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并行处理百万个文件的解析和追加

为实现高效并行处理,可以使用Python中的多种并行和并发编程工具,比如multiprocessing、concurrent.futures模块以及分布式计算框架如Dask和Apache Spark。...这里主要介绍如何使用concurrent.futures模块来并行处理和追加文件。问题背景在数据处理的过程中,经常会遇到需要对大量文件进行解析和追加的情况。如果使用单进程进行处理,则会花费大量的时间。...在 Python 中,可以使用 multiprocessing 模块来实现并行处理。该模块提供了 Process、Queue 和 Pool 等类,可以用于创建进程、共享数据和管理进程池。...main() 函数是主进程的函数,它创建任务队列,将文件放入任务队列,然后创建进程池并启动工作进程。最后,主进程等待所有工作进程完成,然后关闭输出文件。...Dask可以自动管理并行任务,并提供更强大的分布式计算能力。通过合理的并行和分布式处理,可以显著提高处理百万文件的效率。

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Python 并行编程探索线程池与进程池的高效利用

使用线程池进行并行编程在Python中,可以使用concurrent.futures模块来创建和管理线程池。...如果任务主要是IO密集型的,且需要较少的系统资源,那么线程池可能是更好的选择;而如果任务是CPU密集型的,且需要更好的并行性能,那么进程池可能更合适。...任务优先调度: 根据任务的优先来调度线程或进程的执行顺序,优先处理优先高的任务,以提高程序的响应速度和用户体验。...task会对传入的参数进行除法操作,如果参数为0,则会抛出ZeroDivisionError异常。...示例代码以下是一个简单的示例代码,演示了如何使用Dask来实现分布式计算:import daskimport dask.array as da# 创建一个随机数组x = da.random.random

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【Rust日报】2023-07-21 reddit讨论小整理:分布式计算中的Rust

dask 和 ray 这样的库是令人惊叹的库,您可以在其中动态地在正在运行的集群上分派函数。...Dask(注:Dask 是一个灵活的 Python 并行计算库) 完全用 Python 编写,通过序列化 Python 函数并使用 TCP 将它们发送到在本地线程池中运行它们的工作进程来解决这个问题。...我还在学习Rust,假设我Rust学的还行,但不是专家,能用能写小东西。4. 我想使用Rust实现在运行时动态传递函数的行为,并且我要面向的场景是集群(cluster),我该怎么办?...二更问题:如何使用Rust实现一个灵活、高效的分布式计算框架,重点是可以调度任意函数并支持Actor模型,从而可以更方便地进行分布式计算和处理大规模的任务。...二、再说回答 第一种讨论是,在分布式节点中,可以考虑让 WASM模块 与本机计算库交互,但是如果需要高性能和高效率,就需要评估Wasm和本机代码之间的差异了。

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更快更强!四种Python并行库批量处理nc数据

、multiprocessing、ThreadPoolExecutor、和joblib都是Python中用于实现并行计算和任务调度的库或模块,各有其特点和应用场景: Dask Dask 是一个灵活的并行计算库...multiprocessing模块提供了进程、进程池、队列、锁等多种同步原语,支持进程间的通信和数据共享,适合CPU密集型任务。...ThreadPoolExecutor ThreadPoolExecutor 是 concurrent.futures 模块中的一个类,用于简化线程池的管理和使用。...因为multiprocessing需要确保函数定义在顶级作用域 如果合并运行就会出现以下报错 AttributeError:Can't picklelocal object 'inner..read_and_extract_slp...默认情况下,multiprocessing 使用 pickle 模块来序列化要传递的对象,但 pickle 不能序列化定义在交互式会话或某些特定上下文中的函数

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Ray,面向新兴AI应用的分布式框架

当前的一些框架无法完全满足上面的要求: 1.像MapReduce、Spark、Dryad一类BSP模型框架不支持细粒度模拟或策略服务2.CIEL和Dask的任务并行框架对分布式训练和模型服务支持很少3....分布式深度学习框架TensorFlow、MXNet不天然支持模拟和服务 因此,如果要开发端到端解决方案,需要使用不同的计算组件,分布式训练、模拟、模型服务等都需要一个组件。...计算负载包括模拟这样的轻量、无状态的计算,也包括训练这样长时、有状态的计算任务。对于无状态任务,Ray提供了Task抽象,对于有状态任务,Ray提供了actor抽象。...为了降低全部调度器的负载,节点(worker,actor)上派生的任务首先提交给本地调度器,当本地调度器过载时,会把带调度的任务提交给全局调度器。 ?...当任务所需的数据不在本地节点时,数据会从其它节点复制过来。因为认读读写数据都在本地内存中,这极大增加了吞吐量。

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安利一个Python大数据分析神器!

1、什么是Dask? Pandas和Numpy大家都不陌生了,代码运行后数据都加载到RAM中,如果数据集特别大,我们就会看到内存飙升。但有时要处理的数据并不适合RAM,这时候Dask来了。...git clone https://github.com/dask/dask.git cd dask python -m pip install . 4、Dask如何使用?...Dask的使用是非常清晰的,如果你使用NumPy数组,就从Dask数组开始,如果你使用Pandas DataFrame,就从Dask DataFrame开始,依此类推。...Dask delayed函数可修饰inc、double这些函数,以便它们可延迟运行,而不是立即执行函数,它将函数及其参数放入计算任务图中。 我们简单修改代码,用delayed函数包装一下。...因此,如果你将sklearn替换为dklearn,那么速度将会提升很多。

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使用Dask DataFrames 解决Pandas中并行计算的问题

如何将20GB的CSV文件放入16GB的RAM中。 如果你对Pandas有一些经验,并且你知道它最大的问题——它不容易扩展。有解决办法吗? 是的-Dask DataFrames。...如果您考虑一下,单个CPU内核每次加载一个数据集,而其他内核则处于空闲状态。这不是最有效的方法。 glob包将帮助您一次处理多个CSV文件。您可以使用data/*....如果notebook 完全崩溃,使用少量的CSV文件。 让我们看看Dask提供了哪些改进。它接受read_csv()函数的glob模式,这意味着您不必使用循环。...在调用compute()函数之前,不会执行任何操作,但这就是库的工作方式。...结论 今天,您学习了如何从Pandas切换到Dask,以及当数据集变大时为什么应该这样做。Dask的API与Pandas是99%相同的,所以你应该不会有任何切换困难。

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又见dask! 如何使用dask-geopandas处理大型地理数据

如果在使用dask-geopandas时遇到错误,可能是由于多种原因导致的,包括但不限于代码问题、内存管理、任务调度等。 为了更好地诊断问题,需要检查错误消息的具体内容。...代码审查:仔细检查实现代码,尤其是dask-geopandas的部分,确认是否正确使用了并行计算和数据分区功能。 批处理:如果可能,尝试将数据分成更小的批次进行处理,而不是一次性处理所有点。...("file.gpkg", npartitions=4) 以上就是如何使用 Dask-GeoPandas 对大型地理空间数据进行高效处理的简单示例。...原程序 In [2]: import geopandas as gpd import time # 添加时间模块 # 添加dask模块 import dask_geopandas def process_row...import delayed, compute # 从dask中导入compute函数 input_shapefile = '/home/mw/input/dask6250/201105.shp'

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NumPy 1.26 中文官方指南(三)

优先:NumPy 的&运算符的优先高于诸如的逻辑运算符;MATLAB 的优先相反。...许多 NumPy 函数返回数组,而不是矩阵。 元素操作和线性代数操作之间有明显的区别。 如果需要,你可以使用标准向量或行向量/列向量。...如何编写 NumPy 操作指南 读取和写入文件 如何索引 ndarrays 验证 NumPy 中的错误和 bug 修复 如何创建具有等距数值的数组 高级用法和互操作性 从源码编译...使用 NumPy C-API 原文:numpy.org/doc/1.26/user/c-info.html 如何扩展 NumPy 编写扩展模块 必需子程序 定义函数 无关键字参数的函数...可分配数组 F2PY 和构建系统 基本概念 构建系统 高级 F2PY 使用情况 F2PY 生成的模块添加用户定义函数 添加用户定义变量 处理 KIND

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xarray系列 | 基于xarray和dask并行写多个netCDF文件

关于此函数的说明可查看官方文档。...() dask计算图,点击可看大图 计算完成后,为了并行存储nc文件,需要将上述结果分割为多个对象: 创建分割函数将上述dataset对象分割为多个子dataset对象: import itertools...,测试函数是否能正常运行: create_filepath(datasets[1]) 下一步就是为每一个dataset对象创建一个路径,用于保存数据: paths = [create_filepath...目前新版本的netCDF库也逐渐支持zarr格式,但还没测试过效果如何如果不是一定要netCDF格式的话,可以尝试使用zarr格式。 后话:虽然本文使用了dask,但是涉及到dask的内容比较少。...最近在处理数据时用到了dask,后面有时间可能会更一些dask相关的推文,比如数据并行处理。

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2021 年年度最佳开源软件!

分类器实现了一个函数,该函数接收原始文本或 numpy 数组并输出每个类的概率。...Dask https://dask.org/ Dask 是一个用于并行计算的开源库,可将 Python 包扩展到多台机器上。...自动收集网站或应用程序上的每个事件,无需第三方发送数据。PostHog 提供基于用户事件的分析,捕获网站的使用数据,统计各用户在网站中的具体操作。...与Git类似,LakeFS 的数据中会带有提交记录、元数据字段和回滚等信息,此外还有hooks,即在分支合并到主分支前,hooks会检查数据,确保完整性和质量。...社区成员可通过提交开发功能以或提案来参与项目。EleutherAI 的开发者每周会更新项目进度,这些更新会在 YouTube 上进行现场直播。

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Modin,只需一行代码加速你的Pandas

Modin的主要特点: 使用DataFrame作为基本数据类型; 与Pandas高度兼容,语法相似,几乎不需要额外学习; 能处理1MB到1TB+的数据; 使用者不需要知道系统有多少内核,也不需要指定如何分配数据...前面说过,Modin使用Ray或Dask作为后端,在这里我们使用 dask,命令行输入以下代码同时安装Modin和Dask: pip install modin[dask] 接下来是导入Modin,...test1.csv") e = time.time() print("Modin读取时间 = {}".format(e-s)) 输出: Modin读取时间 = 7.6007184982299805 处理GB的数据...通过上面3个函数的比较,Modin在使用append、concat等方法上要比Pandas快5倍以上 对比Modin和其他加速库有何不同?...如果你已经写好基于pandas的脚本,只是想加速运行代码,那么Modin是最佳选择。如果你只是想简单统计或可视化大数据集,可以考虑Vaex。

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重磅!你每天使用的NumPy登上了Nature!

本文对如何从一些基本的数组概念出发得到一种简单而强大的编程范式,以组织、探索和分析科学数据。NumPy是构建Python科学计算生态系统的基础。...步幅(Stride)用于如何将线性存储的计算机内存解释为多维数组。它们描述了要在内存中在行与行之间或列与列之间跳转需要向前移动的字节数。...在广播中,一个或两个数组实际上是虚拟复制的(即不在内存中复制任何数据),以使操作运算的数组形状匹配(图1d)。当使用数组对数组进行索引时,也会应用广播(图1c)。...scipy.optimize模块执行数学优化。NetworkX[22]用于复杂网络分析的软件库,用于验证图像比较的一致性。Astropy处理标准的天文文件格式并计算时间-坐标转换 [23,24]。...图3 NumPy的API和数组协议生态系统公开了新的数组。 在此示例中,在Dask数组上调用了NumPy的mean函数。调用通过分派到适当的库实现(在本例中为Dask),并产生一个新的Dask数组。

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一句代码:告别Pandas的慢慢慢!

Swifter Swifter是一个“以最快的方式将任何函数应用于Pandas dataframe或series”的库。...1、Swifter可以检查你的函数是否可以向量化,如果可以,就使用向量化计算。 2、如果不能进行向量化,请检查使用Dask进行并行处理是否有意义: ?...https://dask.org/ 或者只使用普通的Pandas的apply函数,但并行会使小数据集的处理速度变慢。 所以大家面对数据集大小的不同时,要采取不同的代码思路,否则会适得其反! ?...可以看到,无论数据大小如何,使用向量化总是更好。如果向量化不行,你可以从vanilla Pandas获得最佳速度,直到你的数据足够大。一旦超过了阈值大小,并行处理就最有意义了。...如何写代码: import pandas as pd import swifter df.swifter.apply(lambda x: x.sum() - x.min()) 如上所示,只要在应用之前添加一个快速调用

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satpy系列|卫星视角看3.15北京沙尘暴

关于此次沙尘暴的天气分析已经非常多了,本文不会分析相关的天气背景,主要从技术方面讲一下如何利用satpy处理卫星数据,从卫星视角看一下此次沙尘过程的演变。...本文的数据为 Himawari-8 静止卫星L1b产品: from glob import glob from datetime import datetime import dask import...from pyresample import create_area_def from pyresample.geometry import AreaDefinition 以下是日期解析和数据处理函数...parse_date = lambda f: datetime.strptime(''.join(f.split('_')[2:4]), '%Y%m%d%H%M') 因为所处理的数据比较多,上述 process 函数直接将处理后的结果保存为...如果你想单独看某一个时刻的卫星图像,可以在 save_dataset 之前使用 show 显示图片。

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提升Python运行速度的必备工具清单

如果你的项目对性能要求较高,可以考虑使用PyPy来运行Python代码。2.Numba:Numba是一个优化Python代码的工具,它通过即时编译将Python函数转换成机器码,从而提高了执行速度。...3.Cython:Cython是一个将Python代码转换为C扩展模块的工具,通过将Python代码编译成机器码,可以显著提高执行速度。...7.NumPy:如果你经常进行科学计算、数据分析等任务,那么NumPy是一个必备的工具。它提供了高效的多维数组对象和相应的操作函数,可以显著提高计算速度。...8.DaskDask是一个能够使用分布式计算的工具,它提供了类似于Pandas和NumPy的高级数据结构和操作。通过将任务分布到多个机器或者多个核心中执行,可以加速大规模数据处理的速度。...如果你还有其他好用的工具,欢迎在评论区分享,我们一起交流学习吧!

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Meta(Facebook) 第三代 Notebook Daiquery 与 Byzer Notebook 对比

Byzer Notebook 对 SQL 进行模块如果 Byzer Notebook 实现同样的逻辑,也是类似的,但是相比较 Meta 而言,会更简单,我们来看看。...接着,在第二个 Cell 里,我们可以使用一个窗口函数去添加一个按天对公司进行排名的操作: 可以看到,我们可以直接引用第一个 Cell 中的表。...分布式 Pandas 数据集来操作大规模数据: 这里,我们通过 一行代码,将 SQL 中得到的表转化为 分布式 Pandas(dask)。...df = ray_context.to_dataset().to_dask() 更多能力参考如下一些文章: Byzer 玩转数据可视化 Byzer-python 如何将算法模型存储到数据湖里 Byzer...产品,模块化是少不了的,也是 SQL 未来自身需要进化的方向。

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