腾讯云
开发者社区
文档
建议反馈
控制台
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
搜索
搜索
关闭
发布
登录/注册
精选内容/技术社群/优惠产品,
尽在小程序
立即前往
文章
问答
(9999+)
视频
沙龙
1
回答
mummer共线性
分析
的图怎么看?
想问一下,mummer共线性
分析
的图里有一条序列的一部分(圈起来部分)和参考序列比不上,大概什么原因呢?有什么解决办法吗? 图片
浏览 275
提问于2023-09-25
4
回答
如何使用PLink删除重复的SNP?
、
、
我正在与合作
分析
全
基因组
数据
。 有人知道如何删除重复的SNP吗?
浏览 42
提问于2012-03-26
得票数 5
2
回答
查找VI中任何有ATCG以外的内容的行
、
、
、
我有一个
基因组
数据
文件,大约有500万行长,应该只有A,T,C和G的字符。问题是,我知道这个文件应该有多大,但它比这个稍微大一些。这意味着,某种
分析
出了问题,或者有一些线条包含了
基因组
数据
以外的其他东西。 有没有办法找出除了A、T、C或G之外的任何线?由于文件的性质,任何其他字母、空格、数字、符号都不应该出现。
浏览 0
提问于2018-08-31
得票数 7
回答已采纳
1
回答
R中的主成分
分析
(PCA):使用哪个函数?
、
、
、
如果这是相关的,我正在研究的应用类型是
基因组
(表达)
数据
集的质量控制
分析
。 谢谢!
浏览 0
提问于2013-01-10
得票数 6
回答已采纳
1
回答
Apache 3是否支持将GPU用于Spark?
、
、
、
、
我目前正在使用(用python和Scala编写的
基因组
分析
库)运行
基因组
分析
管道。最近,Apache 3发布,它支持GPU的使用。 我尝试了库,用gpu节点启动了一个前提下的slurm集群。
浏览 7
提问于2021-09-21
得票数 2
回答已采纳
1
回答
在python中有效地获取稀疏
数据
的移动平均值并过滤阈值以上的
数据
、
、
、
、
我正在接触一些
基因组
分析
,有点卡住了。我有一些非常稀疏的
数据
,需要找到移动平均值超过某个阈值的地方,将每个点标记为1或0。
数据
的类型是唯一的,所以我不能使用可用的程序进行
分析
。每个点代表人类
基因组
上的一个点(basepair)。对于每个
数据
集,都有200,000,000个潜在的点。
数据
本质上是一个大约12000个索引/值对的列表,其中所有其他点都被假定为零。我需要做的是对整个
数据
集进行移动平均值,并返回平均值高于阈值的区域。
浏览 1
提问于2013-05-02
得票数 5
回答已采纳
2
回答
将shell脚本的输出组织到文本文件中的表中
、
、
、
、
我正在使用一个unix shell脚本,它可以构建
基因组
,然后创建一个系统发展史。根据您使用的
基因组
组装器,最终输出(系统发生图)可能会发生变化。我希望比较使用不同
基因组
组装器的效果。我已经开发了一些指标来比较它们,但我需要帮助组织它们,以便我可以运行有用的
分析
。我想将我的
数据
按列导入excel中。这是我用来输出
数据
的脚本:read SIZEOFDATASET ec
浏览 3
提问于2015-02-26
得票数 3
1
回答
只有当用户id是当前用户时,我才能覆盖models.py条目?
、
、
、
、
我有
基因组
文件,我希望每个用户都能上传他们自己的
基因组
文件,但是他们只能有一个。我希望这样,如果他们试图上传另一个,那么他们将只是替换
基因组
和形成
数据
为他们的最后一个条目。我正在使用他们的条目,以及使用这个站点的n个人(每人也有一个条目)作为样本,根据这个人的
基因组
进行
分析
,所以我想要保存一个模型文件,里面装满了
基因组
,名字,性别等等。但每个用户只有一个。render(request, 'Upload.html', {
浏览 5
提问于2022-01-27
得票数 0
1
回答
在excel上计数
数据
类别
在我的
基因组
分析
的最后一部分,我必须制作一个与基因功能相关的饼图。我有一个excel电子表格,上面有基因功能和相应的字母类别(COG字母栏D在屏幕截图中),为了制作饼形图,我需要按C列过滤,这样我就可以根据我在
分析
的某些部分看到的
基因组
数量来调整
基因组
的数量,然后计算这个字母在大约
浏览 3
提问于2021-06-21
得票数 0
回答已采纳
1
回答
创建应急表
、
、
、
目前,我有一个在
基因组
中声明特定基因簇的dataframe,它被定义为一个格式良好的选项卡分隔文件,它看起来基本上与下面的dataframe (示例)类似:GCF3371 Streptomyces_xiamenensis 在此基础上,我想创建一个缺位/存在表或基于这个值为0和1的
数据
的应急表,这取决于
基因组
中某个特定基因簇的缺失或存在。整个想法是让我能够测量特定基因簇在
基因组
中的出现,因
浏览 0
提问于2020-01-31
得票数 0
回答已采纳
1
回答
我们如何有效地压缩DNA字符串?
、
、
、
、
DNA字符串可以是由5个字母(A、T、G、C、N)的任意组合组成的任意长度。
浏览 43
提问于2018-08-15
得票数 5
1
回答
具有p>>n和内存不足的随机林
、
、
我试图用200 K的预测器和20行的
数据
对
基因组
数据
进行随机森林分类。预测器已经被修剪,以便进行自相关。是否有任何RF实现可以管理在可用内存中的
分析
(我希望避免增加交换空间)?是否应该使用不同的算法(对于我所读到的,RF应该处理好p>>n)?
浏览 3
提问于2022-03-07
得票数 0
1
回答
程序/脚本-用于峰值检测的局部最大值的多次测试
我正在
分析
基因组
数据
,寻找一种快速从噪声中解析出重要峰值的方法,以获得一系列跨染色体的统计指标(例如Tajima's D)。
浏览 2
提问于2013-10-12
得票数 0
2
回答
根据常见的子模式对短的同构字符串(DNA)进行聚类,并提取类的一致性。
、
、
、
任务:池: ca. 300个序列片段8 -20个字母/片段4个可能的字母: a,g,t,c每个片段被构造成三个区域:<code>H 111</code>5个通用字母<code>H 212</code><code>H 113<//代码>g和c‘s<code>H 214</code><>H 115</code>5个泛型字母的位置。 (作为regex,那将是[gcta]{5}[gc]{8,}[gcta
浏览 11
提问于2009-10-02
得票数 5
3
回答
谷歌云/BigQuery/
基因组
学
数据
位置
、
、
、
我们公司的一些工作需要将云中的
数据
存储在美国。但对于BigQuery和谷歌
基因组
学来说,应用程序接口中没有这样的选项。有人知道这些服务的
数据
存储在哪些国家吗?
浏览 9
提问于2015-04-25
得票数 2
1
回答
是否可以从python创建/编辑excel
宏
?
、
、
、
目前,我正在从事一个项目,要求我编写一系列(看似没完没了的)
宏
,以再现由我们的
分析
人员设计的枢轴表。细节会发生变化,但代码在不同的示例之间大致相同。我想编程地基于几个选项生成vba代码,然后将
宏
添加到给定的工作表中。是否可以使用win32com或其他方式使用python创建excel
宏
?是否可以从另一个excel
宏
创建excel
宏
?项目背景,我有一个python脚本,它执行以下操作:
浏览 2
提问于2012-03-28
得票数 4
1
回答
带有外键的动态SQLAlchemy表名
、
、
在的基础上,我正在致力于将SQLite
数据
库/
数据
库模式转换为SQLAlchemy。 在这种情况下,会动态生成一系列表格,并对
基因组
名称进行
分析
。每个表都有一个指向父表(参考
基因组
)的外键引用。
浏览 2
提问于2016-02-17
得票数 2
1
回答
使函数运行得更快一些,可以使用apply、stringr、stringr和rbind。
我做
基因组
计算工作。是的-只是另一个假装成计算机科学家的生物学家。我正在编写一个脚本,它将允许我根据人类
基因组
中的每一个位置集成一组
数据
集。这将转换为12列超过30亿行的
数据
。作为一个测试
数据
集,我正在使用酵母
基因组
构建我的
分析
管道,它将生成一个包含大约2500万行和12列的
数据
。 问题:我的当前代码运行良好,但速度非常慢。例如,我45分钟前就开始了我的管道,大约是酵母
基因组
的1/3。这意味着完成一个酵母样本可能需要135分
浏览 1
提问于2018-12-13
得票数 2
回答已采纳
2
回答
搜索空间
数据
、
如果不是,这是否只是一次自己随机生成这些
数据
的情况?
浏览 7
提问于2013-08-20
得票数 0
回答已采纳
1
回答
谷歌
基因组
学对那些研究其他生物的人开放了多少?
我想知道谷歌
基因组
学环境对那些不研究人类
基因组
的人来说有多灵活?我找不到一个显而易见的地方来回答这个问题,我不想太深入,然后找出它只适合人类。有人知道吗?
浏览 4
提问于2016-08-22
得票数 0
点击加载更多
扫码
添加站长 进交流群
领取专属
10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关
资讯
宏基因组分析初识-基本分析流程
引进肿瘤全面基因组测序分析 形成中国肿瘤大数据
软件系|宏基因组分析-ShortBRED
宏基因组学分析简介
Nature:基于UK Biobank数据库的脑影像指标全基因组关联分析
热门
标签
更多标签
云服务器
ICP备案
实时音视频
即时通信 IM
对象存储
活动推荐
运营活动
广告
关闭
领券