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ggplot2高效绘制残差图

本节分享一个小案例,如何使用ggplot2中的「stat_smooth」函数来快速绘制残差图。 ❝残差图是一种用于回归分析的图形工具,它显示了模型的预测值与实际观测值之间的差异,即残差。...❞ 「残差图的主要目的是:」 「检查线性回归模型的假设」:线性回归模型有几个关键的假设,误差项的独立性、常数方差(同方差性)和误差项的正态性。残差图可以帮助我们检查这些假设是否得到满足。...「识别模型中的异常值」:如果某些点在残差图上显著偏离其他点,它们可能是异常值或杠杆点,可能会影响模型的准确性。...具体代码 # 使用mtcars数据集 mtcars %>% ggplot(aes(wt,mpg)) + geom_point() + # 添加散点图层,显示每辆车的重量和每加仑的英里数...geom_smooth() + # 基于wt和mpg的数据点拟合回归曲线 stat_smooth(geom="point",color="blue",xseq=mtcars$wt) + # 添加一个平滑层

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R语言绘图之ggplot2

3. ggplot2的函数介绍: ggplot2里的所有函数可以分为以下几类: 用于运算(我们在此不讲,fortify_,mean_等) 初始化、展示绘图等命令(ggplot,plot,print等)...等高线图 geom_crossbar crossbar图(类似于箱线图,但没有触须和极值点) geom_density 密度图 geom_density2d 二维密度图 geom_errorbar 误差线...(通常添加到其他图形上,比如柱状图、点图、线图等) geom_errorbarh 水平误差线 geom_freqpoly 频率多边形(类似于直方图) geom_hex 六边形图(通常用于六边形封箱) geom_histogram...geom_point 点 geom_pointrange 一垂直线,线的中间有一个点(与Crossbar图和箱线图相关,可以用来表示线的范围) geom_polygon 多边形 geom_quantile...stat_spoke 绘制有方向的数据点(由x和y指定位置,angle指定角度) stat_sum 绘制不重复的取值之和(通常用在三点图上) stat_summary 绘制汇总数据 stat_unique

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玩转数据地图系列之——地图上的迷你条形图

一周前更新了一篇数据地图上的气泡散点图的内容,不知怎地,这段时间就是跟地图死磕上了,今天还是数据地图,不过是在数据地图上呈现条形图、柱形图。...之前的一篇因为有现成的作图包支持,geom_scatterpie函数不用花费太大力气就解决了数据地图上的气泡散点图问题。...ggplot的现有图层图形中是没有直接根据点坐标生成条形图、柱形图的,所以这里我们只能曲线救国,使用线条图和误差线来进行模拟。...接下来使用geom_linerange函数(也就是线图函数)进行各个坐标点的模拟柱形绘制。...其实最初在网上看到该图(大概是刘万祥老师的博客,在此感谢老师的启发),他的做法是使用geom_errbar图层函数,也就是误差线图层函数,其实理念是一致的。这里给出原方法。

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【数据分析 R语言实战】学习笔记 第四章 数据的图形描述 (下)

在上述散点图中添加平滑曲线,通过method参数可以指定曲线拟合的方法,默认为method="loess"--平滑局部回归。参数span控制曲线的平滑程度,取值越大曲线越平滑。...aes( )来指变量,还可以指定其他分类变量,颜色,形状,大小等。...=clarity))#定义的第一图层存储于p中 (2)几何对象 基本图层确定了数据源和映射后,通过加号(+)就可以不断地添加新图层.第二图层添加几何对象类的函数,在图中绘制图形元素其他类型的图形,直方图...我们可以自定义函数,基于原始数据计算并在图上表现出来,也可以通过它们改变“geom_函数画图的默认统计参数。...例如用stat_smooth对数据作loess平滑,在carat-price散点图上添加非线性回归线。

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R语言画图时常见问题

1 如何在同一画面画出多张图?...3 如何在已有图形上加一水平线 使用低水平绘图命令 abline(),它可以作出水平线(y 值 h=)、垂线(x 值 v=)和斜线(截距 a=, 斜率 b=) 。...简要地说,高水平绘图命令可以在图形设备上绘制新图;低水平绘图命令将在已经存在图形上添加更多的绘图信息,点、线、多边形等;使用交互式绘图命令创建的绘图,可以使用鼠标这类的定点装置来添加或提取绘图信息。...barplot():space设置bar图间的间距;horiz设置bar的方向是垂直或水平;beside设置height为矩阵时,每列元素的bar排列方式;add设置是否将barplot加在当前已有的图上...13ggplot2包是强大的绘图包。多多练习!!!

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R可视化:不一样的ggplot2箱线图

ggplot2 中,可以通过使用 geom_point() 来在箱线图上增加点,这些点可以代表分组中特定指标的出现率。...的画图,下面是代码的逐行解析:ggplot(data = plotdata, aes(x = Group, y = Index, color = Group)):初始化一个 ggplot 对象,使用 plotdata...stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.15):添加一个箱线图的统计变换,这里使用 errorbar 几何对象,宽度设置为 0.15,这可能是用来表示箱线图的中位数线或四分位数范围的误差...geom_point(size = 2, shape = 5):在箱线图上添加点,大小为 2,形状为 5(通常是一个星号)。labs(x = ""):设置 x 轴的标签为空字符串。...theme_classic():应用经典的 ggplot2 主题。

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三种可视化方法,手把手教你用R绘制地图网络图!

大数据文摘出品 编译:睡不着的iris、陈同学、YYY 不知道如何在图上可视化网络图?下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或ggraph包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。...在地图上这个指标表现为节点的大小。...此外,每条边的颜色都取决于它的类别(category),而它的“尺寸”(指它的线宽)取决于边的权重(一会儿我们会发现后面这一没有实现)。...,提示“已显示‘尺寸’标度,添加其他的标度‘尺寸‘将替换现有的标度。”...在仅显示地图的某些细节,或者对边的定位点添加一些抖动时,这种方法可能会很有用。 完整的R脚本可参阅github上的gist。

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可视化绘制 | R-ggridges包峰峦图绘制

上次可视化系列说了瀑布图(可跳转)。它可以用于展示拥有相同的X轴变量数据(相同的时间序列)、不同的Y轴离散型变量(如不同的类别变量)和Z轴数值变量。...本节使用的峰峦图也可以很好地展示瀑布图的数据信息。它们对于可视化随时间或空间分布的变化非常有用。本节主要使用ggridges包[1]中的geom_density_ridges()进行绘制峰峦图。...# library library(ggridges) # Ridgeline Plots in 'ggplot2', CRAN v0.5.2 library(ggplot2) # Create Elegant...ggplot(diamonds, aes(x = price, y = cut, fill = cut)) + geom_density_ridges() + theme_ridges() +...注意:quantiles=2意味着在两个分位数之间的边界上有一线(即中位数)。 我们还可以通过切点而不是数字来指定分位数。

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R语言可视化——地图与气泡图结合应用

今天跟大家分享如何在图上进行散点图、气泡图绘制。 昨天跟大家介绍了ggplot函数进行地图绘制的原理,通过轮廓点和分组来定义每一个地区(国家边界),通过多边形填充来完成区域填色。...ggplot的图层叠加原理晕允许我们在坐标系统的叠加多个图层; 所以在地图上叠加散点、甚至气泡可以很容易的实现: 包的导入: library(maptools) library(ggplot2) library...地图语句: ggplot()+ geom_polygon(data=china_map1, aes(x=long, y=lat, group=group), fill="grey95", colour...geom_polygon()多边形函数来定义并填充地图背景 (注意里面的fill参数(指定地图区域颜色),colour参数指定多边形(也就是地区轮廓线)边框颜色),然后通过geom_point()函数添加散点图图层

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Python 绘制惊艳的瀑布

今天我们一起了解瀑布图的重要性,以及如何使用不同的绘图库( Matplotlib、Plotly)绘制瀑布图。 瀑布瀑布图经常用于财务分析,以了解多种因素对特定对象的正面和负面影响。...相反,我们可以很容易地看到,按x轴正方向的连贯性顺序显示数据,并且黄色显示减量,红色显示增量。 Plotly 绘制瀑布图 我们将要使用的数据取自Netflix 电影和电视节目的Kaggle数据。...导入库 import plotly.graph_objects as go 数据集 df = pd.read_csv(r'D:/netflix_titles.csv') 添加年和月并转换为正确的日期时间格式...)) 参数设置 go.Waterfall()的每个参数 x: x轴上的值 y: y轴上的值 text: 将要在图表上显示的值 textposition: 我们可以把文本放在图表的柱状图内或柱状图上方...图表的参数 connector: 为连接器线提供颜色 increasing: 给递增的赋予颜色 decreasing: 给递减的上色 其实,上面已经完成了瀑布图的绘制,但若想他更加惊艳,可以进一步设置图表

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可视化图表入门教程

本文主要介绍常见图表的信息表达特征和适用场景,帮助大家了解如何在不同的场景下选择合适的图表,从而帮助我们更清晰的传递信息。...图7:单一指标柱形图 瀑布瀑布图的核心是按维度/指标下钻分解,公司收入各用途分解、公司年利润按分公司分解、业绩按销售团队分解等。...图11:基础散点图 气泡图 在基础散点图上添加一个指标:用气泡大小来表示。 例如图12中,气泡大小表示在职时间。从图中可以看出,当人均接待数>7的时候,在职时间长的员工2分钟内的回复率较高。 ?...图12:气泡图 基于散点图的分类矩阵 在基础散点图上添加一个维度:用颜色来区分。 例如图13中的科室是我们要观察的维度,如果公司要重点运营某些科室,可能会选择右上角区域内的科室。 ?...需要注意的是:雷达图的线条不超过5,衡量指标不要超过8个。

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R语言ggplot2堆积柱形图添加误差线的简单小例子

最近有人在公众号后台留言问到这个问题,今天的推文介绍一下ggplot2做堆积柱形图并添加误差线的办法 完整代码 ''' 堆积柱形图添加误差线 ''' getwd() library(ggplot2)...=cumsum(mean_value)) -> df2 df2$sex<-factor(df2$sex, levels = c("male","female")) ggplot...summarise(mean_value=mean(bill_length_mm), sd_value=sd(bill_length_mm)) -> df1 df1 给数据集添加新的一列用来控制误差线的位置...limits = c(0,100))+ scale_fill_material_d()+ theme_bw()+ labs(x=NULL,y="ABCD") 画图代码在今天推文的第三视频中会有介绍...,这里就不用文字来解释了 今天的推文完整示例数据和代码可以在第二推文的留言区获取(第二推文是一个广告) 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和

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R语言之可视化⑥R图形系统续目录

目录 R语言之可视化①误差棒 R语言之可视化②点图 R语言之可视化③点图续 R语言之可视化④点韦恩图upsetR R语言之可视化⑤R图形系统 R语言之可视化⑥R图形系统续 ===============...======================= ggplot2包中的主要功能是ggplot(),它可用于使用数据和x / y变量初始化绘图系统。...例如,以下R代码将数据集初始化为ggplot,然后将一个图层(geom_point())添加ggplot上,以创建x = Sepal.Length的散点图y = Sepal.Width: library...ggplot2的另一个有趣特性是可以在同一个图上组合多个图层。 例如,使用以下R代码,我们将: 使用geom_point()添加点,按组着色。 使用geom_smooth()添加拟合的平滑回归线。...默认情况下,函数geom_smooth()添加回归线和置信- 区域。

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多种方法在火山图上标记感兴趣基因(差异基因,或者通路)

健明 全国巡讲课程结束后的一个月持续答疑环节,被问的最多的问题居然是如何在差异分析后的火山图上面标记出来感兴趣的基因,这里有必要派我们杰出能干的小洁老师出马!...要玩图,离不开哈德雷大神的ggplot2,《R数据科学》第1章和21章是专门讲图的,我写过对应的笔记: R数据科学--详解ggplot2 R数据科学--第21章 图形化沟通 完整的R数据科学笔记目录(点击这里...学以致用 火山图的本质就是点图,那么在火山图上标记部分基因,就是在点图上标记部分点。...step2:筛选部分基因,用于显示在图上 想在图上做修改,一半是调参数,一半是调数据。我们现在要做的就是调数据:要标记的,label=基因,无需标记的,label=“”。...step2:生成用于添加图层的新数据 ⭐重点在这里 新数据框的内容是你想要标记的基因,这里根据logFC和Pvalue的大小来筛选,可以自定义阈值来调整要显示的基因的数量: for_label <- test

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