如何将存储在磁盘上的邻接矩阵输入到 R 程序中，是进行社交网络分析的起点。在前面的章节中已经介绍了基本的数据结构以及代码结构，本章将会面对一个实质性问题，学习如何导入一个图以及计算图的一些属性。
听说以后医务人员要年薪制了，完全搞不懂这些东西的初衷和理由，感觉自己的🍚里米又要少一些了。🫠
BASGCN(Backtrackless Aligned-Spatial Graph Convolutional Networks）由国内知名大学中央财经大学信息学院白璐副教授带领团队共同研发，已被人工智能领域的国际顶级期刊《IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence》(TPAMI，IEEE模式分析和机器智能汇）刊录用，并将于日后正式刊出。
与"好友"关系不同的是，"粉丝、关注"是一种单向关系，我虽然关注了你，但你不需要同时关注我这个粉丝。
谱聚类算法是一种常用的无监督机器学习算法，其性能优于其他聚类方法。 此外，谱聚类实现起来非常简单，并且可以通过标准线性代数方法有效地求解。 在谱聚类算法中，根据数据点之间的相似性而不是k-均值中的绝对位置来确定数据点属于哪个类别下。具体区别可通过下图直观看出：
data = 包含以下字段的 struct: X: [7165×23×23 single] R: [7165×23×3 single] Z: [7165×23 single] T: [-417.9600 -712.4200 -564.2100 -404.8800 -808.8700 -677.1600 -796.9800 -860.3300 -1.0085e+03 -861.7300 -708.3700 -725.9300 -879.3800 -618.7200 -871.1900 -653.4400 -1.0109e+03 -1.1594e+03 -1.0039e+03 -1.0184e+03 -1.0250e+03 … ] P: [5×1433 int64]
Google通过PageRank算法模型，实现了对全互联网网页的打分。但对于海量数据的处理，在单机下是不可能实现，所以如何将PageRank并行计算，将是本文的重点。
前言 Google通过PageRank算法模型，实现了对全互联网网页的打分。但对于海量数据的处理，在单机下是不可能实现，所以如何将PageRank并行计算，将是本文的重点。 本文将继续上一篇文章 PageRank算法R语言实现，把PageRank单机实现，改成并行实现，利用MapReduce计算框架，在集群中跑起来。 目录 PageRank算法并行化原理 MapReduce分步式编程 1. PageRank算法分步式原理 单机算法原理请参考文章：PageRank算法R语言实现 PageRank的分步
本案例的内容呢，主要是利用论文间的相互引用关系，设计一个GCN网络进行论文分类。具体的数据结构与内容会在下文详细介绍。
图是一个非线性数据结构，本文将讲解图的基本运用，将图巧妙运用，并用TypeScript将其实现，欢迎各位感兴趣的开发者阅读本文。
共表达基因指的是表达量具有协同变化趋势的基因集合，通常认为这些基因参与相同的生物学过程，比如参与同一个代谢通路，正是由于功能上的协同作用，导致表达量呈现出高度相关性。
近期适配几款游戏的数据，因为重复量太大，因此写一个对数据进行处理的程序，下面是整个过程中接触到的一些东西。
谱聚类(Spectral Clustering, SC), 是一种基于图论的聚类方法——将带权无向图划分为两个或两个以上的最优子图，使子图内部尽量相似，而子图间距离尽量距离较远
我在ADGC的基础上重构了代码，让深度聚类的代码实现了更高的统一。具体来说，我重新设计了代码的架构，让你可以在我的框架中轻松运行不同模型的代码，并且提升了可扩展性。此外，我定义了一些工具类和函数来简化代码并使一些配置更加清晰。
原文地址： https://staging.distill.pub/2021/gnn-intro/?ref=https://githubhelp.com 原文是一篇博客形式的文章，该文章最大的特点：全
【导读】图卷积网络（Graph Convolutional Network，GCN）是近年来逐渐流行的一种神经网络结构。不同于只能用于网格结构（grid-based）数据的传统网络模型 LSTM 和 CNN，图卷积网络能够处理具有广义拓扑图结构的数据，并深入发掘其特征和规律，例如 PageRank 引用网络、社交网络、通信网络、蛋白质分子结构等一系列具有空间拓扑图结构的不规则数据。相比于一般的拓扑图而言，人体骨骼拓扑图具有更加良好的稳定性和不变性，因此从2018年开始，就有许多学者尝试将图卷积网络应用到基于人体骨骼的行为识别领域来，也取得了不错的成果。下面就让我们来深入了解一下什么是图卷积网络，以及它在行为识别领域的最新工作进展吧！
今天给大家介绍2019年6月发表在ACL上的论文“Attention Guided Graph Convolutional Networks for Relation Extraction”，该工作由新加坡科技设计大学StatNLP研究小组完成。该研究提出了一种以全依赖树作为输入的注意力引导图卷积网络（AGGCN）模型。该模型充分利用了依赖树中的信息，以便更好地提取出相关关系。
【导读】时空预测在天气预报、运输规划等领域有着重要的应用价值。交通预测作为一种典型的时空预测问题，具有较高的挑战性。以往的研究中主要利用通行时间这类交通状态特征作为模型输入，很难预测整体的交通状况，本文提出的混合时空图卷积网络，利用导航数据大大提升了时空预测的效果（本文作者高德机器学习团队，论文已被收录到KDD2020）。
近几年来深度学习的发展越来越火热，其中最为典型的就是半监督学习的新研究进展GCN。由Kipf和Welling提出的GCN被证明是一种有效的图半监督学习框架应用，如社会、医疗、商业和交通网络分析，其中典型的对象是在少数有标记数据的帮助下对无标记数据进行分类图中的样本。
能够将数据转换到欧几里德空间的便是欧几里德结构化数据，如时间序列数据，图像数据，上图则是图像数据的一个例子
图的基本概念中我们需要掌握的有这么几个概念：无向图、有向图、带权图；顶点（vertex）；边（edge）；度（degree）、出度、入度。下面我们就从无向图开始讲解这几个概念。
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Transformer诞生于NLP领域，目前已经成为NLP中的主力模型。同时，Transformer在CV领域也逐渐显示出其超强的能力，诸如ViT、Swin Transformer、BEiT等Vision Transformer模型验证了Transformer同样适用于图像领域。然而，Transformer在图表示学习领域的发展速度明显不如NLP和CV领域。在图表示学习中，基于图卷积（GCN）的方法仍然是主力模型。
日常通勤中的规律往往相对容易挖掘，但交通状况还会受很多其他因素影响，之前的研究主要利用通行时间这类交通状态作为特征，少量研究引入事件，不能很好地预测实际交通流量。
基于图的机器学习是一项困难的任务，因为图的结构非常复杂，而且信息量也很大。这篇文章是关于如何用图卷积网络（GCNs）对图进行深度学习的系列文章中的第一篇，GCNs是一种强大的神经网络，旨在直接处理图并利用其结构信息。
【导读】Graph Neural Network（GNN）由于具有分析图结构数据的能力而受到了广泛的关注。本文对Graph Neural Network进行了简要介绍。它涵盖了一些图论，以便于理解图和分析图时遇到的问题。然后介绍了不同形式的Graph神经网络及其原理。它还涵盖了GNN可以做什么以及GNN的一些应用。
从图中提取特征与从正常数据中提取特征完全不同。图中的每个节点都是相互连接的，这是我们不能忽视的重要信息。幸运的是，许多适合于图的特征提取方法已经创建，这些技术可以分为节点级、图级和邻域重叠级。在本文中，我们将研究最常见的图特征提取方法及其属性。
题目：Semi-Supervised Classification with Graph Convolutional Networks
今天学习的是 Thomas N. Kipf 的 2016 年的工作《Variational Graph Auto-Encoders》，目前引用量为 260 多。
本文主要介绍CS224W的第十课，图的深度生成模型。第九课是图神经网络的实战，该部分内容会和其他场景的实战进行统一整合，做一个不断更新的实战篇章，并按场景将其梳理到同一个代码库下。回顾第八章，课程主要讲述了图神经网络，以及引入聚合函数和注意力机制的图卷积网络，通过图神经网络可自动化生成Embedding。本课程则主要讲述图的生成模型，如何生成一张图。
Dijkstra是图论中经典的算法，可以计算图中一点到其它任意一点的最短路径。 学过数据结构的应该都接触过，因此具体的演示这里不再赘述。 完整的演示可以参看 图论最短距离(Shortest Path)算法动画演示-Dijkstra(迪杰斯特拉)和Floyd(弗洛伊德) 算法的缺点：不能处理带负权重的图。
NE 的中心思想就是找到一种映射函数，该函数将网络中的每个节点转换为低维度的潜在表示
邻接矩阵：是表示顶点之间相邻关系的矩阵。因此，用一个一维数组存放图中所有顶点数据；用一个二维数组存放顶点间的关系（边或弧）的数据，这个二维数组称为邻接矩阵。邻接矩阵又分为有向图邻接矩阵和无向图邻接矩阵。
WGCNA是目前非常火热的一项研究内容，其全称为weighted correlation network analysis, 直译就是加权基因相关性网络分析。通过这项分析，可以鉴定共表达的基因集合，这样的集合称之为modules, 而且可以将modules与表型数据进行关联分析，挖掘潜在的mark 基因。
通过将邻接矩阵A与D[1]的逆矩阵相乘，可以通过节点度对特征表示进行规范化[1]。因此，我们的简化传播规则如下所示：
图神经网络（GNN）是机器学习中最热门的领域之一，在过去短短数月内就有多篇优秀的综述论文。但数据科学家 Matt Ranger 对 GNN 却并不感冒。他认为这方面的研究会取得进展，但其他研究方向或许更重要。
近几年，神经网络在自然语言、图像、语音等数据上都取得了显著的突破，将模型性能带到了一个前所未有的高度，但如何在图数据上训练仍然是一个可研究的点。
昨天有点事停更了一天，非常抱歉！继续遗传算法可视化项目，之前文章没看的或者今天才关注的点历史消息或者这里：
图的存储必须要完整、准确地反映顶点集和边集的信息。根据不同图的结构和算法，可以用不同的存储方式，但不同的存储方式将对程序的效率产生很大的影响，因此，所选的存储结构应适合于欲求解的问题。无论是有向图还是无向图，主要的存储方式都有两种：邻接矩阵和邻接表。前者属于图的顺序存储结构，后者属于图的链接存储结构。
设G=(V,E)是n个顶点的图，则G的邻接矩阵用n阶方阵G表示，若(Vi ,Vj )或< Vi ,Vj >属于E(G)，则G[i][j]为1，否则为0。
在现实世界的各种场景中，图处处可见。社交网络是在人与人构建连接的图，生物学家使用图描述蛋白质分子的交互，通信网络本身就以图的形式存在。在文本挖掘中还会使用词共现图进行分析。毫无疑问，在图数据上探索机器学习受到越来越多的关注。人们试图通过以此预测社交网络中的新朋友或是发现蛋白质分子新的性质与功能。然而，无论数学家还是统计学家都无法直接在图上进行计算的，如何将图数据处理成可直接应用于机器学习的数据是一项极大的挑战。在这样的背景下，图嵌入方法被提出。
图的概念介绍得差不多了，大家可以消化消化再继续学习后面的内容。如果没有什么问题的话，我们就继续学习接下来的内容。当然，这还不是最麻烦的地方，因为今天我们只是介绍图的存储结构而已。
算法设计题(10分) (1)阅读下列递归算法，写出非递归方法实现相同功能的C程序。 void test(int &sum) { int x； scanf(x)； if(x=0) sum=0 el
图的结构比较复杂，任何两个顶点之间都可能有关系。如果采用顺序存储，则需要使用二维数组表示元素之间的关系，即邻接矩阵(Adjacency Matrix),也可以使用边集数组，把，每条边顺序存储起来。如果采用链式存储,则有邻接表.十字链表和邻接多重表等表示方法。其中，邻接矩阵和邻接表是最简单、最常用的存储方法。。
图神经网络(GNNs)已经成为学习图数据的标准工具箱。gnn能够推动不同领域的高影响问题的改进，如内容推荐或药物发现。与图像等其他类型的数据不同，从图形数据中学习需要特定的方法。正如Michael Bronstein所定义的:
在图的邻接矩阵存储结构中，顶点信息使用一维数组存储，边信息的邻接矩阵使用二维数组存储。
近几年来，伴随着计算机算力的急剧提升，神经网络从历史的尘埃中走出，横扫各大领域，完成一次次颠覆性的创新。依托高度弹性的参数结构，线性与非线性的矩阵变换，神经网络能适用于各式各样的数学场景，在各个类别的应用上我们都能看到神经网络的影子。其中著名的应用方向，包括自然语言处理、计算机视觉、机器学习、生物医疗、推荐系统、自动驾驶等等。图神经网络，广泛应用于社交关系、知识图谱、推荐系统、蛋白质分子建模，同样源自于对传统领域的创新，它的前身是图嵌入算法；而图嵌入算法又以图数据作为载体。这一关系，将贯穿本文始末，成为我们的展开线索。
首先这里涉及到序列推荐的概念：序列推荐就是根据用户的历史行为来预测用户的后续交互。现存两个挑战：
连通图:在无向图G中，若对任何两个顶点 v、u 都存在从v 到 u 的路径，则称G是连通图。
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