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我有匹配分段的200+ CT卷文件。卷采用.nrrd格式，分段采用seg.nrrd格式。我需要这两个作为.nii.gz格式，我想脚本从一种格式转换为另一种格式。关于卷，使用sitk，一切都很容易： 将SimpleITK导入为站点 img =sitk.ReadImage(“your_image.nrrd”) sitk.WriteImage(img，“your_image.nii.gz当我使用3D切片器执行以下手动步骤时，也会发生同样的情况: 1.将.se
浏览 169提问于2021-03-30得票数 0
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选择NIfTi而不是DICOM有什么主要好处吗？作为数据格式的选择？我正在研究3D体积语义分割。在提供给网络之前，我必须将格式转换为numpy数组或张量，但对选择的性能优势感到好奇。
浏览 76提问于2020-01-21得票数 0
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我有2个nifti图像卷，我想使用XTK一起显示。它们都已经使用Mevislab的相关ITK模块转换为NRRD。这两个体积都是在同一个MR会话中获得的，但它们在空间分辨率和视野(甚至在方向上)都不同，因此XTK必须记住NRRD的“空间方向”和“空间原点”字段，以便根据相对空间位置正确地显示它们。我已经读了一个关于修复“太空起源”部分的问答，但它仍然在“太空方向”方面遇到问题。我最近的尝试是试图在加载卷后修改它们<em
浏览 0提问于2012-08-13得票数 0
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我正在处理.dcm图像(dicom图像)我用过..。用于分段的链接。分割后，我在分割区域上使用感兴趣区域(ROI)。现在我有了参数x，y，w，h和从ROI得到的裁剪图像。有没有办法把这些数据可视化。我搞不懂vtk的功能和参数是什么。
浏览 15提问于2019-11-15得票数 0
我从MRI采集中提取了一个3D表面，描述该表面的点的坐标(我相信)相对于该系列第一张图像的参考系(我的意思是原点对应于图像位置(患者)，轴方向对应于图像方向(患者))。我有另一组图像，具有不同的Image Position(Patient)和不同的Image Orientation(Patient)；我希望旋转和平移从第一组图像中提取的曲面，以便使其与第二组图像完全匹配我很难找到正确的4x4矩阵来做这项工作，一旦我得到它，我知道如何将
浏览 14提问于2017-08-15得票数 1
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我有一个精确的植入物网格表面模型，我想最佳地将其与包含完全相同对象的计算机断层扫描(标量体积)对齐。我试着用精明的滤波器检测图像体积中的边缘，并在网格的边缘和顶点之间进行迭代最近点对齐，但它不起作用。我还尝试了对网格进行体素化，并使用图像体积对齐方法(Mattes Mutual)，但结果非常不一致。谢谢。
浏览 1提问于2014-11-11得票数 2
我正在改变一些3D体积的体素大小。如何编辑pixdim字段并计算新的affine 我有一些MR体积是各向异性的，体素大小是，比如说，0.5 x 0.5 x 3 mm。我有一些代码来将它们插入到各向同性(如0.5 x 0.5 x 0.5 mm体素大小)体积中。问题是当我需要保存文件时，我必须计算仿射来将ijk空间中现在更密集的体素映射到引用xyz空间。我该怎么做？首先，我的想法是使用旧的仿射并计算新的
浏览 26提问于2019-04-20得票数 1
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我正在尝试获取一些DICOM堆栈，并将它们转换为Nifti文件。当我进行转换并在3D查看器中打开新的Nifti文件时，体积在z方向上被粉碎在一起。Nifti文件不知道切片之间的间距。如何在转换格式时将元数据从DICOM堆栈复制到Nifti文件？<code>A2</code>我正在使用<code>D3</code>并设置我的体素间距，但当我在
浏览 12提问于2020-08-05得票数 0
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我在试着获取小脑的网状结构。问题是mri体积没有足够高的分辨率来实现不同子结构的可靠识别，所以我正在做的是解析组织学染色幻灯片描绘的svg文件，并将它们转换为填充掩膜，就像在mri体积的一个切片上使用多边形工具后得到的那样。我是否可以在snap中加载标记的体积，其中每个体素都使用与某些结构相对应的id进行标记，并且每个结构都有自己的rgb颜色代码
浏览 6提问于2020-04-23得票数 0
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如何裁剪网格模型匹配机器人模板
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给出一个网格模型(例如一个盒子)和一个包含子部件(基本上是长方体)的体积、纵横比和连接信息的机器人模板，我们希望有一个切割算法将网格模型切割成与机器人模板匹配的块。我们用玛雅做模特。例如，网格模型是一个1X1X1的volume=1盒，机器人模板有1:1:2的体积0.5与身体的头连接，以及1:1:2的体积0.5与头部的连接，然后我们需要将这个盒子切成两半。体积、纵横
浏览 4提问于2014-02-03得票数 0
我有一个包含148 *N个图像的文件夹(N是我的动态PET的帧数)，我想将每个帧的图像分开。首先，我为每个带有相应图像的帧创建了一个子文件夹。(path_subfolder1))frame1 = [image1, ..., image148]
frame2 =，两种方法得不到相同的值。使用series_reader.GDCMSeriesFileNames()创建他
浏览 0提问于2018-06-12得票数 1
问题摘要:我有一些3D建模对象的大型STL文件，我想在需要在Solidworks中分析的CT扫描的特定部分进行叠加和比较。我想知道1是否有函数或算法。)压缩STL文件2。)通过正态分布消除stl文件中的噪声(离散大小标注的高斯消除？)或最后3个。)通过指定坐标体积来分割stl文件，以消除设置体积之外的STL三角形，以实现较小的文件大小和基于特定区域的零件检查。尝试的解决方案:我尝试
浏览 18提问于2019-06-06得票数 1
我正在尝试计算STL文件中定义的对象的质心(x，y，z)坐标(立体光刻，不要与标准模板库混淆)。STL文件包含由三角形组成的边界定义的闭合对象(或多个对象)。三角形本身不一定是任何顺序的，文件只是在3D空间中浮动的每个三角形的3个顶点的坐标加上三角形的法向量(法线应该被忽略，因为它并不总是正确地完成)。没有任何东西将每个三角形彼此联系起来，假设对象是闭合的。
一种简单的方法是<em
浏览 2提问于2010-01-18得票数 9
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我有一个Excel工作表计算，我正在尝试转换为具有web输出的Javascript。我是Javascript的新手，但我对我正在尝试实现的工作表的一个功能遇到了一些麻烦。该工作表是一个The体积计算器，它将采用给定的气球类型，乘以一个数量，然后建议充填给定体积所需的最佳值。下面是供参考的电子表格：
这是我在JSFiddle上尝试的一个简短而简单的</em
浏览 2提问于2016-02-29得票数 0
我是这里的新手。我希望了解有3字节PCM样本的24位PCM原始(无头)文件转换为32位PCM原始文件的任何工具/快速方法，该文件每个样本有4个字节，4字节数据的MSByte作为3字节样本的符号/零扩展。除了24位的原始文件，如果它有帮助的话，我还有相应的WAVE文件。
在大胆尝试时，虽然它将24位转换为32位，但它没有签名/零扩展，但它左移了8位，即24位样本。因此，实际上，24位样本位
浏览 1提问于2017-04-28得票数 0
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我有一个解剖体积图像(B)，它是一个索引图像i，j，k：该文件仅包含0和1。我可以用isosurface正确地将其可视化：isosurface(B);我想为数据获得一个新的正交坐标系，这样我在坐标j中的平面将以更精确<em
浏览 10提问于2013-08-27得票数 4
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像烟雾、雾或云这样的体积效应是如何被射线示踪剂渲染出来的？与固体物体不同的是，它们没有一个定义良好的曲面来计算与之交集。
浏览 0提问于2015-08-13得票数 14
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计算变形体的体积
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所以我想计算使用任意变换矩阵变换的球体(单位球)，长方体(立方体)的体积。
例如:我在3D空间的中心得到半径为1的球体。然后我得到了一个应用于该球体的变换。体积是多少(分别为半径)在那之后？
浏览 1提问于2014-07-08得票数 0
我想要做的是检查16块瓷砖中是否有1块在可见区域内，所以当它们不在屏幕上时，我就停止它们的绘制。我找到了一些非常复杂的方法来做这件事，但是它是三维的，似乎是为了一些应该简单的事情而做的大量工作。我想这就像是在检查一个点是否在可见区域的范围内，但我不知道如何得到可见区域。
浏览 2提问于2013-12-16得票数 0
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我试着测试一个点是否在一个由8点定义的3d卷内。我知道我可以用平面方程来检查所有六面的符号距离总是-1，但是有没有人知道更快的方法，或者能给我指出一些代码呢？我应该补充的是，理想情况下，测试将产生3个线性插值参数，这些参数位于0..1范围内，以表明该点在每个轴的体积内(因为如果发现该点位于卷内，则必须稍后计算这些参数)。
浏览 0提问于2012-10-28得票数 5
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