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阿榜生信笔记3

()读取行数、ncol()读取数、rownames()读取名、colnames()读取列名 3、数据框取子集 ①、$:取数据框中某一项 #4.数据框取子集 df1$gene mean(df1$..."] df1[,c('gene','change')] ## 按条件(逻辑值) df1[df1$score>0,] 大家看看这道思考题: 4、建立自己代码思维 下图教会了我们如何优雅地去数据框最后一...名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" 6、数据框连接 我们如何将这两个数据框连接起来呢?...实际上也不难,原理差不多,merge()厉害地方在于它参数很方便 #6.两个数据框连接 test1 <- data.frame(name = c('jimmy','nicker','Damon',...[,1] m[2,3] m[2:3,1:2] ②、矩阵置和转换 如上图所示,colnames()<-c()列名重新赋值,t()置,互相转换,as.data.frame()将矩阵转换为数据框

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R语言 数据框、矩阵、列表创建、修改、导出

数据框数据框创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame),由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作),读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...[,2] #取出第二所有内容,同df1$df1[c(1,3),1:2] #取出第1、31、2数据,取时候需要组织成合适向量df1[,-ncol(df1)] #删去最后一,"-"意义同向量列名或名取子集...#取子集方法同数据框t(m) #,数据框置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据框列表列表内有多个数据框或矩阵,可通过list函数将其组成一个列表l <- list(m1...(iris)])# 2.提取内置数据iris前5,前4,并转换为矩阵,赋值给a。...rownames(a)<-paste0("flower",1:5);a##是rownames不是rowname,可见tab重要性#再次说明1:5可以换为1:nrow(a)# 4.探索列表取子集l[2]

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生信课程note-3

class3数据框、矩阵和列表向量-一维:表格—二维 :matrix 矩阵-二维,只允许一种数据类型;data.frame数据框-二维,每只允许一种数据类型。...) ,iris,letters,LETTERS是r语言内部数据,可以导出为表格文件打开,但没办法用别的软件直接打开数据框。...c("r1","r2","r3","r4")#只修改某一/名colnames(df1)[2] <- "CHANGE"列名和名都是向量#6.两个数据框连接test1 <- data.frame(...mm[2,]m[,1]m[2,3]m[2:3,1:2]mt(m):m<-as.data.frame(m) 转换为数据框 必须要赋值矩阵画热图: pheatmap::pheatmap(m)...,每个取值重复了多少次iris[,ncol(iris)]table(iris$Species)# 2.提取内置数据iris前5,前4,并转换为矩阵,赋值给a。

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生信技能树DAY 3 R语言入门

| 数据框 一只能有一种数据 | 列表 没有限制 | 区分矩阵和数据框:根据生成它函数 或 class() is()族函数 重点:数据框 1.数据框来源 (1)用代码新建 (2)由已有数据转换或处理得到...(3)读取表格文件 (4)R语言内置数据 2.新建和读取数据框 # data.frame 函数 df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:4),...## [1] "up" df1[2,]# 第二名列名,还是数据框 ## gene change score ## 2 gene2 up 3 df1[,2]# 第二 不带名列名...,是向量 ## [1] "up" "up" "down" "down" df1[c(1,3),1:2] # 多行 数据框 ## gene change ## 1 gene1 up...名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" # 修改第二列名,就是修改列名这个向量第二个元素 6.两个数据框连接 merge # 建立要连接数据框 test1 <- data.frame

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Day3

注意事项:数据分析每一步都要有检查,代码不报错,不代表真的没错,需要检查目的是否达到数据框data.frame-**二维,与表格类似,每是向量,只允许一种数据类型新建用代码新建df1 <- data.frame...(列名 =向量(内容), 列名 =向量(内容))###由已有数据转换或处理得到读取表格文件df2 <- read.csv("gene.csv")R语言内置数据属性dim(df1)#维度nrow(...df1)#行数ncol(df1)#数rownames(df1)#名colnames(df1)#列名取子集:取: $按坐标: [] #2,2取第二第二按名字,c('gene','change')...取/修改一个格-取出后赋值df13,3 <- 5一整列 df1$score <- c(12,23,50,2) 新增一-$接原来表格中不存在。...matrix -**二维,只允许一种数据类型新建 <- matrix()取子集-[]置-t()转换为数据框: as.data.frame()画热图pheatmap::pheatmap()列表list:

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数据分析EPHS(9)-Excel实现一多行

今天我们来学习一个简单功能,就是一多行,本文将介绍如何通过Excel实现,下一篇将介绍Hive中实现方法。 1、数据 先来看看我们数据,主要有2,分别是班级和姓名。 ?...本文主要想实现功能即将上图左侧数据格式转换为右侧数据格式。即实现一多行功能。 先看第一个需求,想必熟悉Excel同学也清楚如何将字符串按照指定分隔符进行拆分: ?...首先选中我们数据区域,点击数据-》获取与转换-》从表格: ? 随后即可进入power query页面,接下来需要做两步,第一是对姓名一进行分列,第二步是进行逆透视。...首先是分列,选中学生一之后点击上方拆分列,并选择按分隔符分列即可: ? 分列后结果如下: ? 然后选中学生对应,点击上面转换选项卡里面的逆透视: ? 结果如下: ?...然后删除中间一,即可得到我们想要结果。 ? 最后咱们简单介绍下什么是逆透视。

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R语言学习笔记-Day3

1 "1" "2" "3" "4"colnames(df1) 1 df1$score 1 5 3 -2 -4 #删掉score,按tab键可自动显示列名mean(df1%score) 1 0.5#统计表格中有多少某一有多少元素...)table(test$strand)**数据框取子集按名字df1,"gene" "gene1" "gene2" "gene3" "gene4"df1,c("gene","change") (可一次取...c(12,23,50,2)#新增一("$"后使用新列名)df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05)#)名修改等价于修改向量rownames(df1) <- c...by.x="name",by.y="NAME",all.x=T,all.y=T) *矩阵新建和取子集m <- matrix(1:9,nrow = 3)#取子集m2,;m,1;m2,3;m1:2,2:3*矩阵置和转换...colmanes(m) <- c("a","b","c")t(m) #置as.data.frame(m) #转换为数据框#此时m数据结构并没有发生改变,仍为矩阵(m = as.data.frame(m

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matlab复杂数据类型(二)

1 表 table是一种适用于以下数据数据类型:即以形式存储在文本文件或电子表格向数据或者表格式数据。表由若干向变量和若干向变量组成。...索引类型 结果 语法 变量 括号 表 T(rows,vars) 一多行,由 rows 指定 一个或多个变量,由 vars 指定 大括号 提取数据 T{rows,vars} 一多行,由 rows...(varindex) 所有 一个变量,由 var(名称)或 varindex(数值)指定 点索引 提取数据 T.var(rows) 一多行,由 rows 指定 一个变量,由 var(名称)指定...可以使用table数据类型来将混合类型数据和元数据属性(例如变量名称、名称、说明和变量单位)收集到单个容器中。表适用于向数据或表格数据,这些数据通常以形式存储于文本文件或电子表格中。...还可以使用表存储试验数据,使用表示不同观测对象,使用列表示不同测量变量。

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从零开始异世界生信学习 R语言部分 02 数据结构之数据框、矩阵、列表

数据框 data.frame 数据框 约等于表格:1.数据框不是一个具体文件,只是R语言内部一个数据;2.数据框每一只能有一种数据类型 图片 新建和读取数据框 #新建和读取数据框 df1 <- data.frame...#取第二 df1[c(1,3),1:2] # 取第一和第三以及第一和第二,注意逗号前后不同向量,分别表示取得!!!...,"b","c") #加列名 m m[2,] #矩阵取子集不支持使用$ m[,1] m[2,3] m[2:3,1:2] m #矩阵中重要函数 t(m) #行列置,名和列名都跟着变换...as.data.frame(m) #将转换为数据框 #作图 pheatmap::pheatmap(m) #使用pheatmap包中pheatmap函数做图,热图会先进行聚类,之后再作图。...= matrix(1:9, nrow = 3), m2 = matrix(2:9, nrow = 2)) l l[[2]] #列表取子集 l$m1 #列表元素有名字,可以用

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PostgreSQL 教程

LIMIT 获取查询生成子集。 FETCH 限制查询返回行数。 IN 选择与值列表任何值匹配数据。 BETWEEN 选择值范围内数据。 LIKE 基于模式匹配过滤数据。...主题 描述 插入 指导您如何将单行插入表中。 插入多行 向您展示如何在表中插入多行。 更新 更新表中现有数据。 连接更新 根据另一个表中值更新表中值。 删除 删除表中数据。...标识 向您展示如何使用标识。 更改表 修改现有表结构。 重命名表 将表名称更改为新名称。 添加 向您展示如何向现有表添加一。 删除 演示如何删除表。...更改数据类型 向您展示如何更改数据。 重命名列 说明如何重命名表中。 删除表 删除现有表及其所有依赖对象。 截断表 快速有效地删除大表中所有数据。...复制表 向您展示如何将表格复制到新表格。 第 13 节. 了解 PostgreSQL 约束 主题 描述 主键 说明在创建表或向现有表添加主键时如何定义主键。

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生信马拉松 Day3

要写能换个环境和场景依然可运行代码,而不是一次性玩意儿 总览 “向量”一维 matrix 矩阵——二维,只允许一种数据类型 data.frame 数据框——二维,每只允许一种数据类型 list 列表...——可装万物 首先是最重要数据框 数据框来源 (1)用代码新建 (2)由已有数据转换或处理得到 (3)读取表格文件 (4)R语言内置数据 1.新建和读取数据框 df1 <- data.frame(gene...数据框维度是行数和数 dim(df1) nrow(df1) #有多少 ncol(df1) #有多少列 rownames(df1) #取名 colnames(df1) #取列名 3.数据框取子集...) df1 #改行名和列名 rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4") #只修改某一/名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" 5.两个数据框连接...进行作图 (这个以前从来没注意过,都是无脑data.frame,matrix分析时候很容易报错,今天小洁老师特地讲了series matrix读取之后可以用as.matrix转换,好奇后续作用,盲猜可能是有时分析和作图需要对数据

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2023.4生信马拉松day3-数据结构

-数据框二维数据;约等于表格 但是:列有要求(同一只允许同一种数据类型);不是文件(可以导出来成为一个文件);数据框单独拿出是向量,视为一个整体;-矩阵二维数据;同一同一都只允许一种数据类型...;-列表什么都可以放;-class()函数可以用于判断数据类型/数据结构本节内容图片1.数据框来源-(1)用代码新建df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:...(df1$score) #向量求平均值做法-(2)按坐标取元素//df1[2,2]df1[2,] #取出来行会继承数据框属性df1[,2] #取出来是向量df1[2] #不加逗号...$进行取子集m[2,]m[,1]m[2,3]m[2:3,1:2]#矩阵置和转换mt(m)as.data.frame(m) class(m) #看着是把m变成了数据框,但是没有赋值就没有发生过...,每个取值重复了多少次table(iris[,ncol(iris)])# 2.提取内置数据iris前5,前4,并转换为矩阵,赋值给a。

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Day09 生信马拉松-GEO数据挖掘 (中)

如果三种办法都不适用,可以继续往后写else if if(F){ # 第一种方法,直接查看data.frame用现成可以用来分组--不一定可以找出 }else if(F){ # 第二种方法...,按取子集——需要解读表格才用代码 ##https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?...acc=GPL570 先下载GPL对应txt到本地文件 if(F){ #注:表格读取参数、文件列名不统一,活学活用,有的表格里没有symbol,也有的GPL平台没有提供注释表格 b = read.delim...图操作代码 dat=as.data.frame(t(exp)) #将matrix形式exp转换为data.frame library(FactoMineR) library(factoextra)...,对于我们一般习惯基因名为,样本名为数据框,就需要t()置 cor()函数求相关系数时候也是按列计算,如果计算之间相关系数也需要对矩阵进行t()置 参考资料:scale函数对矩阵归一化是按归一化

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R语言数据结构与转换

下面介绍 R 中用于存储数据多种数据结构。 R 数据结构 在大多数情况下,结构化数据是一个由很多行和很多组成数据集。在 R 中,这种数据集被称为数据框。...dim(mat1) # 32 dim(mat2) # 23 mat1 %*% mat2 1.3.3 置:t( ) 矩阵置运算就是把矩阵互换。...例如,它可以是向量、数组、表格和任意类型对象组合。...1.6 数据框 数据框(dataframe)是一个由组成二维结构,其中行表示观测(observation)或记录(record),列表示变量(variable)或指标(indicator)。...与矩阵不同是,数据框里不同可以是不同模式(数值型、字符型等)数据。数据框可以通过函数 data.frame( ) 创建。

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