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将集群关联到热图
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我有两个独立的数据帧，其中一个我已经从第一个数据帧创建了一个热图，但是我想添加一个侧栏，指出基因实际与之相关的家族类型。BGC31 Skin CancerBGC34 Lung Cancer
BGC53 Liver Cancer 热图创建,lhei=c(0.5,1), keysize=0.5, cexRow = 0.60, cexCol = 0.65) 我希望创建这样的东西，其中每种颜色代表与特定基因类关联的基因簇的
浏览 17提问于2020-04-20得票数 0
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我试图解释热图，它是基于聚集的分层聚类创建的。我不知道热图到底是做什么的，考虑到我在左手边看到了症状的聚类，在热图的顶部，我得到了下面标签的聚类。📷library(pheatmap)
pheatmap(t(dt_wd[-1]), cluster_rows = TRUE, cluster_cols
浏览 0提问于2020-09-07得票数 1
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我在R中的kohonen包的帮助下创建了一个集群。该集群由6个不同的属性定义，形成一个15x15矩阵=225个不同的集群。现在，我想要创建某种传说，根据特定的值(比如热图)，用不同的颜色填充每个集群的可视化。问题是，这个特定的值不是定义集群的6个属性的一部分。因此，我不能使用SOM包中的标准热图功能，因为它只支持参与计算的值的热图。
是否有任何方法将这些值从集群之
浏览 5提问于2022-02-11得票数 1
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针对热图的地理数据聚类
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它们将显示在一个热图图像中，并透明地放置在Google Map上。诀窍是根据集群大小，找到彼此相邻的位置组，并将它们显示为某个热/颜色的单个热图圆圈/图形。
是否有一些库可以将地图中的位置分组为集群？
浏览 1提问于2012-02-03得票数 3
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我正在制作热图(主要是数据)，并使用自定义热图函数(基于R的内置热图函数)获得漂亮的图形。然而，我想要两个改进。第一种是根据递减的平均值对我的集群进行排序。nstart=10)d = data.frame(d, fit$cluster)给我一个在集群列上排序的什么是对行进行排序的最佳方法，以便8个集群按其各自的均值排
浏览 1提问于2011-01-25得票数 5
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我已经创建了一个热图，并使用树状图进行了聚类，以获得以下结果：你在行树形图上看到的亮点基本上就是我想要区分的。我需要一种方法来获取这些特定行的值，或者找到一种方法来获取与这些行相关联的所有行名。或者，是否可以为每一条线设置特定的颜色。我不知道有什么方法可以做到这一点。这样做的原因是我创建了一个与热图相关的散点图。本质上，每一行(未包括在热图中的名称)将是散点图上的一个点，并且每个突出显示的树状图集群将在散点图上被分配一种颜色。因此，散点图上
浏览 1提问于2013-08-17得票数 1
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我的目的是有一个热图与相关的树状图，并在热图上的聚类的方块识别。0.95 0.43f 0.9 0.63 0.84 0.43 0.14 1
我尝试了这段代码来获得树状图和相关的集群我真正想要的是类似的东西，但是用热图。我想要星团周围的广场和不同星系团成员的名单的热图。热图应该如下所示：
浏览 6提问于2015-01-20得票数 0
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我有以下热图的示例图像(我现在有数百个这样的images...for，以后会增长)：
用我的人眼，我会说heatmap1，3和4是相似的，或者3和4是最相似的，我不确定我希望能够根据模式和强度将最相似的热图图划分成不同的组。
例如，中的每个heatmap包含24行和5列(行表示时间，列表示功能)。每列中的每一种颜色代表一个介于0到1之间的数字。与其他热图相比，第1列中用于heatmap 3和4的
浏览 10提问于2017-05-11得票数 0
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R中的共识聚类加
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在从我的数据集中确定一个最优的集群数时，我遇到了一个两难的问题。我已经获得了ConsensusClusterPlus热图图，但不太确定集群的最优数目。
有人能帮忙吗？我附上了热图和图的图片，以决定最优的簇数。似乎k=3是一个最佳的数字点击这里查看图片图片，pic ，pic ，pic ，pic ，pic ，pic ，pic
浏览 3提问于2018-01-16得票数 0
我正在使用python中的matplotlib为我使用k均值集群创建的不同集群创建热图。现在我能得出这个数字：但是我希望每个集群中的行数反映在热图的大小中，而不是所有的行都被缩放到相同的大小。GridSpec是正确的方法吗？这是我唯一能找到的尝试谷歌解决方案，但它似乎更适合的情况下，你有一个网格子图，你想要一个子图跨越超过一个行或列在网格上。在这种情况下，我将创建一个包含数千行的网格，并告诉每个子
浏览 3提问于2018-06-08得票数 1
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我正试图用Python巧妙地创建一个集群热图(带有树状图)。他们在他们的网站上做的不是很好的扩展，我已经找到了各种各样的解决方案，但大多数是在R或JavaScript。我正在尝试创建一个热图，其中只包含来自热图左侧的树状图，显示跨y轴的集群(从分层聚类)。一个非常好看的例子就是这个例子：。我的目的是创建这样的东西，但只有左边的树状图。
浏览 15提问于2021-03-09得票数 3
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这里有一个热图的例子，它是由区域上的标记/点的数量来决定的。但是，是否有一种方法可以通过平均引脚/标记值来显示热图？例如，如果我有5个引脚和它们的平均支持值speed=3，那么它将显示为绿色集群/热图，如果它们的av。支柱val为6，则为红色星系团/热图。
浏览 10提问于2017-08-24得票数 6
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我正在关注关于programming中的共识集群的这文章。在第7页中，作者指出：“协商一致矩阵很自然地被用作可视化工具，以帮助评估集群的组成和数量。特别是，如果我们将颜色梯度与0-1的实数范围相关联，使白色对应于0，而暗红色对应于1，如果我们假定矩阵的排列使属于同一集群的项目彼此相邻(使用相同的项目顺序来索引矩阵的行和列)，那么对应于完美一致性的矩阵将在白色背景上显示为以红色块沿对角线描述的颜色编码热图为了从一致矩阵到可视化，作者指出：“我们可以利用一
浏览 0提问于2021-02-27得票数 1
我已经生成了一个非常整洁的热图，它使用pheatmap包将我的数据分成两组。虽然它不是完全干净的，但根据我的情况，这两个树状图很大程度上将我的样本分为两个不同的组。现在，我想要将这90个集合减少到一个更严格的集合，大约20-30个观察点，但仍然希望保留与pheatmap中所示的相同的聚类顺序。有没有办法做到这一点？或者任何其他将我的观察结果减少到最小集合的软件包，仍然可以通过现在所看到的聚类顺序来保持？
浏览 0提问于2017-05-05得票数 2
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我使用下面的代码为我的大型数据集制作了这个热图。现在我想要获取第二个集群的行名(基因的名称)(红色在左边，绿色在右边)。首先，我试图按照this page上的说明来划分集群，但由于y轴上树状图的复杂性，解决方案对我来说并不实用。然后，我尝试在制作热图之前进行聚类，希望得到相同的结果。this page上的代码没有生成相同的热图。 有没有可能获得热图中所需区域的基因列表？
浏览 57提问于2020-09-03得票数 1
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我正在海运中制作一个集群热图，如下所示import seaborn as snsdata = np.random.randn(100, 10)但是这些行被压扁了：但是，如果我将一个大小传递给集群映射函数，那么它看起来很糟糕。
有办法只增加热图部件的大小吗？这样行名就可以读取，但不能扩展集群部分。
浏览 1提问于2015-10-15得票数 10
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我想绘制一个DataFrame的集群热图。使用seaborn.clustermap，我非常接近结果。但我只想要没有层次树和列表栏的热图，但我不知道如何停用它们。
浏览 2提问于2016-12-12得票数 1
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可点击的热图图表
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我正在尝试从一些静态数据创建一个热图。数据具有x，y坐标和数据点的值。该值与一个URL相关联，我希望将其设置为可单击事件，以便当单击热图时，它将重定向到该URL。,value:5,url:'http://www.apple.com'},我正在使用来绘制热图。如果我可以生成所需的答案，我
浏览 2提问于2012-07-27得票数 1
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