对dplyr (R)中的命名向量进行筛选 - 腾讯云开发者社区

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python-进阶教程-对列表中的元素进行筛选

本文主要介绍根据给定条件对列表中的元素进行筛序，剔除异常数据，并介绍列表推导式和生成表达式两种方法。。...结论：处理少量数据用列表推导式，处理大量数据用生成器表达式 3.更复杂的筛选条件有的时候筛选的标准并非如此简单，甚至涉及到异常处理等细节，这个时候可以先将复杂的筛选条件写入函数，该函数返回bool值，...然后利用Python内建filter()函数进行处理。...ivals = list(filter(is_int, values)) print(ivals) #result:[‘1’, ‘-123’, ‘+369’] 利用int()转换函数和异常处理函数实现的对...4.实用操作在使用列表推导式和生成器表达式筛选数据的过程，还可以附带着进行数据的处理工作。

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R语言 | 根据数据框的顺序进行筛选

目的这里有两个数据框，两者有相同的列（ID），这里想把第一个数据框，按照第二个数据框的ID列进行提取，顺序和第二个数据框一致。...：用%in%进行提取，会自动排序 > # 使用 %in% 进行匹配时，会自动排序，不是id的顺序 > tt[tt$id %in% id$id,] id y 1 1 0.7264999...模拟两个数据框 tt = data.frame(id = 1:10,y = rnorm(10)) tt id = data.frame(id = c(2,1,5,4,3)) id # 使用 %in% 进行匹配时...第二个系谱文件是第一个系谱文件的子集，它的系谱是正确的。我想将第一个系谱文件错误的系谱矫正一下。...「我的思路：」 1，用%in%将第一个系谱的ID，根据第二个系谱的ID提取出来，然后用第二个系谱的Sire和Dam把第一个系谱相应的IID的Sire和Dam替换掉。

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R中的向量化运算

1、R中的向量化运算-seq seq(1, 10, by=1) seq(1, 10, by=0.1) seq(1.9, 10, by=0.1) #注意，不能这样子递减 seq(10, 1, by=...=100) seq(10, 1, length.out=91) #数清楚里面的个数 2、R中的向量化运算-rep > rep(3.14, 5) [1] 3.14 3.14 3.14 3.14 3.14...8 9 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > length(rep(1:10, 5)) [1] 50 3、R中的向量化运算...message: In 1:3 + 1:10 : longer object length is not a multiple of shorter object length > > #两个向量长度不同的情况下...，要进行向量计算，短的那个向量会循环使用。

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在VScode中对R语言进行环境配置

从前，有一个名叫阿磊的程序员，他对编程充满了热情，但总是对新事物感到好奇又有点害怕。一天，他听说了一个强大的编程语言——R语言，它在数据分析和统计学领域非常流行。...阿磊决定要在他的VSCode编辑器中安装并配置R语言，以便他可以开始探索数据科学的奥秘。阿磊打开了他的VSCode，开始在网上搜索如何在VSCode中安装R语言。...过了一会儿，阿磊终于意识到自己走神了，他重新输入了正确的关键词，找到了R语言的官方网站，下载并安装了R语言。接下来，教程告诉他需要在VSCode中安装R扩展。...阿磊感到困惑，他检查了“R Rainbow”扩展的描述，才发现这只是一个美化R控制台输出的扩展，而不是他想象中的那样。阿磊笑了笑自己的天真，然后继续寻找正确的R扩展。...，到系统环境变量里面，win11电脑下按win,搜环境变量；把r库路径放在系统的环境变量中，新建一个： R_LIBS_USER 你的r库的路径新建完后，点击三次确认在bin x64下双击打开Rgui

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脚本分享——对fasta文件中的序列进行排序和重命名

小伙伴们大家下午好，我是小编豆豆，时光飞逝，不知不觉来南京工作已经一年了，从2018年参加工作至今，今年是我工作最快乐的一年，遇到一群志同道合的小伙伴，使我感觉太美好了。...今天是2022年的最后一天，小编在这里给大家分享一个好用的脚本，也希望各位小伙伴明年工作顺利，多发pepper。‍...pip install biopython pip install pandas 查看脚本参数 python Fasta_sort_renames.py -h 实战演练 # 只对fasta文件中的序列进行命令...python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s F -a rename_fasta.fna # 对fasta文件中序列根据序列长短进行排序...，并对排序后的文件进行重命名 python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s T -a rename_fasta.fna

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对HttpServletRequest中的Header进行增删

HttpServletRequest 没有提供修改/删除的 ApiHttpServletRequest中定义的对 Header 的操作全是只读，没有修改。...不管是任何容器，实现类，肯定是要把请求的 Header 存储在某个地方，于是可以通过反射来对存储Header的容器进行增删。...，只要通过反射获取到这个MimeHeaders，对它进行修改即可。...Header 进行增删假设的场景是，需要对请求 Header 统一添加一个x-request-id，通过这个 ID 来从日志中定位每一个请求。...只要熟悉基本的反射，实现对请求头的增删，都很简单。原文链接：https://forum.springdoc.cn/t/topic/3643如有问题，欢迎微信搜索【码上遇见你】。

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GEO2R:对GEO数据库中的数据进行差异分析

GEO数据库中的数据是公开的，很多的科研工作者会下载其中的数据自己去分析，其中差异表达分析是最常见的分析策略之一，为了方便大家更好的挖掘GEO中的数据，官网提供了一个工具GEO2R, 可以方便的进行差异分析...从名字也可以看出，该工具实现的功能就是将GEO数据库中的数据导入到R语言中，然后进行差异分析，本质上是通过以下两个bioconductor上的R包实现的 GEOquery limma GEOquery...在网页上可以看到GEO2R的按钮，点击这个按钮就可以进行分析了, 除了差异分析外，GEO2R还提供了一些简单的数据可视化功能。 1....点击Sample values, 可以看到对应的表达量值，示意如下 ? GEO2R进行差异分析的步骤如下 1....第一个参数用于选择多重假设检验的P值校正算法，第二个参数表示是否对原始的表达量进行log转换，第三个参数调整最终结果中展示的对应的platfrom的注释信息，是基于客户提供的supplement file

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对HttpServletRequest中的Header进行增删

HttpServletRequest 没有提供修改/删除的 Api HttpServletRequest中定义的对 Header 的操作全是只读，没有修改。...不管是任何容器，实现类，肯定是要把请求的 Header 存储在某个地方，于是可以通过反射来对存储Header的容器进行增删。...，只要通过反射获取到这个MimeHeaders，对它进行修改即可。...Header 进行增删 ★假设的场景是，需要对请求 Header 统一添加一个x-request-id，通过这个 ID 来从日志中定位每一个请求。...只要熟悉基本的反射，实现对请求头的增删，都很简单。原文链接：https://forum.springdoc.cn/t/topic/3643 好了，本章节到此告一段落。希望对你有所帮助，祝学习顺利。

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R语言入门（一）之数据处理

；rep() 重复一个对象 #rep(x,times):x是要重复的对象（例如向量c(1,2,3)）,times为对象中每个元素重复的次数（如times=c(9,7,3)就是将x向量的1重复9次，2重复...#数据排序 a2[order(a2$Sepal.Length), ] dplyr::arrange(a2, Sepal.Length) #对a2数据中Sepal.Length升序排序 ?...a2[order(a2$Sepal.Length, decreasing = T), ] dplyr::arrange(a2, desc(Sepal.Length)) #对a2数据中Sepal.Length...direction = "wide", makeEqual = T） #将d1中group这一列进行分割。..." = "Journal")) #merge 函数类似于 Excel 中的 Vlookup，可以实现对两个数据表进行匹配和拼接的功能；by.x，by.y：指定依据哪些行合并数据框，默认值为相同列名的列

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Nature｜对包含110亿种化合物的虚拟库进行快速筛选

2021年12月15日，Nature杂志发表文章，介绍了一种从包含110亿种化合物的虚拟库中识别潜在药物分子的创新方法，并以3个目标蛋白的抑制剂筛选为例，展示了该方法的性能。...4.几千个排名靠前的VLS化合物经过PAINS、物理化学性质、药物相似性、新颖性和化学多样性的后处理过滤，最终选择有限的化合物集（通常是50-100个）进行合成和实验测试。...在被选中进行合成和体外测试的21个最有希望的化合物中，有6个可以与ROCK1酶结合，并在化合物浓度低于10微摩尔时对其进行抑制。这些化合物可以成为药物发现计划中进一步优化的合适线索。...这篇论文为从现在可用的大型化合物库中识别生物活性分子铺平了道路，使用的计算资源和时间仅为标准虚拟筛选方法的一小部分，而且成功率更高。...在操作过程中可能需要对算法的某些参数进行自定义调整以获得最佳性能，从而为进一步探索该方法开辟了许多途径。

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DAY6-学习R包

install.packages(“包”)或BiocManager::install(“包”)install.packages("dplyr") 加载 library和require 使用一个R包需先安装再加载...library(dplyr）dplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length*Sepal.Width)要修改的数据框的名称将创建的新变量的名称将分配给新变量的值...select()按列筛选select(test,1)#筛选test中的第一列select(test,c(1,5))#筛选test中的第一列和第五列select(test,Sepal.Length)#筛选...test中名为Sepal.Length的一列按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)选择字符向量中的列，select中不能直接使用字符向量筛选，需要使用one_of...列或某几列对整个表格进行排序arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc从大到小summarise

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「Workshop」第二期：程序控制与数据操作流

这一次的内容太多了，我讲了 2 小时都没讲完，后续再放视频吧。有一段还忘记录了。。。...涉及编程的数据和代码都会放到 https://github.com/XSLiuLab/Workshop 推荐图书《R for Data Science》[1] 《R 语言编程指南》《R 实战》其他推荐见..., distinct 列筛选 select 排序 arrange 行列增加/更新基本的数学和比较逻辑运算符 + - * / > < == 偏移 dplyr:: lag lead 聚合 dplyr::..., transmute mutate_ add_row add_column rename rownames_to_column, column_to_rowname 向量化函数汇总计数 dplyr...基础语法一致，也可以使用 tidyverse 处理整数索引逻辑索引命名索引进一步的学习参考小抄、文档和《R 语言编程指南》后几期主题本期未讲述的内容？？？

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对 list 中的相同数据进行分组

同一组数据分组需求：一个 list 里可能会有出现一个用户多条数据的情况。要把多条用户数据合并成一条。思路：将相同的数据中可以进行确认是相同的数据，拿来做分组的 key，这样保证不会重。...实际中使用，以用户数据为例，可能用户名和身份证号是不会变的，用这两个条件拼接起来。

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Day6——R包

vars 向量中的列，select中不能直接使用字符向量筛选，需要使用...one_of函数R语言中使用vars参数指定数据框中需要分析的字段索引范围在R语言中，我们经常需要对数据框进行分析和处理。...数据框是一种二维的表格结构，其中包含了多个变量(字段)和观测值(行)。在进行数据分析时，有时我们只对数据框中的特定字段感兴趣，而不需要使用所有的字段。...setosa","versicolor的行#%in%判断前面一个向量内的元素是否在后面一个向量中，返回布尔值。...arrange()#按某1列或某几列对整个表格进行排序arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc

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自学攻略 | R语言数据筛选和修改

现在，是时候深入探讨如何运用 R 语言对数据进行精细化处理了。本篇推文将详细介绍如何在 R 中对数据进行排序、筛选、替换以及调用特定行和列等核心操作。...准备工作：导入你的数据在进行任何数据处理之前，我们首先需要将文件中的数据导入到 R 中。常用的数据格式包括 .csv（逗号分隔值）、 .txt（制表符分隔值）、.xls 和 .xlsx 等格式。...R 语言数据处理的核心利器：dplyr 包在 R 语言中进行数据处理，dplyr 包是不可或缺的工具。它是 tidyverse 系列包中的一员，提供了一套简洁、一致的函数，让数据操作变得直观高效。...数据的替换和清理 (replace_na(), 基础R替换) 在真实数据中，缺失值（NA）非常常见，对其进行合理处理至关重要。此外，有时我们也需要替换特定值。...) 小结本篇教程详细介绍了 R 语言中数据导入以及对数据进行筛选、替换和调用特定行和列等核心操作。

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R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

/tidyr 数据管理 2.1 filter 使用逻辑条件对行筛选。...dplyr 包的 distinct() 函数可以对数据框指定若干变量，然后筛选出所有不同值，每组不同值仅保留一行。...2.6 arrange 按照数据框里的某列或某几列，对所有行进行排序。可以使用 desc 产生倒序，或写入多个列使其按照多个列进行排序。...按列号 select(test,1) select(test,c(1,5)) 按列名如果想要用向量来存放希望筛选的列名，需要使用函数 one_of 来存放该向量。...其他还有几个变形： summarize_if 对列筛选，进行汇总： d.cancer %>% summarise_if( is.numeric, list(avg = ~mean(.), std = ~

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机器学习中的矩阵向量求导(五) 矩阵对矩阵的求导

在矩阵向量求导前4篇文章中，我们主要讨论了标量对向量矩阵的求导，以及向量对向量的求导。...这两种定义虽然没有什么问题，但是很难用于实际的求导，比如类似我们在机器学习中的矩阵向量求导(三) 矩阵向量求导之微分法中很方便使用的微分法求导。　　　　...矩阵对矩阵求导小结　　　　由于矩阵对矩阵求导的结果包含克罗内克积，因此和之前我们讲到的其他类型的矩阵求导很不同，在机器学习算法优化中中，我们一般不在推导的时候使用矩阵对矩阵的求导，除非只是做定性的分析...如果遇到矩阵对矩阵的求导不好绕过，一般可以使用机器学习中的矩阵向量求导(四) 矩阵向量求导链式法则中第三节最后的几个链式法则公式来避免。　　　　...到此机器学习中的矩阵向量求导系列就写完了，希望可以帮到对矩阵求导的推导过程感到迷茫的同学们。

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如何对矩阵中的所有值进行比较？

如何对矩阵中的所有值进行比较？ (一) 分析需求需求相对比较明确，就是在矩阵中显示的值，需要进行整体比较，而不是单个字段值直接进行的比较。如图1所示，确认矩阵中最大值或者最小值。 ?...(二) 实现需求要实现这一步需要分析在矩阵或者透视表的情况下，如何对整体数据进行比对，实际上也就是忽略矩阵的所有维度进行比对。上面这个矩阵的维度有品牌Brand以及洲Continent。...只需要在计算比较值的时候对维度进行忽略即可。如果所有字段在单一的表格中，那相对比较好办，只需要在计算金额的时候忽略表中的维度即可。 ? 如果维度在不同表中，那建议构建一个有维度组成的表并进行计算。...通过这个值的大小设置条件格式，就能在矩阵中显示最大值和最小值的标记了。...当然这里还会有一个问题，和之前的文章中类似，如果同时具备这两个维度的外部筛选条件，那这样做的话也会出错，如图3所示，因为筛选后把最大值或者最小值给筛选掉了，因为我们要显示的是矩阵中的值进行比较，如果通过外部筛选后

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如何对类中的private方法进行测试？

问题：如何对类中的private方法进行测试？大多数时候，private都是给public方法调用的，其实只要测试public即可。...但是有时由于逻辑复杂等原因，一个public方法可能包含了多个private方法，再加上各种if/else，直接测public又要覆盖其中每个private方法的N多情况还是比较麻烦的，这时候应该考虑单对其中的...那么如何进行呢？思路：通过反射机制，在testcase中将私有方法设为“可访问”，从而实现对私有方法的测试。...假设我们要对下面这个类的sub方法进行测试 class Demo{ private function sub($a, $b){ return...这也是为什么对protected方法更建议用继承的思路去测。附：测试类改写为下面这种方式，个人感觉更清晰。

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使用 Python 对波形中的数组进行排序

在本文中，我们将学习一个 python 程序来对波形中的数组进行排序。假设我们采用了一个未排序的输入数组。我们现在将对波形中的输入数组进行排序。...− 创建一个函数，通过接受输入数组和数组长度作为参数来对波形中的数组进行排序。使用 sort（）函数（按升序/降序对列表进行排序）按升序对输入数组进行排序。...使用 len（）函数（返回对象中的项数）获取输入数组的长度。...例以下程序使用 python 内置 sort（）函数对波形中的输入数组进行排序 − # creating a function to sort the array in waveform by accepting...结论在本文中，我们学习了如何使用两种不同的方法对给定的波形阵列进行排序。与第一种方法相比，O（log N）时间复杂度降低的新逻辑是我们用来降低时间复杂度的逻辑。

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如何对矩阵中的所有值进行比较？

如何对类中的private方法进行测试？

使用 Python 对波形中的数组进行排序

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