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生存分析时间点问题

datasets) 2016-04-27 前者数据是 IlluminaHiSeq TCGA hub表达矩阵,基因SYMBOL的表达矩阵,基因的表达信息,通常是用来把病人进行分组,然后还是需要下载临床信息,才能做生存分析...分分钟对TCGA数据库的任意癌症种类做生存分析,并校验 发现TCGA数据库记录病人的生存事件的时候,区分Alive和Dead,但是呢,不同的事件本来是应该对应不同的时间记录字段,但是突然就发现了一个特例...构建生存分析需要的时间 我这里使用的代码好像很复杂: table(phe$vital_status) phe=phe[phe$vital_status %in% c('Alive' , 'Dead'),...但是也有情况出现就是他们不一致,所以就出现了bugs 生存分析代码是 有了上面的数据, 就可以做生存分析并且绘制代码了。...但是,其实是有些癌症的性别生存差异是显著的,大家猜猜看是哪一个呢?

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Redis 键的生存时间和过期时间

Redis的键可以设置生存时间和过期时间,这个过期时间是如何设置的呢,可以简单看下: 通过 EXPIRE 命令或者 PEXPIRE 命令,客户端可以以秒或者毫秒精度为数据库中的某个键设置生存时间(TTL...),在经过制定的秒数或者毫秒数之后,服务器就会自动删除生存时间为0的键。...这个问题有三种可能的答案,分别代表了三种不同的删除策略: 定时删除:在设置键的过期时间的同时,创建一个定时器,让定时器在键的过期时间来临时,立即执行对键的删除操作。...对CPU时间是不友好的,在过期键很多的情况下,删除过期键往往耗费了不少的CPU资源; 惰性删除:放任键过期不管,但每次获取键时,查询是否过期,如果过期就删除该键,否则就返回该键。...这种策略对CPU时间是友好的,因为只有访问的时候才判断是否删除,基本不占用CPU资源。

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如何合并ESTIMATEScore和生存时间

记录肿瘤组织中基质的存在) 2)ImmuneScore 免疫评分(代表免疫细胞在肿瘤组织中的浸润) 3)ESTIMATEScore 估计分数(推断出肿瘤的纯度) 一、我们可以从TCGA下载到特定肿瘤样本的生存时间...生存时间的数据如下 StromalScore,ImmuneScore和ESTIMATEScore文件如下 你会发现ESTIMATEScore文件中样本的ID号比较长,而生存时间文件中样本ID比较短...那么我们就提取ESTIMATEScore文件中样本的前12位,然后跟生存时间里面的样本ID做比较,找到一样的ID就把免疫分值和生存时间合并起来。...,header=T,sep="\t") #提取样本ID的前12位最为新的样本ID id=substr(score$ID,1,12) #将新ID号作为行名 rownames(score)=id #读入生存时间文件...read.table("Overall_Survival_month.txt",header=T,sep="\t") #将样本ID号作为行名 rownames(os)=os$Patient.ID #删掉生存状态中

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Flink 状态生存时间(State TTL)设置

为什么状态需要被清理 状态不需要一次存储 状态有效期有时间限制,超过时间需要重置状态(业务上) 开启状态清理: StateTtlConfig ttlConfig = StateTtlConfig...OnCreateAndWrite but also updated on read. */ OnReadAndWrite } 有三种 如果设置为 Disabled,则表明不更新时间戳...,永远有效 如果设置为 OnCreateAndWrite,则表明当状态创建或每次写入时都会更新时间戳 如果设置为 OnReadAndWrite,在状态创建、写入、读取均会更新状态的时间戳 失效时间=上次访问的时间戳...+ TTL > 超过了当前时间 2.状态可见性 /** This option configures whether expired user value can be returned or not...expired user value. */ NeverReturnExpired } 如果设置为 ReturnExpiredIfNotCleanedUp,那么即使这个状态的时间戳表明它已经过期了

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只在视图 Body 中生存变量

但很少有人会在 body 中去使用 var 来定义变量,因为实在找不到使用 var 的理由和意义。本文将探讨在 SwiftUI 的视图 body 中用 var 来创建变量的意义和可能的场景。...意义 严格来说,本文接下来介绍的两个场景,都有其他的替代方案( 无需在 body 中创建变量 )。...在此种情况下,在 body 中使用 var 来声明一个变量,或许会有意想不到的效果。...,让我们可以直接在结果生成器中使用惰性变量。...如果计算时间真的较长( 会导致视图停滞 ),通过在 task 中使用异步方法才是更好的选择。 总结 我也是一时兴起写了本文,写完后我也不知道是否能给读者带来什么有价值的东西。

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局部变量的作用域和生存周期

变量定义的三种情况 (1)在函数开头定义 (2)在函数的内部定义 (3)在复合语句块内部定义 局部变量 定义在函数内部的变量只能在函数内部引用,同样定义在复合语句块中的变量只是在复合语句块内有效...将这种变量称为“局部变量”,顾名思义,这些变量的作用域仅仅是在函数内部或复合语句块内。...变量i只在复合语句块内有效,离开该复合语句块变量就失效,系统会把它占用的内存释放掉。...但在主函数中,我想输出定义在func()函数内部局部变量i的值。同样是不可行的,编译器在编译的的时候就会报错。但是在不同的函数中可以定义同名的变量,因为他们代表不同的对象,互不干扰。...上述例子虽然简单,但是也直白直观的感受到局部变量的作用域和生命周期。我们在实际写代码的过程中,一定要注意局部变量的引用。

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6.7 变量的存储方式和生存

一、动态存储方式与静态存储方式 C语言中,每一个变量和函数都有两个属性:数据类型和数据的存储类别 从变量值存在的时间来观察,变量的存储有两种方式静态存储方式和动态存储方式 ?...二、局部变量的存储类别 (1)自动变量(auto变量) 函数中的局部变量,如果不专门声明为static(静态)存储类别,都是动态地分配存储空间 的。...” (2)静态局部变量(static局部变量) 作用:局部变量的值在函数调用结束后不消失而继续保留原值 (3)寄存器变量(register) 为了提高执行效率,允许将局部变量的值放在CPU...三、全局变量的存储类别 (1)在一个文件内扩展外部变量的作用域 如果由于某种考虑,在定义点之前的函数需要引用该外部变量,则应该在引用之前用关键 字extern对该变量作“外部变量声明...”,表示把该外部变量的作用域扩展到此位置 (2)将外部变量的作用域扩展到其他文件 (3)将外部变量的作用域限制在本文件中 原创不易,未经本公众号允许禁止转载,否则追究法律责任

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7.5 变量的存储方式和生存

02 局部变量的存储类别 1、自动变量(auto变量) 函数中的局部变量,如果不专门声明static存储类别,都是动态地分配存储空间的,数据存储在动态存储区中。...2、静态局部变量(static局部变量) 函数中的局部变量的值在函数调用结束后不消失而继续保留原值,即其占用的存储单元不释放,在下一次再调用该函数时,该变量已有值。...3、寄存器变量(register变量) 为提高执行效率,允许将局部变量的值放在CPU中的寄存器中,需要用时直接从寄存器取出参加运算,不必再到内存中去存取。...03 全局变量的存储类别 1、在一个文件内扩展外部变量的作用域 如果由于某种考虑,在定义点之前的函数需要引用该外部变量,则应该在引用之前用关键字extern对该变量作“外部变量声明”,表示把该外部变量的作用域扩展到此位置...2、将外部变量的作用域扩展到其他文件。 3、将外部变量的作用域限制在本文件中。 4、注意,用auto、register和static声明变量时,是在定义变量的基础上加上这些关键字,而不能单独使用。

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Linux Shell 脚本:如何将时间戳转换为时间

在进行系统管理或者软件开发时,我们经常会遇到需要将时间戳转换为人类可读的时间格式的场景。这种转换在日志分析、数据同步、报表生成等多个方面都非常有用。...什么是时间戳? 时间戳是一个用于表示某一特定时间点的数值。它通常是从某一固定时间点(通常为 "Unix 纪元",即 1970 年 1 月 1 日 00:00:00 UTC)开始计算的秒数。...使用 date 命令 在 Linux 系统中,date 命令是一个非常强大的时间处理工具,它不仅能显示、设置系统日期和时间,还能进行日期计算和转换。...基础语法 要用 date 命令将时间戳转换为可读的时间格式,你可以使用以下语法: date -d "@时间戳" 或者 date -d "1970-01-01 UTC 时间戳 seconds" 例如.../convert_timestamp.sh 1631389887 这将输出: 转换后的时间为:2021-09-12 00:04:47 总结 通过使用 Linux 的 date 命令,我们可以轻松地将时间戳转换为人类可读的时间格式

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「R」怎么对连续变量分组并进行生存分析

在探究基因表达、基因拷贝数等连续变量对癌症病人的预后情况的影响时,我不得不面对和处理的主要问题是如何对这种连续型的变量进行分组,然后进行相应的生存分析。...生存分析最最关键的两个变量生存事件和存活时间,前者是指一位病患是死了还是不知道是死是活了,前者一般用1表示,后者用0,其中后者常被称为截尾事件,要么就是研究周期到了,病人还没死;要么是找不到人了。...所以生存分析第三个必不可少的变量是组别变量,用来对比和探寻差异。 有的时候组别不明自显,比如我们要分析某个癌症组织和正常组织的差异,那么划分组别的方式自然就很明显了,而且在实验或分析设计之时就能确定。...这里画图函数涉及一些参数的设定,可以参考《怎么画出好看的生存曲线》这篇文章。 如果我们想要将连续型变量进行生存对比分析,显然我们要在构建生存模型之前将组别划分好。...设置一个时间阈值: plot_surv(res$data, cutoff = 3000) ?

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R语言使用限制平均生存时间RMST比较两条生存曲线分析肝硬化患者

下面是每个实验组的死亡时间的卡普兰-梅尔(KM)估计。 3 限制平均生存时间(RMST)和限制平均损失时间(RMTL RMST被定义为生存函数曲线下的面积,直到一个时间τ(< ∞)。...其中S(t)是所关注的时间-事件变量生存函数。对RMST的解释是:"当我们对患者进行τ的随访时,患者平均会存活μτ",这是对删减的生存数据的相当直接和有临床意义的总结。...第二个参数(status)也是一个向量变量,其长度与时间相同,每个元素取1(如果有事件)或0(如果没有事件)。...设Y为限制性平均生存时间,设Z为治疗指标。同时,让X表示一个q维的基准协变量向量。...受限的平均生存时间是一个稳健的、临床上可解释的生存时间分布的总结方法。与中位生存时间不同,即使在严重的删减情况下,它也是可以估计的。关于限制性平均生存时间,有相当多的方法学研究可以替代风险比方法。

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创业公司的命运——是生存时间还是融资数额?

需要强调的是,这是一个倾斜的数据集,其尾部是细长的,造成该现象的部分原因是由于在种子或天使轮后,随着竞争压力的增大,公司生存能力急剧下降。...因为越老的公司就有更多的时间来构建他们的技术,在市场上的生存时间越长,与那些可以帮助自己进行IPO的潜在收购者或投资银行家接触的机会就越多。 下面的图表,显示了数据集中不同年份成立的公司的分布情况。...一般来说,如果不考虑年龄(生存时间)因素,700万到900万美元的范围是最大化获得收购或上市的可能性的最佳选择。...四、时间就是金钱 但是时间的作用呢?上诉讲到我们已经通过资金总额和大致年龄将公司进行了分类,可以看到,在控制资金的同时,年龄对退出前景有很大的影响。...而这里更重要的一点是:其主要因素是时间还是金钱?通过研究可发现,在所有可能的情况下,时间是关键。 但是,数据也并不是固定不变的。

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7.5 C语言变量的存储方式和生存

02局部变量的存储类别 1、自动变量(auto变量) 函数中的局部变量,如果不专门声明static存储类别,都是动态地分配存储空间的,数据存储在动态存储区中。...2、静态局部变量(static局部变量) 函数中的局部变量的值在函数调用结束后不消失而继续保留原值,即其占用的存储单元不释放,在下一次再调用该函数时,该变量已有值。...3、寄存器变量(register变量) 为提高执行效率,允许将局部变量的值放在CPU中的寄存器中,需要用时直接从寄存器取出参加运算,不必再到内存中去存取。...03全局变量的存储类别 1、在一个文件内扩展外部变量的作用域 如果由于某种考虑,在定义点之前的函数需要引用该外部变量,则应该在引用之前用关键字extern对该变量作“外部变量声明”,表示把该外部变量的作用域扩展到此位置...2、将外部变量的作用域扩展到其他文件。 3、将外部变量的作用域限制在本文件中。 4、注意,用auto、register和static声明变量时,是在定义变量的基础上加上这些关键字,而不能单独使用。

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计量模型 | 前定变量#时间FE

可以观察到,被解释变量$y{it}$与核心解释变量$did{it}$均在个体与时间两个维度上变动,但控制变量$X_{i,2009-2013}$只随着个体变动,在时间维度上始终是一个恒常数。...为了补充控制变量时间维度上的信息,作者将这一系列控制变量时间FE交乘,并称之为控制变量初始值的时间趋势。...仔细思考一下,这里至少存在四个问题: 第一,只有当变量本身就存在明显的时间趋势时才能以变量初始值的时间趋势来作为替代。...第三,变量时间FE的交互项本身不能定义为变量时间趋势。...往期推文有介绍过时间趋势,变量时间趋势就是变量初始值与时间趋势项trend的交乘,而非初始值与时间FE的交乘,后者的范围更广,实际上包含了前者。 第四,多重共线性。

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《Redis设计与实现》读书笔记(十二) ——Redis键的生存时间与过期时间

《Redis设计与实现》读书笔记(十二) ——Redis键的生存时间与过期时间 (原创内容,转载请注明来源,谢谢) 1、设置方式 在redis客户端,可以通过expire命令设置某个键的以秒为单位的生存时间...setex命令可以在对字符串对象设置值的时候,同时设置过期时间,但是其只针对字符串对象可以使用。在经过指定时间后,服务器会自动删除生存时间为0的键值对。...另外,可以用ttl或pttl命令,查看键的剩余生存时间。...如果键不存在数据库,会返回-2;键没有过期时间,返回-1;如果键有过期时间,则用过期时间的unix毫秒时间戳,减去当前时间的unix毫秒时间戳。...activeExpireCycle函数工作方式总结如下: 每次函数运行,都从一定量的数据库中,找出一定量的键,进行检查,并删除过期的键;有一个全局变量current_db,会记录activeExpireCycle

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