我正在使用igraph包来绘制我在yEd中创建的图形。这是一个应该覆盖在地理地图上的图形,所以我要做的第一件事就是改变顶点坐标,使它们与它们所代表的经度/纬度相匹配。(简单线性变换)
我尝试使用GraphML格式,但iGraph无法读取由yEd创建的GraphML文件,因此,我将图形保存为GML文件。顶点信息的结构如下所示:
node [
id 0
label ""
graphics [
x 2181.0043222386603
y 1463.6747524664843
w 5.26098
我知道如何将图形数据库输出到文件(如GraphML文件),但我更愿意遍历节点并将它们作为C#对象,因为我需要在其他地方使用它们。
就像这样:
var it = graph.GetNodeIterator();
while (it.HasNext()) {
var node = new MyNodeObject();
//get attributes or whatever
nodeList.Add(node);
}
//nodeList now contains all nodes in a List
我找不到一种方便的方法来做这件事,Dex文档也没有多大帮助。显然,D
我在编程方面很新。我正试着从一个文件中得到多边形的图形。此代码与另一个文件一起运行。但在这个文件中,一些图形名称不起作用。“熊猫”对象没有属性“gen”的错误发生了。
import geopandas as gpd
import osmnx as ox
path_to_folder = r'/Users/xxx/Desktop/Example/cities.shp'
cities = gpd.read_file('/Users/xxx/Desktop/Example/cities.shp')
for item i
我在Linux Mint (platform i686-pc-linux-gnu)上安装了R 3.4.1,但在以前版本的R和Windows上也会出现同样的问题。当我尝试使用install.packages()安装igraph时,出现以下错误:
foreign-graphml.c: In function ‘igraph_write_graph_graphml’:
foreign-graphml.c:1408:46: error: expected ‘)’ before ‘GRAPHML_NAMESPACE_URI’
ret=fprintf(outstream, "<grap
我想把一棵树从newick转换成一种像graphml这样的格式,这样我就可以用胞景打开它了。
因此,我有一个文件"small.newick“,其中包含:
((raccoon:1,bear:6):0.8,((sea_lion:11.9, seal:12):7,((monkey:100,cat:47):20, weasel:18):2):3,dog:25);
到目前为止,我这样做了(Python3.6.5\Anaconda):
from Bio import Phylo
import networkx
Tree = Phylo.read("small.newick",
我已经将graphml从Gephi导入到NetworkX。
G = nx.read_graphml(r"pah\EXPORTCM0606.graphml")
在Gephi中,我计算了模块化类,获得了6个主要的社区,现在我想在NetworkX中获得这些社区,以便获得他们推文中最频繁的单词。所以我的问题是双重的:我如何使用NetworkX从G中获得这些已经在Gephi中计算的模块化类社区?
那么我如何将我从MongoDB生成的图形与tweet和从Gephi导入的图形进行匹配呢?从MongoDB生成带有tweet的图形的代码:
from pymongo import MongoCli
我在编写一个使用两个名称空间的XDocument时遇到了困难。当我添加由不同方法创建的XElements (该方法引用的是完全相同的XNamespace实例)时,我将得到具有不同前缀的xmlns的重声明。它是完全正确的XML,但它是人类可读性的负担。
XDocument xml = new XDocument();
XElement e_graphml = new XElement(ns_graphML + "graphml",
new XAttribute("xmlns", ns_graphML),
new XA