,该对象将数据解码为更有用的对象表示。...接着进行判断,如果数据长度大于0,而且有响应URL,那么就生成mutableUserInfo信息,调用下面的方法生成错误信息。...@讨论MIME类型基于提供的信息 来源。 但是,该值可能会改变或 如果可以确定原始服务器或来源报告了信息 不正确或不准确,则由协议实施纠正 。...Defaults to `NO`. */ @property (nonatomic, assign) BOOL removesKeysWithNullValues; 是否从响应JSON中删除具有NSNull

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    Rails 构建评论功能(11)

    对评论的删除加入基础认证 [root@h202 blog]# vim app/controllers/comments_controller.rb [root@h202 blog]# cat app...http_basic_authenticate_with name: "soft", password: "dog", only: :destroy [root@h202 blog]# 这时直接添加或修改文章和删除评论都会触发认证...,这个框架已经帮忙自动完成了,我们需要做的只剩下去填补最基本的对象定义,逻辑关系,展示方式 这个流程是绝大多数管理后台的开发过程,使用rails,竟然只用两篇博客就讲清楚了 ---- 命令汇总 ruby...-v gem -v rails --version node -v rvm -v rails server -b 0.0.0.0 rails --help rails generate model Comment...commenter:string body:text rails destroy model Comment rails generate model Comment commenter:string

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    架构之美:教你如何分析一个接口?

    相信没有人能把所有接口细节记住, 如何才能理清繁杂的接口呢? 找主线,看风格。 找主线,你需要找到一条功能主线,建立起对这个项目结构性的认知,而不是一上来就把精力放在每个接口的细节。...REST如今已经成为很多人耳熟能详的名词,它把Web 的各种信息当作资源。...既然是资源,它就可以对这些Web信息做各种操作,这些操作对应着HTTP的各种动词(GET、POST、PUT、DELETE等)。 REST是为了纠正大家对HTTP的误用。...resources :articles ... end 在用Rails写程序的时候,你只要添加一个resource进去,它就会替你规划好这个资源应该如何去写、怎么设计URL、用哪些HTTP动词,以及它们对应到哪些方法...我们不仅要创建一个对象,还要写对应的SQL语句,还要把查询出来的结果,按照一定的规则组装起来。

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    如何删除GIT仓库中的敏感信息

    但如果已经上传了,或功能太多太复制没办法及时删除,就会后悔莫及了。 这里我将演示一个故意写满“敏感信息”的Github仓库,然后一步一步演示怎么在历史记录中,删除“敏感信息”,以完成“脱敏”。...文件夹敏感 删除 Program.exe 大二进制 删除 这个演示满载“敏感”信息的代码仓库,可以从:https://github.com/sdcb/sensitive-repo-demo 这里下载...如何删除敏感信息 2.1 前置条件 必须先切换到主分支(一般为master),然后获取最新代码再进行操作: git checkout master git pull 如果有任何修改的对象,都会阻止提交,...2.3 bfg-删除其它信息 bfg([BFG Repo-Cleaner](https://rtyley.github.io/bfg-repo-cleaner/))是个强大的工具,有如下功能: 用于删除文件内敏感信息...执行命令,删除敏感信息 3.1 删除个人邮箱签入“公司”项目 执行如下命令即可: git filter-branch --env-filter ' OLD_EMAIL="sdflysha@qq.com

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    如何批量删除k8s资源对象

    将 我的小碗汤 设为星标 第一时间阅读精品 文末极客时间课程大减价 kubernetes版本:1.13.2 在云平台开发、中间件容器化时,经常会遇到批量删除k8s资源对象的需求,下面记录一下kubectl...和golang发送删除pvc、pv、pod请求的例子,便于后续学习查阅 kubectl发送删除请求 根据label批量删除pod: kubectl delete pod -n kube-system -...golang发送删除请求 根据label批量删除pvc、pod、pv 注意:启动参数中加入以下参数: --kubeconfig=/root/.kube/config --v=5 package operator...", err) } return kubeClient, extensionClient, kubeconfig, nil } client-go中提供的 Delete方法,只能删除单个资源对象...,第一个参数往往是资源对象名称,第二个参数是删除选项,如:优雅终止时间GracePeriodSeconds、删除传播策略:Foreground前台删除、后台删除:Background、孤儿删除:Orphan

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    Kubernetes 中的对象是如何删除的:Finalizers 字段介绍

    前言 Kubernetes 中的对象删除并不像表面上看起来那么简单,删除对象涉及一系列过程,例如对象的级联和非级联删除,在删除之前检查以确定是否可以安全删除对象等等。...(垃圾收集器)负责的,其作用就是当删除一个对象时,会根据指定的删除策略回收该对象及其依赖对象。...继续重新创建属主和附属对象,Kubernetes 默认删除时使用级联删除,这次我们在删除属主对象的时候加上参数 --cascade=orphan,表示使用非级联删除,这样删除属主对象后,附属对象依然存在...接下来演示 Kubernetes 是如何延迟删除 PV 和 PVC 对象的。首先删除 PV。...Foreground 先删除附属对象,再删除属主对象;Background 先删除属主对象,再删除附属对象。

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    经验分享 | 如何通过SQL获取MySQL对象的DDL、统计信息、查询的执行计划

    获取对象定义的SQL语句 获取表和视图的列表 select table_name, table_type from information_schema.tables where table_schema...获取对象统计信息的SQL语句 2.1 表级统计信息 查询语句 select table_schema, table_name, table_type, engine, table_rows from information_schema.tables...where table_schema = $dbname 查询结果 2.2 索引统计信息 收集索引统计信息的命令 analyze table customer; analyze table 会统计索引分布信息...stat_value, stat_description from mysql.innodb_index_stats where database_name = 'tpch' 查询结果 2.3 列级统计信息...收集列上的统计信息 analyze table orders update histogram on o_custkey, o_orderdate with 100 buckets; 查询语句 select

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    如何在Ubuntu 14.04上使用MySQL和Ruby on Rails应用程序

    本教程将向您展示如何在Ubuntu 14.04服务器上设置开发Ruby on Rails环境,以允许您的应用程序使用MySQL数据库。首先,我们将介绍如何安装MySQL和MySQL适配器gem。...然后我们将向您展示如何创建使用MySQL作为其数据库服务器的rails应用程序。 准备 一台已经设置好可以使用sudo命令的非root账号的Ubuntu服务器,并且已开启防火墙。...首先,我们需要告诉MySQL创建其数据库目录结构,它将存储其信息。...您可以通过输入以下内容来执 sudo mysql_install_db 之后,我们想要运行一个简单的安全脚本,它将删除一些危险的默认值并锁定对我们的数据库系统的访问。...这将删除一些示例用户和数据库,禁用远程root登录,并加载这些新规则,以便MySQL立即尊重我们所做的更改。 MySQL现已安装,但我们仍然需要安装MySQL gem。

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    在Debian 9上使用Apache安装Ruby on Rails

    本指南将向您展示如何使用Phusion Passenger在您的Linode上部署Rails应用程序。...完成“ 保护您的服务器 ”部分以创建标准用户帐户,加强SSH访问并删除不必要的网络服务。...使用Rubygems包管理器安装Rails: gem install rails --version=5.1.4 将您的Rails应用程序移动到您的Linode,或者如果您还没有应用程序,则创建一个新应用程序...将路径替换为您的Rails应用程序,Ruby解释器的路径(来自上一步),主机名或IP地址以及必要时的任何其他信息。...您应该看到显示的默认Rails页面。 更多信息 有关此主题的其他信息,您可能需要参考以下资源。虽然提供这些是希望它们有用,但请注意,我们无法保证外部托管材料的准确性或及时性。

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    总结Web应用中常用的各种Cache

    但是这样会遇到一个问题,假设我们的网站导航有用户信息,一个用户在未登陆专题访问了一下,然后登陆以后再访问,会发现页面上显示的还是未登陆状态。...('public', 'categories'), 'w') do |f| f.write response.body end endend 另外我们需要在任何分类更新的时候,删除掉这个文件..., "xxx", :expires_in => 1.day do 小技巧2:关联对象的自动更新 常使用对象update_at时间戳来作为cache key,可以在关联对象上加上touch选项,自动更新关联对象时间戳...,比如我们可以在更新或者删除文章评论的时候,自动个更新: class Article has_many :commentsendclass Comment belongs_to :article...rails内置了query cache (https://github.com/rails/rails/blob/master/activerecord/lib/active_record/connection_adapters

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    如何在Ubuntu 18.04上使用rbenv安装Ruby on Rails

    接下来,将您对~/.bashrc文件所做的更改应用于当前的shell会话: source ~/.bashrc 使用该type命令验证是否已正确设置rbenv,该命令将显示有关该rbenv命令的更多信息...使用ruby-build插件的' uninstall子命令删除这些以前的版本。...第七步 - 卸载rbenv 如果您已经决定不再使用rbenv,则可以将其从系统中删除。...然后使用以下命令删除rbenv和所有已安装的Ruby版本: rm -rf `rbenv root` 注销并重新登录以将更改应用到shell。...结论 在本教程中,您安装了rbenv 、Ruby及Rails 。从此,您可以了解有关使这些环境更加强大的更多信息。 想要了解更多关于Ubuntu的开源信息教程,请前往腾讯云+社区学习更多知识。

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