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GEE数据集——全球( 30 弧秒)尺度地下水模型GLOBGM v1.0数据集

该数据集利用两个模型层和 MODFLOW 6 框架,利用现有的 30′′ PCR-GLOBWB 数据进行模拟,使研究人员能够探索全球范围地下水流动态。...在模拟,我们使用了非结构化网格和 MODFLOW 6 原型版本,并利用消息传递接口对其进行了并行化处理。...四个地下水模型每个模型都被划分为多个不重叠子模型,这些子模型在 MODFLOW 线性求解器紧密耦合,每个子模型被唯一分配给一个处理器内核,相关子模型数据在预处理过程中使用数据块并行写入。...鉴于串行模拟需要 4.5 个月运行时间,我们设定了最多 16 小时模拟运行时间假设目标。...结果表明,与 5 ′ PCR-GLOBWB 地下水模型相比,将分辨率从 5 ′提高到 30 ′,GLOBGM 在稳态模拟效果明显改善。然而,瞬态模拟结果非常相似,还有很大改进余地。

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JCCP:亲子神经同步:一种阐明学龄前儿童应激性双向相关新方法

研究背景:迄今为止有关应激研究都主要从个体内差异角度开展。然而,人际交往双向交流过程对其影响却鲜受重视。亲子互动双向同步困难可能是幼儿应激一个重要影响因素。...同步编码会持续到互动中断,如实验亲子二人超过3秒没有进行互动,则表明互动终止。使用相同方式对挫折和恢复数据进行编码。 在117个有效数据,有98个是同时具有行为编码和神经同步数据。...本访谈共计包含12个分数:6个发脾气障碍分数(6种社会环境)和6个急躁情绪障碍分数。...这份简短问卷包括7个项目:其中6个用于评估应激严重程度,另一个用于评估损伤。六个严重程度项目的平均值用于分析,对应到应激性严重程度三个等级(0-2)。...发现,轻度挫折和恢复情境都会导致神经同步,在恢复过程,神经同步性与应激性呈负相关,挫折恢复对应激性高儿童来说特别困难。

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JAMA Psychiatry:遭受创伤美国黑人女性对威胁神经反应与种族歧视关系

要求被试通过按下按钮快速识别显示数字数量(3、4、5或6),同时忽略在每个数字刺激前后出现干扰图像(创伤相关、积极和中性场景)。在一些试次,数字数量与实际显示数字不一致。...使用偏相关探索种族歧视与创伤相关试次中情感Stroop任务表现(错误率和反应时间)之间关联(一致试次和不一致试次数量合并)。...在考虑创伤后应激障碍症状或创伤经历后,与创伤相关干扰试次,歧视经历和反应时间之间没有明显相关性。 图2.威胁相关试次种族歧视体验与情感Stroop表现关系(创伤后应激障碍症状共变)。...尽管美国黑人和白人PTSD症状患病率明显不同,但有限研究调查了压力源反应差异如何在这些差异中发挥作用。据报道,过度压力源暴露与关键节点(vmPFC)内神经对威胁反应种族差异有关。...6.结论 这项对55名暴露在创伤美国黑人女性横断面研究发现,在对威胁相关刺激注意方面,那些经历更多种族主义女性在视觉注意、情绪和恐惧调节网络区域关键节点内表现出更高反应,即使考虑到与创伤和创伤后应激障碍症状相关差异也是如此

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单细胞测序下骨髓微环境

摘 · 要 在本研究,在体内平衡和应激诱导造血条件下分别构建了小鼠骨髓血管,血管周围和成骨细胞群单细胞转录组图谱。...尽管我们对骨髓龛理解在过去几十年已经有了很大发展,但是解决骨髓微环境分子异质性和功能可塑性研究任然有限,这主要是由于骨髓中靶标细胞数量太少及分离技术局限性。...在本研究,我们分析了小鼠骨髓龛17,374个单细胞,识别出了骨髓微环境以前未被认识到异质性,并揭示了微环境是如何在单细胞水平对急性骨髓应激作出反应。...为了追踪应激性造血过程骨髓龛基因表达变化,我们用5-氟尿嘧啶处理了7,752个细胞(图3) ?...将来研究需要研究骨髓龛异质性对功能异常干细胞影响,免疫缺陷,造血系统恶性肿瘤和衰老。

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文献翻译:Statistical Approaches for Gene Selection, Hub Gene Identification and Module Interaction in...

通常,微阵列数据用于遗传网络分析基因选择和模块检测,其受到其基因维度较多限制,即基因数量远远大于受试者/样品数量[6]。...在该研究,S = 500用于分别在应激和控制条件下获得500个随机GCN。...氧化还原活性也可能与活性氧物种(ROS)有关,这些物质是由于在非生物胁迫(铝毒性应激由于缺水导致氧化应激而产生[44]。...可以看出,基因最大数量与囊泡和膜有关,这与Al胁迫条件下可获得金属离子解毒机制一致,特别是在液泡隔离[46,47]。...换句话说,从图6可以更好地看出GCN中统计上强弱连接基因之间区别,而不是图5.此外,从提出DHGA方法获得两个对比条件(压力与对照)结果给出了表6.DHGA方法允许将GCN水稻187(胁迫

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NeuroImage:暴力隐式创伤—异常运动振荡脑活动与创伤后应激症状有关

在50%试验,周边条方向是相同,此时受试者用左手按键;不相同时用右手按键。该实验包含了相同数量用左手和右手按键中性和威胁实验。...为了创建情绪调节指数,研究人员减去每个受试者在威胁试验获得较低α频段(8-10Hz)α MRAA活性平均值减去在中性试验获得平均值。...在低PTSS受试者,反应时间与威胁条件下LRP潜伏相关,而在高PTSS受试者,反应时间与中性条件下LRP潜伏相关。...4.2 皮层反应激时间模式与PTSS 相对于中性条件,在威胁条件期间,LSS潜伏表明PTSS与响应准备过程之间没有关联。...4.3 皮层反应激振荡模式与PTSS 本研究,研究人员发现情绪调节PTSSα波段活动,而观看威胁线索会促进相对于中性刺激α抑制减少。

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双硫死亡 | 发现细胞 “新” 型死亡方式-MedChemExpress

SLC7A11----死亡调控途径双刃剑SLC 家族成员 SLC7A11 转运蛋白在维持细胞内谷胱甘肽水平和保护细胞免受氧化应激诱导细胞死亡方面具有重要作用,具有公认促生存作用[3]。...(图 3a-b), 但二硫应激还原剂,二硫苏糖醇 (DTT)、β-巯基乙醇 (2ME) 和 TCEP 可以完全抑制 SLC7A11high 细胞中葡萄糖饥饿诱导细胞死亡 (图 3d)。...在含糖培养基 SLC7A11high 细胞,肌动蛋白丝 (F-肌动蛋白) 主要在细胞皮质和应激纤维;但葡萄糖饥饿会诱导细胞形态显著变化:细胞收缩和 F-肌动蛋白收缩。...新死亡机制鉴定促进人们对细胞稳态基本理解,那 “双硫死亡” 最大意义何在? 双硫死亡,研究意义何在?...在 SLC7A11 过表达细胞,GLUT1 抑制剂处理增加 NADP+/NADPH比值 (图 6a,b),并在 UMRC6 细胞引发强烈细胞死亡(图 6c)。

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成年小鼠肾脏snRNA-seq和scRNA-seq之比较

结论 :在小鼠(C57BL/6)成年肾脏,snRNA-seq可实现与scRNA-seq相当基因检测,并且具有明显优势,包括减少解离偏倚,与冰冻样品相容,消除解离诱导转录应激反应,并成功地应用于炎症纤维化肾脏...第二,目前用于单细胞解离酶和机械方法引入了应激诱导转录伪影。 最后,目前方法与冷冻材料不兼容,当组织可获得性不可预测或诊断需要时间时,这会使分析变得复杂--例如肾活检。...富核基因包括许多驱动细胞特性基因,溶质载体和转录因子,这与大脑最近一份报告一致。作者还可以在单核测序优先检测到长非编码RNA,而不是单细胞(图3D)。...作者可以在小鼠肾小球图谱所有细胞检测到丰富应激反应基因表达,这在snDropSeq生成数据是缺失(图3J)。...作者发现了已知(Bmp6、Pdgfd和Spp1)和新(Sema3c、Sema6a、GPC和Slit3)信号关系(图4F)。图4G总结了这些纤维化肾小管间质串扰通路。 ?

1.6K30

Biological Psychiatry:压力诱导网络重构时空动态反映负性情感

同样,适应性不良应激反应,长时间焦虑、广泛反刍和消极应对策略,是精神障碍,特别是情绪和焦虑障碍常见症状。生理上,适应性不良应激反应反映在内分泌失调和自主调节。...与抑郁相关的人格特征,消极情感或特质焦虑,具有共同基因标签,也会跨阶段影响内分泌应激反应。此外,负性与对压力负性情绪反应相关,并调节应激生活事件对抑郁影响。...预处理在MATLAB 2018a和SPMv12进行。使用DARTEL对fMRI数据进行切片时间校正、重新排列、归一化到蒙特利尔神经学研究所模板,6*6*6mm³半高宽高斯核平滑。...为了模拟跨压力阶段动态FC变化,我们从预处理任务和21个感兴趣区域(ROI)中提取平均时间序列(未平滑)和侧翼静息状态。...蓝色集群主要反映了跨集团连接(即网络之间连接,DMN和SN),显示FC在应激开始时显著下降,然后逐渐恢复。相反,主要反映边连接黄色星团在应激过程显示FC增加。

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European Heart Journal:边缘和自主神经加工改变支持心碎综合征脑神经机制

虽然有强有力证据表明脑心轴参与了心碎综合征(TTS),但其病理机制仍未得到很好了解。应激刺激引起交感神经系统过度刺激被假设为TTS根本原因,但其在TTS影响尚未清楚阐明。...数据是在2013年7月至2014年7月获得,TTS事件和获得MRI扫描之间中位数时间为378天(四分位数范围:116-564天)。...交感神经关联子网络 在较高设定阈值下(t=2.25),与心碎综合征相关交感相关低连接性子网络由分布在6个节点上5条边组成(P=0.044,FWE-校正,5000个排列)。...杏仁核是控制交感神经系统对压力反应关键大脑结构之一。因此,杏仁核是调节应激和心血管疾病之间相互作用主要大脑结构。神经疾病,癫痫发作、颅内出血和偏头痛,在TTS发生率是急性冠脉综合征两倍。...这项研究确定关键节点,杏仁核、海马和扣带回,都是边缘系统结构,控制着情绪、动机、学习和记忆。杏仁核和扣带回也参与自主神经系统中枢控制和心脏功能调节。

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nature mental health:童年时期生活逆境对大脑结构和功能连接耦合影响

我们首先在我们全神经影像学队列模拟了三个时间点(4.5岁,6岁和7.5岁)SC-FC变化,这是不同和重复样本混合物(图1)。我们三个时间点对应于两个标准儿童阶段——学龄前和儿童中期。...讨论我们研究模拟了从学龄前到儿童中期SC-FC变化。因此,我们解决了神经发育文献一个关键空白。之前缺乏从学龄前开始纵向神经成像数据。...我们发现,在4.5岁至6高逆境组,SC-FC加速下降表明,这一时可能是干预潜在窗口,以减少ELA对后期结果影响。...大脑皮层厚度在2岁左右达到峰值,暴露于低SES环境与早期大脑皮层变薄有关。这些发现被认为反映了突触增殖早期减少和突触修剪窗口减少。有关产前应激文献表明,子宫内环境可能影响下游发育几种机制。...DAN也可能对应激暴露后恢复过程很重要,这是影响以后生活行为潜在机制。在解释研究结果时应考虑到一些局限性。

9810

NEJM:创伤后应激障碍

在PTSD定义变化更广泛影响变得清晰之前,临床医生应谨慎对待那些在从早期定义到后期定义转变不再符合PTSD诊断标准的人,不要轻易地使用这些转变标准从而拒绝使他们获得相应治疗或保险或残疾福利。...创伤后应激障碍恐惧习得模型启发了该障碍一些常见治疗方法,基于暴露认知行为疗法,下文将对此进行综述。...具体认知行为治疗方案大致可分为暴露疗法(长期暴露)和非暴露疗法(认知加工)。在暴露疗法,痛苦和恐惧避免创伤事件记忆是在一个安全环境中进行。...它对符合创伤后应激障碍诊断标准患者最有效,在创伤事件发生后1个月或6个月给予同样有效,其结果可维持数年。尽管如此,它在许多事故幸存者身上仍是无效。...治疗建议可以根据患者和临床资源偏好进行调整。在现有的选择,具有最强支持证据干预措施应优先考虑(认知行为疗法、舍曲林或文拉法辛),以及针对患者最令人不安症状干预措施(失眠和易怒)。

96020

ASK1在氧化应激条件下激活 | MedChemExpress

其中氧化应激在糖尿病肾病发病机制起着至关重要作用。氧化应激因其可促进糖尿病肾病中肾小球硬化和肾小管间质纤维化, 常作为糖尿病肾病治疗研究热点。...GS-444217 对 ASK1 自磷酸化以及下游底物磷酸化( p38 和 JNK )可逆性抑制作用呈剂量和时间依赖性(如图1 所示)。...GS-444217 浓度为 0.3 μM 时,降低 ASK1 磷酸化,且阻止 MKK3/6,MKK4,p38 和 JNK 磷酸化;浓度为 1 μM 时,完全抑制 ASK1 活性。...口服 GS-444217 可改善双侧缺血/再灌注诱发肾损伤,损伤后第 1 天血肌酐和血尿素氮,及组织学肾小管坏死评分和凋亡细胞数量得到改善。...从该研究结果不难看出,ASK1 抑制剂( GS-444217)有望成为糖尿病肾病治疗开发热点。 参考文献 [1]Liles JT, etal.

28320

2018 Cell系列相变最强综述,未来已来,你在哪?

然而,细胞内还有不少缺乏分界膜细胞器,它们是由蛋白质、核酸及其他分子组成超分子组装体,细胞核核仁、核斑点 (nuclear speckles),以及细胞质应激颗粒stress granules...随着对驱动无膜细胞器形成分子原理和理化动力日益了解,可以更清晰阐明它们在各种细胞过程(应激反应、基因表达调控和信号转导)多种功能。...基于数学理论计算模拟实验表明,与一对一结合模型相比,部分异构交互可以将相界形成难度降低一个数量级。...确信是,ALS小鼠模型敲低Ataxin-2降低了小鼠脊髓TDP-43聚集物数量,显著延长了存活率。...什么介导蛋白质和RNA形成特定相,以及什么阻止了不同无膜细胞器聚结? 6. 虽然在体外试管确定胞体颗粒内部结构方面取得了一些进展,但缺乏在活细胞研究该问题工具。

2.1K10

癌症起源和治疗细胞死亡

细胞焦亡 细胞焦亡是一种胞内细菌激活程序化死亡形式,沙门氏菌。...如果癌细胞暴露于药物足够浓度及足够长时间,即使没有被彻底杀死,它也将无法复制其DNA并分裂。不幸是,这些治疗对正常细胞,特别是那些正在迅速增殖细胞,骨髓或肠祖细胞,具有相同直接毒性作用。...寻找一种在癌症治疗期间特异性抑制健康组织凋亡方法将至关重要, 这可以使患者接受更高强度治疗,从而获得更大缓解机会。...也许这样药物能够通过激活两种凋亡途径,与BH3模拟药物协同杀死癌细胞。 非凋亡程序性细胞死亡途径在肿瘤发展和抗癌治疗作用 自噬在癌症作用仍在争论。...尽管发现了很多,但仍在继续研究BAX / BAK依赖细胞死亡机制,以确定它们如何在线粒体外膜上形成孔或通道以及如何通过抗凋亡BCL成员调节其激活更详细信息。

1.3K30

scRNA-seq 鉴定上皮卵巢癌复发启动子

转移起始细胞特征 对转移瘤和复发肿瘤marker基因进行富集分析发现,未治疗腹膜转移肿瘤(M1、M2)起始细胞主要与免疫反应相关(CD81、HLA-A、HLA-DRB1、XBP1、CFB、C3...),而复发肿瘤起始细胞(R1、R2)主要与细胞周期相关(MKI67、CKS2、ANLN、CDC20、CDCA8、CENPF)。...细胞G1/S或G2/M在两种复发肿瘤起始细胞中比较多,并且高表达MKI67,但在腹膜转移瘤中比较少见。...追溯原发性肿瘤转移起始细胞 为了追溯原发性肿瘤中转移起始细胞来源,作者对两种复发肿瘤起始细胞和四种原发肿瘤循环细胞进行了差异分析,找到了复发肿瘤起始细胞45个特异差异基因,并且功能主要集中在应激反应...另外发现这5个基因都主要具有压力应激功能,然后去每个原发肿瘤寻找具有该功能top100差异基因,发现CYR61是其marker基因。 接下来网络图显示了化疗耐药基因与CYR61联系。

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Science Advances:通过训练抑制有害思维来改善心理健康

训练后,参与者报告焦虑、负面情绪和抑郁减少,后者益处持续了3个月。高特质焦虑和与大流行相关创伤后应激参与者获得了最大和最持久心理健康益处。...这些发现挑战了百年来智慧,即抑制思想是不适应,为改善心理健康提供了一种可获得方法。2. 引言抑制沮丧想法可能促进逆境促进心理健康,这种能力是可以训练。...即使当我们检查个体恐惧事件时,在任何一组,恐惧恐惧数量在基线和没有想象情况下都没有变化。我们考虑了讽刺性反弹效应可能只出现在参与者非常关注情感强烈恐惧。...在可能患有创伤后应激障碍参与者,82%的人报告焦虑减少,63%的人报告情绪改善,这特别归因于学习思维抑制(图6C),27%的人报告他们“情绪更好”,因为训练而“更少焦虑”。...尽管所有参与者在一开始都产生了相同数量和类型事件,但我们选择性地从这些事件中提取数据来构建四组不同刺激集。

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新西兰版署:VR游戏应该建立全新分级机制

“谈及VR,可能每个人最先想到就是它临场感,感觉就像亲身经历一般,”该分级机构一个工作人员(也是游戏分级领域专家)说道。在新一代恐怖游戏中有很多能够令人产生恐惧和紧张感沉浸式体验。...这在很大程度上是通过引入了玩家肉体化身来实现,比如模拟玩家在游戏中手部动作以及惊慌失措呼吸等等。 ?...“随着VR技术改进,沉浸感不断深入且动作控制将变得更为直接,VR也会产生吓到人可能性,且比目前游戏更为强烈。...即使是简单街机游戏也能唤起肾上腺素得应激生理反应,我正在考虑VR将如何在物理方面影响这些玩家并希望能够在这一领域做进一步研究”,该工作人员继续说道。...而关于VR是否会对分级制度产生重大影响,以及是否同样内容在VR领域会比传统领域获得更低等级分化,该分级机构表示目前还无法得知,但是他们将在未来几个月内给出答案。

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是什么导致你头发一夜变白?

例如,当你在工作一个项目落后时,或者对即将进行公开演讲感到焦虑时,它就不会被用到。因为开启“战或逃”反应需要能量,在这些情况下依赖它是没有意义。...她怀疑,如果压力确实使头发变白,那么它可能是通过免疫系统之类东西起作用,它可能会释放细胞来攻击毛囊中变色细胞;或者通过触发肾上腺释放应激激素,皮质醇。但事实似乎都不是这样。...她用化学方法诱导小鼠产生应激反应,给它们注射一种叫做树脂毒化合物,这种化合物能提高动物应激激素水平;这种方法提供了一种可靠诱导应激反应方法,超过了研究小组探索其他策略,包括使用约束手段、倾斜动物笼子...缺乏免疫细胞小鼠和没有肾上腺小鼠在接受这些模拟压力注射后都继续显示出过早变白。 就在那时,许教授转向交感神经系统,发现它可能对负责染发细胞群造成永久性损伤。“我们真的很惊讶,”她说。...但不同干细胞和不同器官可能对交感神经系统信号做出非常不同反应,我们还不知道具体是如何反应。” 基于这些发现,有可能最终会有一种方法来保存黑素细胞干细胞,或者控制交感神经系统对它们数量影响。

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想要创新,预后模型还能从哪儿入手?这篇4分+文章给你答案

为进一步研究风险打分与ER应激状态关系,作者对风险打分涉及16个基因进行qRT-PCR。...一些神经胶质瘤免疫抑制因子在高风险组过表达(图5D-5O)。此外,MDSCs,Tregs,NK等免疫抑制细胞富集在高打分组(图5P-5R)。...作者发现高打分组和低打分组中最常见亚型为C4和C5,而高打分组C4亚型数量更多,C4亚型预后较差。这些结果进一步证明ER应激相关风险特征预后预后和免疫亚型准确性。...对PD1和PD-L1表达水平与风险打分进行相关性分析,作者发现PD1和PD-L1表达水平与风险打分正相关(图6D-6G),且高风险组表达水平较高(图6H-6K)。...随后作者对ER应激风险特征进行富集分析和免疫相关分析,最后构建列线图。作者研究为阐明内质网应激在神经胶质瘤作用提供了重要信息。

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