官方的话语则是：为了探讨某因素（暴露或干预，下面统称处理因素）与结局的关系，需要设立对照组进行比较，其目地是控制非处理因素的干扰，突显处理因素的的效应。...但是在观察性研究中（如队列研究），研究对象是非随机分配的，这就会使混杂因素在两组中分配不均匀，导致处理因素和结局的关系受到混杂因素的干扰。...近几年在国外研究中用的比较广泛的控制混杂因素的方法—倾向性评分匹配（propensity score matching, PSM）。...数据匹配，采用matchit函数，首先要定义一个逻辑变量，这一点非常重要： ? 生存好逻辑变量之后，接着我们需要进行匹配 ?...Ok，今天的推文就到这，我们分享了如何在基于R语言的PSM的计算，希望能对大家有所帮助，最后，欢迎大家多多交流。 —END—
前言 做数据分析以及制作表格的时候，会遇到长宽格式数据之间相互转换的问题，之前介绍了如果在Hive是使用sql语句实现，现介绍一下如何在R语言中实现长宽格式数据相互转换。...宽格式数据：每个变量单独成一列为宽格式数据，变量的所有属性都在同一行。 长格式数据：长数据中变量的ID没有单独列成一列，而是整合在同一列。 需求描述 下面左右两种长宽格式数据相互转换： ?...需求实现 R语言中有两个包中的函数可以实现长宽格式数据的相关转换： ?...总结 R语言reshap2和tidyr包都可以实现长宽格式数据相互转换，相比较而言，更喜欢tidyr包中的实现方式，与Hive中类似，中间过渡map格式类型数据，key键和value值明确，结合sql...中map格式数据更容易理解R语言tidyr包中实现方式。
本节我们学习如何在MATLAB中创建一个字符串。...my_string 1x9 18 char 你可以使用数字转换函数，如 uint8 或 uint16 字符串中的字符转换成数字代码...建立一个矩形字符数组的最简单的方法是通过连接两个或两个以上的一维字符数组，无论是垂直或水平的要求。...Surgeon' 'R N Tagore Cardiology Research Center' MATLAB中的字符串函数 MATLAB 提供了许多创建、组合、分析、比较和处理字符串的字符串函数。...strfind在另一个字符串中找到一个字符串strrep查找和替换字符串strsplit在指定分隔符处拆分字符串strtok字符串的选定部分validatestring检查文本字符串的有效性symvar在表达式中确定符号变量
朴素贝叶斯的ROC曲线通常低于其他两个ROC曲线，这表明样本内性能比其他两个分类器方法差。 比较所有三个分类器的曲线下面积。...为了直观比较这两个伽玛参数值的分类性能。 绘制分类树的ROC曲线 加载样本数据。 load fisheriris 列向量 species由三种不同物种的鸢尾花组成。...load fisheriris 仅将前两个变量用作预测变量，来定义二元问题。 pred = meas(51:end,1:2); 定义二进制因变量。...2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现 3.matlab中的偏最小二乘回归（PLSR）和主成分回归（PCR） 4.R语言泊松Poisson回归模型分析案例 5.R语言回归中的Hosmer-Lemeshow...拟合优度检验 6.r语言中对LASSO回归，Ridge岭回归和Elastic Net模型实现 7.在R语言中实现Logistic逻辑回归 8.python用线性回归预测股票价格 9.R语言如何在生存分析与
这里我们给出Hmisc包的例子：（两个包中的函数名称重复时，在函数名前面加上包名称即可，如Hmisc::describe()）。 ? 图2:Hmisc包中describe()示例 ?...当有两个以上的类别变量时，就需要生成多维列联表，table() 和 xtabs() 都 可 以 基 于 三 个 或 更 多 的 类 别 型 变 量 生 成 多 维 列 联 表 。...6、连续型变量的比较检验 变量之间的关系除了独立性、相关性之外，还可以进行比较，对于符合正态分布的连续型变量组间比较，我们一般采用t检验（示例数据为MASS包中的UScrime数据集）。...如果各组不独立(如重复测量设计或随机区组设计)，那么Friedman检验（函数friedman.test()）会更合适。（示例数据来自于R基础安装中的state.x77数据集。） ?...小结 这次的课程内容可以说是目前整个《R语言从入门到精通》系列课程中内容最多的一篇，而且涉及统计，理解上难度也比较大。
现在我想做的是对于每一行，找出非NA的值，填充到“mean.scale”这个新的变量；如果有多个非NA，那么就计算其平均值。也就是说，我希望最终得到如下数据集： ?...eddi大神的意思是，原来inti_total_asset和issuing_scale是两个变量，现在要把他们stack起来，“堆成”一列，也就是这样： ?...(fund_name)] 其中的关键在于拼接函数c()，它将不同列的向量拼接成了一列。另外，这个操作是不是有点熟悉？...事实上，大猫把整个过程分解成了好几步，如果对于data.table包比较熟悉，完全可以在一行之内搞定所有事情，根本不需要把进行数据集的拆分、合并： ▶ t.final <- t1[, ":="(mean.scale...本 期总结 本期大猫带领大家学习了如<em>何在</em><em>R</em><em>中</em>按照行进行处理。<em>R</em>的数据处理哲学是向量，是<em>列</em>，但这并不妨碍我们按照行进行处理，其中的关键，就在于运用 c() 函数把不同的向量拼接成一个向量。
在这篇文章中，我们把这个模型称为 "二项逻辑回归"，因为要预测的变量是二进制的，然而，逻辑回归也可以用来预测一个可以两个以上数值的因变量。在这第二种情况下，我们称该模型为 "多项式逻辑回归"。...R中的逻辑Logistic回归实现 R使拟合一个逻辑回归模型变得非常容易。要调用的函数是glm()，其拟合过程与线性回归中使用的函数没有太大区别。...加载和预处理数据 现在我们需要检查缺失值，并使用sapply()函数查看每个变量有多少个唯一值，该函数将作为参数传递的函数应用于数据框的每一列。...这个函数向我们展示变量是如何虚拟出来的，以及如何在模型中解释它们。 ? 例如，你可以看到，在性别这个变量中，女性将被用作参考变量。...Embarked中的缺失值，由于只有两个，我们将剔除这两行（我们也可以替换缺失值，保留数据点）。 data\[!is.na(Embarked),\] 在进行拟合之前，数据的清洗和格式化很重要。
本文以Windows系统为例，向大家展示如何在自己的本本上运行LEfSe，再也不用去求公司了…… 首先，我们要安装好Pyhthon（2.7版本）和R（安装方法不再赘述），然后把软件的安装路径添加到电脑的系统环境变量...，如R我是安装在“D:\Rnew\R-3.4.4”，那么我复制这个路径，如下图： 然后鼠标右击“我的电脑”→“属性” 接下来是“高级系统设置” 接下来是双击“环境变量”...“D:\Rnew\R-3.4.4\bin\x64”加入了“环境变量”，是的，我们需要把这两个路径都加入进来。 ...模块与包的安装 上述的操作后，我们已经把Python和R成功加入到Path中，在用这两个做数据分析时，我们要安装别人已经写好的模块与包（packages）。...首先，对于python，我们需要安装“numpy”、“rpy2”与“matplotlib”三个模块，在R中需要安装好几个packages，如mvtnorm、coin等。
与其他标准统计软件（如SAS、SPSS和Stata）中的数据集类似，数据框（data frame）是R中用于存储数据的一种结构：列表示变量，行表示观测。...在同一个数据框中可以存储不同类型（如数值型、字符型）的变量。数据框将是你用来存储数据集的主要数据结构。 因子（factor）是名义型变量或有序型变量。它们在R中被特殊地存储和处理。...其他多数术语你应该比较熟悉了，它们基本都遵循统计和计算中术语的定义。 这些具体的举例可以看我上篇文章R语言实战.1最后的部分。...类别（名义型）变量和有序类别（有序型）变量在R中称为因子（factor）。因子在R中非常重要，因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。 ? ? ? $是用来选取一个变量时用的符号 ?...请保证指定的水平与数据中的真实值相匹配，因为任何在数据中出现而未在参数中列举的数据都将被设为缺失值。 数值型变量可以用levels和labels参数来编码成因子。
R语言提供大量函数用于回归分析，在平时的学习和工作中，最常用的就是多元线性回归，下面我将简单介绍如何在R中进行多元回归分析。 1....模型对比 在R中你可以使用anova()函数来比较不同的拟合模型，在这里我们比较去掉自变量drat后的模型与原模型的优劣。...在实际应用中，我一般倾向于用10折交叉验证（样本量充足时），这样得出的结果会比较稳定。 5....变量选择 一直以来，关于如何从大数据中挑选预测变量的方法一直存在着争议，我们一般会使用逐步回归筛选的方法来进行变量筛选。...在R中，常用的函数就是“MASS”包里的stepAIC()函数,它是依照赤池信息准则（AIC）进行筛选的。
许多子查询返回单个列值，因为它们与比较运算符（=，！=，，> =）或表达式结合使用。当子查询不用作表达式或使用比较运算符时，它可以返回多个值。...清单7中的代码是一个非常简单的例子，说明如何在FROM子句中使用子查询。...清单10中的代码显示了如何在INSERT语句中使用子查询。...JOIN查询 要比较使用子查询的清单3中的查询的性能和使用JOIN的清单11中的查询，我将使用清单12中的代码运行两个查询。...它不需要来自外部查询的任何列，如果它有来自外部查询的列，它将被称为相关子查询。 问题2： 正确的答案是c和d。当用作表达式或在比较操作中时，子查询需要返回一个列值。
ls() 列出指定环境中的对象，如果无参数，列出其调用环境中的对象 object() 同ls rm() 删除当前环境中的变量 exists() 在指定位置是否存在某变量...row.names() 返回或设置矩阵类对象的行的名称 colnames() 返回或设置矩阵类对象的列的名称 intersect() 两个向量的交 union() 两个向量的并...中的变量执行某函数 unique() 去掉重复的元素 rep() 按照指定方式重复向量中的元素 cut() 将一个数值向量中的元素按指定的方式划分区间，返回一个factor变量...outer() or %o% 计算两个矩阵的外积 %in% 返回一个逻辑向量，当左边向量中的元素出现在右边对象中时为真 solve() 求解方程a %*% x = b....= 比较数值或向量或factor变量，返回逻辑向量 identical 比较两个变量，返回一个逻辑值，适合做if和while的条件判断式 all.equal 比较两个变量,返回真值或某种相似度的描述
难度：2 问题：将处理两个标量函数maxx在两个数组上运行。 输入： 输出： 答案： 16.如何交换2维numpy数组中的两个列？ 难度：2 问题：交换数组arr中的第1列和第2列。...难度：1 问题：使用科学记数法（如1e10）漂亮的打印数组rand_arr 输入： 输出： 答案： 23.如何限制numpy数组输出中打印元素的数量？...难度：2 问题：在iris_2d的sepallength（第1列）中查找缺失值的数量和位置。 答案： 34.如何根据两个或多个条件过滤一个numpy数组？...难度：3 问题：创建由分类变量分组的行号。使用iris的species中的样品作为输入。 输入： 输出： 答案： 53.如何根据给定的分类变量创建分组ID？...输入： 答案： 70.如何在给定一个一维数组中创建步长？
）R语言的命令提示符是 “>” 集成开发环境 图形界面（给简陋的R语言披上了好看的外衣） 开源免费 1.3 如何在R Studio中新建项目（管理工作目录的最佳方式，setwd也可以，但是这个更简单）...> < <= >= == 判断前后两个是否相等，如3==5 FALSE !...= 判断前后两个是否不相等，如3!...因为数据框不是电脑上的一个真实文件，并且要求每一列只能有一种数据类型。但是数据框可以导出，可以导出为一个表格。 ...：变量名称简单点比较好 可以使用的名字：字母（c不行，因为c是一个函数）、英语单词（函数名字不可以用）、字母和数字组合（但是必须是字母在前面开头）、下划线可以用 不可以使用的名字：变量命名里面带空格不能用
DataFrame索引有一些区别： 传入单个索引默认是对列的索引如data[1]将取出第一列的数据。...# 索引 stu_info[1:2] stu_info[c("name", "score")] stu_info$name stu_info[1] attach&detach 在R中的工作区中有两个命名空间...，如果直接对列进行赋值如score=score+10会在全局环境中创建一个新的score变量而不是改变原来列的值，一般只用于简化列名的索引。...patientdata <- data.frame(patientID, age, diabetes, status) str(patientdata) summary(patientdata) 若不告诉r代码中两列变量属于类别型变量...lists list是R中一种比较复杂的数据结构，一般来说，list中的元素可以是目前已经提到的几种数据类型中的任意一种。
赋值 R 中的赋值与一般程序语言存在区别：使用 -< 而非 = 进行赋值。...两个向量操作 向量比较 identical 判断数据是否完全一致，包括类型与结构，只有完全相同才会返回TRUE（一模一样的东西）。...match 实例 x 中的列名与y中的列名一致但顺序不同，如果我们想要按照x 列的顺序来排列行，则可以分别将二者存于向量，并使用match 函数来修改y 向量。...R会尽可能转换为相同类型数据。如int + str 均会变为 str。...# R会尽可能转换为相同类型数据，见2-2 回答。 # 2.如何将两个向量合到一起，组成一个长向量？
如图2 5 - 6所示，M I B被划分为若干个组，如s y s t e m、i n t e r f a c e s、a t（地址转换）和i p组等。 在本节，我们仅仅讨论 U D P组中的变量。...这个组比较简单，它包含几个变量和一个表格。...在该组中，包含4个简单变量和1个由两个简单变量组成的表格。图 2 5 - 8描述了这4个简单变量。 ? 在本章中，我们就以图 2 5 - 8的格式来描述所有的 M I B变量。...哪怕整个组中的变量都是只读的，我们也将列出“ R / W”列，以提示读者管理进程只能对这些变量进行查询操作（上图U D P组我们就是这样做的）。...图2 5 - 9描述了在u d p T a b l e中的两个简单变量。 ? 格中的每一列的参考。在下一节中读者将看到的一些例子也是这样做的。
例如，我们想知道两个教学班的语文成绩中，哪个班级内的成绩分布更分散，就可以用两个班级的四分差或百分点来比较。 3. 相关分析 相关分析探讨数据之间是否具有统计学上的关联性。...简介 若总体中的个体可按两个属性A、B分类，A有r个等级A1,A2,…，Ar，B有c个等级B1,B2,…，Bc,从总体中抽取大小为n的样本，设其中有nij个个体的属性属于等级Ai和Bj，nij称为频数，...将r×c个nij排列为一个r行c列的二维列联表，简称r×c表。...若所考虑的属性多于两个，也可按类似的方式作出列联表，称为多维列联表。 列联表又称交互分类表，所谓交互分类，是指同时依据两个变量的值，将所研究的个案分类。...交互分类的目的是将两变量分组，然后比较各组的分布状况，以寻找变量间的关系。用于分析离散变量或定型变量之间是否存在相关。列联表分析的基本问题是，判明所考察的各属性之间有无关联，即是否独立。
在本文中，在R中拟合BRT（提升回归树）模型。我们的目标是使BRT（提升回归树）模型应用于生态学数据，并解释结果。 引言 本教程的目的是帮助你学习如何在R中开发一个BRT模型。 ...在下面的例子中，我们加载的是训练数据。存在（1）和不存在（0）被记录在第2列。环境变量在第3至14列。...绘制交互作用 该代码评估数据中成对的交互作用的程度。 inter( lr005) 返回一个列表。前两个部分是对结果的总结，首先是5个最重要的交互作用的排名列表，其次是所有交互作用的表格。...persp( lr005, z.range=c(0,0.6) 对新数据进行预测 如果您想对一组地点进行预测（而不是对整个地图进行预测），一般的程序是建立一个数据框架，行代表地点，列代表您模型中的变量...我们用于预测站点的数据集在一个名为test的文件中。"列需要转换为一个因子变量，其水平与建模数据中的水平一致。使用predict对BRT模型中的站点进行预测，预测结果在一个名为preds的向量中。
双向无序R×C表资料 R×C表资料中两个分类变量皆为无序分类变量对于该类资料，若研究目的为多个样本率（或构成比）的比较，可用行×列表资料的χ2检验：若研究目的为分析两个分类变量之间有无关联性以及关系的密切程度时...单向有序R×C表资料 有两种形式。一种是R×C表资料中的分组变量（如年龄）是有序的，而指标变量（如传染病的类型）是无序的。...另一种情况是R×C表资料中的分组变量 (如疗法)为无序的，而指标变量（如疗效按等级分组）是有序的。其研究目的为比较不同疗法的疗效，此种单向有序R×C表资料宜用秩转换的非参数检验进行分析。...双向有序属性不同的R×C表资料 R×C表资料中两个分类变量皆为有序的，但属性不同。...对于该类资料，若研究目的为分析不同年龄组患者疗效之间有无差别时，可把它视为单向有序R×C表资料，选用秩转换的非参数检验；若研究目的为分析两个有序分类变量间是否存在相关关系，宜用等级相关分析：若研究目的为分析两个有序分类变量间是否存在线性变化趋势
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