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【Debug】如何在MAC上优雅的安装clusterProfiler包

【画图】与SARS-CoV-2病毒结合的ACE2基因在人肺组织功能预测分析 今天就和大家来分享一下如何在mac下安装Y叔的clusterProfiler包。...1st 坑 你需要安装一系列的包,这些包有的在CRAN上,有的在BioCondutor上,有的在github上,我们先从CRAN上的包说起,有个包叫做stringi,目前版本是1.4.6。...3rd 坑 第三个坑是这样的,clusterProfiler依赖另外一个叫DOSE的包,而且需要3.13版本以上,这个包可以从Biocondutor上面安装,但是BioC上的版本是3.12,所以你必须从...Y叔的github上安装,不过这次Y叔把DOSE包放在了他们团队的github上,所以命令变了,看好兄弟们,是这样滴: devtools::install_github("YuLab-SMU/DOSE"...至此,安装好了这个包,有了Y叔的神加持站长的代码bug也没了,很顺利地出图了: 虽然Y叔的包安装比较费劲,但很稳定,安上了基本就没有什么大问题了,怎么画图怎么有。

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如何在Windows电脑上使用LDSC软件(2)------LDSC的安装

在上一期的内容中,我带大家完成了Linux子系统的安装,今天我们就要开始在Linux子系统上安装LDSC了,这也是一个很大的坑!!!.../installers),安装到最后一步可以将其配置到环境变量里,这样就可以直接使用Anaconda的相关功能了。...LDSC最简单的安装方法就是官网提供的(https://github.com/bulik/ldsc): git clone https://github.com/bulik/ldsc.git#下载ldsc...,建议开启代理,这样可以直接使用bioconda下载相关依赖包,如果无法使用代理的话,可以使用国内的镜像 conda config --add channels bioconda conda config...--add channels http://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ 接下来一步一步安装所需的软件和安装包: conda install

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    实用技巧:教你如何在没有网络的Linux机器上快速安装软件

    最土但最极客的方法 一些人可能会下载源码,然后上传到服务器上编译安装。编译有问题会报错,一般要么是缺包(比较多),要么是冲突(相对较少)。...环节越多,出现失误的可能性越大; 对于服务器,没有十足的把握谁敢这么操作…… 对于不同版本的CentOS / RedHat,很多依赖的包名都变了……有的包还挺难找的…… 我14年前后,在一台无网络的机器上编译安装过...先找到相关的RPM包,然后用rpm -ivh rpm包名 安装。 RPM可在http://rpmfind.net/ 上找到,我是说大部分。 一般来讲,该方案问可以很好的解决问题,但极端场景下也会跪。...在机器B上执行如下命令: 下载的软件在: 该目录里会存放你想安装的软件所需要的所有RPM包。 将所有RPM包拷贝到服务器上安装既可。如果安装过程中提示xxx已安装是否需要覆盖,全部选否。...apt-get install -d --reinstall 包名 ,这样既可只下载包,而不安装包了,然后拷贝到无网络的机器上安装既可。

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    【Debug】如何在MAC上优雅的安装clusterProfiler包——那位Geek开始连载了

    【画图】与SARS-CoV-2病毒结合的ACE2基因在人肺组织功能预测分析 今天就和大家来分享一下如何在mac下安装Y叔的clusterProfiler包。...1st 坑 你需要安装一系列的包,这些包有的在CRAN上,有的在BioCondutor上,有的在github上,我们先从CRAN上的包说起,有个包叫做stringi,目前版本是1.4.6。...3rd 坑 第三个坑是这样的,clusterProfiler依赖另外一个叫DOSE的包,而且需要3.13版本以上,这个包可以从Biocondutor上面安装,但是BioC上的版本是3.12,所以你必须从...Y叔的github上安装,不过这次Y叔把DOSE包放在了他们团队的github上,所以命令变了,看好兄弟们,是这样滴: devtools::install_github("YuLab-SMU/DOSE"...至此,安装好了这个包,有了Y叔的神加持站长的代码bug也没了,很顺利地出图了: 虽然Y叔的包安装比较费劲,但很稳定,安上了基本就没有什么大问题了,怎么画图怎么有。

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    安装linux环境及相关包方法

    插入U盘到 要装linux系统到电脑中,重启电脑,根据提示安装即可(尽量在安装中保持联网状态,否则在以后安装 包 到时候会出现不必要到麻烦)。...安装 python-jose包 遇到错误:src/MD2.c:31:20: fatal error: Python.h: 没有那个文件或目录 解决方法是安装python-dev,这是Python的头文件和静态库包...: sudo apt-get install python-dev 参考网址:http://www.cnblogs.com/yuxc/archive/2012/05/13/2498019.html 安装...python-support包 在安装其他包时,出现 需要依赖安装 python-support包,但是在linux的16.04版本中,无法通过sudo apt-get install python-support...安装 https://packages.debian.org/jessie/all/python-support/download  选择亚洲的一个连接进行下载 通过cd命令到下载目录,执行 sudo

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    Ubuntu上安装TensorFlow(python2.7版)

    笔记内容:Ubuntu上安装TensorFlow(python2.7版) 笔记日期:2018-01-31 ---- 我的系统环境: Ubuntu 16.04 LTS python 2.7 python...pip安装软件包命令的格式如下: pip install 软件包名 pip卸载软件包命令的格式如下: pip uninstall 软件包名 我这里先使用virtualenv虚拟环境形式的安装...、python-dev以及python-virtualenv等包,我这里安装的是python2.7版本的: $ sudo apt-get install python-pip python-dev python-virtualenv...6.安装完之后进入python命令行,导入tensorflow包,如果没有任何输出则代表安装成功: (tensorflow) [zero@zero-virtual-machine ~]$ python...3.安装完之后也是进入python命令行,导入tensorflow包,如果没有任何输出则代表安装成功: [zero@zero-virtual-machine ~]$ python Python 2.7.12

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    用vmware安装ubuntu_vmware安装ubuntu黑屏

    安装xen server 首先切换到root用户: sudo -s 然后安装系统所需要的软件和补丁: sudo apt- get install build-essential binutils python-dev...virt-viewer virt-manager 重启电脑选择xen4.1 首先切换到root用户: sudo -s 然后查看虚拟机状态 xm list 出现domain0则表示成功 然后修改/etc...vi ~/.bachrc virt安装windows 按windows键,输入virt-manager: 创建新的vm,输入xp 选择安装windows xp: 然后一直下一步,就可以完成安装了...版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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    【详解】解决Kali安装python-dev时依赖出错的问题

    解决Kali安装python-dev时依赖出错的问题在使用Kali Linux进行渗透测试或开发时,有时会遇到需要安装​​python-dev​​包的情况。...升级已安装的包接下来,升级所有已安装的包以确保没有旧版本的包导致冲突:sudo apt upgrade3....安装 ​​python-dev​​尝试安装 ​​python-dev​​ 包:sudo apt install python-dev如果 ​​python-dev​​ 包不存在或有其他问题,可以尝试安装特定版本的...这通常是因为某些必要的依赖项没有正确安装或更新。下面是一些步骤和相关命令,可以帮助你解决这些问题:1. 更新软件包列表首先,确保你的软件包列表是最新的。...python-dev总结通过上述步骤,你应该能够解决在Kali Linux上安装​​python-dev​​时遇到的依赖性问题。

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    Ubuntu下Python的MySQLd

    MySQLdb,前天晚上升级电脑ubuntu系统后(由14.04LTS版本升级到16.04LTS),之后电脑上以前的项目在执行python manage.py runserver命令后就报错了,错误信息是...然后百度寻找解决方法,包括去Stackoverflow上找方法,绝大多数文章说可能是没安装MySQLdb,然后我就去安装MySQLdb,但是系统提醒已经安装了,提醒消息如下:Requirement already...在之前的ubuntu 14.04LTS版本上安装MySQLdb时就遇到过很多问题,今天在这里做一下总结,这些都是我平时遇到的问题,以后可能会遇到更多,慢慢补充,有需要的朋友可以参考下(不正之处,还希望不吝赐教...MySQLdb安装      安装很简单,如果你的电脑里有pythoneer三大神器virtualenv、fabric 和 pip(如果你是一名python开发人员,最后安装一下,这三个工具功能确实很强大...runserver常见问题 (1)错误:mysql_config not found     解决办法:安安装mysqld-dev包,安装命令上面有 (2)错误:_mysql.c:2810: error

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    树莓派python编程入门与实战_树莓派python软件

    一、远程连接和远程桌面设置: 终端下执行命令: ifconfig,查看树莓派的IP 终端下执行命令:sudo apt-get install xrdp ,安装远程桌面支持。...在windows电脑上点开始,输入mstsc,出来远程桌面界面,输入树莓派IP,用户名:pi 密码raspberry,就可以连上了。...(亲测最简单) 方法二:通过WinSCP软件上传到树莓派,如图: 四、安装python相关类库: (1) 安装python库 sudo apt-get install python-dev...然后执行命令:python python文件名,如图: 程序前需加编码格式,不然会报错,如: 运行故障或者想要中途停止程序的运行,可通过Ctrl+C来挂起,终止程序的运行 方法二:通过图形界面方式运行程序...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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    kali安装MITMF

    下面让我们一起看看如何在 Kali2.0上安装使用 Mitmf 。默认在2.0上并未安装,在之前的版本有安装。 首先,我们先进行工具依赖包的安装。...打开 terminal 终端,输入如下命令: apt-get install python-dev python-setuptools libpcap0.8-dev libnetfilter-queue-dev...libjpeg-dev libxml2-dev libxslt1-dev libcapstone3 libcapstone-dev libffi-dev file image.png 以上结果出现一些安装包无法安装的情况...依赖包安装完成后,就可以开始安装Mitmf 了、输入命令: apt-get install mitmf image.png 不过这样安装完成后 mitmf 依然无法正常使用它的一些功能。...因为缺少了 twisted 的版本兼容性。我们来安装适合 mitmf 的 twisted 。如果你已经安装过,那么先卸载之前的版本。

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    真正从零开始,TensorFlow详细图文安装入门教程!

    虽然可以用Docker来实现在Windows上运行,但小问题很多,它支持的最好的还是基于unix内核的系统,如Linux,因此我们最好还是安装一个Linux的环境来运行它。...下载之后,你会得到一个装着Ubuntu系统的.iso文件。有两个办法来处理它,一是直接安装,同电脑现在在用的系统组成双系统(当然你也可以换掉现在的系统,不过我想应该没有人会愿意这么做的吧哈哈)。...不过,安装虚拟机对配置有一定要求,毕竟它相当于在你的电脑上同时打开两个系统了——CPU最好不要低于4代i3(尤其是笔记本,CPU型号的i3/5/7-xxxx的四位数里第一个x就表示它的代数)。...,包含了软件包和索引文件,用户可以很轻松的使用命令自动定位并安装其中的软件,而省去了到处搜索的麻烦。...install则是安装指令,而python-pip和python-dev则是两个需要安装的软件包的名字。

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    安装psycopg2碰见的各种错误

    根据提示No such file or directory的错误,有两种情况,一种是没有Python.h这个文件,一种是Python的版本不对。...可以进入/usr/include/文件夹下的Pythonx.x文件夹里查找是否有Python.h这个文件。 针对这个问题,的确是第一种,那么需要安装python-dev这个包。...那么问题来了,为何安装了Python,还需要python-dev? Linux发行版通常会把类库的头文件和相关的pkg-config分拆成一个单独的xxx-dev(el)包。...其他正常使用python或者通过安装源内的python类库的不需要python-dev。另外,python-dev的包在centos的yum中不叫python-dev,而是python-devel。...注意python-dev或者其他*.devel软件一般都是C语言编写的一些头文件或cpp文件,往往是其他模块或者我们自己写的模块在编译时,需要依赖这些*-devel软件包。

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