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多芯片分析(如何将多个测序、芯片数据集合并为一个数据)(1)

这是一个对我有特殊意义的教程,大约在一年半以前,我和朋友开始研究如何将多个数据集合并为一个数据来分析,但是当时试了很多方法,效果不理想,再加上很多前辈告诉我很多人不认同这样合并多个数据(因为会导致很多误差...然后最近因为疫情我又重新开始研究这段,终于给摸索出来一个还可以的教程并结合自己的数据做了实例验证,效果挺满意的,所以想把这段教程写下来并总结以待后用。 移除批次效应前 ? ? ?...因为目前合并多个测序、芯片数据这一块并没有完全统一的标准,方法大概有五六种。公说公有理婆说婆有理,对于我这样的新手来说,最简单的是跟随顶级文章的文章思路或者分析流程和步骤。

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springboot第31:springboot数据集合

要在数据库中获取两张表中具有相同ID的记录,并获取另一张表中的字段,您可以使用SQL中的JOIN操作来实现。...下面是一个示例,展示如何通过JOIN获取两个表中相关记录: 假设有两张表:table1和table2,它们具有相同的ID字段。您想要获取table1中的记录,并获取table2中的另一个字段。...        factory.setLocation(location);         return factory.createMultipartConfig();     } } Knife4j是一个...BO可以与数据库表、外部服务、用户输入等进行交互,处理和操作相关数据。 业务规则和验证:BO可以包含业务规则和验证逻辑,用于确保业务操作的合法性和一致性。...BO可以接收和传递数据,对数据进行处理和转换,并与其他层进行协调和沟通,实现系统的整体功能。 通过将业务逻辑封装在BO中,可以将关注点分离,提高代码的可维护性和扩展性。

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多个单细胞数据整合的另外一个选择conos

但是现在基本上大家的单细胞转录组项目不太可能是单个样品啦,所以一定会触及到多个样品整合的问题,整合是为了尽可能的去除批次等不需要的差异但是尽可能的保留生物学差异,是一个两难问题,所以关于它的算法基本上都是发表在...但是如果你选择:单细胞降维聚类分群的另外一个工具选择Pagoda2,其实也有一个配套的单细胞数据整合的算法选择conos,让我们来一起看看吧。...', repos='https://kharchenkolab.github.io/drat/', type='source') # install.packages("conos") 然后对测试数据构建...Conos对象 # 2.加载数据 #### ## 2.1 测试数据 ---- library(conosPanel) panel <- conosPanel::panel # panel是一个List...conos的整合 前面的包的安装和加载是一样的,这个时候不选择示例数据,而是 读取pbmc3k和5k数据 : ## 2.1 读取pbmc3k和5k数据 ---- library(conosPanel

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最强数据集合:50个最佳机器学习公共数据丨资源

~ 提前说两个须知: 寻找数据の奥义 根据CMU的说法,寻找一个好用的数据需要注意一下几点: 数据不混乱,否则要花费大量时间来清理数据。...数据不应包含太多行或列,否则会难以使用。 数据越干净越好,清理大型数据可能非常耗时。 应该预设一个有趣的问题,而这个问题又可以用数据来回答。...http://web.mit.edu/torralba/www/indoor.html 情绪分析 多域情绪分析数据一个稍老一点的数据,用到了来自亚马逊的产品评论。...http://robotcar-dataset.robots.ox.ac.uk/ 城市景观数据一个大型数据,记录50个不同城市的城市街景。...https://mimic.physionet.org/ 一般数据 除了机器学习专用的数据,还有一些其他的一般数据,可能很有趣~ 公共政府数据 Data.gov:该网站可以从多个美国政府机构下载数据

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多个数据整合神器-RobustRankAggreg包

4个GEO数据 你也可以很轻松的分析这几个数据:GSE7476, GSE13507, GSE37815 and GSE65635 ,然后作者就使用了RobustRankAggreg包对这4个数据的差异分析结果进行整合...circRNA芯片整合 几百篇文章我们就不用一一解读啦,反正都是独立的数据自己做自己的差异分析,然后把多个数据的差异基因拿去使用RobustRankAggreg包进行整合。...我们的多次数据差异分析结果,也制作成为这样的表格即可哈! 然后直接使用aggregateRanks函数即可,得到的数据结果如下: ?...n和g都是出现两次,而且排名很靠前,所以p值是0.19,马马虎虎 k出现了两次,q出现一次,而且都有一个在各自的抽样场合排名第一,k的另外一次在最后面所以权重很低,所以p值是0.33,很差了。...总结一下, aggregateRanks函数其实就是对多个排好序的基因,进行求交集的同时还考虑一下它们的排序情况。总体上来说,就是挑选那些在多个数据都表现差异的基因,并且每次差异都排名靠前的那些。

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WPF 列表控件数据源绑定多个数据集合方法

在 WPF 用的多的列表控件如 ListBox 或 ListView 等,本文告诉大家在这些列表控件上进行绑定多个数据集合来源的多个实现方法。...如有一个显示动物列表的控件,需要绑定的数据来源是阿猫和阿狗两个 ObservableCollection 列表,不在后台代码编写合并集合的代码情况下,可以通过 XAML 的编写,绑定多个数据集合 准备...在开始之前,咱先搭建一点测试使用的代码,假定咱有一个 列表控件 准备绑定到的数据源是两个 ObservableCollection 对象,下面来定义这两个 ObservableCollection 对象和对应的...咱需要将两个 ObservableCollection 对象作为数据源,放在相同的一个 ListBox 里面 下面是多个不同的实现方式,解决如何在 WPF 中在 ListBox 或 ListView 绑定多个数据集合...性能问题也是很小的问题,对比渲染控件本身,动态绑定性能可以忽略 通过多绑定方法 此方法需要添加一点后台代码,定义 CompositeCollectionConverter 转换器,实现逻辑是通过多绑定的方法,将多个数据集合当成多个参数进行绑定

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【实战】将多个不规则多级表头的工作表合并为一个规范的一维表数据结果表

最近在项目里,有个临时的小需求,需要将一些行列交叉结构的表格进行汇总合并,转换成规范的一维表数据结构进行后续的分析使用。...PowerQuery的M语言查询字符串,然后转换成使用插件方式来实现相同功能更顺手,最后发现,在当前工作薄里使用PowerQuery来获取当前工作薄的其他工作表内容,也是可行的,并且不需要转换智能表就可以把数据抽取至...再最后,发现PowerQuery直接就支持了这种多工作表合并,只要自定义函数时,定义的参数合适,直接使用自定义函数返回一个表结果,就可以展开后得到多行记录的纵向合并(类似原生PowerQuery在处理同一文件夹的多个文件纵向合并的效果

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DEAP数据--一个重要的情绪脑电研究数据(更新)

数据库是基于音乐视频材料诱发刺激下产生的生理信号,记录了32名受试者,观看40分钟音乐视频(每一个音乐视频1分钟)的生理信号和受试者对视频的Valence, Arousal, Dominance,Liking...图1 32电极的国际10-20系统(标记为灰色圈),图片来源[2] DEAP数据数据采集 DEAP 数据库所使用的脑电采集设备为Biosemi ActiveTwo系统,采样频率为512Hz。...Biosemi ActiveTwo脑电采集系统主要组成为:128 导的电极帽、信号接收器、A/D转换 器和一个正常运行的笔记本电脑。...此过程会持续5秒钟,屏幕上会有一个十字架提示符号,此时参与者尽量保持平静,记录脑电信号开始的标记; (3)音乐视频播放。...参与者在进行评估时,需要根据每次看完音乐视频后的真实情感体验; (5)开始下一个实验。重复第(3)~(4)步,直到40个音乐视频材料全部播放完为止。

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多年暴雨tif数据集合成为一个nc数据

前言 当处理多年暴雨的 TIF 数据时,我们可以使用 rioxarray 库将这些数据合成为一个 NetCDF (nc) 文件。...NetCDF 是一种常用的科学数据格式,它具有跨平台、可扩展和自描述的特点,非常适合存储和共享地理空间数据。...我们需要首先定义一个包含多个 TIF 文件路径的列表,并使用 rioxarray.open_rasterio 函数打开这些文件,得到相应的 xarray 数据。...然后,通过使用 xr.concat 函数将这些数据沿时间维度进行合并,形成一个大的数据。最后,我们可以使用 to_netcdf 方法将合并后的数据保存为 NetCDF 文件。...i) xds_list.append(xds) merged_xds = xr.concat(xds_list, dim='time') merged_xds 坏了,两个循环跑出三百多个时间点

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【化解数据结构】详解集合结构,并实现一个集合

大家好,我是小丞同学,一名大二的前端爱好者 这篇文章将讲解数据结构中的集合 非常感谢你的阅读,不对的地方欢迎指正 愿你忠于自己,热爱生活 知识点抢先看 什么是集合?...(3) set.remove(4) // 未找到需要删除的元素 四、集合操作方法 在数学中,我们常常做到一些求,交集,求并,求子集差的操作,在这里我们也可以实现 方法 含义 union() 并 intersection...() 交集 difference() 差 subset() 差 1....实现并操作 并是求给定两个集合一个合集,也就是所有元素组成的新集合 如何实现呢 首先我们需要接收一个传入的集合 otherSet ,并创建一个新的集合用来存放最后的数据 通过 values 方法展开集合成数组...实现差操作 差操作就是返回相对不同的部分,A 和 B 的差就是 A 单独的部分 蓝色这块就是我们要求的 实现思路,和求并相反即可 difference(otherSet) { const

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【化解数据结构】详解集合结构,并实现一个集合

大家好,我是小丞同学,一名大二的前端爱好者 这篇文章将讲解数据结构中的集合 非常感谢你的阅读,不对的地方欢迎指正 愿你忠于自己,热爱生活 知识点抢先看 什么是集合?...(3) set.remove(4) // 未找到需要删除的元素 四、集合操作方法 在数学中,我们常常做到一些求,交集,求并,求子集差的操作,在这里我们也可以实现 方法 含义 union() 并 intersection...实现并操作 并是求给定两个集合一个合集,也就是所有元素组成的新集合 如何实现呢 首先我们需要接收一个传入的集合 otherSet ,并创建一个新的集合用来存放最后的数据 通过 values 方法展开集合成数组...欢迎大家关注本专栏,持续关注最新文章~ 本专栏的其他内容 从这里开始 【化解数据结构】从这里开启数据结构和算法 栈 【化解数据结构】什么是栈?手写实现一个栈结构!...队列 【化解数据结构】详解队列,优先队列,循环队列,并实现一个队列 最后,可能在很多地方讲诉的不够清晰,请见谅 如果文章有什么错误的地方,或者有什么疑问,欢迎留言,也欢迎私信交流

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最新业务数据指标体系集合!覆盖9个行业、多个业务场景

上次我发了第一个版本的六个行业业务指标体系,非常受大家欢迎,但是有一些人没有领到原图,这一次,老李花了两周时间去整理了一份最新最全的指标体系,涵盖了互联网、零售、电商、在线教育、餐饮、保险、银行、制造业...当然,还是要重申一下我的观点:没有任何一个指标体系是放之四海而皆准的,我们只有不断地理解业务、接触业务、熟悉业务,才能建立起最适合自身的指标体系。 最适合的,才是最好的!...互联网行业 互联网的指标体系可以从多个方面来划分,我这边依据了AAARR模型来进行划分,更适用于产品岗和运营岗的朋友。...(3)销售转化指标:分析从下单到支付整个过程的数据,帮助提升商品转化率,也可以对一些频繁异常的数据展开分析。...大金融类 1.保险行业 可从业务发展、成本费用、资金运用、盈利管理和风险管理这五个保险业的重要模块进行数据指标的划分。

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