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回答
如何
根据
日期
对
FASTA
文件
进行
排序
?
、
、
、
我有一个
FASTA
文件
,如下所示 >Spike|hCoV-19/Wuhan/WIV04/2019|2019-12-30|EPI_ISL_402124|Original|hCoV-19^^Hubei|HumanMFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVY
浏览 58
提问于2021-10-02
得票数 0
回答已采纳
2
回答
在使用SeqIO解析的
fasta
文件
上使用
排序
时出现"NotImplementedError: SeqRecord“
、
、
、
我尝试按照
文件
中序列的字母顺序(而不是序列的ID )
对
fasta
文件
进行
排序
。
fasta
文件
包含超过200个序列,我正在尝试在bit master (使用python代码)中查找重复的(我指的是几乎相同的蛋白质序列,但不是相同的ID)。所以我想用
fasta
文件
做一个字典,然后
对
字典的值
进行
排序
。(input_file, "
fasta
&q
浏览 2
提问于2017-02-21
得票数 4
回答已采纳
3
回答
按GC含量
进行
入库序列读取
、
、
我想"bin“(分割成单独的
文件
)多
fasta
核苷酸序列
文件
(例如,Roche-454运行约500,000个读取平均读取长度为250bp)。我想要的垃圾桶基于GC内容的每一个阅读。结果输出将是8个多
fasta
文件
:GC含量21-30%GC含量41-50%GC含量61-70%80% GC含量如果没有,有人可以建议
如何
根据
GC内容
对
多
fast
浏览 1
提问于2010-12-15
得票数 3
1
回答
如何
根据
修改后的
日期
对
Nautilus中的
文件
进行
排序
?
、
我希望按修改
日期
对
Nautilus中的
文件
进行
排序
,类似于Windows Explorer中按修改
日期
对
文件
进行
排序
。
如何
根据
修改后的
日期
对
Nautilus中的
文件
进行
排序
?
浏览 0
提问于2013-06-08
得票数 3
2
回答
如何
对
许多
文件
运行python脚本?
、
我有一个脚本,它对
FASTA
序列
进行
排序
,按字母顺序排列,基于后面的字符串。下面是处理单个输入
文件
35.fas的代码示例。records.sort(key=lambda x : x.id)
fasta
文件
示例:ATCG>ABC正确输出:TCGAATCG 所以,我想尝试
浏览 3
提问于2017-08-04
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何
订购多个
Fasta
对齐
文件
、
、
、
我有很多-10万份
FASTA
文件
,其中包含了同一12个物种的不同基因的比对。并不是所有的
文件
都是以相同的方式
排序
的,我希望它们都是这样。如果这更简单的话,它们可以按字母顺序
排序
,只要所有的
文件
都是相同的
排序
,它们的
排序
方式就无关紧要了。当
文件
数量不是很大时,它就能工作,但在这种情况下,它会创建具有不同名称的重复
文件
。剧本内容如下: #!-e 's/ñ/\n/g' &l
浏览 5
提问于2016-09-01
得票数 1
回答已采纳
1
回答
按列表
文件
顺序提取
fasta
序列
、
、
我需要从"goodProteins.
fasta
“
文件
(第一个输入)中提取一些
fasta
序列,其中id列表
文件
位于单独的
文件
夹中(第二个输入)。
fasta
序列
文件
的格式是:FSKVJLKDFJFDAKJQWERTYU......SKJFHKDAJHLQWERTYGFDFHU......
fasta
_file = "good
浏览 2
提问于2015-02-02
得票数 1
回答已采纳
2
回答
使用sed
根据
物种名称
对
FASTA
序列
文件
进行
排序
、
、
我有一个包含多个物种的536个DNA序列的
FASTA
文件
,但它不一定是按照物种名称排列的。我需要所有的物种名称一起出现在我的
FASTA
文件
中,以及我的数据集中的所有其他物种。ACAAATTT 基本上,我只需要按物种名称
进行
排序
我认为
浏览 0
提问于2023-01-24
得票数 1
1
回答
循环到grep多个文本--从父
文件
到多个
文件
--在单个命令中
、
、
、
我有29个
fasta
文件
(.fa作为扩展名),
根据
它们的基因命名和存储序列。在这29个
fasta
档案中,共有722种。我想把
根据
基因分类的29个
fasta
文件
中的722种转移到单独的722个
文件
中(
根据
物种而不是基因
对
它们
进行
排序
)。 父
文件
中物种的名称被正方形的[ ]所包围。
如何</em
浏览 0
提问于2019-04-05
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何
在iphone中获取
文件
信息(如创建
日期
、大小等)?
、
如何
在iphone中获取
文件
信息(如创建
日期
、大小等)?我需要
根据
创建
日期
、大小等
对
某些
文件
进行
排序
。
浏览 2
提问于2012-02-18
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何
使用包含R中特定ID的数据帧
对
fasta
文件
进行
子集?
、
我有一个复杂的
fasta
文件
,包含794个条目,我想
根据
我创建的各种ID列表
进行
子集。
fasta
文件
的格式如下:ATGTCCTGGATDCGTTACTTGTGTATTGCCGGTCCTC 基于之前的回答,我使用下面的代码读取了
fasta
文件
。然后使用下面的行
根据
包含ID列表的数据帧
对
fasta
文件
<e
浏览 2
提问于2017-03-09
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何
根据
序列id组合
FASTA
序列?
、
、
我有9个
FASTA
文件
,代表了9个基因的DNA序列。>1>16>2...>2>34>1...我想把这9个基因
FASTA
文件
转换成121个菌株<
浏览 0
提问于2018-09-29
得票数 1
回答已采纳
4
回答
根据
.csv重命名
fasta
报头的部分
、
、
、
我想用包含.tsv部分的列表来更改
fasta
头的部分。>Prevalence_Sequence_ID:1|ARO:3003072|RES:mphL|Protein Homolog Model>gb
浏览 0
提问于2019-04-09
得票数 0
2
回答
根据
日期
对
CSV
文件
进行
排序
、
、
、
我正在制作一个通用工具,它可以处理任何csv
文件
。我有一个csv
文件
,看起来像这样。第一行是列名,第二行是变量的类型。13,23,35,4,aligarh12-May-16,17,27,1,aligarh我想
根据
Python中的
日期
(最老的到最新的)
对
整个
文件
进行
排序
,但是找不到出路。
浏览 0
提问于2018-03-24
得票数 2
回答已采纳
2
回答
如何
找到大于某个大小的
文件
,并
根据
上次修改
日期
对
其
进行
排序
?
、
我需要编写脚本,把选定的目录中的每个
文件
都写下来,这些
文件
比某些大小的
文件
要大。另外,我需要按大小、名称和最后修改
日期
对
它们
进行
排序
。因此,我提出了前两种情况:RESULTS=`find $CATALOG -size +$SIZE | sort -n -r | sed 's_.*/__'`RESULTS=`find $CATALOG -size +$SIZE | sed
浏览 5
提问于2012-12-15
得票数 7
回答已采纳
3
回答
如何
通过终端
对
目录中的
文件
进行
排序
?
我希望
根据
大小
对
主目录中的子目录
进行
排序
,并
根据
通过终端创建的
文件
对子目录中的
文件
进行
排序
。这有可能吗?编辑:在我按照下面的答案对
文件
夹中的
文件
进行
排序
后,它不会重新排列,而我正在通过nautilus
进行
查看。我希望
文件
被重新排列,同时通过nautilus查看它。
浏览 0
提问于2013-12-03
得票数 -3
回答已采纳
4
回答
如何
根据
两个值
对
列表
进行
排序
、
我有一个列表,我想在其中基于两个值
进行
排序
,
日期
和状态如下:我希望最新的在顶部,并且总是关闭的在活动的项目之后
如何
根据
这两个
浏览 3
提问于2019-04-30
得票数 8
1
回答
按
日期
和字符串在python中
排序
、
、
、
我有一堆
文件
名为我必须
根据
公司名称对
文件
进行
排序
,然后
根据
日期
将其内容按此
排序
顺序复制到另一个文本
文件
中。下面是我正在尝试的方法: 从每个
文件
名中提取公司名称,然后
日期
,将这两个字段放在字典中,将词典附加到列表中,然后
根据
公司名称的两列对此列表
进行
排序
,然后按
日期
排序
。
浏览 2
提问于2014-03-17
得票数 0
回答已采纳
1
回答
按创建
日期
对
文件
进行
排序
- iOS
、
、
、
我正在尝试获取I目录中的所有
文件
,并
根据
创建
日期
或修改
日期
对
它们
进行
排序
。有很多例子,但我不能让他们中的任何一个工作。 谁有一个很好的例子,
如何
从一个按
日期
排序
的目录中获得一个
文件
数组?
浏览 0
提问于2011-11-02
得票数 6
1
回答
按降序
日期
排序
Django
、
. views.py balances = Balance.objects.filter(record__date__week=current_week).order_by("-record") 这将
根据
创建记录的时间
对
余额条目
进行
排序
,而不是
根据
记录的
日期
进行
排序
。
如何
根据
记录
日期
对
这些余额查询
进行
排序
。
浏览 29
提问于2021-02-10
得票数 0
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