将变量从bash导入R

文章/答案/技术大牛

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如果我在bash中有这个变量： sample='sampleA' export $sample 我如何在R中使用它？

浏览 7提问于2020-04-30得票数 0

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将环境从systemd Config加载到bash脚本

linux、bash、systemd

我想将一些环境变量从服务的systemd Configuration Files (*.conf)导入到bash中。我需要的是bash脚本中变量的值。是否有直接命令(从systemd)将中的变量导入到正在运行的bash脚本中？是否必须解析.conf文件并手动导入变量？备注: bash脚本未作为systemd服务启动。

浏览 5提问于2016-12-15得票数 2

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将变量导入bash脚本？

bash

我找不到任何关于如何将单个变量导入bash脚本的内容。从另一个文件导入变量是唯一的方法吗？我想我会创建一个临时文件temp.txt，其中有一行..。MYTEMPVAR=something 我希望能够从表单中触发bash脚本，所以每次调用bash脚本时都会有不同的值。这能办到吗？

浏览 2提问于2018-05-29得票数 0

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问题:我正在创建一个脚本，允许我将一个数字导入到(变量?操作符？)名称，以便从bash脚本中运行我的python脚本。稍后，它将在许多不同的数据表上与bash脚本中的导入数字交换。t_r+replica number = md.load(data_path+'potein_+replica_number+_centered.xtc', top = data_path+'potein_+replica_number+_fir

浏览 1提问于2021-09-13得票数 2

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Windows 10 Bash和python路径

python、windows、bash、path、pythonpath

我最近安装了windows bash。我试图通过将Anaconda安装的包添加到PYTHONPATH变量中使其可见，但它没有在环境中列出。正如声明的那样，包变量是从环境变量PYTHONPATH实例化的，但是如果它不存在于环境中(windows的Bash)，那么它怎么可能是sys.path.append呢？我已经检查了windows环境，它们是独立的系统(否则Anaconda包将可用于导入)。那么，我可以在哪里设置到windows bash</e

浏览 0提问于2017-01-12得票数 2

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将变量从bash转换为R

r、bash、translate

不过，我以前一直在运行这个bash脚本(它进入包含文件名ID列表的bestcoverage_E036文件，并检索对应于作业数组和行号的ID)--它对bash脚本非常有用。但是，我现在需要使用R作为外部深度中的变量，例如my.bam将是$INPUTFILE#!F

浏览 7提问于2022-09-19得票数 3

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python脚本中bash命令的动态变量

python、bash、shell、subprocess

我在Centos上运行一个python脚本，其中包含一些使用子进程的bash命令： import ConfigParserimport sysconfig.readfp(open(r'config.file'))stdout=subprocess.

浏览 11提问于2019-01-20得票数 0

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R: system()不能使用.bashrc中定义的bash函数

python、r、bash、configuration、path

我试图在R中创建一个函数，它将： use Python-2.7"use“是在我的.bashrc文件中导入的bash函数。它设置了我所有的路径变量(PATH、LIBRARY_PATH、LD_LIBRARY_PATH、CPATH、C_INCLUD

浏览 1提问于2017-10-10得票数 5

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为什么采购一个包含带引号和空格的值的环境变量文件会产生"command not found“错误？

node.js、bash、docker

好了，这不是通常的bash“没有找到命令”的问题。我使用一些bash脚本构建了一个生成的环境文件，然后将其传递到docker-compose服务定义中。该文件包含两个值中带有单引号和空格的变量。“，就好像它是一个在调用命令之前设置变量的调用： $ source ./test.env bash: Bye: command not found... 有没有办法在不计算的情况下导入变量？在您说之前，我不能像您在普通的bash中那样引用或转义这

浏览 14提问于2020-08-27得票数 0

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从bash脚本读取dotenv

bash

我有一个bash文件建立一个postgres数据库。source ./secrets/sqlpassword.sh我有一个简单的bash文件导出密码。#secrets/sqlpassword.sh节点服务器的其余部分使用保存在..env文件中的环境变量。为了秩序和简单起见，我希望将postgres密码存储在同一个文

浏览 4提问于2022-02-06得票数 0

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从Bash中获取R的环境变量

r、bash

我试图从bash访问R的。安装指南最初让我相信$R_HOME是在bash中声明的。然而，这似乎并不准确。有没有办法从bash访问这些环境变量？前面的问题已经问过如何使用Sys.getenv()或Sys.setenv()从R中访问这些变量。这个问题的重点是能够通过bash访问信息。简单地调用echo $R_HOME并不会在bash变量</

浏览 4提问于2015-01-20得票数 2

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在Rmarkdown中在bash中设置环境变量

r、bash、r-markdown

我想在Rmarkdown bash块中设置一个环境变量，并在以后的R块中访问它。本质上，我想做与这个问题相反的事情，这个问题已经被多次回答了：Sys.setenv(MY_PARAM = 'param value') param值再次击打： export

浏览 4提问于2020-03-06得票数 7

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从R返回参数到bash

r、bash

我有以下bash脚本，其中调用了一个R脚本declare -x b=1 我希望修改R脚本中的bash变量，并在bash脚本中返回它们的修改值，因为我随后将修改的变量传递到其他地方。R</e

浏览 2提问于2016-07-08得票数 4

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将拼音变量导出到父流程

python、ruby、linux、bash、environment

我有bash脚本和ruby脚本，有独立的责任。因此，我需要让ruby脚本中变量的修改值也反映在父bash脚本中。我想过的几种方法是： 1.)将变量导出到bash中的环境中，然后让ruby使用ENV[]散列修改它们。在这种情况下，不需

浏览 1提问于2014-07-10得票数 1

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导出python中的环境变量后，导入无法工作。

python、bash、import、pythonpath

linux上从bash shell运行时导入该文件。后来，我使用putty连接到我的linux盒，现在我的脚本从putty中失败了，因为~/..bashrc文件将无法来源。因此，我在脚本中导出了PYTHONPATH变量，如下所示。“导入phx_commonlib.configuration.systemConfig as systemConfig”(如果将导入保持在顶部，它将失败，因为它找不到PYTHONPATH)。上面写的

浏览 1提问于2014-04-08得票数 1

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MySQL SELECT DISTINCT是否不区分大小写？

python、mysql、sql、r

我正在尝试清理从熊猫数据帧导入到MySQL中的一些数据。VARIABLEVariableSELECT DISTINCTas.factor 给了我两个因素。如何让MySQL的SELECT DISTINCT区分大小写，以便检测并修复导入R进行分析的数据？

浏览 1提问于2014-03-24得票数 0

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如何从python调用shell脚本函数/变量？

python、bash

有没有方法调用shell脚本并使用python脚本中定义的函数/变量？#!/bin/bash{} 导出$(set \ tr '\n‘')对于shell全局变量(<em

浏览 4提问于2013-04-16得票数 6

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从配置文件将变量导入bash脚本

mysql、bash、shell

我希望从config.cfg文件中导入用户名、密码、主机名等变量，以便在bash脚本文件script.sh中使用它们。

浏览 2提问于2017-08-07得票数 3

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如何将变量的内容从文本文件导入bash脚本？

bash、shell-script

我希望bash脚本从文本文件中导入变量。for i in 1 2 3 IMPORT THE CONTENT OF FILE file$1.txtdone 其中，文件文本包含变量的值

浏览 0提问于2022-08-29得票数 0

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如何使用bash脚本变量从makefile中的每一行文件中读取

shell、makefile

我不熟悉Makefile，我尝试在Makefile中运行bash脚本，并在目标中使用变量作为结果。#!/bin/bash context="" do \done &l

浏览 4提问于2017-02-10得票数 1

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