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MR应知应会:MungeSumstats

小 p 值超过 R 限制,可能导致 LDSC/MAGMA 出现错误,应进行转换。默认值为 TRUE。 convert_large_p p 值 >1 是否转换为 1?...pos_se 是否应该检查标准错误 (SE) 以确保它大于 0?那些存在内容将被删除(如果 sumstats 文件存在)。默认为TRUE。...indels 您 Sumstats 文件是否包含 Indel?这些不存在于我们参考文件,因此如果该值为 TRUE,它们将被排除在检查之外。默认值为 TRUE。...对于翻转值,这表示等位基因是否根据 MungeSumstats 从输入列标题中选择 A1、A2 进行切换,因此可能与创建者意图不符。请注意,这些出现在返回格式化摘要统计信息。...但是,如果 youf 文件标题丢失,我们提供映射不正确,您可以提供自己映射文件。必须是 2 数据框,列名称为“未更正”和“已更正”。

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实时即未来,车联网项目之将数据落地到文件系统和数据库【三】

/warehouse/ods.db/${tableName}/${dt}"` 如何实现从HDFS中正确或错误数据映射到Hive表 ① ② ③ 如何自动化HDFS数据到Hive表 # 使用shell...写入表名 hbaserowkey 写入簇 columnFamily 列名和值 HBaserowkey设计原则 ① rowkey 长度原则 , 16个字节 ② rowkey 原则...实现 setDataSourcePut 方法 //6.1 如何设计rowkey VIN+时间戳翻转 //6.2 定义名称 //6.3 通过 rowkey 实例化 put //6.4 将所有的字段添加到...put字段 原始数据实时 ETL 任务 HBase 调优 数据写入HBase优化 - 客户端优化 为什么需要优化呢?...防止出现每条数据都读写 HBase 数据库,造成集群宕机和数据丢失。

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6个pandas新手容易犯错误

在实际如果出现了这些问题可能不会有任何错误提示,但是在应用却会给我们带来很大麻烦。 使用pandas自带函数读取大文件 第一个错误与实际使用Pandas完成某些任务有关。...具体来说我们在实际处理表格数据集都非常庞大。使用pandasread_csv读取大文件将是你最大错误为什么?因为它太慢了!...以下这张表是pandas所有类型: Pandas命名方式,数据类型名称之后数字表示此数据类型每个数字将占用多少位内存。因此,我们想法是将数据集中每一都转换为尽可能小子类型。...当我们将df保存到csv文件时,这种内存消耗减少丢失因为csv还是以字符串形式保存,但是如果使用pickle保存那就没问题了。 为什么要减小内存占用呢?...甚至在文档“大型数据集”部分会专门告诉你使用其他软件(如 Dask)来读取大文件并远离 Pandas。其实如果我有时间从头到尾阅读用户指南,我可能提出 50 个新手错误,所以还是看看文档吧。

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MADlib——基于SQL数据挖掘解决方案(23)——分类之SVM

model_table TEXT 包含模型输出表名称,输出表列如表2所示。 dependent_varname TEXT 因变量名称。对于分类,此列可以包含任何类型值,但必须假定两个不同值。...以下参数格式与svm_classification不同: dependent_varname:TEXT类型,因变量名称。...该表由一个名为epsilon组成,该指定epsilon值,以及一个或多个grouping_col。额外组将被忽略,并且此表不存在组将使用参数epsilon中指定epsilon值。...validation_result:缺省值为NULL,存储交叉验证结果名称,包括参数值及其平均错误值。目前0-1用于分类,平均方差用于回归。该表只在名称不是NULL情况下创建。...id_col_name TEXT 输入表id名称。 output_table TEXT 输出预测写入名称如果该表名已被使用,则返回错误

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关于南丁格尔图“绘后感”

因此我们将tNGS和mNGS合并成1,增加1“值分类”,对应数据单元格内标上对应tNGS和mNGS。另外增加1名称分类”,与物种名称对应填上真菌、病毒和细菌。...三、基于以上思路需要准备数据 图形数据,即是表格已有的数据(Counts值) 分组数据和物种分类数据,表格也有(Target和Classification) 文字标签数据,包括 各物种名称 名称旋转角度...物种类别名称 类别名称旋转角度 需要说明是,物种名称我们可以用Species数据,但是你会发现每个名称有2个重复,如果用这个数据,那么标签文字就会有重复。...),但是在这种情况下,对Species去重后,由于每一类重复数量不同,对应生成稍微复杂一点(也可以生成)。...感觉应该还有更简介方式,如果有高手指点,欢迎留言。有错误也请指正。

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R语言里面的文本文件操作技巧合辑

以上就是在R语言中进行文本文件交互一些基本操作。请注意,这些操作可能会出现错误,例如文件不存在或者没有写入权限等,你需要确保你代码能够正确处理这些错误。...GMT文件每一行代表一个基因集,第一是基因集名称,第二是基因集描述(有时可能为空),接下来是基因集中基因。...<- genes } 在这个示例,gene_sets是一个列表,列表每个元素是一个基因集,元素名称是基因集名称。...这可以避免因为文件不存在而导致错误。 处理文件路径:使用file.path()函数来构建文件路径。这个函数根据操作系统不同自动选择正确路径分隔符。...使用tryCatch处理可能错误:在读取或写入文件时可能会出现错误,使用tryCatch()函数可以帮助你处理这些错误,避免程序意外中断。

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ClassNotFoundException,NoClassDefFoundError,NoSuchMethodError排查

前言 在使用java开发过程时常会碰到以上三个错误,其中NoClassDefFoundError、NoSuchMethodError两个error遭遇得多一些。...A.jarA.class依赖了B.jarB.class,但是B.jar由于某些原因并不存在B.class,此时就会抛出NoClassDefFoundError 加载类初始化错误 加载class...排查思路与工具 ClassNotFoundException 由于是出现在运行期,我们要确定是否真的不存在该类,推荐使用脚本扫描war(重点找lib),此扫描脚本 来自于阿里哲良大大。...NoSuchMethodError 这个错误多半是由于jar依赖冲突导致,依赖冲突是一个非常DT问题。...qualified nameclass出现在两个不同jar版,如果存在,则排除其中一个版本jar

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R︱高效数据操作——data.table(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并)

由于业务接触数据量很大,于是不得不转战开始寻求数据操作效率。于是,data.table这个就可以很好满足对大数据量数据操作需求。...显得很繁琐,相比来说,让我多等1分钟data.frame结构,我还是愿意等。...(ID)] 三种数据筛选方式,dplyr、base基础、data.table。其中,dplyr是select语句,data.table要注意.()表达方式。...2、on=""方式 DT[X, on="x"] 这里on指的是DT变量变量名称,X还是按照key,如果没设置就会默认第一行为key。...(x)] 还有 data$x 如果有很多名字很长指标,data.table如果进行遍历呢? data[,1]是不行,选中方式是用列名。

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Node.js学习笔记——模块加载机制及npm指令详解

导入需要 // 注意:导入名称,就是装时候名称 const moment = require('moment') //查文档看用法 const dt = moment().format('YYYY-MM-DD...(dt) console.log(newDT) 在项目中安装命令 下载在项目里 npm install 完整名称 或者 npm i 完整名称 npm i 完整名称 完整名称(加空格可以安装多个...如需安装指定版本,在名之后,@ npm i 完整名称@版本号 不用删除以前版本,npm自动覆盖之前版本。...则 Node.js 从当前模块父目录开始,尝试从 /node_modules 文件夹中加载第三方模块 ​ ●如果没有找到对应第三方模块,则移动到再上一层父目录,进行加载,直到文件系统根目录...入口不存在或无法解析,则 Node.js 将会试图加载目录下 index.js 文件 如果以上两步都失败了,则 Node.js 会在终端打印错误消息,报告模块缺失:Error: Cannot find

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c#操作数据库(winform如何修改数据库设置)

至于其为什么不能执行查询语句呢?因为查询语句要返回是数据,而不是查询出了几行,所以不能使用这个方法。...,只查询密码就可以了,所以这行代码可以改成 string sqlstr="select password from users where username=@username"; 在实际应用,数据库存储用户名肯定是唯一...也是有行和组成一个表格,每个单元格存储都是数据。...第4个步骤Fill方法至少执行了三个工作 打开连接,相当于conn,open(),所以我们使用SqlDataAdapter对象时,不用写这句代码了,连接自动打开。...dt.Rows[0]标示第1行,使用dt.Rows[0]["password"]来获取第1行名称为"password"字段值。

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MySQL DDL 数据定义

如果你包含了 IF NOT EXISTS,它将在创建数据库之前检查是否已经存在同名数据库。如果存在同名数据库,那么不会创建新数据库,也不会引发错误。 db_name 这是要创建新数据库名称。...[RESTRICT | CASCADE] 为了避免在尝试删除不存在表时出现错误,建议您在使用 DROP TABLE 时加上 IF EXISTS 子句。 # 删除单个数据表。...ALTER TABLE student CHANGE student_no student_no INT(10) UNSIGNED; 注意列名称要重复一次,即需要将名称写两次,因为一个是旧列明,一个是新列名...ALTER TABLE tbl_name DROP COLUMN column1, DROP COLUMN column2, ...; 如果您想删除表 orders quantity 和 price...内存表生命周期是服务端 MySQL 进程生命周期,MySQL 重启或者关闭后内存表里数据丢失,但是表结构仍然存在,而临时表生命周期是 MySQL 客户端会话。

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数据湖(五):Hudi与Hive集成

hiveServer2时一直连接本地zookeeper,导致大量错误日志(/tmp/root/hive.log),从而导致通过beeline连接当前node1节点hiveserver2时不稳定,会有连接不上错误信息...映射有两种模式,如果Hudi表是COPY_ON_WRITE类型,那么映射成Hive表对应是指定Hive表名,此表存储着Hudi所有数据。...可以从Maven中下载以上后,将这些包上传到所有Hive节点lib目录下,包括服务端和客户端。...log文件数据,可以看到查询到是修改后结果数据 hive> select `_hoodie_commit_time`,id,name,age,loc,data_dt from infos2_rt;...表后,在代码向Hudi写数据时,指定对应Hive参数即可,这样写入数据自动映射到Hive

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大数据运维之数据质量管理

需求分析 我们数仓项目主要监控以下数据指标: ODS层数据量,每日环比和每周同比变化不能超过一定范围 DIM层不能出现id空值,重复值; DWD层不能出现id空值,重复值; 在每层任意挑选一张表作为示例...,若有异常出现就发送警告。...只有在原Flow正在执行时才能获取 exec_id = get_exec_id(session_id) # 获取日期,如果不存在取昨天 if len(argv) >= 2: ​ dt = argv[1]...只有在原Flow正在执行时才能获取 exec_id = get_exec_id(session_id) # 获取日期,如果不存在取昨天 if len(argv) >= 2: ​ dt = argv[1]...只有在原Flow正在执行时才能获取 exec_id = get_exec_id(session_id) # 获取日期,如果不存在取昨天 if len(argv) >= 2: ​ dt = argv[1]

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【JMeter系列-7】Linux下执行测试

在实际性能测试,一般专门申请一台CPU、内存、磁盘指标都较好linux服务器作为压测机器。...:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar source /etc/profile使配置修改生效; 验证:输入java –version,出现以下信息...二、注意事项 如果使用参数化策略,将参数化文件放入Linux系统Jmeter安装文件bin目录下,同时脚本参数化设置,文件路径只写文件名即可。 ?...以往这种方法是正常,但在最近实践,遇到了诡异问题,参数化文件被报不存在错误: ?...其他可能遇到问题就是,脚本引用了一些jar或者使用了插件,而linuxJMeter安装未含有这些资源,最简单解决方案就是将包含完整资源windows端JMeter安装压缩后上传到Linux

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Zipline 3.0 中文文档(三)

(1256) 在尝试访问不存在之前,快速失败于无效管道。(1280) 修复AverageDollarVolume处理 NaN 问题。...无 错误修复 修复了一个错误,该错误导致在合并两个数值表达式时,如果输入过多,导致运行管道失败,当合并超过十个因子或过滤器时。...为了帮助防止算法在不在现有股票范围内仓位上操作。以前,遍历仓位返回持有零股股票仓位。(在算法代码对pos.amount != 0进行显式检查可以防止使用不存在仓位。)...(1256) 在尝试访问不存在之前,快速失败无效管道。(1280) 修复AverageDollarVolume NaN 处理。...这有助于防止算法对不在现有股票范围内仓位进行操作。以前,遍历仓位返回持有零股股票仓位。(通过在算法代码显式检查pos.amount != 0可以防止使用不存在仓位。)

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npoi批量导入实现及相关技巧

经过考虑,最终实现需要达到 1.不同业务导入无需考虑npoi相关操作,只需要关注自己业务逻辑,这里业务逻辑最重要两点(数据校验和数据保存)    2.导入异常(模板不匹配,数据填写错误...)...阅读目录 设计流程图 代码实现 npoi生成下拉框两种方式比较 总结 回到顶部 设计流程图 本文使用npoi版本:1.2.5,可以nuget下载相应。系统相关流程和重要类类图如下。 ?...response.Message.indexOf("http://") >= 0) { $('#' + file.id).find('.state').html("上传数据存在错误数据...页 将下拉选项值写入到对应列 区域引用sheet页数据     该方式相当于Excel以下操作 ?...该方式不存在上限限制,方便在Excel里面查看下拉选项,更加通用。

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机房收费系统(VB.NET)——超详细报表制作过程

选择需要用到数据库对象,设置DataSet名称,完成,自动返回“ 报表向导 ”窗体,下一步: ?        ...将需要字段按顺序拖入行组或,由于“∑值”必须拖入字段,这里我们随便拖入一个字段(如果不需要的话后面还可以改),一直点“下一步”,直到“完成”,RDLC文件雏形就出来了: ?        ...第一行为标题,第二行为数据关联行,即与数据库数据关联,鼠标放到第二行每个单元格时,单元格右上角会出现一个小图标,点击则可以为该单元格以及该单元格所在整列关联数据集中数据。      ...DataSetCheckoutReport一定要与刚开始创建RDLC文件时设定数据集名称DataSetCheckoutReport一样,否则将会出现“尚未为数据源***提供数据源实例”错误。        ...到此,一张简单报表就制作好了        如果步骤中有错误或不全面的地方,欢迎补充说明。

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