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【命名实体识别】训练端到端的序列标注模型

模型详解 NER任务的输入是"一句话",目标是识别句子中的实体边界及类别,我们参照论文[2]仅对原始句子进行了一些简单的预处理工作:将每个词转换为小写,并将原词是否大写另作为一个特征,共同作为模型的输入...数据说明 在本例中,我们以 CoNLL 2003 NER(https://www.clips.uantwerpen.be/conll2003/ner/)任务为例,原始Reuters数据由于版权原因需另外申请免费下载...CoNLL 2003原始数据格式如下: U.N....我们在reader.py脚本中完成对原始数据的处理以及读取,主要包括下面几个步骤: 从原始数据文件中抽取出句子和标签,构造句子序列和标签序列; 将 I-TYPE 表示的标签转换为 BIO 方式表示的标签...; 将句子序列中的单词转换为小写,并构造大写标记序列; 依据词典获取词对应的整数索引。

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    简单有效,来看看这个NER SOTA!

    结束了,是不是很简单,但效果很不错,在多个few shot NER的数据集上拿到了SOTA。...改成自然语言的形式,比如"PER"改成"person"; 将label的BIO tag改成自然语言形式,比如“B-PER”就变成了 "begin person", "I-PER"就变成了"inside...label name + 上下文去生成label表征的方式,具体方式如下: 这里面的BIO+tag自然语言形式的格式,他们也尝试了好多种,但不是重点,详细的可以去论文的附录E部分查看。...随机挑选数据集中包含entity type的文本,然后将该entity type的文本替换为BIO+tag自然语言形式的结构,然后用label Encoder编码这段文本,用文本的average pooling...此外,CoNLL-2003/WNUT-2017/I2B2-2014这三个数据集与source dataset的标签名很相近,所以相对于其他数据集,这仨数据集的小样本量效果距大样本量的效果较小。

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    使用fasterq-dump命令将sra格式数据转换为fastq格式遇到的问题

    从NCBI下载了一些转录组数据,这里用到的下载工具是kingfisher ,github的链接是 https://github.com/wwood/kingfisher-download 下载方法选的是...aws-http (下载速度超级快) 默认会将sra格式转换为fastq格式,使用到的工具是fasterq-dump这个工具,试了几次一直遇到报错,所以就将下载格式默认选择为sra 需要制定参数-f sra...想的是后续再单独转成fastq格式 下载完成后转化fastq格式还是有问题,使用fasterq-dump命令有时候可以成功,但是有时候就会卡住,卡住后按ctrl+c命令也不能退出,只能关掉窗口重新链接服务器...github.com/ncbi/sra-tools/issues/463 大家的问题基本都是一样的 计算机集群,slurm这个命令提交系统 BeeGFS 这个存储系统 和我的硬件情况一样 没有找到解决办法...,如果没有下载就指定 SRR5187763 不带后缀名sra 文件下载好以后转换起来还是相当快的 大家如果遇到这个问题也可以试试这个替代方案

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    独家 | 轻松上手,通过微调Transformers完成命名实体识别任务

    NERDA是一套通用的NER系统,可用于以最少的代码量对任意语言的NER任务和任意transformer进行微调。...命名实体识别简介 如果你还不熟悉NER,请查看维基百科上的定义: 命名实体识别(也称(命名)实体标识,实体片取或实体提取)是用于信息提取的自然语言处理子任务,旨在将非结构化文本中提到的命名实体定位并分到预定义的类别...它可通过如下方式安装: pip install NERDA 数据集 我们将使用带有NER标注的CoNLL-2003英文数据集来训练和验证我们的模型。...下面,你将看到CoNLL数据集中随机取出的一个句子示例,同时列出了其分词与对应的命名实体标签([标签])。...转载须知 如需转载,请在开篇显著位置注明作者和出处(转自:数据派ID:DatapiTHU),并在文章结尾放置数据派醒目二维码。

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    试用开源标注平台 Label Studio

    OK,如果你还满意的话可以继续往下看安装、导入数据等部分了。接下来我会以标注 NER 数据为例,介绍如何使用 Label Studio。...假设我们计划将标注相关文件放在 ner_labeling 文件夹中,你不用事先创建。...注意官方并不建议直接修改项目中的文件,建议使用网页或者命令修改。 导入任务 接着点击左上角图标回到主页面,进行第二步导入任务,可以导入 json、csv、tsv 和 txt 等文件格式。...JSON、CSV、TSV、CoNLL 2003、COCO 和 Pascal VOC XML,其中 CoNLL 2003 是 ner 数据格式的一种,但是经过我测试导出这种格式并不成功,导出的文件是空的。...优缺点 经过我粗浅的使用,发现一些优缺点: 优点: 界面相对美观 部署方便 配置方便,有多种内置模板 导入数据方便 可以明晰了解任务的完成度及每条任务的完成时间 支持图像、文本和音频等多种数据格式和多种任务数据的标注

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    【万字详文介绍】:迭代扩张卷积神经网络(IDCNN)

    在本文中,我们以自然语言处理中的命名实体识别(NER)任务为例,选择经典的CoNLL-2003数据集。该数据集包含英语句子的序列标注,标签包括人物、地点、组织等实体类型。...加载和预处理数据加载数据集dataset = load_dataset("conll2003", trust_remote_code=True)这里我们加载了 CoNLL-2003 数据集,它是一个常用于命名实体识别...特殊标记 "" 用于填充短句子,它的 ID 为 0。这个词汇表帮助我们将单词转换为整数索引。...= item['ner_tags'] # 将tokens转换为词ID,labels转换为标签ID token_ids = [word_to_index.get(token,...= item['ner_tags'] # 将tokens转换为词ID,labels转换为标签ID token_ids = [word_to_index.get(token,

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    这篇文章告诉你,如何用阅读理解来做NER!

    作者:林哲乐 之前做过实体关系抽取/联合抽取等任务,是用LSTM+CRF模型+BIO标注的方法,最近看到有一篇ACL用MRC(Machine Reading Comprehension)的方法去做NER...2.flat NER (普通命名实体识别,将实体识别看作序列标注任务来解决,不适用于存在实体嵌套的情况) 本文提出的统一化MRC框架则同时解决了上述两种类型的任务。...本文对nested NER和flat NER的实验,分别采用不同的数据集 1....,在另一个数据集上测试 训练数据:CoNLL 2003 测试数据:OntoNotes5.0 OntoNotes5.0有18种实体类型,其中有3种和CoNLL03中的实体类型一样 ?...结论 本文将NER任务转化为MRC下的问答任务,好处有: 可以处理重叠或嵌套的实体 问题编码了重要的先验知识 同时在nested和flat数据上都取得了SOTA的效果

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    Python环境中HanLP安装与使用

    lem:词的词形还原键。 pos:词性标记的键。 dep:依赖关系树的键。 sdp:语义依赖关系树/图的键。SDP 可视化尚未实现。 ner:命名实体识别标记的键。 srl:语义角色标注的键。...con:句法分析树的键。 show_header:是否打印标题,标题显示每个字段的名称。默认值为 True。 html:是否以 HTML 格式输出格式化文本。这确保了非 ASCII 字符可以正确对齐。...Returns: A squeezed document with only one sentence. 3.5 转为 CoNLL 格式 to_conll(tok='tok', lem='lem', pos...Returns: A CoNLLSentence representation. 3.6 转换为 JSON 兼容的字典 to_dict()[source] Convert to a json compatible...Returns: A dict representation. 3.7 将文档转换为 JSON 字符串 to_json(ensure_ascii=False, indent=2)→ str[source

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    『跟着雨哥学AI』系列之八:趣味案例——有关NLP任务数据预处理的那些事儿

    那么我们如何将文本类型的数据转变成模型可以识别的内容,这就是我们本节课要学习的知识啦。针对不同的任务和数据集,数据处理的细节上可能会有所不同,但是大致的流程相似。...[鼓掌] 读取数据后,我们将数据处理成[sentence, label]的格式存在列表中,并将数据集打乱。...我们将通过这一步构建的词表来进行映射。 # 下载词汇表文件word_dict.txt,用于构造词-id映射关系。 !...例如,本例中使用的CoNLL2003数据集只包含4种实体类别,而另一个NER任务的常用数据集OntoNotes5.0则包含18种实体类别。...PaddleNLP中提供了很多用于文本处理的接口,这里我们结合PaddleNLP进行数据集的构建以及加载。

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    TextBrewer:融合并改进了NLP和CV中的多种知识蒸馏技术、提供便捷快速的知识蒸馏框架、提升模型的推理速度,减少内存占用

    examples/conll2003_example (英文): CoNLL-2003英文实体识别任务上的序列标注任务蒸馏。...examples/msra_ner_example (中文): MSRA NER(中文命名实体识别)任务上,使用分布式数据并行训练的Chinese-ELECTRA-base模型蒸馏。...蒸馏到T4-tiny的实验中,SQuAD任务上使用了NewsQA作为增强数据;CoNLL-2003上使用了HotpotQA的篇章作为增强数据 蒸馏到T12-nano的实验中,CoNLL-2003上使用了...BasicTrainer:用于单个模型的有监督训练,而非蒸馏。可用于训练教师模型。...3.3.2Adaptor 将模型的输入和输出转换为指定的格式,向distiller解释模型的输入和输出,以便distiller根据不同的策略进行不同的计算。

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    自然语言处理全家福:纵览当前NLP中的任务、数据、模型与论文

    近期发展出来的方法(《Grammar as a Foreign Language》)将解析树转换为按深度优先遍历的序列,从而能应用序列到序列模型到该解析树上。...WikiText-2 由大约两百万个从维基百科文章中提取的单词构成。 ? 机器翻译 机器翻译是将句子从源语言转换为不同的目标语言的任务。...命名实体识别 命名实体识别(NER)是在文本中以对应类型标记实体的任务。常用的方法使用 BIO 记号,区分实体的起始(begining,B)和内部(inside,I)。O 被用于非实体标记。...Story Cloze Test Story Cloze Test 是一个用于故事理解的数据集,它提供了 four-sentence 形式的故事和两个可能的结局,系统将尝试选择正确的故事结局。...BIO 符号经常用于语义功能标注。 示例: ?

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    ArgMiner:一个用于对论点挖掘数据集进行处理、增强、训练和推理的 PyTorch 的包

    由于每个数据集都以不同的格式存储,使上述挑战变得更加复杂,这使得在实验中对数据进行标准化处理变得困难(Feedback Prize比赛就可以确认这一点,因为大部分代码都是用于处理数据的)。...关于论点标签的实际信息包含在train.csv中。 没有一个数据集实际上表明文章中不是论点组成部分的部分,即所谓的“其他”类。...为了以标准化的格式处理这些变化很大的原始文本,ArgMiner采用了3个阶段: 预处理:从源中提取数据 这个步骤以原始格式(对于每个数据集)获取数据,并使用span_start和span_end特性和原始文本生成一个...__init__(path) def _preprocess(self): pass 生成标签和(可选)增加数据 数据经过了处理已经变为标准格式了,那么下一步就可以为数据生成NER样式标签...在这一步结束时,数据集将像这样:[essay_id, text, argument_component, NER_labels]。

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    「自然语言处理(NLP)论文推送」(微信AI团队论文分享,附下载链接)808

    ,本文提出了一种用于现代汉语诗歌生成的修辞控制编码器。...在两个标准序列标记任务上的实验表明,在只给出训练数据和单词嵌入(Glove)的情况下,我们的GCDT在CoNLL03 NER任务上取得了91.96 F1的成绩,在CoNLL2000分块任务上取得了95.43...此外,通过利用BERT作为一个额外的资源,我们得到了最好的结果,在NER上的结果是93.47 F1以及在Chunking上的结果为97.30 F1。...的标签的输出输入解码器,然后将解码器 ? 的输出转换为 ? ,在标签词汇表上进行最终的softmax。在形式上,将单词 ? 的标号预测为概率方程。 ?...此外,我们使用波束搜索算法来推断测试时标签的最可能序列。 主要实验结果 在CoNLL03上面的结果: ? 在CoNLL2000 Chunking Task上的结果: ?

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    腾讯云ES AI增强搜索:十分钟快速入门自然语言处理(NLP)与向量检索

    在生产中,企业可以将腾讯云ES作为向量数据库使用,有效地创建、存储和搜索密集向量,为用户提供更加智能的搜索功能。...例如,企业可在腾讯云ES上传自定义大数据模型来做Embedding,如词嵌入模型(Word Embedding)或深度学习模型(如BERT),在读写过程中实时将图片、文本等数据转换为向量,然后存入Elasticsearch...说明:如果是本地上传,需要使用公网访问地址,并将IP白名单设置为当前机器的IP地址;公网访问仅适用于测试环境,在生产环境中,推荐使用内网访问。...图十 进入Kibana后,在右侧选择「Dev tools」: 图十一 一、命名实体识别(NER) POST /_ml/trained_models/elastic__distilbert-base-cased-finetuned-conll03...模型将“Kevin”识别成了“人”,将“Shenzhen”识别成了“地点”: 图十二 POST /_ml/trained_models/elastic__distilbert-base-cased-finetuned-conll03

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    用飞桨做命名实体识别,手把手教你实现经典模型 BiGRU + CRF

    命名实体识别(Named Entity Recognition,NER)是 NLP 几个经典任务之一,通俗易懂的来说,就是从一段文本中抽取出需求的关键词,如地名,人名等。 ?...下面我们先带您了解一些 Gated RNN 和 CRF 的背景知识,然后再教您一步一步用 飞桨(PaddlePaddle)实现一个命名实体任务。另外,我们采用经典的 CoNLL 数据集。...如下面图所示,低端的 表示输入,顶端的输出表示 BIO 标注。 ?...# 导入 PaddlePaddle 函数库. import paddle from paddle importfluid # 导入内置的 CoNLL 数据集. from paddle.datasetimport...conll05 # 获取数据集的内置字典信息. word_dict, _,label_dict = conll05.get_dict() WORD_DIM = 32 # 超参数

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