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python比较两个文件差异

使用python脚本比较两个文件差异内容并输出到html文档中,可以通过浏览器打开查看。...fromlines和tolines,用于比较内容,格式为字符串组成列表 fromdesc和todesc,可选参数,对应fromlines,tolines差异化文件标题,默认为空字符串 context... 和 numlines,可选参数,context 为True,只显示差异上下文,为false,显示全文,numlines默认为5, context为True,控制展示上下文行数,context...为false,控制不同差异高亮之间移动“next”开始位置 3.使用argparse传入两个需要对比文件 """ import difflib import argparse import sys...        return text     except IOError as e:         print("Read file Error:", e)         sys.exit() # 比较两个文件并输出到

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比较两个vcf文件多种实现方法

有粉丝邮件求助,给了我两个vcf文件,旧vcf文件是标准bwa+gatk流程,参考基因组是hg19,新文件参考基因组是hg38,也是gatk标准流程。...想有比较它们,首先得保证两个vcf文件参考基因组一致,因为版本不一致,所以需要使用CrossMap等软件进行参考基因组版本转换,然后里使用 SnpSift 软件 Concordance 命令比较它们...vcf文件,至少是从染色体**变异位点记录数量上来说,非常类似的。...image-20200711195600818 最后看专业软件进行两个vcf文件比较 这里使用 SnpSift 软件 Concordance 命令,代码如下: java -Xmx1g -jar...但是可以继续细致探索 comp.results.txt 文件,拆分染色体后,继续统计上面提到6种情况发生频次。那就出一个学徒作业吧,比较两个vcf文件,然后区分染色体绘制韦恩图。

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.NET CORE下最快比较两个文件内容是否相同方法

最近项目有个需求,需要比较两个任意大小文件内容是否相同,要求如下: 项目是.NET CORE,所以使用C#进行编写比较方法 文件大小任意,所以不能将文件内容全部读入到内存中进行比较(更专业点说,需要使用非缓存比较方式...下面我们开始尝试各个比较方法,选出最优解决方案: 比较两个文件是否完全相同,首先想到是用哈希算法(如MD5,SHA)算出两个文件哈希值,然后进行比较....而我们需求中,两个文件都是固定,那么每次都要计算两个文件哈希值,就不太合适了. 所以,哈希比较这个方案被PASS....但是这样又带来一个新问题,就是如何快速比较两个字节数组是否相同?...后记 文中代码只是出于实验性质,实际应用中仍可以继续细节优化, 如: 如两个文件大小不同,直接返回false 如果两个文件路径相同,直接返回true ...

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如何防范最大云安全威胁

安全管理员或最终用户未能正确设置某些安全属性,就会发生这种情况。因此,对云中计算服务器或存储服务器访问是完全开放,并且容易受到破坏。...导致错误原因有很多,以下是最常见两个: (1)缺乏网络安全方面的培训或安全经验 很明显,大多数无意中泄露数据或错误配置和其他错误可以追溯到员工对安全设置如何工作缺乏了解。...企业员工经常忽略更新他们知识和软件,通常是因为他们忙于其他工作而没有足够时间关注。 某些事情发生变化并且需要更新设置,它们不会得到更新。...这种方法会产生一系列问题,尤其是云计算供应商对修复已知漏洞犹豫。与其相反,企业和云计算供应商需要更好地协调,以更好地适应这些变化。...这意味着找到另一位云安全管理员来查看企业安全措施并确保没有遗漏任何内容。 围绕这一点问题包括同行可能比较熟悉,从而忽视了真正审查设置。或者有些居心不良员工可能故意让同事难堪。

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git 合并原理(递归三路合并算法)

出现冲突,如果你只能看到不同两行,那么你根本不知道究竟应该如何修改。就像下面这样: <<<<<<< HEAD Console.WriteLine("Hello Walterlv!")...当然,前一节问题依然会冲突,因为两个分支相对于共同祖先节点 a 对同一个文件都有修改。 递归三路合并 从上面我们可以看到三路合并解决了二路合并中对于相同行不知道用哪一个问题。...我们这里 a、b、c 只是个比较简单例子,实际提交树往往更加复杂,这就需要不断重复以上操作以便找到一个真实存在共同祖先,而这个操作是递归。这便是“递归三路合并”含义。...这是 git 合并默认采用策略。 快进式合并 git 还有非常简单快进式(Fast-Forward)合并。快进式合并要求合并两个分支(或提交)必须是祖孙/父子关系。...这时,直接将 master 分支 HEAD 指向 f 提交即完成了合并。当然,可以生成也可以生成新 g 提交,内容与 f 内容完全一样。

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【redis从入门到上线(2)】- redis配置要点

运行多个redis服务,会用得到,需要指定不同pid文件和端口。...,上面有两个地址,如果绑定,则两个网卡口都接受请求。...(总会有些运维痛点,同行们懂redis为集群架构,前端还有代理,timeout可能需要根据实际情况来设置,比如保持长连接 ---- tcp-keepalive 0 指定TCP连接是否为长连接,...redis 是一个内存数据库,内存满,无法接收新写请求,所以在redis2.0后,提供了虚拟内存支持 需要注意,redis 所有的key都会放在内存中,在内存不够,只把value 值放入交换区...,如果有特殊需求,请考虑以下几种情况: key很小而value很大,使用VM效果会比较好.因为这样节约内存比较key较大,可以考虑用一些非常方法将很大key变成很大value,如可将

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java中hashcode用法_javahashcode作用

2.比较两个对象时候,首先根据他们 hashcode去hash表中找他对象,两个对象hashcode相同,那么就是说他们这两个对象放在Hash表中同一个key,那么他们一 定在这个key链表...如 果Integer忽略equals() 和 hashCode()情况又将如何?如果我们从未在HashMap或其它基于散列集合中使用Integer作为关键字的话,什么也不会发生。...编写自己equals()和hashCode()方法 忽 略缺省equals()方法比较简单,如果违反对称(Symmetry)或传递性(Transitivity)需求,忽略已经忽略 equals...通常,扩展一个自身忽略了 equals()instantiable类忽略equals()是不切实际,而且编写将被忽略equals()方法(如在抽象类中)不同于为 具体类编写equals()方法...如果Integer忽略equals() 和 hashCode()情况又将如何?如果我们从未在HashMap或其它基于散列集合中使用Integer作为关键字的话,什么也不会发生。

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TiDB 数据一致性校验实现:Sync-diff-inspector 优化方案

缺少自适应 GC 功能,导致正在校验 Snapshot 被 GC,使得校验失败 Sync-diff-inspector 2.0 新特性 Chunk 划分 对于比较两个表数据是否相同,可以通过分别计算两个...同时这种特性也可以判断两个 chunk 是不是连续。每次断点时钟触发,会选择已完成比对连续 chunk 最后一个 chunk 作为检查点,写入该 chunk 信息到本地文件。...校验出不同行时,Sync-diff-inspector 会生成修复 SQL 并保存在本地文件中。...但是由于桶切分是随机分,因此尽管切分后 chunk 个数固定,一次检查出同行在切分后 chunks 第三个,这次可能跑到了第四个chunk 范围内。...但是 chunkSize 也不能设定过大,一次二分后两边子 chunk 都存在不同行,那么会停止二分,进行行比对。过大 chunk 就更有可能同时包含多个不同行,二分校验作用也会减小。

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Linux下文本处理“三剑客”

' filename -c(count) :打印符合要求行数 -i (ignore-case):忽略大小写 -n (line-number):在输出符合要求同时连同行号一起输出 -v (invert-natch...如果加上 -n 参数后,则只有经过sed 特殊处理那一行(或者动作)才会被列出来 -f,–file=script-file 以选项中指定script文件来处理输入文本文件...,多文件记录递增 FNR 与NR类似,不过多文件记录递增,每个文件都从1开始 \t 制表符 \n 换行符 FS BEGIN定义分隔符 RS 输入记录分隔符...= 不等于,精确比较 && 逻辑与 || 逻辑或 + 匹配表示1个或1个以上 /[0-9][0-9]+/ 两个两个以上数字 /[0-9][0-9]*...= 等等,值得注意是,即使$3为数字,awk也不会把它数字看待,它会认为是一个字符。所以不要妄图去拿$3数字去和数字做比较。 !

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flyway 实现 java 自动升级 SQL 脚本

因为正常我们都是从 Git 拉代码下来,拉数据库脚本,这样要是有人更新了数据库,其他同事不一定能够收到最新通知,使用了 Flyway 就可以有效避免这个问题了。...flyway.baseline-description #迁移时发现目标schema非空,而且带有没有元数据,是否自动执行基准迁移,默认false....flyway.enabled=true #设置迁移时编码,默认UTF-8. flyway.encoding #读取元数据表是否忽略错误迁移,默认false....Flyway 是如何比较两个 SQL 文件先后顺序呢?它采用 采用左对齐原则, 缺位用 0 代替 。举几个例子: 1.0.1.1 比 1.0.1 版本高。...__:这个是两个 _ create_user是一个简单sql描述 .sql:以.sql结尾文件后缀是约定 ? ? ? ? ?

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java 自动升级sql脚本 flyway 工具

因为正常我们都是从 Git 拉代码下来,拉数据库脚本,这样要是有人更新了数据库,其他同事不一定能够收到最新通知,使用了 Flyway 就可以有效避免这个问题了。...flyway.baseline-description #迁移时发现目标schema非空,而且带有没有元数据,是否自动执行基准迁移,默认false....flyway.enabled=true #设置迁移时编码,默认UTF-8. flyway.encoding #读取元数据表是否忽略错误迁移,默认false....可重复运行SQL,则以大写“R”开头,后面再以两个下划线分割,其后跟文件名称,最后以.sql结尾。。比如,R__truncate_user_dml.sql。...Flyway 是如何比较两个 SQL 文件先后顺序呢?它采用 采用左对齐原则, 缺位用 0 代替 。举几个例子: 1.0.1.1 比 1.0.1 版本高。 ​

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我看还有谁不动Git

工作区(Working Directory):指的是你在本地电脑实际修改文件。当你修改了文件没有执行Git命令,这些文件状态就是“未跟踪”或“已修改”。...它可以用于比较两个提交之间差异,或比较工作目录中文件与暂存区或最新提交之间差异。...以上是 git diff 命令一些常见用法,使用这些命令可以帮助开发者比较不同版本之间差异,从而更好地管理代码仓库。 6.3、git如何处理代码冲突 在多人协作开发,经常会出现代码冲突情况。...两个或多个开发者同时修改同一个文件同一部分时,就会发生冲突。... PR 请求被接受并合并到原始项目后,你代码贡献就完成了。 以上是在 GitHub 贡献代码基本步骤。

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SVN使用指南【工作培训版】

SVN 什么是冲突 团队协同工作多位团队成员同时修改同一个文件,造成本地文件与SVN系统中文件版本不一致,而导致文件无法提交情况 SVN 冲突产生原因 团队协同工作时候,多位团队成员同时操作一个文件...团队成员A操作完成后,将该文件提交到SVN。此时,其他团队成员本地文件与SVN文件版本不一致。...团队成员B操作完成并对文件进行提交操作,就会产生冲突 SVN 冲突提示页面 提交产出冲突 ? SVN 冲突解决方案 遇到冲突,需要update该文件。...对比两个版本文件,解决冲突 工具中会列出两个版本冲突部分,并让我们选择使用哪个版本内容 SVN 用revert放弃所做修改 选择SVN还原(revert) 放弃自己所做修改 ?...Import(导入) 将需要文件导入到版本库中; Relocated(重新定位) 服务器版本库目录已经改变,我们可以把工作复本重新定位; CleanUp(清理)

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git 那些事儿 —— 基于 Learn Git Branching

多个 commit 如何合并成一条提交?如何定位分支一个提交(以便对比、回退、拉取新分支)?在一个分支处理多个任务如何切换?如何调整一条分支多个 commit 顺序?...git branch -u origin/master dev 这种方法当当前分支为 dev ,最后一个参数可省略。总体推荐上面的做法,容易造成混乱。...总体推荐上面的做法,容易造成混乱,在这里介绍它主要是为了从概念上说明 fetch 和 push 相似性。...包含这个提交) 文件修改历史 git blame .....在 windows 和 linux 之间切换开发文件权限可能会发生变更 (0644 0755), diff 产生大量 file mode 变更记录会严重干扰对比,通过配置忽略文件权限位变化

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Linux 文件管理命令语法、参数、实例全汇总(一)

-b 或 --number-nonblank:和 -n 相似,只不过对于空白行编号。 -s 或 --squeeze-blank:遇到有连续两行以上空白行,就代换为一行空白行。...这项指令可改变存放在ext2文件系统文件或目录属性,这些属性共有以下8种模式: 让文件或目录仅供附加用途。 更新文件或目录最后存取时间。 将文件或目录压缩后存放。...注意:如果文件中有任何字符被修改,都将改变计算后CRC校验码值。 命令:cmp Linux cmp命令用于比较两个文件是否有差异。 相互比较两个文件完全一样,则该指令不会显示任何信息。...-P或--unidirectional-new-file  与-N类似,只有当第二个目录包含了一个第一个目录所没有的文件,才会将这个文件与空白文件比较。...-p  与-n参数相同,此处包括了文件路径。 -w  指定输出栏位宽度。 -V  显示版本信息。

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【Git|GitHub|SSH|Sourcetree 上篇】Git环境搭建及核心概念学习

此命令通常用于合并在两个不同分支所做更改。 例如,开发人员想要将功能分支中更改合并到主分支以进行部署,他们会合并。 git pull 使用远程对应项更新来更新本地开发线。...重置命令: 重置暂存区指定文件,与一次commit保持一致,工作区不变 $ git reset [file] 重置暂存区与工作区,与一次commit保持一致 $ git reset...表示忽略(跟踪)匹配到文件或目录; 示例 解释 # 此为注释 表示注释, 将被忽略 或/ *代表所有,即忽略.gitignore所在根目录下所有文件 *.html 忽略所有后缀名为.html文件...js 忽略所有后缀名为.js文件 Note:git 对于 .gitignore 配置文件是按行从上到下进行规则匹配,即如果上面的配置范围较大,下面的配置可能无效 下面为可能无效原因:...分支合并冲突问题 分支merge,如果分支A某个文件只是在分支B文件上进行了一些修改,两个分支合并,便会出现以下情况,此时我们进入了另一个页面,相当于对这次合并出现分支conflict

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