如何向networkx中的节点添加属性
在networkx中向节点添加属性，可以通过以下步骤实现：
- 创建一个空的图形对象：
import networkx as nx
G = nx.Graph()- 添加节点到图形对象中：
G.add_node('A')
G.add_node('B')- 为节点添加属性：
G.nodes['A']['color'] = 'red'
G.nodes['B']['color'] = 'blue'在上述代码中，我们为节点'A'和'B'分别添加了名为'color'的属性，并分别赋值为'red'和'blue'。
- 可以通过以下方式获取节点的属性：
print(G.nodes['A']['color'])上述代码将打印出节点'A'的'color'属性值。
在networkx中，节点的属性可以是任何Python对象，例如字符串、数字、列表等。你可以根据需要为节点添加多个属性，以满足具体的应用场景。
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相关·内容
我在NetworkX中有一个NetworkX()，并且希望为CircosPlot中的每一个边缘设置边缘颜色。我使用以下语法(这只是一个例子)：
import networkx as nx
G = nx.DiGraph()
G.add_edge(1,2,color='r',weight=2)
G.add_edge(2,3,color='b',weight=4)
pos = nx.circular_layout(G)
edges = G.edges()
colors = [G[u][v]['color'] for u,v in edges]
w
浏览 0提问于2018-11-18得票数 2
回答已采纳
我希望每个节点都有一个ipaddress字符串、纬度和经度值。另外，在查找networkx创建的图形时，如何获得指向此类对象的指针？
浏览 0提问于2011-12-13得票数 3
回答已采纳
我想使用DiGraph of networkx创建一个无向图。我想要不同的标签在边缘为相对边缘。我的代码是：
G = nx.DiGraph()
nodes = [1, 2, 3]
edges = [
(1, 2, {"label": "1-2"}),
(2, 3, {"label": "2-3"}),
(3, 1, {"label": "3-1"})
]
G.add_nodes_from(nodes)
G.add_edges_from(edges)
edge_labe
浏览 0提问于2021-04-23得票数 2
我有一个问题，我有一个有向(或无向)非加权图，我需要找到从s-t的简单路径。唯一的复杂之处在于，我需要避免某些标记为红色的节点。 我找到了python NetworkX图形库，发现它非常合适。我想用networkx.dijkstra_path() (或者也可以使用bfs函数)来查找最短路径。 在这段代码中，我构建了一个非常简单的图，并找到了从s=0到t=4的路径： import networkx
G = networkx.Graph()
for i in range(5):
G.add_node(i)
# from zero
G.add_edge(0,1)
G.add_edg
浏览 52提问于2020-11-02得票数 0
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我试图在NetworkX中绘制自循环，但没有成功，所以我改用GraphViz，它很管用。但是，我不知道如何才能像在NetworkX中那样将图形节点和边变成彩色。
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.cm as cm
import matplotlib.colors as cl
G = nx.DiGraph()
G.add_edges_from([('A', 'B'),('A', 'B'), ('A', &#
浏览 3提问于2021-09-02得票数 0
我使用networkX构建有向图，并且需要找到包含特殊节点的子图。我尝试了node_connected_component，但是它不能实现有向图，还有其他函数可以在networkX中实现有向图吗？
浏览 2提问于2017-11-14得票数 0
我在试着把networkx的数据带进cytoscape。我使用的是graphml，这部分很好，但是我有一个属性parent=node_name，我想用它来建立一个组。我找不到如何在cytoscape中映射它。关于如何在cytoscape中自动创建群组有什么想法吗？
示例：
G = nx.Graph()
G.add_node("server1")
G.add_node("server1_port1", parent="server1")
G.add_node("server1_port2", parent="server1&
浏览 1提问于2018-02-08得票数 0
2回答
我试图在pygraphviz中可视化一个自动机，就像中的例子一样
我发现节点形状可以更改如下：
A.node_attr['shape']='circle' # A is a pygraphviz AGraph
这会改变所有节点的形状，但是我想对不同的节点使用不同的节点形状(有些是'circle'，有些是'doublecircle')。有什么建议吗？
注意:我使用pygraphviz是因为我想使用networkx图形对象，这些对象可以转换为pygraphviz__的AGraph对象。而且，显然networkx不能产生这样的
浏览 0提问于2020-01-05得票数 1
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我正在使用deap符号回归示例中的代码，图形显示得很好，但我希望节点作为圆角矩形展开，以适应文本automatically.(我不想通过尝试和错误来指定节点大小)。我该怎么做？
# show tree
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx
nodes, edges, labels = gp.graph(bests[0])
graph = networkx.Graph()
graph.add_nodes_from(nodes)
graph.add_edges_from(edges)
pos = networkx.graphviz_lay
浏览 8提问于2015-01-10得票数 6
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在igraph中，我发现了两种将图转换为无向图的不同方法：
第一个是to_undirected，它简单地“将有向图转换为无向图”。第二个是as_undirected，它在副本上调用to_undirected。
在NetworkX中，我发现只有一个方法to_undirected，它只是简单地创建图形的无定向深层副本。问题是我真的找不到与igraph中的第一个方法类似的方法。在不使用NetworkX创建副本的情况下转换图形有什么解决方案吗？
浏览 3提问于2015-06-29得票数 0
我有图表
我需要获取节点的颜色。我试着用
color = nx.get_node_attributes(G, 'color')
但它返回空字典。我做错了什么？图形是用
G = nx.erdos_renyi_graph(100, 0.05)
pos = nx.spring_layout(G)
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, G.nodes(), node_size=20, node_color='b')
nx.draw_networkx_edges(G,pos, alpha=0.3)
plt.show()
浏览 0提问于2017-03-23得票数 1
在下面的示例中，如何更改单个节点的颜色？
%pylab inline
import pandas as pd
import networkx as nx
import holoviews as hv
hv.extension('bokeh')
G = nx.Graph()
ndxs = [1,2,3,4]
G.add_nodes_from(ndxs)
G.add_weighted_edges_from([(1,2,0), (1,3,1), (1,4,-1),
(2,4,1), (2,3,-1), (3,4,10)])
浏览 4提问于2018-05-22得票数 0
1回答
在networkx中，我有一个Graph对象，我希望存储一个像partition这样的节点属性，以生成一个分区。实现这一目标的最佳做法是什么？
浏览 0提问于2017-01-17得票数 0
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1回答
我已经将graphml从Gephi导入到NetworkX。
G = nx.read_graphml(r"pah\EXPORTCM0606.graphml")
在Gephi中，我计算了模块化类，获得了6个主要的社区，现在我想在NetworkX中获得这些社区，以便获得他们推文中最频繁的单词。所以我的问题是双重的:我如何使用NetworkX从G中获得这些已经在Gephi中计算的模块化类社区？
那么我如何将我从MongoDB生成的图形与tweet和从Gephi导入的图形进行匹配呢？从MongoDB生成带有tweet的图形的代码：
from pymongo import MongoCli
浏览 48提问于2021-06-20得票数 0
我有以下代码来可视化networkx图：
node_positions = networkx.spring_layout(graph)
networkx.draw_networkx_nodes(graph, node_positions)
networkx.draw_networkx_edges(graph, node_positions, style='dashed')
我想在每个节点上显示节点标签。graph.nodes()将给出所有节点的列表，但是我如何使用它们来标记图上的节点呢？
我试过了，但不起作用：
networkx.draw_networkx_labels(gra
浏览 3提问于2015-09-28得票数 3
如果我有一个来自python dataframe的networkx图，并且我已经从它生成了邻接矩阵。那么基本上，如何得到邻接矩阵的标签呢？
浏览 0提问于2019-01-19得票数 0
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当将networkx图导出到GML时，我如何显式地设置标签？考虑到这个脚本：
import networkx as nx
G2 = nx.DiGraph()
G2.add_node( "id:UserA", label="Cat" )
G2.add_node( "id:Userb", label="Dog" )
nx.write_gml(G2, 'tt.gml')
我得到了
graph [
directed 1
node [
id 0
label "id:UserA"
浏览 0提问于2020-05-10得票数 0
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我想将一个具有非唯一节点的networkx对象存储在graphviz文件中。我使用标签在networkx中创建了非唯一节点。但是它能够用非唯一的标签显示节点。
G = nx.MultiDiGraph()
G.add_node(0)
G.add_node(1)
G.add_node(2)
labels = {0: 'a', 1: 'b', 2: 'a'}
pos=nx.spring_layout(G)
nx.draw_networkx_nodes(G,pos)
nx.draw_networkx_edges(G,pos)
nx.draw_networ
浏览 4提问于2019-11-03得票数 1
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我有一个.txt文件，它有46行，每一行代表网络中的一个节点，然后它后面有很多属性。
Example Name; 03.01.194, Luzern, (LU), Test, Attribute, Other Attribute,
Kasdasd Alex; 22.12.1957, in Blabla, (ZH), Bürgerorte, Oeschgen (AG), Zivilstand,
我不知道我怎么能让networkx把它看作是一个节点主义者，一些我想过的事情，也许可以工作，但现在不行。
import pandas as pd
import networkx as nx
node
浏览 2提问于2015-11-02得票数 2
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我正在尝试使用networkx为树图创建可视化。
如何选择根节点？也就是说，第一个从上到下。
运行以下代码：
import networkx as nx
import pydot
import matplotlib.pyplot as plt
from networkx.drawing.nx_pydot import *
G = nx.Graph()
G.add_edge(1,2)
G.add_edge(2,3)
G.add_edge(2,4)
G.add_edge(4,5)
G.add_edge(4,6)
G.add_edge(5,7)
pos = pydot_layout(G, pro
浏览 18提问于2020-11-17得票数 0
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1回答
我正在处理属于两种类型{'human', 'machine'}的一个小示例节点集，我希望在networkx图中的每个节点之外以字典形式标记节点属性，例如下面的图中的节点c、e、j中所示的节点属性。(我使用MS Word在图形上添加字典类型的属性)：
使用以下代码生成基本图：
import networkx as nx
G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(['a', 'b', 'c', 'd', 'e', 'f', 'g'
浏览 4提问于2017-09-15得票数 6
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2回答
我试图在不使用networkx的情况下从头开始实现。我是图和图论的新手，我不能完全理解如何实际计算图中节点的近邻。有没有人能帮我讲讲这个概念以及如何计算？
浏览 1提问于2017-05-25得票数 0
我正在使用networkx从一个txt文件构建一个电子邮件网络结构，其中每一行代表一个“边缘”。我首先将txt文件(3列：{‘#发件人’、‘收件人’、'time'})加载到Python中，然后使用以下代码将其转换为networkx对象：
import networkx as nx
import pandas as pd
email_df = pd.read_csv('email_network.txt', delimiter = '->')
email = nx.from_pandas_dataframe(email_df, '
浏览 1提问于2017-09-19得票数 0
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2回答
我有一个networkx DiGraph，我想通过传递一个节点列表从其中提取一个子图。但是，子图可以包含在我传递的节点之间的所有节点。我检查了nx.subgraph()，但它不像我打算的那样工作。关于一个小例子：
import networkx as nx
G = nx.DiGraph()
edges = [(7, 4), (3, 8), (3, 2), (3, 0), (3, 1), (7, 5), (7, 6), (7, 8)]
G.add_edges_from(edges)
H = get_subgraph(G, [0,6,7,8])
如何编写函数get_subgraph()，使H具有
浏览 8提问于2020-05-21得票数 1
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我使用python3和networkx来构造一个图。Networkx真的很棒，但假设我想将一些不错的对象作为节点放入其中。下面是我的对象生成器(为了演示目的，它是一个简单的类)：
class DictToObject:
def __init__(self, dic):
for key, value in dic.items():
setattr(self, key, value)
def __eq__(self, other):
return self.id == other.id
下面是一些节点：
import netw
浏览 1提问于2016-01-11得票数 1
回答已采纳
1回答
我有一个shapefile，我正在转换为一个.xml文件，以便在MATSim中使用。文件结构如下：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE network SYSTEM "http://www.matsim.org/files/dtd/network_v1.dtd">
<network name="VISUM export national network 2007-11-28">
<!-- ===================
浏览 7提问于2014-09-12得票数 0
我是networkx (2.4版)的新手，当我尝试添加nodelist时，我对中的错误感到有点困惑。我试图使用以下代码为网络中的每个块设置一个不同的颜色属性：
import networkx as nx
N_p = 10
N_n = 10
N_0 = 30
sizes = [N_p, N_n, N_0]
probs = [[0.25, 0.05, 0.02],
[0.05, 0.35, 0.07],
[0.02, 0.07, 0.40]]
nodelist = ['blue' for i in range(N_p)]
nodelist.ext
浏览 2提问于2019-11-26得票数 1
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3回答
我目前正在研究我的大学专题。我的问题是，我可以删除所有我不想要的节点，但是我想保留一些特定的节点。我就是这样做的。
1.将gml读入networkx
2.使用此代码删除我不想要的网站，然后将其写入一个新的gml文件中
import networkx as nx
G = nx.read_gml('test.gml')
for i in range(2000):
for node in G.nodes:
if "pu.edu.tw" not in node:
G.remove_node(node)
浏览 3提问于2020-12-01得票数 2
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我仍然是networkx的初学者，我想在不同的位置添加多种类型的节点，我使用了以下代码
pos = {0: (40, 20), 1: (20, 30), 2: (40, 30), 3: (30, 10)}
X=nx.Graph()
nx.draw_networkx_nodes(X,pos,node_size=3000,nodelist=[0,1,2,3],node_color='r')
但是当我想访问图形X时，如果我输入X.node，它会返回一个空列表，如果我想添加更多的节点，我必须使用pos字典在开头设置它们的位置。
如何使用add_node()将节点添加到图中的特定位置x
浏览 0提问于2012-08-04得票数 37
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1回答
给出的是：大边缘列表，约有9000万到1亿个边，200万个节点.这些边构成了一个由数千个连通部件组成的巨型图。
我还有一个感兴趣的节点列表。我只想提取包含这些节点的CCs的边缘。
例如，下面是一个很小的例子:考虑一个包含3 CCs的小图。
edge_list = [(1,2), (3,2), (1,1), (4,5), (5,6), (4,6), (7,8), (8,9), (9,7)] #three CCs
## Below commands for visualization sake
G = nx.Graph()
G.add_edges_from(edges)
nx.draw(G, w
浏览 5提问于2021-07-03得票数 1
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我刚开始用Python创建图形。我试图使用Python中的graphviz库创建一个简单的逻辑树。
我使用的代码如下
import graphviz
h = graphviz.Digraph(filename = "output/logictree.gv")
#Nodes
#Red boxes
h.attr('node', color='red', shape = "box" )
h.node(name = "a", label = "Emissions Intensity (gCO2/vkm)"
浏览 14提问于2022-03-18得票数 0
1回答
我编写了一个代码来将我的MultiDiGraph()转换成一个pydot图来显示自循环和箭头，但是在转换之后，pydot图A丢失了G的所有属性。如何更改图A的节点大小并将其设置为node_sizes[]列表中的相应值，就像我对G所做的那样
代码：
def draw_graph(graph, size):
# extract nodes from graph
nodes = set([n1 for n1, n2 in graph] + [n2 for n1, n2 in graph])
print("Nodes ",nodes,"\n")
浏览 2提问于2017-11-05得票数 4
1回答
在python3中标记图形
、、、、
我正在尝试使用networkx构建一个图形，使用节点作为类对象。我已经标记了节点，但是我不能显示标记的边(实际上，根本不是边)。我希望通过在Node类中定义相邻节点来做到这一点。我的代码如下： # Packages
import random as rd
import networkx as nx
from matplotlib import pyplot as plt
# Classes
class Node:
def __init__(self, name):
self.name = name
self.state = rd.choice([
浏览 14提问于2020-07-13得票数 0
在Gephi中，当我将Fuchterman Reignold应用于几乎没有边的图时，我得到的结果如下： ? 当我使用networkx使用spring_layout绘制相同的图形时，圆的中心往往更空： ? 我如何才能使networkx布局看起来更像gephi布局，而不是自己定位每个节点？
浏览 60提问于2019-04-23得票数 0
5回答
我已经使用networkx很长一段时间了，直到最近我开始研究社区检测时，它已经很好地满足了我的目的。相比之下，igraph包似乎有更广泛的社区检测方法实现(甚至与Thomas的社区包中的networkx相比)。我只是想知道是否有任何现有的、经过测试的API，可以轻松地将networkx图转换成in结构，这样我就可以利用in在这方面提供的强大功能了吗？
我们非常感谢您的好意回答。
浏览 21提问于2014-04-23得票数 19
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1回答
我目前正在尝试用NetworkX生成一个网络图。数据集有以下格式(它是一个CSV)：
Id, Tag
0, 'science'
0, 'history'
1, 'sports'
3, 'sci-fi'
3, 'history'
3, 'music'
目标是显示标签之间的关系。F.e.科学与历史有着密切的联系，因为它们有着相同的身份。现在我被困在这里了:我如何创建一个表/矩阵，其中有两个列供NetworkX使用作为源(-Tag)和目标(-Tag)？
我试着用Pandas创建一个Dataframe，然后
浏览 3提问于2020-04-02得票数 1
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我有一个关于PageRank的问题，这可能表明我对它不太了解。如果我有一个具有两个节点"A“和"B”的图，并且链接A --> B权重1.0和B --> A权重2.0，那么A不应该排名更高，因为它的度权重更高吗？
当我在networkx上尝试PageRank时，似乎情况并非如此，但我不知道为什么。
>>> from networkx import nx
>>> DG = nx.DiGraph()
>>> DG.add_weighted_edges_from([("A", "B",
浏览 0提问于2013-04-12得票数 2
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1回答
如何在最短路径中(在NetworkX库中)对节点进行着色。我找到了一种添加不同颜色节点的方法，但是我不知道如何编辑随机图中的节点。我可以想象这相当容易，但我在文档中找不到这一部分。下面的代码生成一个随机图，并计算最短路径，如果这是完美的，那么我所需要的就是以某种方式标记这条路径。
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
G = nx.fast_gnp_random_graph(20, 0.14, seed="303", directed=False)
shortestPath = nx.shortest_p
浏览 18提问于2014-11-27得票数 1
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1回答
我使用的是NetworkX 1.9.1。
我有一个图形，我需要组织与立场，然后我导出到图形to格式。
我尝试过中的代码。它不起作用，下面是我的例子
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
G = nx.read_graphml("colored.graphml")
pos=nx.spring_layout(G) # an example of quick positioning
nx.set_node_attributes(G, 'pos', pos)
nx.write_graphml(G
浏览 8提问于2015-03-07得票数 1
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2回答
我一直试图解析networkx的一些附加属性，以供以后使用，并且遇到了一个问题。
当从Cytoscape给出gml文件时，networkx输出自己无法读取的gml文件。
例如，将->转换为networkx ->输出->到networkx ->错误：
pyparsing.ParseException: Expected "]" (at char 1116756), (line:71732, col:3)
现在，该错误在节点之后请求一个额外的] (AKA使图形忽略边缘)，如果这样做，则该图可以工作。然而，它不再有任何边缘。
为了全面测试这一点，我完成了“-&
浏览 8提问于2013-10-14得票数 1
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我正在使用networkx (python中的图形库)，我发现有文档说PageRank算法在评分时会考虑边权重，但我想知道边权重越大越好，还是权重越低越好？
浏览 0提问于2012-02-04得票数 22
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1回答
我使用库networkx在python中定义了两个图，现在我想测量这两个图之间的距离，考虑到节点的“名称”。
我创建了两个图，看起来完全相同(树图)
G=nx.Graph()
G.add_edges_from([("A","B"),("A","C")])
H=nx.Graph()
H.add_edges_from([("X","Y"),("X","Z")])
res=nx.graph_edit_distance(G,H)
res2=nx.optimize_edit
浏览 3提问于2019-03-29得票数 4
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1回答
我正在尝试使用给定节点和属性的networkX来制作网络图。每个节点都是唯一的，但它可以具有与其他节点匹配的属性。这些属性将充当所有具有相同属性的节点之间的边。
输入示例(节点和属性)
Name1 2-s2.0-84905590088, 2-s2.0-84901477890
Name2 2-s2.0-84941169876
Name3 2-s2.0-84958012773
Name4 2-s2.0-84960796474
Name5 2-s2.0-84945302996, 2-s2.0-84953281823, 2-s2.0-84944268402, 2-s2.0-8494
浏览 3提问于2016-12-20得票数 0
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
usernode = input("How many node does your graph have?")
G = nx.Graph()
nodenum = []
labels = {}
for node in range(usernode):
nodenum.append(node)
for label in range(usernode):
labels[label] = str(label)
print(labels)
G.add_nodes
浏览 3提问于2015-05-19得票数 1
我在NetworkX中有一个图表。我有：
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_size=node_sizes, ax=ax0)
将该文件导出到Gephi：
nx.write_gexf(G, 'graph.gexf')
但是，在导出中没有保留节点大小。
我怎样才能做到这一点？
浏览 2提问于2018-11-10得票数 1
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我用networkx和draw_circular画了一张图
networkx.draw_circular(g)
我尝试更改一些节点的颜色，可能是使用。
但是为此，我需要知道节点的位置，如何在draw_circular中获得节点的位置？
或者直接地，我如何在draw_circular中改变一些节点的颜色？
浏览 3提问于2011-11-11得票数 1
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目标如下:我有一组节点，大小为N，我想
生成(作为可迭代的)一组所有可能的有向图(想必使用networkx.DiGraph()和numpy.arange(0，N))(编辑:为了澄清-这是一个非常多的图，即使是小的N，所以需要某种可迭代的结构，使集合可以动态构建)
根据满足某些条件(例如，从节点0到节点N-1的完整路径的存在)过滤这组图。
存储与每个边相关联的参数值
跨过滤的图集计算函数，同时考虑到这些函数中与边缘相关的参数值，而不需要同时拥有内存中的所有图(因为如果没有并行化，这将是非常麻烦的，而且我还不知道如何处理并行化)。
对于如何有效地处理具有多个节点和边的图(即
浏览 4提问于2015-01-09得票数 0
回答已采纳
1回答
我有汽车，城市和路线。每个城市都是一个节点。每条路都是由一辆汽车产生的一条路。
不同的汽车会有不同的道路，有时道路可能会相交(这意味着不同的汽车在它们的道路上发现了相同的城市)，有时不是。
我会把所有的城市和所有不同的道路都画成一幅图，然后用圆滑的方式画出这幅图。示例：
List of cities: CityA -CityB -CityD -CityZ -CityK
List of cars: Car1, Car2
Routes:
Car1 will have a path through cityA - cityB - cityD this path will be colored
浏览 1提问于2020-05-04得票数 1
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我想使用NetworkX的找到图中所有节点的所有直接前置节点。下面是我的代码和图表：
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
nodes = ['0','1','2','3','4','5']
G = nx.DiGraph(name='G')
G.add_nodes_from(nodes)
edges = [('0','1'),('2','1'),(&#
浏览 0提问于2021-03-23得票数 0
我正在寻找一种简单的方法来修改NetworkX图中单个节点的单个属性的值。
NetworkX文档只提到了为图中的所有节点设置属性的函数，例如：
nx.set_node_attributes(G, bb, 'betweenness')
在许多情况下，这样的属性对于图中的所有节点都很容易计算(例如，在图之间提到)，这可能是合适的。同样，在NetworkX中有一种访问单个节点属性的简单方法：
graph.nodes[nodeName][attribute]
但是，以这种方式访问的属性是只读的。
所以，我正在寻找一种方法来设置属性，就像阅读一样简单。
提前谢谢。
浏览 0提问于2018-11-27得票数 10
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