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我正在处理.dcm图像(dicom图像)我用过..。用于分段的链接。分割后，我在分割区域上使用感兴趣区域(ROI)。现在我有了参数x，y，w，h和从ROI得到的裁剪图像。有没有办法把这些数据可视化。我搞不懂vtk的功能和参数是什么。
浏览 15提问于2019-11-15得票数 0
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我目前正在做一个任务，我需要使用NumPy，Matplotlib，(Marchingcubes，Triangulation或Volumemodel)将DICOM切片绘制成一个3D模型。我已经尝试了这个网站上的方法： https://www.raddq.com/dicom-processing-segmentation-visualization-in-python/ 但不幸的是，这对我来说并不奏效continuous_update=False)
interact(s
浏览 93提问于2019-06-23得票数 2
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我需要转置h5py数据集，以访问3D数组作为2D图像堆栈。
我希望能够在3个可能的方向中的任何一个方向切片3D体积，同时保持第一个维度作为图像索引。我不想将我的数据集转换为numpy数组，以避免在只需要显示部分图像时从磁盘读取整个数据集。
浏览 1提问于2016-12-16得票数 3
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我想知道我可以使用什么工具来将单个切片(图像)转换为3D。我可以在我的程序中打开dicom和raw图像，但我想以3D方式显示这些图像(只显示单个图像，而不是整个堆栈)。我使用了一些ImageJ文件来打开图像，但我不喜欢ImageJ在3d中显示堆栈的方式，而且它也不能真正在3D中显示单个图像。我发现了许多工具，如jogl，java 3d</
浏览 5提问于2014-07-28得票数 1
我有很多二维的nibabel (.nii)切片，我需要从这些切片创建一个3D nibabel (.nii)图像，有什么方法吗？
浏览 14提问于2022-03-17得票数 0
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根据SVG规范，您可以将任意2x3转换矩阵应用于任何元素。
我想利用这种方法，将三维预期投影应用于SVG中的图像，以模拟平面图像的三维投影。我使用javascript中的矩阵计算将三维模型空间坐标(x，y，z)转换和投影到2D图像空间坐标(x'，y')。但是，为了将投影应用于SVG中的图像或文本，我需要将3D矩阵投影到2D转换矩阵。假设图像在三维模型空间中的任意平面上，并将图像原点定义为平面上的
浏览 7提问于2012-12-05得票数 4
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我期待着Opencv中3d图像处理的教程。我有一本O‘’Reilly出版的书，这是一本关于Opencv中2D图像处理的好书。有人能给我介绍一些3D图像处理的源码吗？
浏览 1提问于2014-06-29得票数 4
我有一个包含148 *N个图像的文件夹(N是我的动态PET的帧数)，我想将每个帧的图像分开。首先，我为每个带有相应图像的帧创建了一个子文件夹。image = sitk.ReadImage(series_reader.GDCMSeriesFileNames(path_subfolder1))
创建所有这些子文件夹对用户不是很友好，所以我尝试将图像的所有路径存储在列表中似乎使用series_reader.GDCMSeriesFileNames() SimpleITK可以检索一些有关DICOM图像</e
浏览 0提问于2018-06-12得票数 1
我有一个从NIfTI文件读取到SimpleITK (使用python)的3D图像，取每个轴向切片，对其做一些操作，并将新的2D切片重新插入到具有(希望)适当尺寸的3D体积中。original.GetDepth()): << Do Something in SimpleITK>>
<< Produce a new 2D, in <module
浏览 1提问于2015-05-14得票数 3
我们正在为dicom文件编写一个进口商。对于大多数供应商来说，是否有一种通用的方法来决定这一点？我查看了DICOM标签，没有找到明显的解决方案。
浏览 8提问于2013-08-30得票数 11
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我需要开始一个项目，处理DICOM数据操作，可视化。作为一些基础研究的一部分，我发现有一些工具包，如ITK、VTK对医学图像数据进行数据处理。我的问题是，使用ITK+VTK+QT处理DICOM图像(分割和注册)是一个更好的选择，还是使用ITK与OpenCV是一个更好的选择？或者，是否存在任何可能实现我的需求的替代工具包？
浏览 3提问于2017-05-08得票数 0
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问题是CT扫描是逐片进行的，而在一个典型的扫描中，可能有200多个切片。扫描中的切片数不一致，取决于扫描机器和扫描对象的年龄。
(1)如何将切片数统一到深度学习网络中？(2)是否可以采用类似的方法使切片(时间步骤)统一，或者有更好的方法？
浏览 0提问于2018-06-03得票数 0
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如何矢量化三维Numpy阵列
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现在的问题是，这个操作比其他人要慢得多，例如c = b * b (我实际上描述了这个函数，它比使用numpy内置的函数和向量化函数的其他函数慢了大约2个数量级，在相同数量的元素上)
如何提高这种将三维数组映射为2D
浏览 3提问于2014-12-23得票数 6
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我需要用以下输入/输出编写python函数或类
二维X射线扫描(模拟X最后，我创建了一个3D数组，并将所有图像添加到该数组中，以便绘制结果(您可以在添加的图像中看到它们)--这是CT扫描的切片。list(slices[0].pixel_array.shape)img3d = np.zeros(img_sh
浏览 4提问于2019-08-14得票数 8
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我有一个非结构化2D网格的模拟结果。我通常将结果导出到VTK中，然后用Paraview可视化它们。这就是结果的样子。
我想从结果中获得一个光栅图像(有或没有插值)，以便在3D软件中将其用作可视化的纹理。通过阅读，我已经了解到，我需要做一些重采样，以便将非结构化网格转换为光栅图像的2d规则网格。VTK可以导出为光栅，但它仅导出没有任何定义边界的完整场景，因此它需要手动调整以适应图像。理想情况下，我希望只导出结果边界框中的结果，并使用Ruby或<e
浏览 1提问于2015-04-21得票数 1
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我有几个2D图像，并想用python将这些切片转换为3D图像。TypeError Traceback (most recent call last)
48 return ar
~\a
浏览 0提问于2020-05-26得票数 0
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我正在尝试将图形背景设置为一个dicom图像。我跟踪了，但是来自dicom.pixel_array的图像数据不是RGBA。我也不知道该如何转换它。我也不知道bokeh到底在期待什么。from bokeh.plotting import figure, show, output_fileimport numpy as np
data = dicom.read_file
浏览 3提问于2016-06-15得票数 2
我基本上是试图对图像进行预处理，以便更好地识别OCR。我决定使用scikit-image (或者我应该使用其他的东西)？Downloads/test.py", line 207, in <module>File "/usr/local/lib/python3.9_otsu_3D, image,
File "/usr/local/lib/pytho
浏览 5提问于2021-05-25得票数 0
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动态3d数组切片和排序
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我对如何在numpy中准确地切片和排序3D数组感到有点困惑。似乎有很多方法可以手动完成此操作，但我需要使用numpy.where()完成此操作。例如，如果lo360是2D经度值，lat2d是2D纬度值，yi是经度值的一维数组，xi是纬度值的一维数组。切片时，这会返回一个一维数组。然后，当我尝试对3D数组A[i][slice2d]进行切片时，我得到了一个不容易动态验证的1D数组。当我弄清楚如何附加文件时，我会附加图像。
浏览 1提问于2012-09-07得票数 0
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对于3D图像的配准和分割，我有一些疑问：
加载dicom图像:在DCE中有4000个切片和总共100个堆栈，所以每个堆栈中有40个.如何使用GDCM simpleITK函数将它们加载到4D数组中？目前，利用区域生长或阈值分割对各种图像都是不容易的。假设我只想手动地、交互式地选择一个区域。是否有可能做到这一点？然后我只想用选择的掩码来评估注册的准确性。可视化和编写:需要使用matplotlib或VTK在3D中可视化。所有的绘图功能都是为2d切
浏览 9提问于2017-03-22得票数 0
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