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命令帮助类基础命令

常用命令缩写 缩写 | 全称 | 说明 — | — | — apt | Advanced Packaging Tool | 是Debian Linux发行版中的APT软件包管理工具。一般配合apt-get或者apt-update awk | Aho Weiberger and Kernighan | Alfred Aho,Peter Weinberger, 和 Brian Kernighan 的Family Name的首字符。一种编程语言,用于在linux/unix下对文本和数据进行处理。 bash | Bourne Again SHell | 一种shell bg | BackGround | 用于将作业放到后台运行,使前台可以执行其他任务。该命令的运行效果与在指令后面添加符号&的效果是相同的,都是将其放到系统后台执行。 cal | CALendar | 用于显示当前日历,或者指定日期的日历。 cat | CATenate | “连接”,连接文件并打印到标准输出设备上,cat经常用来显示文件的内容,类似于下的type命令。 chgrp | CHange GRouP | 用来改变文件或目录所属的用户组。 chmod | CHange MODe | 用来变更文件或目录的权限。 chown | CHange OWNer | 改变某个文件或目录的所有者和所属的组,该命令可以向某个用户授权,使该用户变成指定文件的所有者或者改变文件所属的组。 cd | Change Directory | 切换工作目录 cp | CoPy | 将一个或多个源文件或者目录复制到指定的目的文件或目录 dd | Data Description | 用于复制文件并对原文件的内容进行转换和格式化处理。 df | Disk Free | 用于显示磁盘分区上的可使用的磁盘空间。默认显示单位为KB。 du | Disk Usage | 查看使用空间的,但是与df命令不同的是Linux du命令是对文件和目录磁盘使用的空间的查看,还是和df命令有一些区别的。 diff | DIFFerence | 在最简单的情况下,比较给定的两个文件的不同。 dpkg | Debian PacKaGe | Debian Linux系统用来安装、创建和管理软件包的实用工具。 ed | EDitor | 单行纯文本编辑器,它有命令模式(command mode)和输入模式(input mode)两种工作模式。 emacs | Editor MACroS | 是由GNU组织的创始人Richard Stallman开发的一个功能强大的全屏文本编辑器,它支持多种编程语言,具有很多优良的特性。(备注:vim大法好!!!) env | ENVironment | 用于显示系统中已存在的环境变量,以及在定义的环境中执行指令。 exec | EXECute | 用于调用并执行指令的命令。 fsck | File System Consistency checK, or fuck | 用于检查并且试图修复文件系统中的错误。 gawk | Gnu Aho Weiberger and Kernighan | grep | Gnu Regular Expression Print | (global search regular expression(RE) and print out the line,全面搜索正则表达式并把行打印出来)是一种强大的文本搜索工具,它能使用正则表达式搜索文本,并把匹配的行打印出来。 grub | GRand Unified Bootloader | 多重引导程序grub的命令行shell工具。 ifconfig | InterFace CONFIGuration | 被用于配置和显示Linux内核中网络接口的网络参数。 init | INITialization | Linux下的进程初始化工具 insmod | INStall Module | 用于将给定的模块加载到内核中。 ln | LiNk | 用来为文件创件连接,连接类型分为硬连接和符号连接两种,默认的连接类型是硬连接。如果要创建符号连接必须使用”-s”选项。 ls | LiSt | 显示目标列表 lsmod | LiSt Module | 用于显示已经加载到内核中的模块的状态信息。 man | MANual | Linux下的帮助指令,通过man指令可以查看Linux中的指令帮助、配置文件帮助和编程帮助等信息。一般戏称有问题找男人。。。 mkdir | MaKe DIRectory | 创建目录 mkfs | MaKe FileSystem | 用于在设备上(通常为硬盘)创建Linux文件系统。 mv | MoVe | 对文件或目录重新命名,或者将文件从一个目录移到另一个目录中。 nano | Nano’s

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Bioinformatics丨SumGNN:基于高效知识图总结的多类型药物相互作用预测

今天为大家介绍的是剑桥大学CaoXiao等人发表在Bioinformatics上的文章“SumGNN: 基于高效知识图总结的多类型药物相互作用预测”。由于药物-药物相互作用(DDI)数据集和大型生物医学知识图(KGs)的不断增加,使用机器学习模型准确检测不良的DDI成为可能。然而,如何有效地利用生物医学大噪声KGs进行DDI检测仍是一个有待解决的问题。此外,以往的研究多集中于二值DDI预测,而多型DDI的药理作用预测更有意义,但任务更艰巨。为了填补空白,作者提出了一种新的方法SumGNN: 知识摘要图神经网络。这个网络是通过子图提取模块实现的,该子图提取模块可以有效地锚定KG中的相关子图,从而在子图中生成推理路径,以及多通道知识和数据集成模块,该模块利用大量外部生物医学知识,显著改善了多类型DDI的预测。SumGNN比最佳模型的性能高出5.54%,在低数据关系类型中性能提高尤其显著。此外,SumGNN通过为每个预测生成的推理路径提供可解释的预测。

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Python语法之模块和包

这一节,我将为大家介绍模块和包: > 在开发大型软件时,随着代码写的越来越多,如果将所有的代码都放在一个文件里,势必为以后的维护带来很大的困难。正如仓颉造字一样,仓颉是黄帝的史官,用祖传结绳记事的老办法记载史实。时间一长,那些大大小小,奇形怪状的绳结都记了些什么,连他自己也没法辨认了。于是,仓颉开始想新的办法,用什么方式可以帮助大家分辨清不同的事物,在仓颉的努力下,他创造了文字,解决了这个问题。而在 Python 中,为了编写易于维护的代码,我们会将代码拆分放到不同的文件里,这样每个文件包含的代码相对就会减少。在 Python 中,一个 .py 文件称为一个模块(Module)。

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