将变量赋值给coxph函数
是指在统计学中使用R语言的survival包中的coxph函数进行Cox比例风险回归分析时，需要将相关变量赋值给该函数进行计算。
coxph函数是用于拟合Cox比例风险模型的函数，它可以用来分析生存数据中的风险因素对生存时间的影响。Cox比例风险模型是一种常用的生存分析方法，用于研究不同因素对生存时间的影响程度。
在R语言中，使用coxph函数进行Cox比例风险回归分析时，需要将待分析的生存数据和相关变量作为参数传递给coxph函数。具体的语法如下：
coxph(formula, data, subset, na.action, method, init, control, weights, singular.ok)
其中，formula表示模型公式，data表示数据集，subset表示子集选择条件，na.action表示缺失值处理方法，method表示拟合方法，init表示初始值，control表示控制参数，weights表示权重，singular.ok表示是否允许奇异矩阵。
在赋值给coxph函数时，需要根据具体的研究问题和数据特点来选择合适的变量，并将其赋值给formula参数。通常，变量可以是数值型、分类型或二进制型的，可以包括多个自变量。
在云计算领域，如果需要进行大规模的生存分析或者需要与其他云计算服务进行集成，可以考虑使用腾讯云的云服务器、云数据库等相关产品。具体推荐的腾讯云产品和产品介绍链接地址可以参考腾讯云官方网站。
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1回答
更改列表中的值
、、
我有下面的示例代码
library(survival)
fit2 <- coxph( Surv(stop, event) ~ size, data = bladder )
# single curve
ggadjustedcurves(fit2, data = bladder)
fit2 <- coxph( Surv(stop, event) ~ size + strata(rx), data = bladder )
# average in groups
ggadjustedcurves(fit2, data = bladder, method = "average&#
浏览 0提问于2019-09-01得票数 1
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1回答
我对如何调整coxph函数中的变量感到非常困惑。我知道可以用strata()进行分层，但是如何调整变量呢？
在线性模型中，可以通过以下方式调整变量
(这是我在这个中看到的一个示例)
fit.diamOnMachine <- lm(diameter˜machine)
diam.adjusted <- residuals(fit.diamOnMachine)
fit.diamadjmach <- lm(strength ˜ diam.adjusted + machine)
在coxph中，人们会做同样的事情吗？例如，我有1000个人的年龄、性别、BMI、到达事件的时间、结果和蛋白
浏览 0提问于2017-10-09得票数 1
2回答
我想要创建一个用户定义的函数来在一个变量列表上运行coxph。这个公式运行得很好：
summary(coxph(
Surv(var1, factor(var1)) ~ var3,
data = df_wts))
但是，如果我试图将它转换成函数，我就会得到一个“对象未找到”的警告：
cox_fun <- function(x, y) {
summary(coxph(
Surv(x, factor(y)) ~ var3,
data = df_wts))
已经试过了所有的东西，如(X)，{{}，[[]]，！，as.name()等等。
为什么会发生这种事？环境？谢谢!
浏览 4提问于2022-04-29得票数 0
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下面是我为理解我的困惑而列举的例子。现在我的问题是，当我将函数变成局部变量时，它是立即开始运行，还是等待局部变量被调用。
//Here is the function
function myFunction(){
return 'Hello Stackoverflow';
}
//Does the functio run at this point
$stackoverflow = myFunction();
//Or does the function run here?
echo $stackoverflow;
浏览 2提问于2016-03-24得票数 1
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1回答
在Codecademy骰子游戏中，我想要理解这一部分：guess = get_user_guess()，它是什么意思？将函数转换为变量？
from random import randint
from time import sleep
def get_user_guess():
guess = int(input("Guess a number: "))
return guess
def get_user_guess():
guess = int(input("Guess a number: "))
return guess
def r
浏览 1提问于2020-06-14得票数 0
使用以下代码：
variable = puts "hello world".upcase
为什么Ruby会自动将Hello放在大写中，而不首先调用变量呢？我知道您将函数设置为变量，如果调用该变量，它将返回返回值(在本例中为零)，但是为什么几乎没有权限运行puts "hello world".upcase方法(没有调用它，只是分配给一个变量)？
浏览 2提问于2016-10-31得票数 8
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1回答
如何使用函数在R中运行一组模型
、、、、
library(survival)
justices <- read.csv("http://data.princeton.edu/pop509/justices2.csv")
PREDS = c("age", "year")
m = coxph(Surv(tenure, event == 1) ~ age + year, data = justices)
summary(m)
exp(coef(m)[1])
exp(confint(m,level=(1-0.05/1))[1,])
DVMOD <- function(PREDS
浏览 11提问于2020-05-16得票数 1
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当将ggforest()应用于coxph对象时，我得到以下错误消息 error in ggforest(res.cox3, data = Selection_cox) :
class(model) == "coxph" are not all TRUE res.cox3是coxph()的输出，其中包含tt术语strata，并且是类： > class(res.cox3)
[1] "coxph.penal" "coxph" 对于下面的虚拟数据，我得到了相同的消息： set.seed(132456)
'dummy survival
浏览 140提问于2020-01-24得票数 1
1回答
library(survival)
library(survminer)
library(dplyr)
ovarian=ovarian
ovarian$weighting = sample(1:100,26,replace=T)
fitWEIGHT <- coxph(Surv(futime, fustat) ~ age + rx,data=ovarian,weight=weighting)
fitNOWEIGHT <- coxph(Surv(futime, fustat) ~ age + rx,data=ovarian)
在上面的例子中，fitWEIGHT的R平方等于1。然而
浏览 0提问于2019-03-04得票数 0
1回答
下面的示例是通过添加“年龄”从文档示例中修改的
d.coxph <- (survfit(Surv(time, status) ~ sex+age, data = lung))
autoplot(d.coxph)
我将得到以下错误：
levels<-(*tmp*，value = if (nl == nL) as.character(labels) level paste0(标签)：因子级别41被复制)中的错误
输入一个帧号，或0以退出1:自动绘图(d.coxph)>levels<-中的错误(*tmp*，value = if (nl == nL) as.character
浏览 0提问于2018-05-01得票数 1
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1回答
当使用变量交互作用时，我试图通过绘制cox回归来绘制调整后的生存曲线。
读取survfit.coxph页面https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/survival/html/survfit.coxph.html时，我看到了参数"newdata“
newdata
a data frame with the same variable names as those that appear in the coxph formula. It is also valid to use a vector, if the data frame w
浏览 1提问于2015-12-01得票数 2
我试图用coxph安全地使用purrr：：，以便捕获错误消息。我制作了一个安全的coxph版本，如下所示
library(survival)
library(purrr)
coxph_safe <- safely(coxph)
当我唯一的输入是公式和数据时，这是非常有效的，但是，如果我添加了另一个输入，例如子集或权重，我会得到以下错误消息：
simpleError (替换(子集)，数据，env)：..3在不正确的上下文中使用，不.向内看
当需要额外的输入时，有人知道如何安全地应用于coxph吗？我也得到了同样的错误使用安静，而不是安全，如果我做了一个安全版本的lm，并指定一个子集。我使
浏览 0提问于2019-07-31得票数 2
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我有一个由多个计算出来的类mids数据集。我使用with()函数来用coxph()函数估计m个不同的数据集。但是，我在自己的函数中使用with()函数时遇到了问题。
下面的代码是一个简单的示例，它在Surv(enter、exit、event)对象“enter”未找到时复制了错误: Error
list<-"X1+X2"
var.used<-formula(paste("Surv(enter,exit,event)~",list,sep=""))
with.coxph<-function(form,dataset){
with
浏览 3提问于2014-12-04得票数 0
1回答
我想探索以下变量及其双向交互作用作为可能的预测因子:兄弟姐妹数量(nsibs)、断奶年龄(wmonth)、母亲年龄(mthage)、种族、贫困、出生体重(bweight)和母亲吸烟(smoke)。
我创建了我的Cox回归公式，但我不知道如何与预测因子形成双向交互：
coxph(Surv(wmonth,chldage1)~as.factor(nsibs)+mthage+race+poverty+bweight+smoke,data=pneumon)
final<-step(coxph(Surv(wmonth,chldage1)~(as.factor(nsibs)+mthage+race
浏览 1提问于2017-05-18得票数 0
2回答
我想在函数中使用survfit()和basehaz()，但它们不起作用。你能看一下这个问题吗？谢谢你的帮助。以下代码导致错误：
library(survival)
n <- 50 # total sample size
nclust <- 5 # number of clusters
clusters <- rep(1:nclust,each=n/nclust)
beta0 <- c(1,2)
set.seed(13)
#generate phmm data set
Z <- cbind(Z1=sample(0:1,n,replace=TRUE),
浏览 3提问于2012-01-25得票数 4
下面的代码记录赋值后的a值
var a = []
if (true) {
a = 1
function a() {}
a = 2
function a() {}
a = 3
console.log('0: ', a)
}
console.log('1: ', a)
我怀疑输出可能是：
0: 3
1: 3
但实际上日志上面的代码
0: 3
1: 2
为什么？
浏览 0提问于2020-12-02得票数 7
当我尝试在R中创建一个类，包含一个应该接受glm类对象或coxph类对象的插槽时，在包构建过程中我得到了一个错误，那就是Error in setClassUnion(name = "glmORcoxph", members = c("glm", "coxph")) : the member classes must be defined: not true of "coxph"。我试着把@import，@importClassesFrom，@importFrom Roxygen指令放到我的源代码中，但是没有成功。这是我用来创建Do
浏览 3提问于2018-01-26得票数 0
回答已采纳
我决定不使用geneirc TList<integer>，而是使用
TSolutions = array of integer;
然后：
function TEuclidMod.gcdExtended(p, q: integer): TSolutions;
var tmpArr: TSolutions;
begin
SetLength(tmpArr, 3);
if (q = 0) then
begin
tmpArr[0] := p;
tmpArr[1] := 1;
tmpArr[2] := 0;
end
else
begin
vals
浏览 0提问于2017-08-30得票数 7
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1回答
有没有办法对多个输入运行coxph。在这里，我使用了输入hsa_let_7b_5p。
coxph(Surv(Time, Status)~ hsa_let_7b_5p, data=as.data.frame(test))
Call:
coxph(formula = Surv(Time, Status) ~ hsa_let_7b_5p, data = as.data.frame(test))
coef exp(coef) se(coef) z p
hsa_let_7b_5p 0.169 1.184 0.173
浏览 1提问于2016-05-04得票数 1
我在试着解决这个问题，但我不知道该怎么做..。当我点击第一个按钮时，第二个按钮没有出现。它会引发这个异常： _tkinter.TclError: image "pyimage2" doesn't exist 我什么都试过了，但我不知道该怎么办。 错误： Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
File "C:\Program Files\Python39\lib\tkinter\__init__.py", line 1892, in __call__
浏览 561提问于2021-11-22得票数 0
在R中，当比例检验(带coxph)表明违背Cox模型中的比例假设时，合并协变量与时间之间的相互作用项的最佳方法是什么？我知道你既可以用地层，也可以用时间项进行交互，我对后者很感兴趣。我还没有找到一个明确的解释，并举例说明如何在互联网上这样做。在最常见的使用Rossi数据集的例子中，Fox建议这样做，
coxph(formula = Surv(start, stop, arrest.time) ~ fin + age + age:stop + prio, data = Rossi.2)
建模和年龄之间是否有区别:停止和年龄:开始？公式必须使用这种格式吗？如果我使用两个参数格式的Surv，下面的内
浏览 1提问于2017-08-24得票数 6
1回答
我试图使用JavaScript对匿名JSLint函数进行评估。但是，JSLint无法评估它，因为函数缺少一个名称。我可以设置什么选项来允许JSLint忽略该错误？
类似于：
function(test) {
return;
}
在以下方面的成果：
Missing name in function statement.
function(test) {
编辑：为了澄清，匿名函数将用作CouchDB的视图。我想确保语法在到达DB之前是正确的。
浏览 0提问于2013-04-27得票数 0
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1回答
我正在尝试用ipython中的rpy2与R一起执行生存分析。
以下公式失败：
%Rpush df
surv_fit = surv.coxph("Surv(start, end, status) ~ x", data=df)
> RRuntimeError: Error: $ operator is invalid for atomic vectors
但是，如果我使用r魔法完成所有这些工作，它将会工作：
%Rpush df
%R surv.fit <- coxph(Surv(start, end, status) ~ x, data=df)
Surv对象有问题吗？
浏览 0提问于2014-11-01得票数 0
1回答
我在这里做错什么了？我需要用复选框替换不同的字符，但得到一个错误：
Sub ReplaceCheckboxes()
Selection.HomeKey Unit:=wdStory
Selection.Find.ClearFormatting
Selection.Find.Replacement.ClearFormatting
Do
With Selection.Find
.Text = ChrW(13)
.Forward = True
.Wrap = wdFindStop
.Format = False
.MatchCase = False
浏览 1提问于2017-03-02得票数 1
回答已采纳
1回答
我理解Ruby的含义，并试图解决Tealeaf上的某些挑战：
以下是实际问题：
片段1：
class BankAccount
def initialize(starting_balance)
@balance = starting_balance
end
# balance method can be replaced with attr_reader :balance
def balance
@balance
end
def positive_balance?
balance >= 0 #calls the balance gette
浏览 1提问于2015-05-23得票数 1
回答已采纳
3回答
嘿，我有这个代码的例子：
function generateRandStr($length){
$randstr = "";
for($i=0; $i<$length; $i++){
$randnum = mt_rand(0,61);
if($randnum < 10){
$randstr .= chr($randnum+48);
}else if($randnum < 36){
$randstr .= chr($randnum+55)
浏览 0提问于2013-04-19得票数 0
回答已采纳
我是个新手，来自Java + IntelliJ世界，我觉得VSCode没有捕捉到基本的错误，如下所示 const ProductContext = React.createContext; 在使用上述语法运行代码后，我得到了奇怪的错误，一个小时后，我发现语法应该是 const ProductContext = React.createContext(); 这是VSCode的错误，还是我需要安装一些插件来捕获这些语法错误？
浏览 8提问于2020-09-22得票数 0
1回答
我需要研究复数，用牛顿法提取多项式的虚根。
我得到了一个错误，所以我把代码分解成简单的问题，看看出了什么问题。当我试图编译它时，它返回一个错误：
警告:任务的目标实际上不是一个值，这将是未来的一个严重错误。
另外，我想知道是否存在，我可以显示整个复数，而不需要使用creal和cimag。
#include<stdio.h>
#include<complex.h>
int main()
{
double complex z1 = 2 + 3*I;
creal(z1) = 5;
cimag(z1) = 10;
printf("%.2f +%
浏览 1提问于2013-02-19得票数 0
因此，我有一个输出两个值的函数：
def example(a, b):
c = math.floor(a / b)
a = a%b
return (c, a)
我想以这样的方式使用这个函数：
print("text: ", c)
我如何使用函数和打印c，但存储x以后呢？
浏览 3提问于2022-08-25得票数 -1
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4回答
我有这样的结构：
//function declaration
someFunc() = {
// ...
}
//assign function to variable
let f = someFunc();
//call
f();
我希望通过按变量调用这个函数将参数传递给someFunc()，如下所示：
f(arg);
但是f不是变量。如何用这种方法处理函数中的参数？
编辑：在上面的问题中，我考虑通过变量调用函数。类似于：
{{ f}
而f被赋值给函数，它返回一些值。
之所以这样做，是因为我需要在ngOnInit生命周期中初始化函数(我的目标是只调用一次函数)。
我的视图和ts代码
浏览 1提问于2018-11-29得票数 0
我试图将一个值添加到一个变量中，并将其打印在同一行if循环中。
首先，我尝试用一个,将我的两个动作分开
test = 0
if True : test = 4, print(test)
> 0
print (test)
> (4, None)
我不知道为什么我的变量在从if打印时得到值0。在外面，我得到一个列表，就像测试值是4, print(test)一样
在尝试在两个操作之间使用and之后：
test = ""
if True : test = "hello" and print(test)
>
print(test)
> No
浏览 3提问于2021-03-10得票数 0
回答已采纳
我正在运行一个cox比例风险模型，该模型重复超过20,000次(给定不同基因组合的计算结果)。当我运行几百或数千次时，我没有得到任何错误。然而，根据绝对的概率，一些基因最终(我假设)完全分离，这阻止了收敛并产生了这样的警告。 Warning message:
In coxph.fit(X, Y, istrat, offset, init, control, weights = weights, ... :
Loglik converged before variable 1 ; coefficient may be infinite. 这会终止该函数。因此，我想做一个tryCatc
浏览 1879提问于2021-09-14得票数 0
2回答
我刚刚发布了一个关于这个代码的问题，很抱歉再次这样做，但是我的返回语句不起作用。每当我试图运行代码时，它都会请求一个全局变量的位置，我试图在搜索方法中返回这个变量。任何帮助都是非常感谢的。谢谢。
def main():
names = ['Ava Fischer', 'Bob White', 'Chris Rich', 'Danielle Porter','Gordon Pike', 'Hannah Beauregard', 'Matt Hoyle', 'Ross
浏览 4提问于2014-04-15得票数 0
回答已采纳
我有一个家长班：
public class ParentSchedule
{
protected readonly int[] numbersArray;
public ParentSchedule()
{
numbersArray = new int[48];
//code
}
}
然后我有个孩子班：
public class ChildSchedule: ParentSchedule
{
public ChildSchedule()
{
numbersArray = new int[24]; /
浏览 1提问于2015-03-23得票数 5
回答已采纳
1回答
我从互联网上得到了一个示例代码，如
const net = require('net');
var server = net.createServer(function(socket) {
socket.end('goodbye\n');
}).on('error', function(err) {
// handle errors here
throw err;
});
// grab a random port.
server.listen(function() {
address = se
浏览 1提问于2016-10-24得票数 0
1回答
我熟悉海象运算符:= 在Python中，但无法理解它在实体中的用途。
一个示例片段是：
assembly { codehash := extcodehash(account) }
浏览 0提问于2021-06-16得票数 2
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我正在尝试将侦听器附加到我的视频以更新一些自定义控件上的输入范围，但得到了一个错误，显示为Uncaught ReferenceError: Invalid left-hand side in assignment
$(document).on('click', '.play-pause', function() {
const video = $(this).closest('.video-container').children('video').get(0);
if (video.paused == true)
浏览 30提问于2018-02-03得票数 1
为了给JavaScript中的变量赋值，我们执行以下操作：
var x = 3;
问题：
如何通过getElementByID和jQuery将表单文本字段的值分配给变量？
如何通过getElementByID和jQuery将变量的值赋给表单文本字段？
我试着这样做：
我想计算在两个表单字段中输入的数字。将值发送到变量，然后通过getElementByID或$('#textbox')将总数传递给另一个表单字段。我对语法有点困惑。
这里的初学者..。
浏览 2提问于2015-05-17得票数 0
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1回答
函数返回中间值。
、、
我可能误解了PowerShell函数是如何工作的，但是我要从一个字符串(如“abcdef20201123xyz”)中提取年份：
function getYear($str) {
$str -match ".*(?<year>[\d]{4})[\d]{4}.*"
return $matches['year']
}
我原以为getYear("abcdef20201123xyz")只会返回"2020"，但我得到了
True
2020
为什么是这样，我怎样才能得到我在“回报”中所放的东西？
浏览 2提问于2020-11-23得票数 1
回答已采纳
当我对survfit对象使用summary()时，我得到了一个很好的data.frame，其中包含
time n.risk n.event survival std.err lower 95% CI upper 95% CI
但是coxph对象上的summary()给出了不同的结果。到目前为止，我还没有在文档中找到答案。
谢谢!汤姆
浏览 0提问于2012-10-26得票数 0
回答已采纳
1回答
在以下代码中：
>>> import time
>>> cache = {}
>>>
>>> def squared(num):
... if num in cache: return cache[num]
... print ("Calculating...")
... time.sleep(1) # fake a calculation
... result = num * num
... cache[num] = result
... return r
浏览 4提问于2019-10-20得票数 1
回答已采纳
Helloı通过getlist()函数在名为"list“的模块中创建了ı() 2d数组。我想要将tableData()数组复制到主子。我认为，首先，ı必须调用和运行函数在主子之后复制。但是ıdk怎么做，你能帮我吗？我希望问题是清楚的。
'list module
Public Function getlist()
Dim tableData() As String
End Function
'Main Module
Sub Main()
Dim partlist() As String
partlist() = list.tableData() ' ıdk :)
浏览 8提问于2022-11-17得票数 -1
假设我有这样的代码
def function(a):
newInput = "hello, your input was " + a
return newInput
现在我正在写一段代码，想要使用上面的newInput，有没有办法在另一个函数中使用这个返回值？
示例：
def function2(b):
sentence = newInput + b
return sentence
输入是字符串，如果这有什么不同，谢谢您的帮助
浏览 0提问于2015-11-16得票数 0
4回答
在阅读Django的源代码时，我发现了一些语句：
class Field(object):
"""Base class for all field types"""
__metaclass__ = LegacyConnection
# Generic field type description, usually overriden by subclasses
def _description(self):
return _(u'Field of type: %(field_t
浏览 0提问于2010-10-19得票数 22
回答已采纳
2回答
按年分层
、、、
我认为这应该是很容易的事情，但我不太明白。
我有以下代码：
library(survival)
cox <- coxph(Surv(SURV, DEAD)~YEAR, data)
summary(cox)
但我希望把结果分成几年。
这里是SPSS语法和解决方案的样子：
COXREG surv /STATUS=dead(1) /CONTRAST (year)=Indicator(1)
/METHOD=ENTER year /PRINT=CI(95)
/CRITERIA=PIN(.05) POUT(.10) ITERATE(20).
EXECUTE.
和STATA中的相同之处：
浏览 4提问于2013-05-14得票数 0
回答已采纳
我有一个JS模块，它是一个从我们公司的Github获取问题数据的函数，然后我想将其赋给一个变量： import { request } from "https://cdn.skypack.dev/@octokit/request";
let issueData
async function getIssues() {
const issueAPI = await request("GET repos/{owner}/{repo}/issues", {
baseUrl: "https://company.com/api/v3/
浏览 16提问于2021-04-29得票数 0
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我最近浏览了js代码，下面的语法不断出现：
var foo = bar.bi = function() {...}
这对我来说是不熟悉的语法。是否仅为同一函数定义两个名称？如果是这样，为什么不只将其定义为bar.bi = function()
浏览 0提问于2012-01-16得票数 5
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我想用Cox比例风险模型的coxph R函数从惩罚的R包中得到对肺数据集的预测。
我有下面的示例代码。
library(survival)
library(pec)
library(penalized)
data("lung")
data <- lung
trainind <- sample(1:n,n*0.7)
testind <- (1:n)[-trainind]
frm <- as.formula(paste("Surv(time, status)~",paste(names(data[,-c(2,3)]), col
浏览 7提问于2017-09-11得票数 0
回答已采纳
1回答
我知道这对许多人来说是微不足道的，但对我来说不是，因为我是新手。我需要将create function中的回滚函数赋给一个我尝试过的变量：
var obj_transaction = Transaction.create({ amount: 200 }).exec(function(err, transaction){
return transaction;//if print transaction here returns json of new transaction
浏览 0提问于2015-12-21得票数 0
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