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R语言中 apply 函数详解

你可以看到输出与上面返回列表lappy有何不同 vapply() 来到vapply()函数。lapply()、apply()和vapply()这三个函数是专门所有类型向量定制。...正如预期那样,我们得到了一个错误,因为无法从字符列表中计算最大。numeric(1)指定我们希望输出单个数值,其中每个元素长度1。如果我们使用lapply()或sapply()呢?...因此,当你提供一个向量作为输入时,tapply()会对向量每个子集执行指定操作。需要参数包括: tapply(X, INDEX, FUN) 其中INDEX表示要用于分隔数据因子。听起来耳熟吗?...是的,tapply()只不过是执行groupy操作并对分组数据应用某些函数简单方法!...), b = c(13, 14, 15), c = c(16, 17, 18)) 现在,如果我们想找出每对列表元素之间最大呢?

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R语言︱数据分组统计函数族——apply族用法与心得

lapply使用格式lapply(X, FUN, ...) lapply返回是和一个和X有相同长度list对象, 这个list对象每个元素是将函数FUN应用到X每一个元素。...如果参数simplify=TRUE,函数sapply返回不是一个list,而是一个矩阵; 若simplify=FALSE,函数sapply返回仍然是一个list。...USE.NAMES 逻辑如果TRUE,且x没有被命名,对x进行命名。 FUN.VALUE 一个通用型向量,FUN函数返回值得模板。...X 一个列表 classes 关于类名字符向量,或者any时匹配任何类 deflt 默认结果,如果使用了how=”replace”,则不能使用 how 字符串匹配三种可能结果 参考文献:...lapply中所要使用函数,一定需要是输入单一变量,输出单一变量可以存至list

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R语言数据结构(包含向量和向量化详细解释)

3向量化及向量化函数 3.1向量输入,向量或矩阵输出 向量输入,向量输出 向量化就是对向量每一个元素应用函数,如果一个函数使用了向量化运算符,那么它也被向量化了,代码运行速度会提升。...所以实际是用布尔向量筛选x符合条件元素,也就是执行是 x[c(TRUE,FALSE,TRUE,TRUE)] 运用上述方式可以筛选另一个向量,也可以筛选自身。...并且三个变量类型不一样,分别是字符型,数字型,逻辑。 注意,列表长度是3,是组件个数。 列表索引 三种方式访问列表lst组件c,返回是c数据类型。...apply系列函数lapply``sapply lapply=list apply,对每个组件执行给定函数,并返回另一个列表。...还有合并 apply族函数在数据框用法 apply lapply sapply apply 如果数据框每一列数据类型相同,则可以对该数据框使用apply函数。或针对数据框某些列应用。

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R语言入门系列之三:R脚本

写在前面: 在前面两篇文章R语言入门系列之一与R语言入门系列之二,我分别介绍了R语言中对象与结构、数据输入输出及可视化。...其中by是制定进行统计类别列表,一般因子变量,FUN统计函数,可以随意选择。...lapply()通过对x每一个元素运用函数,生成一个与元素个数相同列表lapply(X, FUN, ...)...# return:一个函数返回是在函数体评估计算最后一个表达式。...内置参数,用户输入参数从第6个开始,R脚本命令行参数使用示例如下所示: 如果想忽略R内置参数,则可以如下设置: Args <- commandArgs(TRUE) 这样,Args[1]即为用户输入第一个位置参数

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MADlib——基于SQL数据挖掘解决方案(3)——数据类型之向量

如果右边数组每个非零元素都等于左边数组相同下标的元素,函数返回TRUE。 array_max() 返回数组最大,忽略,返回数组元素相同类型。...array_max_index() 返回数组最大及其对应下标,忽略,返回类型格式[max, index],其元素类型与输入类型相同。...array_min_index() 返回数组最小及其对应下标,忽略,返回类型格式[min, index],其元素类型与输入类型相同。...array_fill() 将数组每个元素设置参数值。 array_filter() 过滤掉数组指定元素,要求所有。返回与输入相同数据类型。...如果在数组不存在,结果返回原数组。 (10)将二维数组列展开一维数组集合。

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快速掌握apply函数家族推荐这篇文档

❝apply 家族是 R 语言中常用函数,用于对列表、数组或其他类型数据进行循环操作。 ❞ apply 家族包括以下几个函数: ❝lapply:用于遍历列表每一个元素,并对其执行函数操作。...例如,下面的代码使用 lapply 函数对列表每个字符串执行 toupper 函数,将其转换为大写: # 创建列表 x <- list("apple", "banana", "cherry") #...使用 lapply 函数对列表每个字符串执行 toupper 函数 lapply(x, toupper) [[1]] [1] "APPLE" [[2]] [1] "BANANA" [[3]]...[1] "CHERRY" 注意,lapply 函数返回是一个列表,其中每个元素表示对应数据执行函数后结果。...❝如果想要将结果转换为向量、矩阵或数组,可以使用 sapply 函数。它基本语法与 lapply 类似,只是将 lapply 替换为 sapply 即可。

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隐式循环及function函数

apply()函数 apply()一般用于处理矩阵/数据框,返回通过将函数应用于数组或矩阵边距而获得向量或数组或列表。...[,1:4], 2, plot) lapply()函数 lapply返回与X长度相同列表,其中每个元素都是将FUN应用于X相应元素结果。...lapply是apply()函数变种,主要用于处理列表/向量(列表/向量没有行和列概念,所以会比对矩阵/数据框操作更简单一些),也更适用于批量读取数据或者处理统计数据 基本语法lapply(...X:向量(原子或列表)或表达式对象。其他对象(包括分类对象)将被base::as.list强制转换。 FUN:函数,即对x每一行/列执行FUN这个函数。...写函数函数——function() 使用apply或者lapply函数时,都有FUN参数,就是我们在执行循环时需要用函数,这个函数可以是内置比如mean或者sum等函数,也可以由我们自己构建 如果需要写对应需求函数

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R语言常用函数速查

一、基本 1.数据管理 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框c:连接向量或列表 length...:求长度 subset:求子集seq,from:to,sequence:等差序列rep:重复 NA:缺失 NULL:对象sort,order,unique,rev:排序unlist:展平列表attr...计算 +, -, *, /, ^, %%, %/%:四运算ceiling,floor,round,signif,trunc,zapsmall:舍入max,min,pmax,pmin:最大最小 range...on.exit:指定退出时执行 eval,expression:表达式计算system.time:表达式计算计时 invisible:使变量不显示menu:选择菜单(字符列表菜单) 其它与函数有关还有...比如,正态分布这四个函数dnorm,pnorm,qnorm,rnorm。

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

filter——数据筛选(筛选观测,行) filter(Hdma_dat,pclass == 1) ##################################### #dplyr基本函数...,它输入参数和计算结果都是数据框,用法相对简单。...也可以,返回列表 > lapply(g,mean) $USA [1] 18.57292 $`non-USA` [1] 20.50889 ##分组结果 summary(g) split还有一个逆函数...lapply函数可以对每组数据都执行同样算法。Split和lapply两者结合可以实现本案例。 2.由于分组后数据可以复用,因此本算法比aggregate性能更高。...data.table包语法简洁,并且只需一行代码就可以完成很多事情。进一步地,data.table在某些情况下执行效率更高。

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R语言︱词典型情感分析文本操作技巧汇总(打标签、词典与数据匹配等)

} review <- lapply(completepath, read.txt) #如果程序警告,这里可能是部分文件最后一行没有换行导致,不用担心。...is.na(sentence)] #清除对应sentence里面的(文本内容),要先执行文本名 sentence <- sentence[!...去除原理就是导入停用词列表,是一列chr[1:n]格式; 先与情感词典匹配,在停用词库去掉情感词典单词,以免删除了很多情感词,构造新停用词; 再与源序列匹配,在原序列中去掉停用词。...如图1 id,就是一个主键,建立主键之间关联可以用plyrJoin函数,`join`默认设置下执行左连接。...is.na(表1$label),] #非NA行赋值 代码解读:表1图1数据表,表2是id+label; join之后,在表1加入匹配到表2label; 并且通过[!

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「R」apply,lapply,sapply用法探索

参数列表: X:list、data.frame数据 FUN: 自定义调用函数 …: 更多参数,可选 比如,计算list每个KEY对应该数据分位数。...会分别循环矩阵每个,而不是按行或按列进行分组计算。...4. sapply函数 sapply函数是一个简化版lapply,sapply增加了2个参数simplify和USE.NAMES,主要就是让输出看起来更友好,返回向量,而不是list对象。...时,输出结果按数组进行分组 USE.NAMES: 如果X字符串,TRUE设置字符串数据名,FALSE不设置 我们还用上面lapply计算需求进行说明。...> sapply(data.frame(x), sum) x1 x2 12 12 # 检查结果类型,sapply返回类型向量,而lapply返回类型list > class(lapply(

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【R语言经典实例8】如何定义一个R函数。

先前例子我们提到将cv函数作为lapply函数一个参数,而若使用匿名函数直接作为lapply函数参数,则能将原先命令简化至同一行: > lapply(lst, function(x) sd(...调用 函数参数是“调用”——如果你改变了函数参数值,改变只是局部,并不会影响该参数所引用变量值。 局部变量 你可以简单地通过赋值来创建一个局部变量,函数结束后该局部变量会消失。...条件执行 R语法包含if语句,更多详情可以使用help(Control)命令查看。 循环语句 R语法也包括for循环、while循环以及repeat循环语句。...先前例子我们提到将cv函数作为lapply函数一个参数,而若使用匿名函数直接作为lapply函数参数,则能将原先命令简化至同一行: > lapply(lst, function(x) sd(...调用 函数参数是“调用”——如果你改变了函数参数值,改变只是局部,并不会影响该参数所引用变量值。 局部变量 你可以简单地通过赋值来创建一个局部变量,函数结束后该局部变量会消失。

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从零开始异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

, 10:5) l2 <- list() l2[[1]] <- 1:10 l2[[2]] <- 10:5 ##生成列表方式,直接生成以及生成一个列表后添加元素 identical...(i in 1:length(x)){ s=s+x[[i]] result[[i]] = c(x[[i]],s) } result do.call(cbind,result) ## 通过先生成列表...##对test数据框每一行求和 图片 图片 ### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量每个元素(向量)实施相同操作 test <- list(x = 36:33...,y = 32:35,z = 30:27);test #返回列表,对列表每个元素(向量)求均值(试试方差var,分位数quantile) lapply(test,mean) lapply(test...(第一个写数据框),右表多余数据舍去,没有的数据显示缺失 right_join(test1,test2,by="name") ##右连接,以右侧行为准构成新数据框(第二个写数据框),左表多余数据舍去

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R语言基础概要

attach(Affairs) 上述操作逆操作 detach(Affairs) 一般操作 列出所有对象 objects() ls() 查看对象x模式:,数值,字符,逻辑,复数,列表,函数 (NULL...若M数值型向量,t(M)矩阵型行向量 > t(M) 矩阵X乘矩阵Y。若Y是数值型向量,R会自动判断其为行向量还是列向量。...功能与apply类似(参考上面的apply),用于列表型数据 > lapply(...) simplified apply。...功能与lapply类似,区别在于函数结果类型不是列表(list) > sapply(...) 与数据框有关基本操作 数据框是一种特殊列表,所以对列表适用函数往往对数据框也适用。...(逻辑向量)维度相同数值向量,若b[i]TRUE,x[i]u,反之为v x = ifelse(b, u, v)

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入门和初级R语言使用者界限??

从概念上讲,循环是在某些条件下重复执行一系列指令一种方式。它们使您可以自动执行需要重复代码部分。在深入研究R编写循环之前,很多人告诉我应该避免使用R循环。为什么?那是因为R支持向量化。...例如,写循环比函数(例如lapply和sapply)矢量化低。但是,作为R初学者,对循环以及如何编写循环有一个基本了解是很好。 在R编写一个简单for循环 让我们回到循环概念上。...因此,您可以随时随地变量命名,但是如果您使用有意义名称,更易于理解。 使用next语句 让我们看一个更数学例子。 假设您需要打印介于1到10之间所有不均匀数字,但不应打印偶数。...万一进入循环,我们需要检查i是否不均匀。如果i除以2时余数零(这就是为什么我们使用模数操作数%%原因),则无需输入if语句,而是执行print函数并返回。...如果余数不为零,if语句计算结果TRUE,然后输入条件。现在,我们在这里看到下一条语句,该语句导致以1:10条件循环回到i,从而忽略了随后指令(即print(i))。

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ORA富集分析

认为其为小概率事件,在一次假设检验不可能发生,拒绝原假设,接受备择假设,也就差异表达基因与该通路有比较强联系。...(gs)]->GO #提取GO列表每一个元素下GOID,Term,Ontology,Definition #这里是写了一个函数,用lapply循环列表每一个元素,使用@提取其信息,以向量形式返回赋给...ENTREZID,通路默认最少要包含10个基因,物种默认为人类 #p校正方法BH法,结果显示阈值:p小于0.05,padjust结果显示阈值 ORA_GOGO #提取GO列表每一个元素下GOID,Term,Ontology,Definition #这里是写了一个函数,用lapply循环列表每一个元素,...富集分析pX个基因富集到通路及大于X个基因富集到通路(更极端情况)概率之和,p.adjust是对多重假设检验校正,目的是减少假阳性率。

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