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2
回答
python如何实现动态规划算法寻找最优匹配子串?
题,譬如现在有一串
字符串
s1=“agtcgtaatgc”,想将另一个
字符串
s2="cgaa"
比对
到s1上,可以看到s2并非完全
比对
到s1上面,其中是有一个错配的。现在我要实现的就是寻找s2
比对
到s1上面的错配最少的位点。
浏览 765
提问于2017-11-27
1
回答
有没有一个R函数可以返回
比对
过的DNA序列的
比对
分数?
、
、
我想提取两个
字符串
(DNA序列)并生成
比对
分数。我找到了解密包,但它只允许我生成
比对
,而不是
比对
分数。我也试过使用“生物
字符串
”,但我无法生成分数。 谢谢你的帮忙!
浏览 9
提问于2019-08-30
得票数 0
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1
回答
将表格数据放到网络上供用户编辑的最佳实践?
、
、
我在
ASP
.net工作了三年多了。 我正在从事的项目是用3层表示/业务/数据设计来设计的。表示层是一个
ASP
.net网站。业务层和数据层也在.net中,数据层与server一起工作。最近,我不得不向我的
ASP
.net web应用程序添加几个新屏幕。我的客户的命令是,“把这些Excel电子表格放到网上,这样我就不必把它们传递给不同的编辑人员,我也不必担心跟踪变化。”(3)将
ASP
.net网页编码给用户
ASP
.net GridView,将表格数据显示给用户。有一个按钮,用户可以单击添加一个
浏览 0
提问于2011-08-01
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1
回答
在使用AntiXssEncoder.UrlEncode时,使用+代替%20作为空格的最佳方式
我使用AntiXssEncoder.UrlEncode对查询
字符串
参数中的值进行编码。空格被编码为%20,但我想使用加号代替。有没有
比对
结果
字符串
调用.Replace("%20","+")更好的方法呢?
浏览 1
提问于2016-07-01
得票数 0
1
回答
外键对象引用的模型验证问题
、
、
、
我开始检查
asp
.net 6/ mvc /实体框架应用程序,只是在一个基本的测试应用程序上遇到了麻烦。为了简单起见,更改了几个字段名,但基本上是这样的,模型中有几个额外的
字符串
--用所需的部门描绘一个用户:public int DeptId { get; set;我完全可以在
asp
.net 3.1中重新创建,它没有任何问题。没有检查虚拟Dept对象,但它位于
asp
.net 6中。这是预期的结果吗?在每次创建时,是否有
比对
每个外
浏览 9
提问于2022-04-20
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1
回答
快速Python短DNA
字符串
比较
、
、
我有一个8个碱基的
字符串
testStr我想把它与绿色的8个碱基
字符串
greenList的列表进行比较。GGCGCATG ACTGAAAT ATGCCCGT ACTGAGTG||||| ||我第一次尝试这样做的中心是创建一个绿色列表,其中包含了greenList中
字符串
的所有可能的hamming距离1变体。但一定有更好的方法.我也知道有大量的
浏览 7
提问于2020-12-11
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4
回答
如何计算文本
字符串
的多序列
比对
、
、
、
、
我正在写一个程序,它必须计算一组
字符串
集的。我正在考虑用Python来做这件事,但如果更实用的话,我可以使用外部软件或其他语言。数据不是特别大,我没有很强的性能要求,我可以容忍近似(即。唯一的问题是
字符串
是常规
字符串
(即,UTF-8
字符串
(可能包含应被视为常规字符的换行符);它们不是DNA序列或蛋白质序列。我可以找到大量的工具和信息,用于生物信息学中的常见情况,具有特定的复杂文件格式和许多我不需要的功能,但出人意料地很难找到用于简单
字符串
情况的软件、库或示例代码。我可能会重新实现解决这个问题的众多算法中的
浏览 1
提问于2011-04-28
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1
回答
如何在biopython中使用fasta文件而不是蛋白质序列
字符串
创建多个序列
比对
、
、
、
、
我希望能够使用我在与脚本相同的目录中下载的文件来编写多个序列
比对
。然而,在Biopython Cookbook中,显示这一点的唯一方式是通过写出
字符串
而不是加载文件。我希望能够做到后者。下面是在中进行多序列
比对
的方法from Bio.SeqRecord import SeqRecord from Bio.Align import MultipleSeqAlignment
浏览 31
提问于2019-12-01
得票数 0
3
回答
动态时间规整和Needleman-Wunsch算法有什么不同?
、
、
、
我需要计算短
字符串
序列(<20个字符)和几千个
字符串
之间的
比对
(相似性)分数。 我无法弄清楚这两种算法之间的差异,也无法决定为我的工作选择哪种算法。有没有人能帮我弄清楚其中的区别?
浏览 0
提问于2011-08-05
得票数 7
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1
回答
NSPredicate中参数个数对CoreData获取速度有何影响?
、
、
同样,对int的索引
比对
字符串
的索引更快吗?
浏览 2
提问于2012-02-22
得票数 1
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1
回答
node如何读取csv文件指定的一行?
、
读取指定两行进行比较是否一致
浏览 300
提问于2020-09-30
1
回答
是否支持离线人脸
比对
?
、
、
因为现场客户那边没有网络,想实现离线
比对
,例如 身份证照片和 摄像头拍照的照片
比对
[附加信息]
浏览 416
提问于2018-08-03
1
回答
官网的人脸
比对
API更新了,怎么能找到2018年使用人脸
比对
的API文档?
、
、
官网的人脸
比对
API更新了,怎么能找到2018年使用人脸
比对
的API文档
浏览 217
提问于2019-09-06
3
回答
原语和对象
他像标准一样将原语定义为数字、
字符串
、布尔值、空值和未定义的原语。因为他们有自己的方法和复杂的实体。实际问题 在定义
字符串
、布尔值和数字时,原始对象会
比对
象更精确吗?
浏览 4
提问于2013-01-18
得票数 4
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1
回答
根据给定的相似度将大容量文本分组为组
、
、
、
是否有任何gem或库可用于根据给定的类似百分
比对
文本进行分组。以上所有的宝石都有助于发现两个
字符串
之间的相似之处,但是分组大量的数据需要花费大量的时间。
浏览 5
提问于2017-01-28
得票数 0
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3
回答
ASP
.NET GridView宽度在绑定到SqlDataAdapter后不会保持在100%
、
、
、
、
我承认,我对所有这些都是陌生的,所以我相信,对你们所有人来说,答案会
比对
我更明显。<div id="X" class="In-lineControl" style="width:100%"> <H
浏览 3
提问于2014-07-31
得票数 2
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1
回答
在GnuPG中使用的关键派生函数是什么,它的输入可能是多长时间?
、
目前,我正在与GnuPG合作我的一个新项目。了解手册中没有描述的两件事是非常有用的:GnuPG使用什么键派生函数?
浏览 0
提问于2017-07-08
得票数 2
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3
回答
在python中
比对
DNA序列
、
、
我有数以千计的DNA序列,范围在100到5000 bp之间,我需要对指定对进行
比对
并计算身份得分。the scriptjob 4945543.1 died through signal XCPU (24) 我知道还有其他用于
比对
的工具,但它们主要只能将比分写入输出文件中,需要再次读取和解析,以便检索和使用
比对
分数。有没有什么工具可以像pairwise2那样在python环境中对序列进行
比对
并返回
比对
分数,而不会造成内存泄漏?
浏览 1
提问于2015-11-10
得票数 4
2
回答
python中更快的相似性聚类
、
、
我收集了几千个
字符串
(DNA序列)。我想通过排除非常相似的序列,将其减少到几百个(确切的数字并不重要)。 我可以通过使用"Levenshtein“模块进行匹配来实现。
浏览 1
提问于2014-02-27
得票数 0
3
回答
对任何类型的序列使用nwalign()
我需要一个用于Matlab的近似
字符串
匹配函数。我通过调用nwalign()发现了生物信息学工具箱中的。唯一的问题是它只对氨基酸序列起作用。因此,当我尝试将
字符串
与数字和其他符号进行比较时,我得到一个错误消息:“两个序列都必须是氨基酸。”有没有办法让nwalign()函数接受任何类型的序列,或者有没有另一个matlab函数可以执行近似的
字符串
匹配,而不限于生物信息学?
浏览 1
提问于2011-10-01
得票数 1
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