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GWAS分析SNP解释百分比PVE | 第三篇,MLM模型如何计算PVE?

GWAS分析SNP解释百分比PVE | 第三篇,MLM模型如何计算PVE? #2021.12.24 1. R语言计算PVE能否用于MLM模型?...昨天介绍了使用R语言计算显著SNP表型方差解释百分比(PVE),它步骤有三步: 第一步:将SNP和协变量(PCA和其它协变量)放到模型计算回归模型R方(R-squared)「这一步加上显著SNP...」 第二步:将协变量(PCA和其它协变量)放到模型计算回归模型R方(R-squared)「这一步去掉显著SNP」 第三步:将第一步R方减去第二步R方,得到值就是该SNP表型变异解释百分比(...所以,在MLM模型GWAS,我们要选择MLM方法计算PVE。 问题来了,如果不用GAPIT软件,该如何手动计算PVE值呢? 4....其它GWAS分析软件如何计算PVE 我们知道,其它GWAS软件是没有PVE结果,比如: GEMMA GCTAfast-GWA 下一节介绍一下如何用R语言进行演示MLMPVE计算方法。

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GWAS分析SNP解释百分比PVE | 第二篇,GLM模型如何计算PVE?

GWAS分析SNP解释百分比PVE | 第二篇,GLM模型如何计算PVE? #2021.12.22 1....# 这个是单位点包括此SNP解释百分比(R方) 「上面两者之差,即为该SNP解释百分比(PVE)」 $$SNPPVE = Rsquare.of.Model.with.SNP - Rsquare.of.Model.without.SNP...相关问题在 GWAS分析SNP解释百分比PVE | 第一篇,SNP解释百分比之和为何大于1?中有过介绍。 5. 用R语言如何计算? 简单来说,就是单位点回归分析,计算R方。...这里,一般线性模型,可以针对显著性SNP,进行单位点回归分析,计算PVE。对于混合线性模型,也可以将显著性位点提取,进行R语言手动计算,这个也是PVE计算一种方法。...混合线性模型,还有其它计算方法,我们后面进行介绍,欢迎继续关注我。

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MVCM(model)、MVC总结

MVCM(model)、MVC总结 MVC封装message.js(重点明白M封装) 这篇博客源代码是我正在写在线简历,博客是继上一篇写 完整代码(项目暂未完成) 预览地址 在本地预览项目的时候用...将view和model传入controller,对其操作 在controller添加并初始化model 使用model里操纵数据函数(fetch和save),并对返回promise使用.then(...操纵数据交给model,之后成功或失败处理,交给controller.在返回Promise在后面then就好了.至于是成功还是失败,就要看model层返回信息了 message.js分离MVCM...完整代码 MVC总结 MVC就是把代码分为三块 V(view)只负责看得见东西....,也不是任何一种技术,只是组织代码思想,要做就是V和M传给C,C去统筹 至于M,V,C是对象还是类,都不重要.在js里,MVC分别由三个对象去担任三个职责 MVC逻辑顺序(绿色字) ?

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GWAS分析SNP解释百分比PVE | 第四篇,MLM模型如何手动计算PVE?

GWAS分析SNP解释百分比PVE | 第四篇,MLM模型如何手动计算PVE? #2021.12.25 今天介绍第四篇,如何手动计算MLM模型GWASPVE结果。...因为GAPITMLM模型又PVE结果,但是常用GEMMA、GCTAGWAS结果并没有PVE,本篇介绍一下如何根据GWAS结果手动计算,用R语言进行演示。 1....GEMMA如何计算PVE,GCTA如何计算PVE,EMMA如何计算PVE各种问题,可以休矣。...讨论 读到此,你是否有一种豁然开朗感觉,GWAS分析显著SNP如何计算解释百分比(PVE)相关问题,终于解决了。...最后,如果想要更严谨计算多个SNP解释百分比,或者一个区段内显著SNP解释百分比(PVE),可以将该区段作为随机因子,在LMM模型估算其方差组分,然后计算Vsnp/Vtotal比值,这应该会降低假阳性

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ASP.NET MVCActionFilter是如何执行

在ASP.NET MVC四大筛选器(Filter),ActionFilter直接应用在某个Action方法上,它在目标Action方法执行前后对调用进行拦截以执行一些额外操作。...本篇文章主要讲述多一个应用到相同Action方法上ActionFilter执行机制。[本文已经同步到《How ASP.NET MVC Works?》...在通过Visual StudioASP.NET MVC项目模板创建空Web应用我们定义了如下三个ActionFilter(FooAttribute、BarAttribute和BazAttribute...方法抛出异常,整个ActionFilter链又会如何执行。...如果异常是在非链头ActionFilterOnActionExecuted方法抛出,处理流程与此类似。 我们不妨举例说明Action链在执行过程对异常处理。

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PowerBI: 条件格式中百分比计算原理

最近在使用条件格式图标功能时,发现存在一个百分比名词。...通过查阅资料,发现百分比计算是基于如下公式: 其中 Xn代表计算依据字段的当前取值,Xmin 是依据字段最小值,Xmax 是依据字段最大值。...公式分母是整个区间最大变动范围,数学上称之为极差,或全距。 基于上述百分比计算公式,可以理解上图第4行货号STY0487对应是半角。...销售金额最大值是63111,最小值是0,所以百分比 = (39337 - 0)/ (63111 - 0)= 62%,对应是半角区间(33% ~ 67%)。.../create-reports/desktop-conditional-table-formatting) [2] 条件格式中百分比计算原理(https://www.powerbigeek.com/percentile-in-powerbi-conditional-formatting

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浅谈MVC--Node如何使用ORM?

在正常开发,大部分都会使用MVC为主要系统架构模式。而Model一般包含了复杂业务逻辑以及数据逻辑,因为Model逻辑复杂度,所以我们有必要降低系统耦合度。...参数3:对选填参数配置 这里对于Sequelize数据类型直接贴下文档中提供: ?...findOne():只能查询一条语句,一样可以指定findAll()各种条件,但是只会返回符合条件第一条数据。...到这里我们对于Sequelize基础操作就差不多了解了,接下来来看看Sequelize封装sql如何链式调用多个数据库操作,因为Sequelize是基于PromiseORM框架,所以我们很简单使用链式调用数据库读取操作实现多个数据库操作...到这里我们就可以实现MVC架构,将数据库数据读取操作封装到db层,将路由操作封装到routes层,将业务逻辑操作封装到service下。有利于项目的不断迭代开发。

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MVC查询语句

查询语句 开发工具与关键技术:MVC 作者:盘洪源 撰写时间:2019年3月30日星期六 查询在MVC做项目必不可少,数据新增、修改、删除都离不开查询。...查询分为单表查询和多表查询两种(目前所学到),单表查询是比较简单,而多表就是比单表多了个联表,其他好像都差不多。...在做项目的时候你要把一个表数据显示在页面上,这时候你就需要在控制器写一个单表查询方法将数据库里数据查询出来,然后再通过异步提交把数据提交到页面上。 ?...就是你需要显示在页面上数据字段在一个表无法找全,这个时候你就需要用到多表查询。 看下图 ?...首先两个表是通过ID来连接,这两个表是由第一个表外键ID连第二个表主键ID,通过这个ID就能把这两个表连接起来。

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如何对Spring MVCController进行单元测试

具体来讲,是由Spring框架spring-test模块提供实现,详见MockMvc。...如下将详细阐述如何使用MockMvc测试框架实现对“Spring Controller”进行单元测试,基于Spring Boot开发框架进行验证。 添加测试框架依赖: <!...Controller”类进行配置 方式2:基于Spring容器进行配置,包含了Spring MVC环境和所有“Controller”类,通常使用这种方式。...MockMvcBuilders.standaloneSetup(new TestController()).build(); // 方式2:基于Spring容器进行配置,包含了Spring MVC...断言工具判断返回结果,这是一种非常普遍和常见方式 2.在MockMvc框架可以通过andExpect()方法定义一个或多个预期结果,当其中一个期望结果断言失败时,就不会断言其他期望值了 // 使用

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Java 新手如何使用Spring MVC 双向数据绑定?

使用Spring MVC实现双向数据绑定 步骤 1: 步骤 2: 步骤 3: 步骤 4: 步骤 5: 深入拓展双向数据绑定 结语 欢迎来到架构设计专栏~Java 新手如何使用Spring MVC 双向数据绑定...在这篇文章,我们将向Java新手介绍如何使用Spring MVC实现双向数据绑定,以及为什么这个特性如此重要。 什么是双向数据绑定?...Spring MVC使用数据绑定来将HTTP请求参数绑定到Java对象,然后将Java对象数据传递到视图中,以便在用户界面上显示。...我们将创建一个简单Java Web应用程序,演示如何将用户输入绑定到Java对象,并将Java对象数据渲染到视图上。...结语 Spring MVC双向数据绑定是构建Java Web应用程序强大工具,可以大大简化开发工作。在本文中,我们创建了一个简单示例,演示了如何在Spring MVC实现双向数据绑定。

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如何在 Spring MVC 处理表单提交

如何在 Spring MVC 处理表单提交 摘要 嗨,我是猫头虎博主。在本篇博文中,我们将探讨在Spring MVC框架处理表单提交方法。...我们将通过实际代码示例展示如何配置Spring MVC以接收表单数据,进行数据验证,以及如何返回处理结果。随着SEO不断演变,理解并掌握表单处理技术是每个Java Web开发者必备技能。...本文旨在为你提供一种清晰、简洁方法来处理Spring MVC表单提交。 引言 在Web开发,表单提交是一个基本而重要功能,它允许用户输入数据并将数据发送到服务器进行处理。...Spring MVC 表单处理 配置控制器 在Spring MVC,我们通常会创建一个控制器来处理表单提交。控制器方法会接收用户输入数据,进行必要处理,并返回结果。...这些基本知识和技能为我们提供了在Spring MVC构建交互式Web应用程序基础。希望这篇文章能为你在Spring MVC处理表单提交提供有用指导和帮助。

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Servlet是如何实现MVC

Servlet是一种服务器端编程语言,是J2EE中比较关键组成部分,Servlet技术推出,扩展了Java语言在服务器端开发功能,巩固了Java语言在服务器端开发地位,而且现在使用非常广泛...JSP+JavaBeans+Servlet成为实现MVC模式一种有效选择。 ? 如果我们要实现一个对用户增删改查,并且要求符合对扩展开发,对修改关闭原则,该怎么做呢?...url-pattern> --> *.do 这里我们发现,在testAction类,...String path = "/servlet/delUser"; /根据截取URL请求,到Map取得本次请求对应Action ActionMapping actionMapping...// 采用反射动态实例化Action Action action = (Action)class.forName(type).newInstance(); /动态待用Action

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如何实现类属性自动计算

1、问题背景在软件开发,有时我们需要创建一个类,该类实例具有许多属性,这些属性可以通过某种计算方法获得。...我们希望能够通过一种简便方法自动计算这些属性,而无需手动编写每个属性计算方法。2、解决方案有几种方法可以实现类属性自动计算。1、使用魔法方法__getattr__。...元类是一个特殊类,它可以用来创建其他类。在上面的代码,MetaCalculateAttr元类通过重写__new__方法来实现属性自动计算。...在上面的代码,MetaCalculateAttr元类遍历Test类属性列表,并为每个属性创建一个属性描述符。属性描述符是一个特殊对象,它可以用来控制属性访问和赋值。...如果只需要实现少数几个属性自动计算,可以使用魔法方法__getattr__。如果需要实现大量属性自动计算,可以使用类装饰器或元类。

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聊聊QMLMVC文化

先放实例demo, 一张图概括一下mvc在qml实现,过过眼瘾 (请忽略美工。。) 实现了2个不同View,2个不同Model,2个长不一样Delegate。...如下图,QtMVC构成图。 这种MVC框架是不是用起来非常舒服,使用得当的话,一定会帮你完成扩展性强设计。...在前端mvc, 不仅数据与显示要分离, 在显示, 布局与样式也要分离, 布局指的是大框架背景, 元素排列组合方式和定位模式, 而样式指的是子元素颜色, 字体, 滤镜等效果. qml mvc中正是遵循了这一原则...用json又如何呢?...如何在项目中使用json呢?请参考这里 View有坑 视图中明确定义高度和宽度会有意向到不错误哦! 没什么可说Delegate 委托的话就跟自己写组件没什么区别。

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MVC新增、修改、删除

新增、修改、删除 开发工具与关键技术:MVC 作者:盘洪源 撰写时间:2019年3月30日星期六 新增、删除、修改、查询这都是MVC中最基础,所以说想要学好MVC必须先把基础打好,查询是比较复杂点...下一步就可以把你在页面上数据保存在数据库中了,用一个”.Add”方法把你所填数据保存到数据库,如果有新增图片那就得再做处理了,这里就不说了。...保存成功后再到视图上保存点击事件写个回调函数,然后再做个简单判断刷新页面就OK了。 修改其实跟新增差不多,只不过是修改比新增多了个回填数据。...然后到控制器写个删除方法,很简单,通过你所选中数据可以认证ID到数据库表查询出这条数据然后进行删除,删除在这里用到关键字是” Remove”,移出意思。...Remove(你所查询出来数据),就是把你所查询出来数据从数据库移出。然后到删除点击事件写个异步提交就完事了。这样一个简单删除就可以做出来了。

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